MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_010102	ATTT	2	8	815002	815009	25 %	75 %	0 %	0 %	161613180
16002	NC_010102	GCC	2	6	815022	815027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613180
16003	NC_010102	TCG	2	6	815112	815117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613180
16004	NC_010102	CAG	2	6	815180	815185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613180
16005	NC_010102	CGG	2	6	815209	815214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613180
16006	NC_010102	CGT	2	6	815215	815220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613180
16007	NC_010102	TAA	2	6	815259	815264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613180
16008	NC_010102	GC	3	6	815337	815342	0 %	0 %	50 %	50 %	161613180
16009	NC_010102	GC	3	6	815446	815451	0 %	0 %	50 %	50 %	161613180
16010	NC_010102	TCT	2	6	815523	815528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613180
16011	NC_010102	TCCT	2	8	815531	815538	0 %	50 %	0 %	50 %	161613180
16012	NC_010102	GGCA	2	8	815557	815564	25 %	0 %	50 %	25 %	161613180
16013	NC_010102	GCAG	2	8	815614	815621	25 %	0 %	50 %	25 %	161613180
16014	NC_010102	GC	3	6	815644	815649	0 %	0 %	50 %	50 %	161613180
16015	NC_010102	CTG	2	6	815684	815689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613180
16016	NC_010102	GA	3	6	815727	815732	50 %	0 %	50 %	0 %	161613180
16017	NC_010102	CTG	2	6	815753	815758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613180
16018	NC_010102	CGA	2	6	815890	815895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613180
16019	NC_010102	CAC	3	9	815951	815959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161613180
16020	NC_010102	T	7	7	815966	815972	0 %	100 %	0 %	0 %	161613180
16021	NC_010102	TTA	2	6	816027	816032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613180
16022	NC_010102	CCG	2	6	816118	816123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613180
16023	NC_010102	AAG	2	6	816128	816133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161613180
16024	NC_010102	CAT	2	6	816146	816151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613180
16025	NC_010102	ACGG	2	8	816309	816316	25 %	0 %	50 %	25 %	161613181
16026	NC_010102	CGAAA	2	10	816326	816335	60 %	0 %	20 %	20 %	161613181
16027	NC_010102	AGAA	2	8	816344	816351	75 %	0 %	25 %	0 %	161613181
16028	NC_010102	GGT	2	6	816362	816367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613181
16029	NC_010102	TTA	2	6	816466	816471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613181
16030	NC_010102	CTT	2	6	816521	816526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613181
16031	NC_010102	CTTCA	2	10	816567	816576	20 %	40 %	0 %	40 %	161613181
16032	NC_010102	CAG	2	6	816585	816590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613181
16033	NC_010102	GCCA	2	8	816628	816635	25 %	0 %	25 %	50 %	161613181
16034	NC_010102	CCG	2	6	816830	816835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613181
16035	NC_010102	CG	3	6	816834	816839	0 %	0 %	50 %	50 %	161613181
16036	NC_010102	GTA	2	6	816875	816880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613181
16037	NC_010102	GTT	2	6	816885	816890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613181
16038	NC_010102	TAT	2	6	816896	816901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613181
16039	NC_010102	CAG	2	6	816915	816920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613181
16040	NC_010102	GCG	2	6	816928	816933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613181
16041	NC_010102	CGC	2	6	817011	817016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613181
16042	NC_010102	ACG	2	6	817122	817127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613181
16043	NC_010102	TGC	2	6	817153	817158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613181
16044	NC_010102	CCA	2	6	817185	817190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161613181
16045	NC_010102	TCA	2	6	817228	817233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613181
16046	NC_010102	TTG	2	6	817243	817248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613181
16047	NC_010102	ATA	2	6	817399	817404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613181
16048	NC_010102	TTCTG	2	10	817408	817417	0 %	60 %	20 %	20 %	161613181
16049	NC_010102	CCA	2	6	817461	817466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161613181
16050	NC_010102	AT	3	6	817582	817587	50 %	50 %	0 %	0 %	161613181
16051	NC_010102	GCA	2	6	817673	817678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613181
16052	NC_010102	CCT	2	6	817751	817756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161613181
