MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010102	CA	3	6	686727	686732	50 %	0 %	0 %	50 %	161613025
13502	NC_010102	GTG	2	6	686794	686799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613025
13503	NC_010102	CAG	2	6	686890	686895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613025
13504	NC_010102	GTC	2	6	686929	686934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13505	NC_010102	GCG	2	6	686970	686975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613026
13506	NC_010102	GCA	2	6	687020	687025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13507	NC_010102	GCCGT	2	10	687050	687059	0 %	20 %	40 %	40 %	161613026
13508	NC_010102	GT	3	6	687079	687084	0 %	50 %	50 %	0 %	161613026
13509	NC_010102	TGG	2	6	687085	687090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613026
13510	NC_010102	GCA	2	6	687095	687100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13511	NC_010102	TGC	2	6	687220	687225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13512	NC_010102	GGA	2	6	687299	687304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161613026
13513	NC_010102	GCC	2	6	687390	687395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613026
13514	NC_010102	AAC	2	6	687426	687431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161613026
13515	NC_010102	CGG	2	6	687463	687468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613026
13516	NC_010102	TGG	2	6	687469	687474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613026
13517	NC_010102	GCT	2	6	687511	687516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13518	NC_010102	ACG	2	6	687517	687522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13519	NC_010102	CCG	2	6	687605	687610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613026
13520	NC_010102	ATT	2	6	687741	687746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613026
13521	NC_010102	AAC	2	6	687750	687755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161613026
13522	NC_010102	TTC	2	6	687771	687776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613026
13523	NC_010102	GCG	2	6	687852	687857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613026
13524	NC_010102	CGA	2	6	687896	687901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13525	NC_010102	CTG	2	6	688092	688097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13526	NC_010102	ACGA	2	8	688218	688225	50 %	0 %	25 %	25 %	161613026
13527	NC_010102	CG	3	6	688314	688319	0 %	0 %	50 %	50 %	161613026
13528	NC_010102	TAA	2	6	688358	688363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161613026
13529	NC_010102	GGCCG	2	10	688373	688382	0 %	0 %	60 %	40 %	161613026
13530	NC_010102	GC	3	6	688462	688467	0 %	0 %	50 %	50 %	161613026
13531	NC_010102	AAG	2	6	688510	688515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161613026
13532	NC_010102	CGC	2	6	688536	688541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613026
13533	NC_010102	CGT	2	6	688617	688622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13534	NC_010102	GAG	2	6	688632	688637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161613026
13535	NC_010102	CGG	2	6	688714	688719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613026
13536	NC_010102	GAGC	2	8	688736	688743	25 %	0 %	50 %	25 %	161613026
13537	NC_010102	GAA	2	6	688809	688814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161613026
13538	NC_010102	CGA	2	6	688859	688864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13539	NC_010102	CG	4	8	688874	688881	0 %	0 %	50 %	50 %	161613026
13540	NC_010102	GTC	2	6	688896	688901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13541	NC_010102	CGG	2	6	689029	689034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613026
13542	NC_010102	CGC	2	6	689112	689117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613026
13543	NC_010102	GC	3	6	689181	689186	0 %	0 %	50 %	50 %	161613026
13544	NC_010102	CGT	2	6	689193	689198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13545	NC_010102	GTC	2	6	689216	689221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613026
13546	NC_010102	CCG	2	6	689222	689227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613026
13547	NC_010102	CCG	2	6	689271	689276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613026
13548	NC_010102	TTC	2	6	689298	689303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613026
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13550	NC_010102	CT	3	6	689352	689357	0 %	50 %	0 %	50 %	161613026
13551	NC_010102	AAG	2	6	689373	689378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161613026
13552	NC_010102	GCC	3	9	689440	689448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613027
13553	NC_010102	TGT	2	6	689462	689467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613027
13554	NC_010102	GCGG	2	8	689475	689482	0 %	0 %	75 %	25 %	161613027
13555	NC_010102	GGC	2	6	689486	689491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613027
13556	NC_010102	TGGCG	2	10	689495	689504	0 %	20 %	60 %	20 %	161613027
13557	NC_010102	CG	4	8	689525	689532	0 %	0 %	50 %	50 %	161613027
13558	NC_010102	GC	3	6	689560	689565	0 %	0 %	50 %	50 %	161613027
13559	NC_010102	TGAA	2	8	689566	689573	50 %	25 %	25 %	0 %	161613027
13560	NC_010102	TG	3	6	689592	689597	0 %	50 %	50 %	0 %	161613027
13561	NC_010102	TCG	2	6	689686	689691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613027
13562	NC_010102	TG	3	6	689713	689718	0 %	50 %	50 %	0 %	161613027
13563	NC_010102	TGA	2	6	689780	689785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613027
13564	NC_010102	TGC	2	6	689806	689811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613027
13565	NC_010102	GCTGC	2	10	689843	689852	0 %	20 %	40 %	40 %	161613027
13566	NC_010102	GCTGGA	2	12	689897	689908	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161613027
13567	NC_010102	GC	3	6	689934	689939	0 %	0 %	50 %	50 %	161613027
13568	NC_010102	GGCT	2	8	690075	690082	0 %	25 %	50 %	25 %	161613027
13569	NC_010102	A	6	6	690136	690141	100 %	0 %	0 %	0 %	161613028
13570	NC_010102	TGG	2	6	690145	690150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613028
13571	NC_010102	GCTG	2	8	690161	690168	0 %	25 %	50 %	25 %	161613028
13572	NC_010102	CAG	2	6	690255	690260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613028
13573	NC_010102	GCTGT	2	10	690370	690379	0 %	40 %	40 %	20 %	161613028
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13577	NC_010102	GCT	2	6	690555	690560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613028
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13580	NC_010102	TTA	2	6	690658	690663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613028
13581	NC_010102	GC	3	6	690704	690709	0 %	0 %	50 %	50 %	161613028
13582	NC_010102	A	6	6	690754	690759	100 %	0 %	0 %	0 %	161613028
13583	NC_010102	TCAC	2	8	690857	690864	25 %	25 %	0 %	50 %	161613028
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13587	NC_010102	ATGG	2	8	691114	691121	25 %	25 %	50 %	0 %	161613029
13588	NC_010102	TGG	2	6	691134	691139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613029
