MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010102	CAGA	2	8	561200	561207	50 %	0 %	25 %	25 %	161612893
11002	NC_010102	ATC	2	6	561223	561228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612893
11003	NC_010102	ACGG	2	8	561236	561243	25 %	0 %	50 %	25 %	161612893
11004	NC_010102	AG	3	6	561258	561263	50 %	0 %	50 %	0 %	161612893
11005	NC_010102	GGT	2	6	561336	561341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612893
11006	NC_010102	GT	3	6	561370	561375	0 %	50 %	50 %	0 %	161612893
11007	NC_010102	GTT	2	6	561419	561424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612893
11008	NC_010102	CGC	2	6	561533	561538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612893
11009	NC_010102	ATTG	2	8	561562	561569	25 %	50 %	25 %	0 %	161612893
11010	NC_010102	GTTT	2	8	561578	561585	0 %	75 %	25 %	0 %	161612893
11011	NC_010102	TAT	2	6	561632	561637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612893
11012	NC_010102	CAG	2	6	561641	561646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612893
11013	NC_010102	AAT	2	6	561649	561654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612893
11014	NC_010102	GTT	2	6	561674	561679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612893
11015	NC_010102	ATT	2	6	561807	561812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612893
11016	NC_010102	AGC	2	6	561823	561828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612893
11017	NC_010102	TGC	2	6	561868	561873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612893
11018	NC_010102	GCG	2	6	561907	561912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612893
11019	NC_010102	GCG	2	6	561932	561937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612893
11020	NC_010102	T	6	6	561943	561948	0 %	100 %	0 %	0 %	161612893
11021	NC_010102	TGC	2	6	561991	561996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612893
11022	NC_010102	GCT	2	6	562061	562066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612893
11023	NC_010102	TAAT	2	8	562136	562143	50 %	50 %	0 %	0 %	161612893
11024	NC_010102	TGA	2	6	562254	562259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612894
11025	NC_010102	ATT	2	6	562281	562286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612894
11026	NC_010102	GCC	2	6	562289	562294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612894
11027	NC_010102	GAA	2	6	562336	562341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612894
11028	NC_010102	TGAA	2	8	562385	562392	50 %	25 %	25 %	0 %	161612894
11029	NC_010102	GCT	2	6	562395	562400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612894
11030	NC_010102	GGCA	2	8	562437	562444	25 %	0 %	50 %	25 %	161612894
11031	NC_010102	GTG	2	6	562522	562527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612894
11032	NC_010102	CGC	2	6	562686	562691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612894
11033	NC_010102	CGC	2	6	562763	562768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612894
11034	NC_010102	GGT	2	6	562869	562874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612894
11035	NC_010102	CGC	2	6	562881	562886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612894
11036	NC_010102	GTT	2	6	562887	562892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612894
11037	NC_010102	GTG	2	6	562924	562929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612894
11038	NC_010102	TG	3	6	562935	562940	0 %	50 %	50 %	0 %	161612894
11039	NC_010102	GC	3	6	563029	563034	0 %	0 %	50 %	50 %	161612894
11040	NC_010102	CAC	2	6	563037	563042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612894
11041	NC_010102	AGC	2	6	563081	563086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612894
11042	NC_010102	CTGC	2	8	563107	563114	0 %	25 %	25 %	50 %	161612894
11043	NC_010102	ATG	2	6	563189	563194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612894
11044	NC_010102	CGA	2	6	563202	563207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612894
11045	NC_010102	GTC	2	6	563286	563291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612894
11046	NC_010102	TG	3	6	563303	563308	0 %	50 %	50 %	0 %	161612894
11047	NC_010102	ACG	2	6	563309	563314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612894
11048	NC_010102	GCC	2	6	563323	563328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612894
11049	NC_010102	TCA	2	6	563358	563363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612894
11050	NC_010102	CGGT	2	8	563532	563539	0 %	25 %	50 %	25 %	161612895
11051	NC_010102	TGG	2	6	563590	563595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612895
