MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
85501	NC_010102	CCTCAG	2	12	4505088	4505099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161617492
85502	NC_010102	CA	3	6	4505113	4505118	50 %	0 %	0 %	50 %	161617492
85503	NC_010102	TGA	3	9	4505147	4505155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617492
85504	NC_010102	TGA	2	6	4505550	4505555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617494
85505	NC_010102	ACC	2	6	4505557	4505562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617494
85506	NC_010102	CTG	2	6	4505623	4505628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617494
85507	NC_010102	GTG	2	6	4505732	4505737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617494
85508	NC_010102	CTTTT	2	10	4505811	4505820	0 %	80 %	0 %	20 %	161617496
85509	NC_010102	CTGG	2	8	4505835	4505842	0 %	25 %	50 %	25 %	161617496
85510	NC_010102	TTC	2	6	4505944	4505949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617496
85511	NC_010102	GCTG	2	8	4506099	4506106	0 %	25 %	50 %	25 %	161617495
85512	NC_010102	GTT	2	6	4506195	4506200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617495
85513	NC_010102	AC	3	6	4506214	4506219	50 %	0 %	0 %	50 %	161617495
85514	NC_010102	GCCT	2	8	4506464	4506471	0 %	25 %	25 %	50 %	161617495
85515	NC_010102	TGA	2	6	4506521	4506526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617495
85516	NC_010102	CAA	2	6	4506547	4506552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617495
85517	NC_010102	ACT	2	6	4506614	4506619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617495
85518	NC_010102	ATA	2	6	4506652	4506657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617495
85519	NC_010102	CAGG	2	8	4506831	4506838	25 %	0 %	50 %	25 %	161617495
85520	NC_010102	CCTGCG	2	12	4506891	4506902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	161617495
85521	NC_010102	GCT	2	6	4506942	4506947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617495
85522	NC_010102	TC	3	6	4507027	4507032	0 %	50 %	0 %	50 %	161617495
85523	NC_010102	GCAG	2	8	4507115	4507122	25 %	0 %	50 %	25 %	161617495
85524	NC_010102	AGT	2	6	4507182	4507187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617495
85525	NC_010102	GCA	2	6	4507320	4507325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617495
85526	NC_010102	TCA	2	6	4507424	4507429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617497
85527	NC_010102	CAC	2	6	4507453	4507458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617497
85528	NC_010102	TCA	2	6	4507459	4507464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617497
85529	NC_010102	GCA	2	6	4507485	4507490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617497
85530	NC_010102	GCA	2	6	4507510	4507515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617497
85531	NC_010102	CTG	2	6	4507529	4507534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617497
85532	NC_010102	ACTG	2	8	4507593	4507600	25 %	25 %	25 %	25 %	161617497
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85534	NC_010102	GC	3	6	4507698	4507703	0 %	0 %	50 %	50 %	161617497
85535	NC_010102	TCT	2	6	4507714	4507719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617497
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85537	NC_010102	GTC	2	6	4507745	4507750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617497
85538	NC_010102	GCA	2	6	4507808	4507813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617497
85539	NC_010102	TAAC	2	8	4507824	4507831	50 %	25 %	0 %	25 %	161617497
85540	NC_010102	TCA	2	6	4507901	4507906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617498
85541	NC_010102	TGAA	2	8	4507914	4507921	50 %	25 %	25 %	0 %	161617498
85542	NC_010102	GTC	2	6	4507983	4507988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617498
85543	NC_010102	CAAC	2	8	4508000	4508007	50 %	0 %	0 %	50 %	161617498
85544	NC_010102	TGT	2	6	4508008	4508013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617498
85545	NC_010102	TGGA	2	8	4508015	4508022	25 %	25 %	50 %	0 %	161617498
85546	NC_010102	GGT	2	6	4508056	4508061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617498
85547	NC_010102	TGC	2	6	4508197	4508202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617498
85548	NC_010102	TCAGC	2	10	4508309	4508318	20 %	20 %	20 %	40 %	161617498
85549	NC_010102	GGC	2	6	4508552	4508557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617498
85550	NC_010102	G	7	7	4508563	4508569	0 %	0 %	100 %	0 %	161617498
85551	NC_010102	AGA	2	6	4508595	4508600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617498
85552	NC_010102	ACG	2	6	4508628	4508633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617498
85553	NC_010102	CAG	2	6	4508691	4508696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617498
85554	NC_010102	AC	3	6	4508721	4508726	50 %	0 %	0 %	50 %	161617498