13589	NC_010102	GTG	2	6	691143	691148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613029
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13591	NC_010102	GCC	2	6	691267	691272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613029
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13593	NC_010102	GAC	2	6	691306	691311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613029
13594	NC_010102	ACG	2	6	691358	691363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613029
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13596	NC_010102	CGC	2	6	691428	691433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613029
13597	NC_010102	CTGC	2	8	691444	691451	0 %	25 %	25 %	50 %	161613029
13598	NC_010102	TGG	2	6	691586	691591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613030
13599	NC_010102	GCC	2	6	691602	691607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161613030
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13601	NC_010102	CGG	2	6	691642	691647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613030
13602	NC_010102	CAT	2	6	691648	691653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613030
13603	NC_010102	GGC	2	6	691661	691666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613030
13604	NC_010102	GAG	2	6	691742	691747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161613030
13605	NC_010102	ACA	2	6	691767	691772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161613030
13606	NC_010102	GCG	2	6	691779	691784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613030
13607	NC_010102	GAT	2	6	691834	691839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161613030
13608	NC_010102	GATA	2	8	691888	691895	50 %	25 %	25 %	0 %	161613030
13609	NC_010102	GGC	2	6	691944	691949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613030
13610	NC_010102	ACA	2	6	691959	691964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161613030
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13612	NC_010102	ACC	2	6	692281	692286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161613031
13613	NC_010102	CTG	2	6	692287	692292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613031
13614	NC_010102	CTG	2	6	692296	692301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613031
13615	NC_010102	GC	3	6	692311	692316	0 %	0 %	50 %	50 %	161613031
13616	NC_010102	CGG	2	6	692322	692327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613031
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13618	NC_010102	CTT	2	6	692448	692453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613031
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13620	NC_010102	GCA	2	6	692547	692552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613031
13621	NC_010102	CGCGC	2	10	692587	692596	0 %	0 %	40 %	60 %	161613031
13622	NC_010102	CGA	2	6	692607	692612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613031
13623	NC_010102	GC	3	6	692644	692649	0 %	0 %	50 %	50 %	161613031
13624	NC_010102	CGG	2	6	692656	692661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613031
13625	NC_010102	GGC	2	6	692664	692669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613031
13626	NC_010102	AC	3	6	692670	692675	50 %	0 %	0 %	50 %	161613031
13627	NC_010102	CAC	2	6	692700	692705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161613031
13628	NC_010102	CCA	2	6	692706	692711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161613031
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13632	NC_010102	TTC	2	6	692850	692855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161613032
13633	NC_010102	TCA	2	6	692863	692868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613032
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13635	NC_010102	GCT	2	6	692903	692908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613032
13636	NC_010102	CAT	2	6	692927	692932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161613032
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13638	NC_010102	GCT	2	6	692945	692950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613032
13639	NC_010102	GCT	2	6	692957	692962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613032
13640	NC_010102	CGA	2	6	692984	692989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161613032
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13649	NC_010102	CGGC	2	8	693223	693230	0 %	0 %	50 %	50 %	161613032
13650	NC_010102	GCG	2	6	693233	693238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613032
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13682	NC_010102	T	6	6	694274	694279	0 %	100 %	0 %	0 %	161613034
13683	NC_010102	CTGG	2	8	694282	694289	0 %	25 %	50 %	25 %	161613034
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13724	NC_010102	GCCC	2	8	695526	695533	0 %	0 %	25 %	75 %	161613036
13725	NC_010102	GGC	2	6	695543	695548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613036
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13728	NC_010102	GCTGG	2	10	695603	695612	0 %	20 %	60 %	20 %	161613036
13729	NC_010102	GGC	2	6	695613	695618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613036
13730	NC_010102	TGG	2	6	695619	695624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613036
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13732	NC_010102	TGGC	2	8	695661	695668	0 %	25 %	50 %	25 %	161613036
13733	NC_010102	CTG	2	6	695679	695684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613036
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13738	NC_010102	CGG	2	6	695873	695878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161613036
13739	NC_010102	GCT	3	9	695882	695890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613036
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13742	NC_010102	GCT	3	9	695954	695962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613036
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13747	NC_010102	TGC	2	6	696001	696006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613036
13748	NC_010102	CTG	2	6	696015	696020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613036
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13756	NC_010102	CTG	2	6	696281	696286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161613036
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13758	NC_010102	TGG	2	6	696364	696369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161613036
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13848	NC_010102	A	8	8	700795	700802	100 %	0 %	0 %	0 %	161613043
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13977	NC_010102	AT	3	6	707182	707187	50 %	50 %	0 %	0 %	161613053
13978	NC_010102	TTA	2	6	707217	707222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161613053
13979	NC_010102	GTT	2	6	707322	707327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613053
13980	NC_010102	TAAAA	2	10	707341	707350	80 %	20 %	0 %	0 %	161613053
13981	NC_010102	A	6	6	707347	707352	100 %	0 %	0 %	0 %	161613053
13982	NC_010102	TTG	2	6	707397	707402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161613053
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