MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_010102	GC	3	6	534400	534405	0 %	0 %	50 %	50 %	161612861
10502	NC_010102	CCG	2	6	534412	534417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612861
10503	NC_010102	TGG	2	6	534506	534511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612861
10504	NC_010102	GCA	2	6	534522	534527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612861
10505	NC_010102	GCT	2	6	534555	534560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612861
10506	NC_010102	GCCGG	2	10	534640	534649	0 %	0 %	60 %	40 %	161612861
10507	NC_010102	TTA	2	6	534793	534798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612861
10508	NC_010102	CGCGC	2	10	534877	534886	0 %	0 %	40 %	60 %	161612861
10509	NC_010102	AAC	2	6	534887	534892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612861
10510	NC_010102	GCC	2	6	534909	534914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612861
10511	NC_010102	CTGG	2	8	535116	535123	0 %	25 %	50 %	25 %	161612861
10512	NC_010102	ATA	2	6	535133	535138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612861
10513	NC_010102	A	6	6	535154	535159	100 %	0 %	0 %	0 %	161612861
10514	NC_010102	ATT	2	6	535238	535243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612863
10515	NC_010102	TGA	2	6	535379	535384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612863
10516	NC_010102	T	6	6	535409	535414	0 %	100 %	0 %	0 %	161612863
10517	NC_010102	ACG	2	6	535476	535481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612863
10518	NC_010102	TACG	2	8	535495	535502	25 %	25 %	25 %	25 %	161612863
10519	NC_010102	ATT	2	6	535506	535511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612863
10520	NC_010102	TCAG	2	8	535537	535544	25 %	25 %	25 %	25 %	161612863
10521	NC_010102	ACA	2	6	535630	535635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612863
10522	NC_010102	ATG	2	6	535690	535695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612863
10523	NC_010102	CAC	2	6	535700	535705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612863
10524	NC_010102	GCA	2	6	535739	535744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612863
10525	NC_010102	GCA	2	6	535785	535790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612863
10526	NC_010102	CG	3	6	535807	535812	0 %	0 %	50 %	50 %	161612863
10527	NC_010102	AGC	3	9	535825	535833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612863
10528	NC_010102	TA	3	6	535837	535842	50 %	50 %	0 %	0 %	161612863
10529	NC_010102	TTG	2	6	535867	535872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612863
10530	NC_010102	AAT	2	6	535911	535916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612863
10531	NC_010102	TGG	2	6	535927	535932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612863
10532	NC_010102	A	8	8	535961	535968	100 %	0 %	0 %	0 %	161612863
10533	NC_010102	CGG	2	6	535969	535974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612863
10534	NC_010102	CGA	2	6	536033	536038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612863
10535	NC_010102	A	6	6	536060	536065	100 %	0 %	0 %	0 %	161612863
10536	NC_010102	GCG	2	6	536097	536102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612863
10537	NC_010102	AG	3	6	536133	536138	50 %	0 %	50 %	0 %	161612863
10538	NC_010102	GCT	2	6	536162	536167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612863
10539	NC_010102	GTA	2	6	536182	536187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612863
10540	NC_010102	TCAA	2	8	536209	536216	50 %	25 %	0 %	25 %	161612863
10541	NC_010102	GCG	2	6	536242	536247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612863
10542	NC_010102	TGC	2	6	536278	536283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612863
10543	NC_010102	CGACT	2	10	536381	536390	20 %	20 %	20 %	40 %	161612863
10544	NC_010102	GCAG	2	8	536470	536477	25 %	0 %	50 %	25 %	161612863
10545	NC_010102	GC	3	6	536522	536527	0 %	0 %	50 %	50 %	161612863
10546	NC_010102	TATT	2	8	536631	536638	25 %	75 %	0 %	0 %	161612863
10547	NC_010102	CGG	2	6	536641	536646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612863
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10549	NC_010102	GGC	2	6	536813	536818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612863
10550	NC_010102	TTA	2	6	536826	536831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612863
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10552	NC_010102	GCG	2	6	536893	536898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612863
10553	NC_010102	CAG	2	6	536913	536918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612863
10554	NC_010102	ATG	2	6	536962	536967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612863
10555	NC_010102	CTGG	2	8	537034	537041	0 %	25 %	50 %	25 %	161612863
10556	NC_010102	ACC	2	6	537078	537083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612863
10557	NC_010102	GTG	2	6	537189	537194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612863
10558	NC_010102	GAT	2	6	537219	537224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612863
10559	NC_010102	ATG	2	6	537230	537235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612863
10560	NC_010102	TGAT	2	8	537251	537258	25 %	50 %	25 %	0 %	161612864
10561	NC_010102	GCAG	2	8	537300	537307	25 %	0 %	50 %	25 %	161612864
10562	NC_010102	CGTG	2	8	537315	537322	0 %	25 %	50 %	25 %	161612864
10563	NC_010102	TG	3	6	537390	537395	0 %	50 %	50 %	0 %	161612864
10564	NC_010102	TGA	2	6	537422	537427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612864
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10566	NC_010102	CGGT	2	8	537595	537602	0 %	25 %	50 %	25 %	161612864
10567	NC_010102	CGG	2	6	537610	537615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612864
10568	NC_010102	CAG	2	6	537625	537630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612864
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10572	NC_010102	TGG	2	6	537965	537970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612864