11052	NC_010102	GCG	2	6	563618	563623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612895
11053	NC_010102	GAC	2	6	563693	563698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612895
11054	NC_010102	ACCGTA	2	12	563805	563816	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161612895
11055	NC_010102	CTG	2	6	563852	563857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612895
11056	NC_010102	GCG	2	6	563858	563863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612895
11057	NC_010102	G	6	6	563884	563889	0 %	0 %	100 %	0 %	161612895
11058	NC_010102	A	6	6	563939	563944	100 %	0 %	0 %	0 %	161612895
11059	NC_010102	GCT	2	6	563977	563982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612895
11060	NC_010102	TGA	2	6	563998	564003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612895
11061	NC_010102	GAT	2	6	564005	564010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612895
11062	NC_010102	GCC	2	6	564018	564023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612895
11063	NC_010102	TGC	2	6	564039	564044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612895
11064	NC_010102	GCT	2	6	564046	564051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612895
11065	NC_010102	CGT	2	6	564083	564088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612895
11066	NC_010102	TCG	2	6	564090	564095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612895
11067	NC_010102	TGA	2	6	564129	564134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612895
11068	NC_010102	TCCG	2	8	564201	564208	0 %	25 %	25 %	50 %	161612895
11069	NC_010102	GGC	2	6	564211	564216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612895
11070	NC_010102	GC	3	6	564224	564229	0 %	0 %	50 %	50 %	161612895
11071	NC_010102	AGA	2	6	564265	564270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612895
11072	NC_010102	CT	3	6	564317	564322	0 %	50 %	0 %	50 %	161612895
11073	NC_010102	TG	3	6	564329	564334	0 %	50 %	50 %	0 %	161612895
11074	NC_010102	CGG	2	6	564397	564402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612895
11075	NC_010102	ATC	2	6	564471	564476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612896
11076	NC_010102	ACG	2	6	564509	564514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612896
11077	NC_010102	GCA	2	6	564515	564520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612896
11078	NC_010102	TAT	2	6	564523	564528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612896
11079	NC_010102	GAT	2	6	564769	564774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612896
11080	NC_010102	CG	3	6	564780	564785	0 %	0 %	50 %	50 %	161612896
11081	NC_010102	ATC	2	6	564817	564822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612896
11082	NC_010102	ATC	2	6	564827	564832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612896
11083	NC_010102	CG	3	6	564904	564909	0 %	0 %	50 %	50 %	161612896
11084	NC_010102	CG	3	6	564949	564954	0 %	0 %	50 %	50 %	161612896
11085	NC_010102	TGG	2	6	565025	565030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612896
11086	NC_010102	TCA	2	6	565056	565061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612896
11087	NC_010102	CTG	2	6	565087	565092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612896
11088	NC_010102	GGC	3	9	565161	565169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612896
11089	NC_010102	TAT	2	6	565335	565340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612897
11090	NC_010102	GTC	2	6	565447	565452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612897
11091	NC_010102	GCT	2	6	565476	565481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612897
11092	NC_010102	TGG	2	6	565538	565543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612897
11093	NC_010102	CGC	2	6	565557	565562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612897
11094	NC_010102	CCG	2	6	565644	565649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612897
11095	NC_010102	CCA	2	6	565668	565673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612897
11096	NC_010102	CGG	2	6	565689	565694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612897
11097	NC_010102	TCGC	2	8	565709	565716	0 %	25 %	25 %	50 %	161612897
11098	NC_010102	GCC	2	6	565786	565791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612897
11099	NC_010102	GC	3	6	565805	565810	0 %	0 %	50 %	50 %	161612897
11100	NC_010102	TTC	2	6	565846	565851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612897
11101	NC_010102	GCT	2	6	565884	565889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612897
11102	NC_010102	GC	3	6	565950	565955	0 %	0 %	50 %	50 %	161612897
