MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_010102	GGCG	2	8	992956	992963	0 %	0 %	75 %	25 %	161613381
19503	NC_010102	T	7	7	993001	993007	0 %	100 %	0 %	0 %	161613381
19504	NC_010102	TAC	2	6	993025	993030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613381
19505	NC_010102	GGT	3	9	993031	993039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613381
19506	NC_010102	GCG	3	9	993080	993088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613381
19507	NC_010102	TCAT	2	8	993138	993145	25 %	50 %	0 %	25 %	161613381
19508	NC_010102	ATT	2	6	993161	993166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613381
19509	NC_010102	AGGCG	2	10	993178	993187	20 %	0 %	60 %	20 %	161613381
19510	NC_010102	GCG	2	6	993273	993278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613381
19511	NC_010102	TGA	2	6	993312	993317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613381
19512	NC_010102	CGG	2	6	993322	993327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613381
19513	NC_010102	ATT	2	6	993344	993349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613381
19514	NC_010102	CAG	2	6	993352	993357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613381
19515	NC_010102	ATT	2	6	993452	993457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613381
19516	NC_010102	TGA	2	6	993465	993470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613381
19517	NC_010102	GGC	2	6	993673	993678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613381
19518	NC_010102	TAT	2	6	993721	993726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613381
19519	NC_010102	TGC	2	6	993916	993921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613381
19520	NC_010102	GGC	2	6	993937	993942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613381
19521	NC_010102	GC	4	8	993972	993979	0 %	0 %	50 %	50 %	161613381
19522	NC_010102	CGTG	2	8	994111	994118	0 %	25 %	50 %	25 %	161613381
19523	NC_010102	GCTG	2	8	994152	994159	0 %	25 %	50 %	25 %	161613381
19524	NC_010102	CG	3	6	994170	994175	0 %	0 %	50 %	50 %	161613381
19525	NC_010102	CCT	2	6	994866	994871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161613382
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19529	NC_010102	GGA	2	6	995109	995114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161613383
19530	NC_010102	TGTT	2	8	995210	995217	0 %	75 %	25 %	0 %	161613383
19531	NC_010102	CTGT	2	8	995227	995234	0 %	50 %	25 %	25 %	161613383
19532	NC_010102	TCT	2	6	995346	995351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613383
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19534	NC_010102	GGCTC	2	10	995443	995452	0 %	20 %	40 %	40 %	161613383
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19536	NC_010102	CGG	2	6	995760	995765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613383
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19540	NC_010102	ACG	2	6	996113	996118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613383
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19544	NC_010102	CGA	2	6	996278	996283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613383
19545	NC_010102	GCT	2	6	996324	996329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613383
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19547	NC_010102	TAC	2	6	996443	996448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613383
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19561	NC_010102	GTC	2	6	997549	997554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613387
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19591	NC_010102	AAG	2	6	998716	998721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161613387
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19603	NC_010102	AATA	2	8	999490	999497	75 %	25 %	0 %	0 %	161613388
19604	NC_010102	GA	3	6	999499	999504	50 %	0 %	50 %	0 %	161613388
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19606	NC_010102	CGT	2	6	999536	999541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613388
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19621	NC_010102	TTC	2	6	1000188	1000193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613388
19622	NC_010102	CGT	2	6	1000301	1000306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613388
19623	NC_010102	AAT	2	6	1000355	1000360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613388
19624	NC_010102	TGTTTT	2	12	1000474	1000485	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	161613388
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19626	NC_010102	AAGT	2	8	1000651	1000658	50 %	25 %	25 %	0 %	161613388
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19630	NC_010102	AGGGG	2	10	1000886	1000895	20 %	0 %	80 %	0 %	161613388
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19637	NC_010102	GTC	2	6	1001128	1001133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613388
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19642	NC_010102	AT	4	8	1001319	1001326	50 %	50 %	0 %	0 %	161613388
19643	NC_010102	TTC	2	6	1001365	1001370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613388
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19729	NC_010102	TTTG	2	8	1006284	1006291	0 %	75 %	25 %	0 %	161613401
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19856	NC_010102	CAT	2	6	1012494	1012499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613405
19857	NC_010102	ATG	2	6	1012576	1012581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613405
19858	NC_010102	TAA	2	6	1012634	1012639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613405
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19860	NC_010102	GTT	2	6	1012690	1012695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613405
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19862	NC_010102	GACAT	2	10	1012731	1012740	40 %	20 %	20 %	20 %	161613405
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19867	NC_010102	GTT	2	6	1013416	1013421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613406
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19969	NC_010102	TGA	2	6	1018434	1018439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613409
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19971	NC_010102	GGGA	2	8	1018536	1018543	25 %	0 %	75 %	0 %	161613409
19972	NC_010102	TAT	2	6	1018551	1018556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613409
19973	NC_010102	TGA	2	6	1018563	1018568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613409
19974	NC_010102	CAT	2	6	1018638	1018643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613409
19975	NC_010102	GCTG	2	8	1018791	1018798	0 %	25 %	50 %	25 %	161613409
19976	NC_010102	GTC	2	6	1018807	1018812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613409
19977	NC_010102	GCAAA	2	10	1019064	1019073	60 %	0 %	20 %	20 %	161613410
19978	NC_010102	CGG	2	6	1019229	1019234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613410
19979	NC_010102	TAT	2	6	1019380	1019385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613410
19980	NC_010102	ATT	2	6	1019411	1019416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613410
19981	NC_010102	TGA	2	6	1019464	1019469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613410
19982	NC_010102	TTC	2	6	1019472	1019477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613410
19983	NC_010102	ACT	2	6	1019547	1019552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613410
19984	NC_010102	ATT	2	6	1019585	1019590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613410
19985	NC_010102	TAC	2	6	1019638	1019643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613410
19986	NC_010102	ATTT	2	8	1019650	1019657	25 %	75 %	0 %	0 %	161613410
19987	NC_010102	GAA	2	6	1019672	1019677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161613410
19988	NC_010102	A	8	8	1019676	1019683	100 %	0 %	0 %	0 %	161613410
19989	NC_010102	TGG	2	6	1019764	1019769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613410
19990	NC_010102	TAC	2	6	1019791	1019796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613410
19991	NC_010102	GAA	2	6	1019926	1019931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161613410
19992	NC_010102	CAT	2	6	1019966	1019971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613410
19993	NC_010102	AT	5	10	1020088	1020097	50 %	50 %	0 %	0 %	161613411
19994	NC_010102	CAG	2	6	1020113	1020118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613411
19995	NC_010102	TGC	2	6	1020124	1020129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613411
19996	NC_010102	TGT	2	6	1020130	1020135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613411
19997	NC_010102	GTT	2	6	1020151	1020156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613411
19998	NC_010102	ACTG	2	8	1020172	1020179	25 %	25 %	25 %	25 %	161613411
19999	NC_010102	GAT	2	6	1020183	1020188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613411
20000	NC_010102	CCAT	2	8	1020217	1020224	25 %	25 %	0 %	50 %	161613411

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