MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_010102	AGC	2	6	968613	968618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613352
19002	NC_010102	CG	3	6	968625	968630	0 %	0 %	50 %	50 %	161613352
19003	NC_010102	CTT	3	9	968640	968648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613352
19004	NC_010102	CTG	2	6	968755	968760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613352
19005	NC_010102	GC	3	6	968770	968775	0 %	0 %	50 %	50 %	161613352
19006	NC_010102	GCA	2	6	968910	968915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613352
19007	NC_010102	AATC	2	8	968947	968954	50 %	25 %	0 %	25 %	161613353
19008	NC_010102	AG	3	6	969062	969067	50 %	0 %	50 %	0 %	161613353
19009	NC_010102	CGA	2	6	969082	969087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613353
19010	NC_010102	TGA	2	6	969217	969222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613353
19011	NC_010102	CGA	2	6	969247	969252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613353
19012	NC_010102	CTT	2	6	969304	969309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613353
19013	NC_010102	CGG	2	6	969320	969325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613353
19014	NC_010102	GC	3	6	969355	969360	0 %	0 %	50 %	50 %	161613353
19015	NC_010102	GGC	2	6	969362	969367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613353
19016	NC_010102	CCG	2	6	969414	969419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613353
19017	NC_010102	GTC	2	6	969452	969457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613353
19018	NC_010102	TGT	2	6	969493	969498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613353
19019	NC_010102	GGA	2	6	969524	969529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161613353
19020	NC_010102	CAG	2	6	969560	969565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613353
19021	NC_010102	GC	3	6	969566	969571	0 %	0 %	50 %	50 %	161613353
19022	NC_010102	ACG	2	6	969575	969580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613353
19023	NC_010102	GCACG	2	10	969661	969670	20 %	0 %	40 %	40 %	161613353
19024	NC_010102	GC	3	6	969764	969769	0 %	0 %	50 %	50 %	161613353
19025	NC_010102	CCGGAG	2	12	969822	969833	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161613353
19026	NC_010102	AAG	2	6	969876	969881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161613353
19027	NC_010102	CTT	2	6	969994	969999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613353
19028	NC_010102	GAC	2	6	970027	970032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613353
19029	NC_010102	CGG	2	6	970132	970137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613353
19030	NC_010102	CGG	2	6	970141	970146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613353
19031	NC_010102	CTG	2	6	970187	970192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613353
19032	NC_010102	GCG	2	6	970202	970207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613353
19033	NC_010102	GC	3	6	970209	970214	0 %	0 %	50 %	50 %	161613353
19034	NC_010102	CAT	3	9	970229	970237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613353
19035	NC_010102	CAA	2	6	970267	970272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161613353
19036	NC_010102	GGT	2	6	970292	970297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613353
19037	NC_010102	CTT	2	6	970375	970380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613353
19038	NC_010102	CTT	2	6	970531	970536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613353
19039	NC_010102	CGA	2	6	970867	970872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613354
19040	NC_010102	CGC	2	6	970876	970881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613354
19041	NC_010102	GC	3	6	970897	970902	0 %	0 %	50 %	50 %	161613354
19042	NC_010102	CGT	2	6	971041	971046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613354
19043	NC_010102	AAT	2	6	971057	971062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613354
19044	NC_010102	CGC	2	6	971080	971085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613354
19045	NC_010102	CG	3	6	971095	971100	0 %	0 %	50 %	50 %	161613354
19046	NC_010102	TGG	2	6	971128	971133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613354
19047	NC_010102	CCG	2	6	971149	971154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613354
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19049	NC_010102	T	6	6	971317	971322	0 %	100 %	0 %	0 %	161613354
19050	NC_010102	TC	3	6	971335	971340	0 %	50 %	0 %	50 %	161613354
19051	NC_010102	TGT	2	6	971370	971375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613354
19052	NC_010102	CCA	2	6	971419	971424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161613354
19053	NC_010102	TGC	2	6	971431	971436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613354
19054	NC_010102	T	6	6	971463	971468	0 %	100 %	0 %	0 %	161613355
19055	NC_010102	TTCAC	2	10	971507	971516	20 %	40 %	0 %	40 %	161613355
19056	NC_010102	TGCG	2	8	971523	971530	0 %	25 %	50 %	25 %	161613355
19057	NC_010102	CGC	2	6	971574	971579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613355
19058	NC_010102	TAT	2	6	972020	972025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613356
19059	NC_010102	AGGC	2	8	972124	972131	25 %	0 %	50 %	25 %	161613356
19060	NC_010102	CAA	2	6	972143	972148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161613356
19061	NC_010102	GGC	2	6	972155	972160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613356
19062	NC_010102	ATGA	2	8	972246	972253	50 %	25 %	25 %	0 %	161613356
19063	NC_010102	T	6	6	972306	972311	0 %	100 %	0 %	0 %	161613356
19064	NC_010102	GTT	2	6	972319	972324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613356
19065	NC_010102	GC	3	6	972328	972333	0 %	0 %	50 %	50 %	161613356
19066	NC_010102	ATT	2	6	972375	972380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613356
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19068	NC_010102	TAT	2	6	972506	972511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613356
19069	NC_010102	GGC	2	6	972534	972539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613356
19070	NC_010102	CTG	2	6	972543	972548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613356
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19072	NC_010102	CAT	2	6	972594	972599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613356
