MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010102	AGC	2	6	407930	407935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612731
8002	NC_010102	GCCA	2	8	408077	408084	25 %	0 %	25 %	50 %	161612731
8003	NC_010102	ACC	3	9	408092	408100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612731
8004	NC_010102	CGGATA	2	12	408261	408272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161612731
8005	NC_010102	GTT	2	6	408277	408282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612731
8006	NC_010102	TGCA	2	8	408390	408397	25 %	25 %	25 %	25 %	161612731
8007	NC_010102	ACA	2	6	408432	408437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612731
8008	NC_010102	ATA	2	6	408486	408491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612731
8009	NC_010102	GCG	2	6	408576	408581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612731
8010	NC_010102	GCG	2	6	408591	408596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612731
8011	NC_010102	GGCA	2	8	408637	408644	25 %	0 %	50 %	25 %	161612731
8012	NC_010102	CGTG	2	8	408660	408667	0 %	25 %	50 %	25 %	161612731
8013	NC_010102	TAT	2	6	408676	408681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612732
8014	NC_010102	AAT	2	6	408696	408701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612732
8015	NC_010102	CATT	2	8	408746	408753	25 %	50 %	0 %	25 %	161612732
8016	NC_010102	ATGT	2	8	409376	409383	25 %	50 %	25 %	0 %	161612733
8017	NC_010102	CCAAA	2	10	409454	409463	60 %	0 %	0 %	40 %	161612733
8018	NC_010102	ATA	2	6	409481	409486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612733
8019	NC_010102	CG	4	8	409494	409501	0 %	0 %	50 %	50 %	161612733
8020	NC_010102	CGC	2	6	409611	409616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612733
8021	NC_010102	GGCGC	2	10	409643	409652	0 %	0 %	60 %	40 %	161612733
8022	NC_010102	CAC	2	6	409690	409695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612733
8023	NC_010102	GCGGAG	2	12	409728	409739	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	161612733
8024	NC_010102	TGA	2	6	409741	409746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612733
8025	NC_010102	GCA	2	6	409869	409874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8026	NC_010102	ACAG	2	8	409886	409893	50 %	0 %	25 %	25 %	161612733
8027	NC_010102	GGC	2	6	409975	409980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8028	NC_010102	CAG	3	9	409984	409992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8029	NC_010102	CAA	2	6	410003	410008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612733
8030	NC_010102	GTT	2	6	410069	410074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612733
8031	NC_010102	GCG	2	6	410220	410225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8032	NC_010102	CGG	2	6	410226	410231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8033	NC_010102	GGC	2	6	410267	410272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8034	NC_010102	CCA	2	6	410334	410339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612733
8035	NC_010102	CGACGG	2	12	410347	410358	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161612733
8036	NC_010102	GCA	2	6	410466	410471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8037	NC_010102	GCA	2	6	410538	410543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8038	NC_010102	A	6	6	410562	410567	100 %	0 %	0 %	0 %	161612733
8039	NC_010102	CGTCAT	2	12	410601	410612	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161612733
8040	NC_010102	CT	3	6	410615	410620	0 %	50 %	0 %	50 %	161612733
8041	NC_010102	TAC	2	6	410665	410670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612733
8042	NC_010102	CGA	2	6	410680	410685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8043	NC_010102	CCAG	2	8	410688	410695	25 %	0 %	25 %	50 %	161612733
8044	NC_010102	GACC	2	8	410704	410711	25 %	0 %	25 %	50 %	161612733
8045	NC_010102	ACG	2	6	410736	410741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8046	NC_010102	GCT	2	6	410782	410787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8047	NC_010102	GCC	2	6	410873	410878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612733
8048	NC_010102	GGACG	2	10	410890	410899	20 %	0 %	60 %	20 %	161612733
8049	NC_010102	CGA	2	6	410941	410946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8050	NC_010102	GATC	2	8	410955	410962	25 %	25 %	25 %	25 %	161612733
8051	NC_010102	TGAT	2	8	410967	410974	25 %	50 %	25 %	0 %	161612733
8052	NC_010102	ATA	2	6	411078	411083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612733
8053	NC_010102	GC	4	8	411134	411141	0 %	0 %	50 %	50 %	161612733
8054	NC_010102	GCAG	2	8	411167	411174	25 %	0 %	50 %	25 %	161612733
8055	NC_010102	GCA	2	6	411231	411236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8056	NC_010102	CGG	2	6	411310	411315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8057	NC_010102	GCC	2	6	411323	411328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612733
8058	NC_010102	CGC	3	9	411334	411342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612733
8059	NC_010102	AAC	2	6	411410	411415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612733
8060	NC_010102	AAC	2	6	411476	411481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612733
8061	NC_010102	GCG	2	6	411486	411491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8062	NC_010102	CAC	2	6	411493	411498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612733
8063	NC_010102	CGG	2	6	411505	411510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8064	NC_010102	GCG	2	6	411546	411551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8065	NC_010102	ACA	2	6	411558	411563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612733
8066	NC_010102	GCG	2	6	411564	411569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8067	NC_010102	GCG	2	6	411657	411662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8068	NC_010102	ACA	2	6	411663	411668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612733
8069	NC_010102	GGC	2	6	411677	411682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8070	NC_010102	ACC	2	6	411683	411688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612733
8071	NC_010102	CGG	2	6	411694	411699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8072	NC_010102	GCG	2	6	411735	411740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8073	NC_010102	GCG	2	6	411753	411758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8074	NC_010102	GCG	2	6	411846	411851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