16053	NC_010102	GAT	2	6	817769	817774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613181
16054	NC_010102	CCAG	2	8	817835	817842	25 %	0 %	25 %	50 %	161613181
16055	NC_010102	GCC	3	9	817882	817890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613181
16056	NC_010102	GCG	2	6	817927	817932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613181
16057	NC_010102	CGTT	2	8	817942	817949	0 %	50 %	25 %	25 %	161613181
16058	NC_010102	GGC	3	9	817953	817961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613181
16059	NC_010102	TC	3	6	817987	817992	0 %	50 %	0 %	50 %	161613181
16060	NC_010102	CACG	2	8	818017	818024	25 %	0 %	25 %	50 %	161613181
16061	NC_010102	GC	3	6	818077	818082	0 %	0 %	50 %	50 %	161613181
16062	NC_010102	GAA	2	6	818172	818177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161613181
16063	NC_010102	TTC	2	6	818256	818261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613181
16064	NC_010102	GCA	2	6	818264	818269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613181
16065	NC_010102	ATC	2	6	818361	818366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613181
16066	NC_010102	ATTC	2	8	818409	818416	25 %	50 %	0 %	25 %	161613182
16067	NC_010102	CGG	2	6	818525	818530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613182
16068	NC_010102	TCC	2	6	818555	818560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161613182
16069	NC_010102	GC	3	6	818582	818587	0 %	0 %	50 %	50 %	161613182
16070	NC_010102	TAA	2	6	818599	818604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613182
16071	NC_010102	CCAG	2	8	818607	818614	25 %	0 %	25 %	50 %	161613182
16072	NC_010102	GCC	2	6	818714	818719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613182
16073	NC_010102	ATG	2	6	818722	818727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613182
16074	NC_010102	GCG	2	6	818739	818744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613182
16075	NC_010102	GCG	2	6	818767	818772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613182
16076	NC_010102	CGC	2	6	818800	818805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613182
16077	NC_010102	T	7	7	818836	818842	0 %	100 %	0 %	0 %	161613182
16078	NC_010102	CTG	2	6	818845	818850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613182
16079	NC_010102	GCG	2	6	818860	818865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613182
16080	NC_010102	AGCGCC	2	12	818942	818953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161613182
16081	NC_010102	GCC	2	6	818958	818963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613182
16082	NC_010102	TTTC	2	8	819000	819007	0 %	75 %	0 %	25 %	161613182
16083	NC_010102	GTTT	2	8	819036	819043	0 %	75 %	25 %	0 %	161613182
16084	NC_010102	T	8	8	819041	819048	0 %	100 %	0 %	0 %	161613182
16085	NC_010102	A	6	6	819064	819069	100 %	0 %	0 %	0 %	161613182
16086	NC_010102	AAT	2	6	819079	819084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613182
16087	NC_010102	ATT	2	6	819101	819106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613182
16088	NC_010102	CCT	2	6	819110	819115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161613183
16089	NC_010102	TGA	2	6	819116	819121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613183
16090	NC_010102	CAA	2	6	819257	819262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161613183
16091	NC_010102	GTAGC	2	10	819270	819279	20 %	20 %	40 %	20 %	161613183
16092	NC_010102	GCA	3	9	819296	819304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613183
16093	NC_010102	GCA	2	6	819362	819367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613183
16094	NC_010102	TAA	2	6	819401	819406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613183
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16096	NC_010102	ACC	2	6	819589	819594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161613183
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16098	NC_010102	TGT	2	6	819655	819660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613183
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16101	NC_010102	GC	3	6	819701	819706	0 %	0 %	50 %	50 %	161613183
16102	NC_010102	TAT	2	6	819710	819715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613183
16103	NC_010102	TTG	2	6	819782	819787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613183
16104	NC_010102	TCA	2	6	819821	819826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613183
16105	NC_010102	T	6	6	819884	819889	0 %	100 %	0 %	0 %	161613183
16106	NC_010102	AGTTT	2	10	819940	819949	20 %	60 %	20 %	0 %	161613183
