MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010102	GGC	2	6	51952	51957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612369
1002	NC_010102	ATGG	2	8	51998	52005	25 %	25 %	50 %	0 %	161612369
1003	NC_010102	TTG	2	6	52202	52207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612370
1004	NC_010102	GC	3	6	52229	52234	0 %	0 %	50 %	50 %	161612370
1005	NC_010102	GC	4	8	52459	52466	0 %	0 %	50 %	50 %	161612370
1006	NC_010102	G	6	6	52555	52560	0 %	0 %	100 %	0 %	161612370
1007	NC_010102	TGG	2	6	52568	52573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612370
1008	NC_010102	TGAT	2	8	52670	52677	25 %	50 %	25 %	0 %	161612370
1009	NC_010102	TCG	2	6	52703	52708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612370
1010	NC_010102	TGG	2	6	52793	52798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612370
1011	NC_010102	TCTAAC	2	12	52816	52827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612370
1012	NC_010102	GAA	2	6	52856	52861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612370
1013	NC_010102	CGA	2	6	52875	52880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612370
1014	NC_010102	GCG	2	6	52882	52887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612370
1015	NC_010102	AGG	2	6	52895	52900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161612370
1016	NC_010102	GCC	2	6	52915	52920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612370
1017	NC_010102	GGC	3	9	52996	53004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612370
1018	NC_010102	GAA	2	6	53029	53034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612370
1019	NC_010102	T	6	6	53257	53262	0 %	100 %	0 %	0 %	161612371
1020	NC_010102	AAAAT	2	10	53297	53306	80 %	20 %	0 %	0 %	161612371
1021	NC_010102	TGGA	2	8	53339	53346	25 %	25 %	50 %	0 %	161612371
1022	NC_010102	CAA	2	6	53349	53354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612371
1023	NC_010102	GAA	2	6	53543	53548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612372
1024	NC_010102	CAG	2	6	53590	53595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612372
1025	NC_010102	A	6	6	53627	53632	100 %	0 %	0 %	0 %	161612372
1026	NC_010102	CACGAA	2	12	53695	53706	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	161612372
1027	NC_010102	GATT	2	8	53737	53744	25 %	50 %	25 %	0 %	161612372
1028	NC_010102	G	6	6	53853	53858	0 %	0 %	100 %	0 %	161612372
1029	NC_010102	TTG	2	6	53907	53912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612372
1030	NC_010102	GCG	2	6	54045	54050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612372
1031	NC_010102	TGC	2	6	54053	54058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612372
1032	NC_010102	GGAAA	2	10	54084	54093	60 %	0 %	40 %	0 %	161612372
1033	NC_010102	GATC	2	8	54106	54113	25 %	25 %	25 %	25 %	161612372
1034	NC_010102	TAT	2	6	54196	54201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612372
1035	NC_010102	CGC	2	6	54234	54239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612372
1036	NC_010102	ATT	2	6	54527	54532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612373
1037	NC_010102	TGA	2	6	54553	54558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612373
1038	NC_010102	CGCTG	2	10	54574	54583	0 %	20 %	40 %	40 %	161612373
1039	NC_010102	C	6	6	54588	54593	0 %	0 %	0 %	100 %	161612373
1040	NC_010102	TAA	2	6	54609	54614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612373
1041	NC_010102	A	6	6	54642	54647	100 %	0 %	0 %	0 %	161612373
1042	NC_010102	GCT	2	6	54721	54726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612373
1043	NC_010102	TGA	2	6	54846	54851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612373
1044	NC_010102	TG	3	6	55068	55073	0 %	50 %	50 %	0 %	161612373
1045	NC_010102	GTA	2	6	55185	55190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612373
1046	NC_010102	CTGG	2	8	55231	55238	0 %	25 %	50 %	25 %	161612373
1047	NC_010102	CCG	2	6	55302	55307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612373
1048	NC_010102	GGT	2	6	55315	55320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612373
1049	NC_010102	TGGCGC	2	12	55362	55373	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161612373
1050	NC_010102	GTGG	2	8	55396	55403	0 %	25 %	75 %	0 %	161612373
1051	NC_010102	TC	3	6	55472	55477	0 %	50 %	0 %	50 %	161612374
1052	NC_010102	CTG	2	6	55566	55571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612374
1053	NC_010102	CTG	2	6	55594	55599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612374
1054	NC_010102	CTGC	2	8	55606	55613	0 %	25 %	25 %	50 %	161612374
1055	NC_010102	TCA	2	6	55653	55658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612374
1056	NC_010102	TGC	2	6	55794	55799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612374