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8080	NC_010102	GGCGAG	2	12	411959	411970	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	161612733
8081	NC_010102	CGG	2	6	412054	412059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8082	NC_010102	CAC	2	6	412060	412065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612733
8083	NC_010102	GAC	2	6	412070	412075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
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8088	NC_010102	CGG	2	6	412261	412266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8089	NC_010102	GCC	2	6	412277	412282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612733
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8093	NC_010102	GGCGAG	2	12	412337	412348	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	161612733
8094	NC_010102	GCG	2	6	412413	412418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
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8103	NC_010102	GCA	2	6	412596	412601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
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8106	NC_010102	GGC	2	6	412706	412711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8107	NC_010102	ACAG	2	8	412742	412749	50 %	0 %	25 %	25 %	161612733
8108	NC_010102	CGA	2	6	412813	412818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
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8113	NC_010102	CGG	2	6	412990	412995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
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8119	NC_010102	ACG	2	6	413165	413170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
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8121	NC_010102	GCG	2	6	413262	413267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
8122	NC_010102	CGA	2	6	413268	413273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612733
8123	NC_010102	CGG	2	6	413386	413391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612733
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8125	NC_010102	GTC	2	6	413417	413422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612733
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8151	NC_010102	GC	3	6	414662	414667	0 %	0 %	50 %	50 %	161612733
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8242	NC_010102	CG	4	8	418899	418906	0 %	0 %	50 %	50 %	161612736
8243	NC_010102	GC	3	6	419049	419054	0 %	0 %	50 %	50 %	161612736
8244	NC_010102	GCT	2	6	419098	419103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612736
8245	NC_010102	TCCG	2	8	419143	419150	0 %	25 %	25 %	50 %	161612736
8246	NC_010102	GAA	2	6	419204	419209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612736
8247	NC_010102	ATC	2	6	419330	419335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612736
8248	NC_010102	GAC	2	6	419336	419341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612736
8249	NC_010102	GC	3	6	419348	419353	0 %	0 %	50 %	50 %	161612736
8250	NC_010102	CGA	2	6	419371	419376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612736
8251	NC_010102	TC	3	6	419392	419397	0 %	50 %	0 %	50 %	161612736
8252	NC_010102	CGG	2	6	419398	419403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612736
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8255	NC_010102	TCG	2	6	419469	419474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612736
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8257	NC_010102	GCTG	2	8	419584	419591	0 %	25 %	50 %	25 %	161612736
8258	NC_010102	ATC	2	6	419621	419626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612736
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8261	NC_010102	GCG	2	6	419726	419731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612736
8262	NC_010102	TCA	2	6	419754	419759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612736
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8264	NC_010102	CGG	2	6	419776	419781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612736
8265	NC_010102	GGGCC	2	10	419906	419915	0 %	0 %	60 %	40 %	161612736
8266	NC_010102	GTGAA	2	10	419934	419943	40 %	20 %	40 %	0 %	161612736
8267	NC_010102	CTG	2	6	419960	419965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612736
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8274	NC_010102	CGT	2	6	420641	420646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612737
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8282	NC_010102	TC	3	6	421108	421113	0 %	50 %	0 %	50 %	161612738
8283	NC_010102	GTG	2	6	421687	421692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612740
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8362	NC_010102	AGAC	2	8	425274	425281	50 %	0 %	25 %	25 %	161612743
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8485	NC_010102	CCG	2	6	431160	431165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612750
8486	NC_010102	TGT	2	6	431266	431271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612750
8487	NC_010102	CTG	2	6	431289	431294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612750
8488	NC_010102	TAC	2	6	431362	431367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612750
8489	NC_010102	TGT	2	6	431368	431373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612750
8490	NC_010102	TAT	2	6	431408	431413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612750
8491	NC_010102	GCG	2	6	431416	431421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612750
8492	NC_010102	TCTG	2	8	431428	431435	0 %	50 %	25 %	25 %	161612750
8493	NC_010102	A	6	6	431451	431456	100 %	0 %	0 %	0 %	161612750
8494	NC_010102	GGCT	2	8	431466	431473	0 %	25 %	50 %	25 %	161612750
8495	NC_010102	GATGT	2	10	431475	431484	20 %	40 %	40 %	0 %	161612750
8496	NC_010102	GCTG	2	8	431531	431538	0 %	25 %	50 %	25 %	161612750
8497	NC_010102	CGG	2	6	431545	431550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612750
8498	NC_010102	CTGC	2	8	431565	431572	0 %	25 %	25 %	50 %	161612750
8499	NC_010102	ATT	2	6	431601	431606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612750
8500	NC_010102	GGT	2	6	431726	431731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612750

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