MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010102	GCG	2	6	24838	24843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612340
502	NC_010102	CGA	2	6	24914	24919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612340
503	NC_010102	CG	3	6	25154	25159	0 %	0 %	50 %	50 %	161612341
504	NC_010102	A	8	8	25205	25212	100 %	0 %	0 %	0 %	161612341
505	NC_010102	ATT	2	6	25231	25236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612341
506	NC_010102	CTG	2	6	25241	25246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612341
507	NC_010102	CGG	2	6	25248	25253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612341
508	NC_010102	CCT	2	6	25335	25340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612341
509	NC_010102	ATT	2	6	25346	25351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612341
510	NC_010102	TTC	2	6	25354	25359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612341
511	NC_010102	CGC	2	6	25434	25439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612341
512	NC_010102	CT	3	6	25440	25445	0 %	50 %	0 %	50 %	161612341
513	NC_010102	A	6	6	25460	25465	100 %	0 %	0 %	0 %	161612341
514	NC_010102	AT	3	6	25470	25475	50 %	50 %	0 %	0 %	161612341
515	NC_010102	TAT	2	6	25480	25485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612341
516	NC_010102	ACCG	2	8	25504	25511	25 %	0 %	25 %	50 %	161612341
517	NC_010102	TATTT	2	10	25524	25533	20 %	80 %	0 %	0 %	161612341
518	NC_010102	AAAT	2	8	25564	25571	75 %	25 %	0 %	0 %	161612341
519	NC_010102	TATT	2	8	25617	25624	25 %	75 %	0 %	0 %	161612341
520	NC_010102	TAC	2	6	25721	25726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612341
521	NC_010102	A	6	6	25757	25762	100 %	0 %	0 %	0 %	161612341
522	NC_010102	CCG	2	6	25781	25786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612341
523	NC_010102	ACG	2	6	25856	25861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612341
524	NC_010102	ATG	2	6	25885	25890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612341
525	NC_010102	TCTG	2	8	26021	26028	0 %	50 %	25 %	25 %	161612342
526	NC_010102	GGC	2	6	26078	26083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
527	NC_010102	ACG	2	6	26160	26165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612342
528	NC_010102	GC	3	6	26173	26178	0 %	0 %	50 %	50 %	161612342
529	NC_010102	CCA	2	6	26179	26184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612342
530	NC_010102	GCCT	2	8	26202	26209	0 %	25 %	25 %	50 %	161612342
531	NC_010102	CGG	2	6	26275	26280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
532	NC_010102	GCC	2	6	26313	26318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612342
533	NC_010102	GCA	2	6	26339	26344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612342
534	NC_010102	GGC	2	6	26369	26374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
535	NC_010102	GGC	2	6	26487	26492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
536	NC_010102	ACT	2	6	26560	26565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612342
537	NC_010102	GCG	2	6	26584	26589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
538	NC_010102	AGCGAC	2	12	26598	26609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612342
539	NC_010102	GCA	2	6	26612	26617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612342
540	NC_010102	ATT	2	6	26696	26701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612342
541	NC_010102	CCTT	2	8	26708	26715	0 %	50 %	0 %	50 %	161612342
542	NC_010102	GAC	2	6	26739	26744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612342
543	NC_010102	CAT	2	6	26837	26842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612342
544	NC_010102	GCC	2	6	26858	26863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612342
545	NC_010102	CCG	2	6	26896	26901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612342
546	NC_010102	GCG	2	6	26905	26910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
547	NC_010102	CCG	2	6	26971	26976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612342
548	NC_010102	GGC	2	6	26998	27003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
549	NC_010102	GCG	2	6	27012	27017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
550	NC_010102	TAG	2	6	27041	27046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612342
551	NC_010102	TCAG	2	8	27067	27074	25 %	25 %	25 %	25 %	161612342
552	NC_010102	GCG	2	6	27163	27168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
553	NC_010102	ATA	2	6	27232	27237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612342
554	NC_010102	GAT	2	6	27351	27356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612342
