MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_010102	TGC	2	6	612175	612180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612949
12002	NC_010102	GC	4	8	612268	612275	0 %	0 %	50 %	50 %	161612949
12003	NC_010102	GGC	3	9	612323	612331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612949
12004	NC_010102	GAC	2	6	612414	612419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612949
12005	NC_010102	GAT	2	6	612429	612434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612949
12006	NC_010102	CGC	2	6	612437	612442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612949
12007	NC_010102	CG	3	6	612453	612458	0 %	0 %	50 %	50 %	161612949
12008	NC_010102	GC	3	6	612474	612479	0 %	0 %	50 %	50 %	161612949
12009	NC_010102	ACAAA	2	10	612548	612557	80 %	0 %	0 %	20 %	161612949
12010	NC_010102	A	6	6	612591	612596	100 %	0 %	0 %	0 %	161612949
12011	NC_010102	GGC	2	6	612644	612649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612949
12012	NC_010102	GTG	2	6	612679	612684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612949
12013	NC_010102	ATG	2	6	612738	612743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612949
12014	NC_010102	GGC	2	6	612744	612749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612949
12015	NC_010102	ACGCGG	2	12	612790	612801	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161612949
12016	NC_010102	TGG	2	6	612802	612807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612949
12017	NC_010102	CG	3	6	612844	612849	0 %	0 %	50 %	50 %	161612949
12018	NC_010102	CGC	2	6	612854	612859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612949
12019	NC_010102	TGG	2	6	612883	612888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612949
12020	NC_010102	TCA	2	6	612970	612975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612949
12021	NC_010102	CG	3	6	612987	612992	0 %	0 %	50 %	50 %	161612949
12022	NC_010102	CTT	2	6	612998	613003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612949
12023	NC_010102	CTA	2	6	613022	613027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612949
12024	NC_010102	GCTGGC	2	12	613054	613065	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161612949
12025	NC_010102	TGGAC	2	10	613102	613111	20 %	20 %	40 %	20 %	161612949
12026	NC_010102	GCC	2	6	613143	613148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612949
12027	NC_010102	CGC	2	6	613175	613180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612949
12028	NC_010102	GC	3	6	613218	613223	0 %	0 %	50 %	50 %	161612949
12029	NC_010102	GC	3	6	613256	613261	0 %	0 %	50 %	50 %	161612949
12030	NC_010102	AACC	2	8	613335	613342	50 %	0 %	0 %	50 %	161612949
12031	NC_010102	GGC	2	6	613428	613433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612949
12032	NC_010102	GCGT	2	8	613456	613463	0 %	25 %	50 %	25 %	161612949
12033	NC_010102	TTGA	2	8	613464	613471	25 %	50 %	25 %	0 %	161612949
12034	NC_010102	ATT	2	6	613492	613497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612949
12035	NC_010102	ACC	2	6	613558	613563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612949
12036	NC_010102	CGA	2	6	613574	613579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612949
12037	NC_010102	CGG	2	6	613642	613647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612949
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12039	NC_010102	GGCAG	2	10	613745	613754	20 %	0 %	60 %	20 %	161612949
12040	NC_010102	CTGG	2	8	613794	613801	0 %	25 %	50 %	25 %	161612949
12041	NC_010102	CG	3	6	613802	613807	0 %	0 %	50 %	50 %	161612949
12042	NC_010102	CAA	2	6	613830	613835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612949
12043	NC_010102	CTG	2	6	613868	613873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612950
12044	NC_010102	GGT	2	6	613888	613893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612950
12045	NC_010102	CTG	2	6	613898	613903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612950
12046	NC_010102	GTC	2	6	613907	613912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612950
12047	NC_010102	CGT	2	6	613943	613948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612950
12048	NC_010102	CTG	2	6	613949	613954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612950
12049	NC_010102	GCTC	2	8	614001	614008	0 %	25 %	25 %	50 %	161612950
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12051	NC_010102	GAT	2	6	614095	614100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612950
12052	NC_010102	GCT	3	9	614113	614121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612950
12053	NC_010102	GTG	2	6	614156	614161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612950
12054	NC_010102	TTC	2	6	614186	614191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612950
12055	NC_010102	TGA	2	6	614193	614198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612950
12056	NC_010102	CAA	3	9	614245	614253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612950
12057	NC_010102	GCT	2	6	614260	614265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612950
12058	NC_010102	GC	3	6	614275	614280	0 %	0 %	50 %	50 %	161612950