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19079	NC_010102	GGTTGT	2	12	973334	973345	0 %	50 %	50 %	0 %	161613357
19080	NC_010102	TGA	2	6	973358	973363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613357
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19088	NC_010102	A	6	6	973839	973844	100 %	0 %	0 %	0 %	161613357
19089	NC_010102	CGA	2	6	973874	973879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613357
19090	NC_010102	A	6	6	973944	973949	100 %	0 %	0 %	0 %	161613357
19091	NC_010102	CGC	2	6	974113	974118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613357
19092	NC_010102	CAG	2	6	974130	974135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613357
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19099	NC_010102	TGGCG	2	10	974933	974942	0 %	20 %	60 %	20 %	161613359
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19103	NC_010102	CGACC	2	10	975191	975200	20 %	0 %	20 %	60 %	161613359
19104	NC_010102	CTC	2	6	975255	975260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161613359
19105	NC_010102	ATT	2	6	975277	975282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613359
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19107	NC_010102	GCC	2	6	975402	975407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613359
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19110	NC_010102	GAT	2	6	975534	975539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613359
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19112	NC_010102	GAT	2	6	975647	975652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613359
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19120	NC_010102	GGC	2	6	975917	975922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613359
19121	NC_010102	ACT	2	6	975955	975960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613359
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19240	NC_010102	TGC	2	6	980870	980875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613366
19241	NC_010102	CGG	2	6	981053	981058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613366
19242	NC_010102	GTC	2	6	981061	981066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613366
19243	NC_010102	TGA	2	6	981069	981074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613366
19244	NC_010102	GCGG	2	8	981112	981119	0 %	0 %	75 %	25 %	161613366
19245	NC_010102	CGG	2	6	981257	981262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613366
19246	NC_010102	GTCA	2	8	981286	981293	25 %	25 %	25 %	25 %	161613366
19247	NC_010102	TGG	2	6	981310	981315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613366
19248	NC_010102	TGA	2	6	981372	981377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613366
19249	NC_010102	GTG	2	6	981478	981483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613366
19250	NC_010102	GCC	2	6	981497	981502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613366
19251	NC_010102	GC	3	6	981538	981543	0 %	0 %	50 %	50 %	161613366
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19253	NC_010102	CCT	2	6	981635	981640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161613366
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19255	NC_010102	CCGGC	2	10	981749	981758	0 %	0 %	40 %	60 %	161613366
19256	NC_010102	TTA	2	6	981766	981771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613366
19257	NC_010102	ATG	2	6	981882	981887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613367
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19263	NC_010102	GCC	2	6	982185	982190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613367
19264	NC_010102	GCT	2	6	982193	982198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613367
19265	NC_010102	CTG	2	6	982245	982250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613367
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19270	NC_010102	GTG	2	6	982407	982412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613367
19271	NC_010102	CCG	2	6	982417	982422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613367
19272	NC_010102	AAGA	2	8	982428	982435	75 %	0 %	25 %	0 %	161613367
19273	NC_010102	TCG	2	6	982501	982506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613367
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19359	NC_010102	GCG	2	6	985815	985820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613372
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19481	NC_010102	TTG	2	6	991378	991383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613379
19482	NC_010102	GCC	2	6	991419	991424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613379
19483	NC_010102	GTC	2	6	991433	991438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613379
19484	NC_010102	GCC	2	6	991501	991506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613379
19485	NC_010102	GCA	2	6	991596	991601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613379
19486	NC_010102	TAT	3	9	991663	991671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613379
19487	NC_010102	ATTGGT	2	12	991705	991716	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	161613379
19488	NC_010102	CGC	2	6	991733	991738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613379
19489	NC_010102	AT	4	8	991885	991892	50 %	50 %	0 %	0 %	161613379
19490	NC_010102	CCAT	2	8	991907	991914	25 %	25 %	0 %	50 %	161613379
19491	NC_010102	GTCA	2	8	991948	991955	25 %	25 %	25 %	25 %	161613379
19492	NC_010102	A	6	6	992131	992136	100 %	0 %	0 %	0 %	161613379
19493	NC_010102	TGC	2	6	992159	992164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613379
19494	NC_010102	GGCCT	2	10	992258	992267	0 %	20 %	40 %	40 %	161613379
19495	NC_010102	GCG	2	6	992594	992599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613380
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19497	NC_010102	TTG	2	6	992663	992668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613380
19498	NC_010102	T	6	6	992681	992686	0 %	100 %	0 %	0 %	161613380
19499	NC_010102	ATT	2	6	992723	992728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613380
19500	NC_010102	GTC	2	6	992795	992800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613381

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