1057	NC_010102	CGG	2	6	55882	55887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612374
1058	NC_010102	AAT	2	6	55895	55900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612374
1059	NC_010102	A	6	6	55962	55967	100 %	0 %	0 %	0 %	161612374
1060	NC_010102	CTT	2	6	56009	56014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612374
1061	NC_010102	CGA	2	6	56041	56046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612374
1062	NC_010102	CCA	2	6	56077	56082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612374
1063	NC_010102	TTC	2	6	56142	56147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612375
1064	NC_010102	ATT	2	6	56190	56195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612375
1065	NC_010102	CGA	2	6	56201	56206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612375
1066	NC_010102	ACCA	2	8	56242	56249	50 %	0 %	0 %	50 %	161612375
1067	NC_010102	GTT	2	6	56271	56276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612375
1068	NC_010102	GTGG	2	8	56277	56284	0 %	25 %	75 %	0 %	161612375
1069	NC_010102	AAT	2	6	56352	56357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612375
1070	NC_010102	CAA	2	6	56453	56458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612375
1071	NC_010102	CATT	2	8	56467	56474	25 %	50 %	0 %	25 %	161612375
1072	NC_010102	CAA	2	6	56501	56506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612375
1073	NC_010102	ATA	2	6	56553	56558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612375
1074	NC_010102	GGT	3	9	56582	56590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612375
1075	NC_010102	TGG	2	6	56626	56631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612375
1076	NC_010102	CTG	3	9	56640	56648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612375
1077	NC_010102	CAGCGC	2	12	56652	56663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161612375
1078	NC_010102	CAG	2	6	56685	56690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612375
1079	NC_010102	TGG	2	6	56699	56704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612375
1080	NC_010102	TGC	2	6	56725	56730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612375
1081	NC_010102	GC	3	6	56734	56739	0 %	0 %	50 %	50 %	161612375
1082	NC_010102	TTG	2	6	56800	56805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612375
1083	NC_010102	TAA	2	6	56813	56818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612375
1084	NC_010102	AAT	2	6	56841	56846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612375
1085	NC_010102	T	6	6	56901	56906	0 %	100 %	0 %	0 %	161612375
1086	NC_010102	T	7	7	56908	56914	0 %	100 %	0 %	0 %	161612375
1087	NC_010102	GCG	2	6	56915	56920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612375
1088	NC_010102	AAG	2	6	56929	56934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612375
1089	NC_010102	TGG	2	6	56953	56958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612375
1090	NC_010102	GCG	2	6	57006	57011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612375
1091	NC_010102	ACA	2	6	57083	57088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612375
1092	NC_010102	GCT	2	6	57116	57121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612375
1093	NC_010102	GCG	2	6	57165	57170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612375
1094	NC_010102	ACA	2	6	57179	57184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612375
1095	NC_010102	CAG	3	9	57189	57197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612375
1096	NC_010102	CGT	2	6	57386	57391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612375
1097	NC_010102	CGC	2	6	57398	57403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612375
1098	NC_010102	AT	3	6	57409	57414	50 %	50 %	0 %	0 %	161612375
1099	NC_010102	TGG	2	6	57674	57679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612375
1100	NC_010102	CAG	2	6	57980	57985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1101	NC_010102	GCC	2	6	58032	58037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612376
1102	NC_010102	CCG	2	6	58045	58050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612376
1103	NC_010102	CCG	2	6	58057	58062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612376
1104	NC_010102	CAG	2	6	58103	58108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1105	NC_010102	GCC	2	6	58128	58133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612376
1106	NC_010102	ACC	2	6	58152	58157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612376
1107	NC_010102	CAG	3	9	58160	58168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1108	NC_010102	CCA	2	6	58204	58209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612376
1109	NC_010102	CCA	2	6	58288	58293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612376
1110	NC_010102	CGC	2	6	58294	58299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612376