10573	NC_010102	TGG	2	6	537989	537994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612864
10574	NC_010102	GGC	2	6	537999	538004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612864
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10580	NC_010102	TGC	2	6	538250	538255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612864
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10582	NC_010102	GAGCC	2	10	538294	538303	20 %	0 %	40 %	40 %	161612864
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10586	NC_010102	A	6	6	538432	538437	100 %	0 %	0 %	0 %	161612864
10587	NC_010102	A	6	6	538741	538746	100 %	0 %	0 %	0 %	161612865
10588	NC_010102	ATG	2	6	538762	538767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612865
10589	NC_010102	TTAT	2	8	538807	538814	25 %	75 %	0 %	0 %	161612865
10590	NC_010102	TC	3	6	538823	538828	0 %	50 %	0 %	50 %	161612865
10591	NC_010102	ACTGG	2	10	538923	538932	20 %	20 %	40 %	20 %	161612865
10592	NC_010102	A	6	6	538938	538943	100 %	0 %	0 %	0 %	161612865
10593	NC_010102	AGC	2	6	539069	539074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612865
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10595	NC_010102	GGTT	2	8	539149	539156	0 %	50 %	50 %	0 %	161612865
10596	NC_010102	GGCG	2	8	539178	539185	0 %	0 %	75 %	25 %	161612865
10597	NC_010102	A	6	6	539447	539452	100 %	0 %	0 %	0 %	161612865
10598	NC_010102	ATATT	2	10	539493	539502	40 %	60 %	0 %	0 %	161612865
10599	NC_010102	GAA	2	6	539548	539553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612865
10600	NC_010102	TGG	2	6	539607	539612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612865
10601	NC_010102	TAA	3	9	539631	539639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612865
10602	NC_010102	T	6	6	540001	540006	0 %	100 %	0 %	0 %	161612866
10603	NC_010102	CGC	2	6	540027	540032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612866
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10607	NC_010102	CGA	2	6	540216	540221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612866
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10609	NC_010102	TCA	2	6	540258	540263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612866
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10611	NC_010102	CTGC	2	8	540287	540294	0 %	25 %	25 %	50 %	161612866
10612	NC_010102	GAT	2	6	540322	540327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612866
10613	NC_010102	CCAG	2	8	540328	540335	25 %	0 %	25 %	50 %	161612866
10614	NC_010102	TCA	2	6	540419	540424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612866
10615	NC_010102	AT	3	6	540434	540439	50 %	50 %	0 %	0 %	161612866
10616	NC_010102	CGC	2	6	540451	540456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612866
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10619	NC_010102	AAT	2	6	540578	540583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612866
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10621	NC_010102	GCC	2	6	540646	540651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612866
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10742	NC_010102	TTCA	2	8	547725	547732	25 %	50 %	0 %	25 %	161612874
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10848	NC_010102	ATCT	2	8	552926	552933	25 %	50 %	0 %	25 %	161612883
10849	NC_010102	CTG	2	6	552936	552941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612883
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10852	NC_010102	GC	3	6	553034	553039	0 %	0 %	50 %	50 %	161612883
10853	NC_010102	GACGC	2	10	553080	553089	20 %	0 %	40 %	40 %	161612883
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10858	NC_010102	AGA	2	6	553403	553408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612884
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10862	NC_010102	CGC	2	6	553792	553797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612885
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10865	NC_010102	GC	3	6	553893	553898	0 %	0 %	50 %	50 %	161612885
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10980	NC_010102	TCA	2	6	560085	560090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612892
10981	NC_010102	T	6	6	560140	560145	0 %	100 %	0 %	0 %	161612892
10982	NC_010102	CG	3	6	560159	560164	0 %	0 %	50 %	50 %	161612892
10983	NC_010102	GGCG	2	8	560238	560245	0 %	0 %	75 %	25 %	161612892
10984	NC_010102	GCT	2	6	560298	560303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612892
10985	NC_010102	GCT	2	6	560343	560348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612892
10986	NC_010102	GC	3	6	560435	560440	0 %	0 %	50 %	50 %	161612892
10987	NC_010102	GGC	2	6	560442	560447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612892
10988	NC_010102	GAC	2	6	560505	560510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612892
10989	NC_010102	GCT	2	6	560523	560528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612892
10990	NC_010102	GGGCCT	2	12	560622	560633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161612892
10991	NC_010102	GGC	2	6	560788	560793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612892
10992	NC_010102	CTG	2	6	560836	560841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612892
10993	NC_010102	TGGC	2	8	560848	560855	0 %	25 %	50 %	25 %	161612892
10994	NC_010102	GGCGC	2	10	560881	560890	0 %	0 %	60 %	40 %	161612892
10995	NC_010102	CGG	2	6	560979	560984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612892
10996	NC_010102	CGC	2	6	560988	560993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612892
10997	NC_010102	GGT	2	6	561093	561098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612892
10998	NC_010102	CCAG	2	8	561143	561150	25 %	0 %	25 %	50 %	161612893
10999	NC_010102	ATT	2	6	561166	561171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612893
11000	NC_010102	ACA	2	6	561182	561187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612893

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