11103	NC_010102	A	6	6	566391	566396	100 %	0 %	0 %	0 %	161612898
11104	NC_010102	AGAC	2	8	566402	566409	50 %	0 %	25 %	25 %	161612898
11105	NC_010102	AGAA	2	8	566422	566429	75 %	0 %	25 %	0 %	161612898
11106	NC_010102	TGG	2	6	566449	566454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612898
11107	NC_010102	CGC	3	9	566489	566497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612898
11108	NC_010102	GGC	2	6	566517	566522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612898
11109	NC_010102	TTCG	2	8	566550	566557	0 %	50 %	25 %	25 %	161612898
11110	NC_010102	GT	3	6	566595	566600	0 %	50 %	50 %	0 %	161612898
11111	NC_010102	CGG	2	6	566612	566617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612898
11112	NC_010102	CG	3	6	566618	566623	0 %	0 %	50 %	50 %	161612898
11113	NC_010102	AAG	2	6	566629	566634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612898
11114	NC_010102	CGG	2	6	566668	566673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612898
11115	NC_010102	GCG	2	6	566737	566742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612898
11116	NC_010102	CG	3	6	566815	566820	0 %	0 %	50 %	50 %	161612898
11117	NC_010102	GCC	2	6	566849	566854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612898
11118	NC_010102	TGATA	2	10	566897	566906	40 %	40 %	20 %	0 %	161612898
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11120	NC_010102	TGA	2	6	566956	566961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612898
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11231	NC_010102	T	7	7	572626	572632	0 %	100 %	0 %	0 %	161612904
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11237	NC_010102	TGAC	2	8	573071	573078	25 %	25 %	25 %	25 %	161612905
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11360	NC_010102	CGG	2	6	579488	579493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612911
11361	NC_010102	CGC	2	6	579501	579506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612911
11362	NC_010102	ACC	2	6	579538	579543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612911
11363	NC_010102	TCA	2	6	579556	579561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612911
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11372	NC_010102	CGC	2	6	579993	579998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612911
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11471	NC_010102	GCG	2	6	584949	584954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612918
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11477	NC_010102	CGA	2	6	585150	585155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612918
11478	NC_010102	TAT	2	6	585168	585173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612918
11479	NC_010102	GA	3	6	585177	585182	50 %	0 %	50 %	0 %	161612918
11480	NC_010102	A	6	6	585188	585193	100 %	0 %	0 %	0 %	161612918
11481	NC_010102	GTA	2	6	585301	585306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612918
11482	NC_010102	TC	3	6	585504	585509	0 %	50 %	0 %	50 %	161612919
11483	NC_010102	CTGG	2	8	585603	585610	0 %	25 %	50 %	25 %	161612919
11484	NC_010102	GTC	2	6	585673	585678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612919
11485	NC_010102	GGA	2	6	585697	585702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161612919
11486	NC_010102	CGC	3	9	585711	585719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612919
11487	NC_010102	CG	4	8	585761	585768	0 %	0 %	50 %	50 %	161612919
11488	NC_010102	GAA	2	6	585812	585817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612919
11489	NC_010102	GTG	2	6	585830	585835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612919
11490	NC_010102	A	6	6	585848	585853	100 %	0 %	0 %	0 %	161612919
11491	NC_010102	ATTT	2	8	585936	585943	25 %	75 %	0 %	0 %	161612919
11492	NC_010102	TGA	2	6	585978	585983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612919
11493	NC_010102	GGC	2	6	586027	586032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612919
11494	NC_010102	GCG	2	6	586237	586242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612920
11495	NC_010102	CG	3	6	586241	586246	0 %	0 %	50 %	50 %	161612920
11496	NC_010102	TGC	3	9	586399	586407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612920
11497	NC_010102	GCA	2	6	586430	586435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612920
11498	NC_010102	AG	3	6	586448	586453	50 %	0 %	50 %	0 %	161612920
11499	NC_010102	CGA	2	6	586489	586494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612920
11500	NC_010102	CAG	2	6	586560	586565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612920

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