555	NC_010102	ATT	2	6	27433	27438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612342
556	NC_010102	TTA	2	6	27446	27451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612342
557	NC_010102	AGG	2	6	27456	27461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161612342
558	NC_010102	ATCA	2	8	27480	27487	50 %	25 %	0 %	25 %	161612342
559	NC_010102	TTA	2	6	27514	27519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612342
560	NC_010102	CAGC	2	8	27524	27531	25 %	0 %	25 %	50 %	161612342
561	NC_010102	TGA	2	6	27548	27553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612342
562	NC_010102	TTG	2	6	27564	27569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612342
563	NC_010102	ACA	2	6	27619	27624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612342
564	NC_010102	GAT	2	6	27708	27713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612342
565	NC_010102	CTG	2	6	27807	27812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612342
566	NC_010102	ACA	2	6	27832	27837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612342
567	NC_010102	GCG	2	6	27874	27879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
568	NC_010102	CAG	2	6	27954	27959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612342
569	NC_010102	GCG	2	6	27976	27981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612342
570	NC_010102	TGG	2	6	27985	27990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612342
571	NC_010102	AGCC	2	8	28014	28021	25 %	0 %	25 %	50 %	161612342
572	NC_010102	CG	3	6	28103	28108	0 %	0 %	50 %	50 %	161612342
573	NC_010102	GGT	2	6	28118	28123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612342
574	NC_010102	ACA	2	6	28134	28139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612342
575	NC_010102	TGA	2	6	28181	28186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612342
576	NC_010102	TGA	2	6	28196	28201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612342
577	NC_010102	CCGA	2	8	28221	28228	25 %	0 %	25 %	50 %	161612342
578	NC_010102	GC	3	6	28231	28236	0 %	0 %	50 %	50 %	161612342
579	NC_010102	GC	3	6	28267	28272	0 %	0 %	50 %	50 %	161612342
580	NC_010102	ACGGTG	2	12	28323	28334	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161612342
581	NC_010102	TTG	2	6	28357	28362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612342
582	NC_010102	GCGTC	2	10	28447	28456	0 %	20 %	40 %	40 %	161612342
583	NC_010102	ATC	2	6	28459	28464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612342
584	NC_010102	TC	3	6	28463	28468	0 %	50 %	0 %	50 %	161612342
585	NC_010102	TCC	2	6	28470	28475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612342
586	NC_010102	ACA	2	6	28493	28498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612342
587	NC_010102	CTG	2	6	28539	28544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612343
588	NC_010102	GT	3	6	28581	28586	0 %	50 %	50 %	0 %	161612343
589	NC_010102	ATTA	2	8	28614	28621	50 %	50 %	0 %	0 %	161612343
590	NC_010102	A	6	6	28681	28686	100 %	0 %	0 %	0 %	161612343
591	NC_010102	CCG	2	6	28717	28722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612343
592	NC_010102	TTC	2	6	28850	28855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612343
593	NC_010102	GGCG	2	8	28856	28863	0 %	0 %	75 %	25 %	161612343
594	NC_010102	ATG	2	6	28900	28905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612343
595	NC_010102	TCG	2	6	28981	28986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612343
596	NC_010102	CCG	2	6	29035	29040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612343
597	NC_010102	A	6	6	29208	29213	100 %	0 %	0 %	0 %	161612343
598	NC_010102	ATG	2	6	29374	29379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612343
599	NC_010102	ACA	2	6	29454	29459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612343
600	NC_010102	GAC	2	6	29592	29597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612344
601	NC_010102	AAC	2	6	29720	29725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612344
602	NC_010102	TGGGGT	2	12	29879	29890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612344
603	NC_010102	ATG	2	6	29902	29907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612344
604	NC_010102	AAT	2	6	29928	29933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612344
605	NC_010102	GGT	2	6	29942	29947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612344
606	NC_010102	CGG	2	6	30034	30039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612344
607	NC_010102	ATGA	2	8	30061	30068	50 %	25 %	25 %	0 %	161612344
608	NC_010102	TGC	2	6	30115	30120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612345