12059	NC_010102	GTG	2	6	614333	614338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612950
12060	NC_010102	GTCACC	2	12	614454	614465	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161612950
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12063	NC_010102	TGGC	2	8	614608	614615	0 %	25 %	50 %	25 %	161612950
12064	NC_010102	TTC	2	6	614663	614668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612950
12065	NC_010102	ATG	3	9	614669	614677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612950
12066	NC_010102	CGT	2	6	614694	614699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612950
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12068	NC_010102	TGCC	2	8	614747	614754	0 %	25 %	25 %	50 %	161612950
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12088	NC_010102	GTCG	2	8	615851	615858	0 %	25 %	50 %	25 %	161612952
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12091	NC_010102	GC	3	6	615925	615930	0 %	0 %	50 %	50 %	161612952
12092	NC_010102	AC	3	6	615943	615948	50 %	0 %	0 %	50 %	161612953
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12099	NC_010102	TC	3	6	616313	616318	0 %	50 %	0 %	50 %	161612954
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12105	NC_010102	CT	3	6	616494	616499	0 %	50 %	0 %	50 %	161612954
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12119	NC_010102	TGA	2	6	617050	617055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612954
12120	NC_010102	TGG	2	6	617074	617079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612954
12121	NC_010102	CGC	2	6	617117	617122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612954
12122	NC_010102	CCA	2	6	617161	617166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612954
12123	NC_010102	GCG	2	6	617217	617222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612954
12124	NC_010102	TGA	2	6	617233	617238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612954
12125	NC_010102	CTT	2	6	617246	617251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612954
12126	NC_010102	GCT	2	6	617258	617263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612954
12127	NC_010102	GAACA	2	10	617304	617313	60 %	0 %	20 %	20 %	161612954
12128	NC_010102	TGG	2	6	617368	617373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612954
12129	NC_010102	G	6	6	617372	617377	0 %	0 %	100 %	0 %	161612954
12130	NC_010102	CTT	2	6	617414	617419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612954
12131	NC_010102	CTGG	2	8	617436	617443	0 %	25 %	50 %	25 %	161612954
12132	NC_010102	TGG	2	6	617473	617478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612954
12133	NC_010102	CCT	2	6	617503	617508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612954
12134	NC_010102	GAT	2	6	617522	617527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612954
12135	NC_010102	TCATGC	2	12	617558	617569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161612954
12136	NC_010102	CCA	2	6	617585	617590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612954
12137	NC_010102	TGA	2	6	617608	617613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612954
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12139	NC_010102	GCC	2	6	617645	617650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612954
12140	NC_010102	TGC	2	6	617662	617667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612954
12141	NC_010102	AACTG	2	10	617675	617684	40 %	20 %	20 %	20 %	161612954
12142	NC_010102	TGGCTG	2	12	617757	617768	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161612954
12143	NC_010102	GC	3	6	617803	617808	0 %	0 %	50 %	50 %	161612954
12144	NC_010102	CTG	2	6	617817	617822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612954
12145	NC_010102	TGG	2	6	617829	617834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612954
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12147	NC_010102	TGA	2	6	617932	617937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612954
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12149	NC_010102	CGG	2	6	618420	618425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612955
12150	NC_010102	GGC	2	6	618532	618537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612955
12151	NC_010102	CCG	2	6	618554	618559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612955
12152	NC_010102	GCT	2	6	618645	618650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612955
12153	NC_010102	TGG	2	6	618653	618658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612955
12154	NC_010102	CTT	2	6	618726	618731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612955
12155	NC_010102	ACCTGA	2	12	618734	618745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161612955
12156	NC_010102	GGC	2	6	618757	618762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612955
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12158	NC_010102	ATG	2	6	618817	618822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612955
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12160	NC_010102	TTC	2	6	618904	618909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612955