1111	NC_010102	CAG	2	6	58334	58339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1112	NC_010102	CGGCG	2	10	58340	58349	0 %	0 %	60 %	40 %	161612376
1113	NC_010102	GCA	3	9	58354	58362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1114	NC_010102	CCA	2	6	58366	58371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612376
1115	NC_010102	GTA	2	6	58372	58377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612376
1116	NC_010102	T	6	6	58399	58404	0 %	100 %	0 %	0 %	161612376
1117	NC_010102	CTCCGT	2	12	58448	58459	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	161612376
1118	NC_010102	GC	4	8	58465	58472	0 %	0 %	50 %	50 %	161612376
1119	NC_010102	CGG	2	6	58478	58483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612376
1120	NC_010102	CGC	2	6	58517	58522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612376
1121	NC_010102	CAG	2	6	58538	58543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1122	NC_010102	CGC	2	6	58591	58596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612376
1123	NC_010102	GCC	3	9	58611	58619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612376
1124	NC_010102	AGT	2	6	58648	58653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612376
1125	NC_010102	TCAGCG	2	12	58654	58665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1126	NC_010102	GCC	2	6	58698	58703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612376
1127	NC_010102	AGC	2	6	58710	58715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1128	NC_010102	CAG	2	6	58733	58738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1129	NC_010102	CGCCCA	2	12	58759	58770	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	161612376
1130	NC_010102	GCG	2	6	58783	58788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612376
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1133	NC_010102	CGT	2	6	58972	58977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612376
1134	NC_010102	CAG	2	6	58985	58990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
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1140	NC_010102	CAG	4	12	59102	59113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612376
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1156	NC_010102	CCG	2	6	59782	59787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612377
1157	NC_010102	GGC	2	6	59788	59793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612377
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1228	NC_010102	AGTC	2	8	62583	62590	25 %	25 %	25 %	25 %	161612379
1229	NC_010102	TAA	2	6	62617	62622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612379
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1231	NC_010102	TTA	2	6	62851	62856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612381
1232	NC_010102	TTAA	2	8	62864	62871	50 %	50 %	0 %	0 %	161612381
1233	NC_010102	ATTT	2	8	63011	63018	25 %	75 %	0 %	0 %	161612381
1234	NC_010102	GTCG	2	8	63043	63050	0 %	25 %	50 %	25 %	161612380
1235	NC_010102	CTG	2	6	63215	63220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612380
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1237	NC_010102	GCAG	2	8	63328	63335	25 %	0 %	50 %	25 %	161612380
1238	NC_010102	CAG	2	6	63361	63366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612380
1239	NC_010102	GC	3	6	63377	63382	0 %	0 %	50 %	50 %	161612380
1240	NC_010102	TGG	2	6	63477	63482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612380
1241	NC_010102	AGA	2	6	63529	63534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612380
1242	NC_010102	T	7	7	63542	63548	0 %	100 %	0 %	0 %	161612380
1243	NC_010102	ACCG	2	8	63554	63561	25 %	0 %	25 %	50 %	161612380
1244	NC_010102	GAC	2	6	63683	63688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612380
1245	NC_010102	GATC	2	8	63700	63707	25 %	25 %	25 %	25 %	161612380
1246	NC_010102	GTC	2	6	63857	63862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612380
1247	NC_010102	GC	3	6	63951	63956	0 %	0 %	50 %	50 %	161612380
1248	NC_010102	CTG	2	6	63963	63968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612380
1249	NC_010102	GCC	2	6	63995	64000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612380
1250	NC_010102	AC	3	6	64003	64008	50 %	0 %	0 %	50 %	161612380
1251	NC_010102	GGCA	2	8	64074	64081	25 %	0 %	50 %	25 %	161612382
1252	NC_010102	TGA	2	6	64100	64105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612382
1253	NC_010102	TCCA	2	8	64116	64123	25 %	25 %	0 %	50 %	161612382
1254	NC_010102	AG	3	6	64149	64154	50 %	0 %	50 %	0 %	161612382
1255	NC_010102	AGC	2	6	64163	64168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612382
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1257	NC_010102	GGT	2	6	64191	64196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612382