16107	NC_010102	TTCC	2	8	819959	819966	0 %	50 %	0 %	50 %	161613183
16108	NC_010102	GAAA	2	8	819973	819980	75 %	0 %	25 %	0 %	161613183
16109	NC_010102	GTA	2	6	820032	820037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613183
16110	NC_010102	GCCA	2	8	820066	820073	25 %	0 %	25 %	50 %	161613183
16111	NC_010102	CGC	2	6	820208	820213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613183
16112	NC_010102	GTT	2	6	820214	820219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613183
16113	NC_010102	A	6	6	820229	820234	100 %	0 %	0 %	0 %	161613183
16114	NC_010102	TAT	2	6	820260	820265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613183
16115	NC_010102	CG	3	6	820624	820629	0 %	0 %	50 %	50 %	161613184
16116	NC_010102	CAC	2	6	820708	820713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161613184
16117	NC_010102	GTC	2	6	820720	820725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613184
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16119	NC_010102	AAC	2	6	820739	820744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161613184
16120	NC_010102	A	6	6	820755	820760	100 %	0 %	0 %	0 %	161613184
16121	NC_010102	AGG	2	6	820836	820841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161613184
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16124	NC_010102	GCG	2	6	820915	820920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613184
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16241	NC_010102	ACG	2	6	825630	825635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613187
16242	NC_010102	CAT	2	6	825730	825735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613187
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16258	NC_010102	TCG	2	6	826206	826211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613187
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16359	NC_010102	AAT	2	6	830200	830205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613188
16360	NC_010102	CAG	2	6	830230	830235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613188
16361	NC_010102	GTG	2	6	830237	830242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613188
16362	NC_010102	GCC	2	6	830275	830280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613188
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16365	NC_010102	GGT	2	6	830364	830369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613190
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16381	NC_010102	ACG	2	6	831114	831119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613190
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16479	NC_010102	GCC	2	6	835862	835867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613193
16480	NC_010102	TCT	2	6	835877	835882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613193
16481	NC_010102	AC	3	6	835926	835931	50 %	0 %	0 %	50 %	161613193
16482	NC_010102	AG	3	6	836084	836089	50 %	0 %	50 %	0 %	161613193
16483	NC_010102	GAC	2	6	836136	836141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613193
16484	NC_010102	GTA	2	6	836157	836162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613193
16485	NC_010102	CGC	2	6	836192	836197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613193
16486	NC_010102	ATT	2	6	836226	836231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613193
16487	NC_010102	TCA	2	6	836450	836455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613193
16488	NC_010102	GGCA	2	8	836460	836467	25 %	0 %	50 %	25 %	161613193
16489	NC_010102	A	6	6	836479	836484	100 %	0 %	0 %	0 %	161613193
16490	NC_010102	AGC	2	6	836530	836535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613193
16491	NC_010102	A	7	7	836581	836587	100 %	0 %	0 %	0 %	161613193
16492	NC_010102	GC	3	6	836798	836803	0 %	0 %	50 %	50 %	161613193
16493	NC_010102	ATA	2	6	836816	836821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613193
16494	NC_010102	GCC	2	6	836880	836885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613193
16495	NC_010102	GCG	2	6	836891	836896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613193
16496	NC_010102	GCA	2	6	836975	836980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613193
16497	NC_010102	GCC	2	6	836995	837000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613193
16498	NC_010102	ATA	2	6	837004	837009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613193
16499	NC_010102	GGC	2	6	837039	837044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613193
16500	NC_010102	TGC	2	6	837071	837076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613193

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