609	NC_010102	GGC	2	6	30122	30127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612345
610	NC_010102	CT	3	6	30195	30200	0 %	50 %	0 %	50 %	161612345
611	NC_010102	GCA	2	6	30313	30318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612345
612	NC_010102	GCG	2	6	30325	30330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612345
613	NC_010102	GCG	2	6	30351	30356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612345
614	NC_010102	AG	3	6	30464	30469	50 %	0 %	50 %	0 %	161612345
615	NC_010102	CG	3	6	30521	30526	0 %	0 %	50 %	50 %	161612345
616	NC_010102	GGC	2	6	30540	30545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612345
617	NC_010102	TATC	2	8	30687	30694	25 %	50 %	0 %	25 %	161612347
618	NC_010102	GTAA	2	8	30724	30731	50 %	25 %	25 %	0 %	161612347
619	NC_010102	TGG	2	6	30774	30779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612347
620	NC_010102	CGC	2	6	30830	30835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612347
621	NC_010102	ATT	2	6	30837	30842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612346
622	NC_010102	GC	3	6	30853	30858	0 %	0 %	50 %	50 %	161612346
623	NC_010102	GGT	2	6	30876	30881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612346
624	NC_010102	CCG	2	6	30902	30907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612346
625	NC_010102	CGC	2	6	30936	30941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612346
626	NC_010102	TTCG	2	8	30986	30993	0 %	50 %	25 %	25 %	161612346
627	NC_010102	GCA	2	6	31038	31043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612346
628	NC_010102	ATCTG	2	10	31055	31064	20 %	40 %	20 %	20 %	161612346
629	NC_010102	TTACG	2	10	31110	31119	20 %	40 %	20 %	20 %	161612346
630	NC_010102	TTA	2	6	31126	31131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612346
631	NC_010102	GC	3	6	31143	31148	0 %	0 %	50 %	50 %	161612346
632	NC_010102	TAT	2	6	31358	31363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612348
633	NC_010102	TAT	2	6	31365	31370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612348
634	NC_010102	CGC	2	6	31439	31444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612348
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644	NC_010102	GTG	2	6	31727	31732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612348
645	NC_010102	TGG	2	6	31750	31755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612348
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659	NC_010102	AGGC	2	8	32352	32359	25 %	0 %	50 %	25 %	161612349
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662	NC_010102	ATT	2	6	32481	32486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612349
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670	NC_010102	CAG	2	6	32846	32851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612350
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713	NC_010102	GAT	2	6	35897	35902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612357
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741	NC_010102	A	6	6	37487	37492	100 %	0 %	0 %	0 %	161612358
742	NC_010102	GAA	2	6	37509	37514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612358
743	NC_010102	GTT	2	6	37523	37528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612358
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745	NC_010102	TGAT	2	8	37696	37703	25 %	50 %	25 %	0 %	161612358
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747	NC_010102	TGGT	2	8	37741	37748	0 %	50 %	50 %	0 %	161612358
748	NC_010102	GCG	2	6	37767	37772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612358
749	NC_010102	ACG	2	6	37777	37782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612358
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753	NC_010102	GGC	2	6	38147	38152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612358
754	NC_010102	C	6	6	38165	38170	0 %	0 %	0 %	100 %	161612358
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756	NC_010102	CGC	2	6	38290	38295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612358
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885	NC_010102	ATA	2	6	45369	45374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612363
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997	NC_010102	AGC	3	9	51834	51842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612369
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999	NC_010102	AAAG	2	8	51865	51872	75 %	0 %	25 %	0 %	161612369
1000	NC_010102	CGC	2	6	51892	51897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612369

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