1258	NC_010102	CG	3	6	64228	64233	0 %	0 %	50 %	50 %	161612382
1259	NC_010102	GC	3	6	64256	64261	0 %	0 %	50 %	50 %	161612382
1260	NC_010102	GGC	3	9	64290	64298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612382
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1263	NC_010102	GTG	2	6	64530	64535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612383
1264	NC_010102	CGT	2	6	64583	64588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612383
1265	NC_010102	GTG	2	6	64591	64596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612383
1266	NC_010102	GCTGGA	2	12	64643	64654	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161612383
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1268	NC_010102	TGG	2	6	64780	64785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612383
1269	NC_010102	GGC	2	6	64796	64801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612383
1270	NC_010102	TGC	2	6	64873	64878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612383
1271	NC_010102	GCG	2	6	64881	64886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612383
1272	NC_010102	CG	3	6	64885	64890	0 %	0 %	50 %	50 %	161612383
1273	NC_010102	GCC	2	6	64902	64907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612383
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1279	NC_010102	GCC	2	6	65082	65087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612383
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1281	NC_010102	CG	3	6	65165	65170	0 %	0 %	50 %	50 %	161612383
1282	NC_010102	GTG	2	6	65175	65180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612383
1283	NC_010102	AAGG	2	8	65209	65216	50 %	0 %	50 %	0 %	161612383
1284	NC_010102	CGT	2	6	65371	65376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612384
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1288	NC_010102	CGG	2	6	65646	65651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612384
1289	NC_010102	CGTGC	2	10	65706	65715	0 %	20 %	40 %	40 %	161612384
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1292	NC_010102	TTGAT	2	10	65876	65885	20 %	60 %	20 %	0 %	161612384
1293	NC_010102	GGC	2	6	65979	65984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612384
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1305	NC_010102	GTG	2	6	66469	66474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612384
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1343	NC_010102	GAT	2	6	68071	68076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612386
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1349	NC_010102	GAT	2	6	68568	68573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612387
1350	NC_010102	GCC	2	6	68632	68637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612387
1351	NC_010102	TAC	2	6	68663	68668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612387
1352	NC_010102	GAC	2	6	68676	68681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612387
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1356	NC_010102	CAC	2	6	68832	68837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612387
1357	NC_010102	CGGG	2	8	68991	68998	0 %	0 %	75 %	25 %	161612387
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1361	NC_010102	ATAA	2	8	69286	69293	75 %	25 %	0 %	0 %	161612389
1362	NC_010102	TTC	2	6	69322	69327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612389
1363	NC_010102	T	6	6	69463	69468	0 %	100 %	0 %	0 %	161612390
1364	NC_010102	AAAGAA	2	12	69515	69526	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	161612390
1365	NC_010102	TTA	2	6	69556	69561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612390
1366	NC_010102	T	6	6	69580	69585	0 %	100 %	0 %	0 %	161612390
1367	NC_010102	ATG	2	6	69595	69600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612390
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1369	NC_010102	T	6	6	69727	69732	0 %	100 %	0 %	0 %	161612391
1370	NC_010102	GTT	2	6	69733	69738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612391
1371	NC_010102	GCCA	2	8	69778	69785	25 %	0 %	25 %	50 %	161612391
1372	NC_010102	T	6	6	69787	69792	0 %	100 %	0 %	0 %	161612391
1373	NC_010102	A	6	6	69889	69894	100 %	0 %	0 %	0 %	161612392
1374	NC_010102	GCC	2	6	69937	69942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612392
1375	NC_010102	CGG	2	6	70116	70121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612393
1376	NC_010102	TCCT	2	8	70177	70184	0 %	50 %	0 %	50 %	161612393
1377	NC_010102	CTTA	2	8	70205	70212	25 %	50 %	0 %	25 %	161612393
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1499	NC_010102	CG	4	8	76105	76112	0 %	0 %	50 %	50 %	161612397
1500	NC_010102	CTT	2	6	76168	76173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612397

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