85555	NC_010102	GCAG	2	8	4508781	4508788	25 %	0 %	50 %	25 %	161617498
85556	NC_010102	CAG	2	6	4508925	4508930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617498
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85558	NC_010102	CTG	2	6	4508996	4509001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617498
85559	NC_010102	CAC	2	6	4509178	4509183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617498
85560	NC_010102	TGC	2	6	4509201	4509206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617498
85561	NC_010102	GCG	2	6	4509453	4509458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617498
85562	NC_010102	CG	3	6	4509471	4509476	0 %	0 %	50 %	50 %	161617498
85563	NC_010102	CTG	2	6	4509512	4509517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617498
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85569	NC_010102	ATG	2	6	4509701	4509706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617499
85570	NC_010102	CT	3	6	4509745	4509750	0 %	50 %	0 %	50 %	161617499
85571	NC_010102	CTG	2	6	4509764	4509769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617499
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85574	NC_010102	CAG	3	9	4509900	4509908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617499
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85579	NC_010102	TTA	2	6	4510080	4510085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617499
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85584	NC_010102	CCA	2	6	4510238	4510243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617499
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85586	NC_010102	TGGC	3	12	4510299	4510310	0 %	25 %	50 %	25 %	161617499
85587	NC_010102	ACGG	2	8	4510316	4510323	25 %	0 %	50 %	25 %	161617499
85588	NC_010102	GGA	2	6	4510381	4510386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161617499
85589	NC_010102	CG	3	6	4510397	4510402	0 %	0 %	50 %	50 %	161617499
85590	NC_010102	CTT	2	6	4510409	4510414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617499
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85603	NC_010102	GCC	2	6	4511028	4511033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617500
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85608	NC_010102	CGG	2	6	4511479	4511484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617501
85609	NC_010102	GT	3	6	4511561	4511566	0 %	50 %	50 %	0 %	161617501
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85612	NC_010102	ATCTT	2	10	4511739	4511748	20 %	60 %	0 %	20 %	161617501
85613	NC_010102	CGCC	2	8	4511820	4511827	0 %	0 %	25 %	75 %	161617501
85614	NC_010102	T	6	6	4511943	4511948	0 %	100 %	0 %	0 %	161617501
85615	NC_010102	TCA	2	6	4511966	4511971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617501
85616	NC_010102	GCT	2	6	4512003	4512008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617501
85617	NC_010102	CGG	2	6	4512078	4512083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617501
85618	NC_010102	CCCG	2	8	4512111	4512118	0 %	0 %	25 %	75 %	161617501
85619	NC_010102	GGT	2	6	4512133	4512138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617501
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85621	NC_010102	CGT	2	6	4512352	4512357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617501
85622	NC_010102	TGC	2	6	4512396	4512401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617501
85623	NC_010102	TCA	2	6	4512404	4512409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617501
85624	NC_010102	TGT	2	6	4512440	4512445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617501
85625	NC_010102	TGA	2	6	4512489	4512494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617501
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85627	NC_010102	TCT	2	6	4512557	4512562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617501
85628	NC_010102	CGC	2	6	4512754	4512759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617501
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85722	NC_010102	TGC	2	6	4518881	4518886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617508
85723	NC_010102	CTCC	2	8	4518903	4518910	0 %	25 %	0 %	75 %	161617508
85724	NC_010102	TTA	2	6	4518949	4518954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617508
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85726	NC_010102	GAT	2	6	4519046	4519051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617509
85727	NC_010102	A	7	7	4519077	4519083	100 %	0 %	0 %	0 %	161617509
85728	NC_010102	ATC	2	6	4519107	4519112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617509
85729	NC_010102	GTCA	3	12	4519175	4519186	25 %	25 %	25 %	25 %	161617510
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85733	NC_010102	CTG	2	6	4519246	4519251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617510
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