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12184	NC_010102	GGT	3	9	619980	619988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612956
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12221	NC_010102	TGGG	2	8	622414	622421	0 %	25 %	75 %	0 %	161612960
12222	NC_010102	GTT	2	6	622422	622427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612960
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12224	NC_010102	AGAA	2	8	622504	622511	75 %	0 %	25 %	0 %	161612960
12225	NC_010102	GCC	2	6	622560	622565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612960
12226	NC_010102	A	6	6	622578	622583	100 %	0 %	0 %	0 %	161612960
12227	NC_010102	GTAAT	2	10	622711	622720	40 %	40 %	20 %	0 %	161612960
12228	NC_010102	CG	3	6	622727	622732	0 %	0 %	50 %	50 %	161612960
12229	NC_010102	GCG	2	6	622829	622834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612960
12230	NC_010102	GCC	3	9	622856	622864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612960
12231	NC_010102	AGA	2	6	622880	622885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612960
12232	NC_010102	ACC	2	6	623069	623074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612960
12233	NC_010102	CAGC	2	8	623115	623122	25 %	0 %	25 %	50 %	161612960
12234	NC_010102	TGCG	2	8	623173	623180	0 %	25 %	50 %	25 %	161612960
12235	NC_010102	GGC	2	6	623211	623216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612960
12236	NC_010102	GGT	2	6	623304	623309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612960
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12238	NC_010102	ACC	2	6	623385	623390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612960
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12360	NC_010102	CGG	2	6	629962	629967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612966
12361	NC_010102	TCT	2	6	629973	629978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612966
12362	NC_010102	CTG	2	6	629981	629986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612966
12363	NC_010102	CGC	2	6	629991	629996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612966
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12366	NC_010102	GCTG	2	8	630112	630119	0 %	25 %	50 %	25 %	161612966
12367	NC_010102	TGG	2	6	630156	630161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612966
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12372	NC_010102	CGG	2	6	630393	630398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612967
12373	NC_010102	TCA	2	6	630410	630415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612967
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12375	NC_010102	ACA	2	6	630443	630448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612967
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12380	NC_010102	GGT	2	6	630547	630552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612967
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12476	NC_010102	A	6	6	635574	635579	100 %	0 %	0 %	0 %	161612974
12477	NC_010102	CAG	2	6	635628	635633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612974
12478	NC_010102	GAG	2	6	635791	635796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161612974
12479	NC_010102	CGC	2	6	635805	635810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612974
12480	NC_010102	CCG	2	6	635845	635850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612974
12481	NC_010102	GCG	2	6	635863	635868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612974
12482	NC_010102	CTT	2	6	635873	635878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612974
12483	NC_010102	GC	3	6	635898	635903	0 %	0 %	50 %	50 %	161612974
12484	NC_010102	TCGC	2	8	636021	636028	0 %	25 %	25 %	50 %	161612974
12485	NC_010102	GC	3	6	636044	636049	0 %	0 %	50 %	50 %	161612974
12486	NC_010102	AGC	2	6	636085	636090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612974
12487	NC_010102	TCGCG	2	10	636190	636199	0 %	20 %	40 %	40 %	161612974
12488	NC_010102	AGC	2	6	636233	636238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612974
12489	NC_010102	GCCA	2	8	636247	636254	25 %	0 %	25 %	50 %	161612974
12490	NC_010102	GCA	2	6	636302	636307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612974
12491	NC_010102	CAC	2	6	636312	636317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612974
12492	NC_010102	ACA	2	6	636435	636440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612974
12493	NC_010102	ATC	2	6	636466	636471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612974
12494	NC_010102	GA	3	6	636517	636522	50 %	0 %	50 %	0 %	161612974
12495	NC_010102	GCCAC	2	10	636578	636587	20 %	0 %	20 %	60 %	161612974
12496	NC_010102	GGC	2	6	636803	636808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612974
12497	NC_010102	TAG	2	6	636826	636831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612974
12498	NC_010102	ATA	2	6	636858	636863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612974
12499	NC_010102	TCA	2	6	636875	636880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612974
12500	NC_010102	GCA	2	6	636979	636984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612975

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