MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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81002	NC_010102	TTA	2	6	4260134	4260139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617246
81003	NC_010102	GCCGC	2	10	4260169	4260178	0 %	0 %	40 %	60 %	161617246
81004	NC_010102	ACT	2	6	4260230	4260235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617246
81005	NC_010102	GCG	2	6	4260269	4260274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617246
81006	NC_010102	GCC	2	6	4260279	4260284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617246
81007	NC_010102	CGC	2	6	4260309	4260314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617246
81008	NC_010102	TGGT	2	8	4260320	4260327	0 %	50 %	50 %	0 %	161617246
81009	NC_010102	GC	3	6	4260398	4260403	0 %	0 %	50 %	50 %	161617246
81010	NC_010102	CG	3	6	4260451	4260456	0 %	0 %	50 %	50 %	161617246
81011	NC_010102	TTC	2	6	4260469	4260474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617246
81012	NC_010102	CCG	2	6	4260515	4260520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617246
81013	NC_010102	ATT	2	6	4260535	4260540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617246
81014	NC_010102	A	6	6	4260577	4260582	100 %	0 %	0 %	0 %	161617246
81015	NC_010102	GAT	2	6	4260643	4260648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617246
81016	NC_010102	TGG	2	6	4260668	4260673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617246
81017	NC_010102	CGAC	2	8	4260979	4260986	25 %	0 %	25 %	50 %	161617247
81018	NC_010102	G	7	7	4261031	4261037	0 %	0 %	100 %	0 %	161617247
81019	NC_010102	GCGCAG	2	12	4261048	4261059	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161617247
81020	NC_010102	CAGC	2	8	4261063	4261070	25 %	0 %	25 %	50 %	161617247
81021	NC_010102	TGG	2	6	4261077	4261082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617247
81022	NC_010102	ACT	2	6	4261180	4261185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617247
81023	NC_010102	GCT	2	6	4261211	4261216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617247
81024	NC_010102	GTG	2	6	4261232	4261237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617247
81025	NC_010102	CCG	2	6	4261240	4261245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617247
81026	NC_010102	GTTT	2	8	4261264	4261271	0 %	75 %	25 %	0 %	161617247
81027	NC_010102	GGC	2	6	4261323	4261328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617247
81028	NC_010102	CGT	2	6	4261398	4261403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617247
81029	NC_010102	TTG	2	6	4261404	4261409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617247
81030	NC_010102	GCG	2	6	4261675	4261680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617247
81031	NC_010102	GCC	3	9	4261692	4261700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617247
81032	NC_010102	ACG	2	6	4261735	4261740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617247
81033	NC_010102	GCGGCA	2	12	4261794	4261805	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161617247
81034	NC_010102	CAG	2	6	4261865	4261870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617247
81035	NC_010102	TTC	2	6	4261956	4261961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617247
81036	NC_010102	CAT	2	6	4262042	4262047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617247
81037	NC_010102	A	6	6	4262070	4262075	100 %	0 %	0 %	0 %	161617247
81038	NC_010102	CGT	2	6	4262142	4262147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617247
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81040	NC_010102	GCG	2	6	4262334	4262339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617247
81041	NC_010102	CGG	2	6	4262408	4262413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617247
81042	NC_010102	GGC	2	6	4262424	4262429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617247
81043	NC_010102	GC	3	6	4262437	4262442	0 %	0 %	50 %	50 %	161617247
81044	NC_010102	AGA	2	6	4262510	4262515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617247
81045	NC_010102	ACG	2	6	4262526	4262531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617247
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81047	NC_010102	GGCG	2	8	4262564	4262571	0 %	0 %	75 %	25 %	161617247
81048	NC_010102	GGC	2	6	4262588	4262593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617247
81049	NC_010102	GCT	2	6	4262595	4262600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617247
81050	NC_010102	GCCGG	2	10	4262630	4262639	0 %	0 %	60 %	40 %	161617247
81051	NC_010102	GCT	2	6	4262681	4262686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617247
81052	NC_010102	CGA	2	6	4262737	4262742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617247
81053	NC_010102	TTGA	2	8	4262754	4262761	25 %	50 %	25 %	0 %	161617247
81054	NC_010102	GCA	2	6	4262768	4262773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617247
81055	NC_010102	CTT	2	6	4262894	4262899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617247
81056	NC_010102	CTG	2	6	4262907	4262912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617247
81057	NC_010102	ACCG	2	8	4262933	4262940	25 %	0 %	25 %	50 %	161617247
81058	NC_010102	GC	4	8	4263041	4263048	0 %	0 %	50 %	50 %	161617247
81059	NC_010102	TCG	2	6	4263100	4263105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617247
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81062	NC_010102	ATA	2	6	4263254	4263259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617249
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81069	NC_010102	GCA	2	6	4263715	4263720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617249
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81077	NC_010102	A	6	6	4263898	4263903	100 %	0 %	0 %	0 %	161617248
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81099	NC_010102	GC	3	6	4264715	4264720	0 %	0 %	50 %	50 %	161617250
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81116	NC_010102	CTT	2	6	4265563	4265568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617251
81117	NC_010102	T	6	6	4265567	4265572	0 %	100 %	0 %	0 %	161617251
81118	NC_010102	CGG	2	6	4265599	4265604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617251
81119	NC_010102	CTT	2	6	4265656	4265661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617251
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81225	NC_010102	TAT	2	6	4270427	4270432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617256
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81230	NC_010102	GGC	2	6	4270718	4270723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617256
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81464	NC_010102	GCT	2	6	4281279	4281284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617265
81465	NC_010102	CGCAG	2	10	4281372	4281381	20 %	0 %	40 %	40 %	161617265
81466	NC_010102	CGG	2	6	4281405	4281410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617265
81467	NC_010102	TAAT	2	8	4281437	4281444	50 %	50 %	0 %	0 %	161617265
81468	NC_010102	CCA	2	6	4281446	4281451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617265
81469	NC_010102	GCG	2	6	4281461	4281466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617265
81470	NC_010102	TCA	2	6	4281540	4281545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617265
81471	NC_010102	CG	3	6	4281608	4281613	0 %	0 %	50 %	50 %	161617265
81472	NC_010102	GCC	2	6	4281635	4281640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617265
81473	NC_010102	CGT	2	6	4281747	4281752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617265
81474	NC_010102	TGG	2	6	4281806	4281811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617265
81475	NC_010102	TTG	2	6	4281826	4281831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617265
81476	NC_010102	GCG	2	6	4281841	4281846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617265
81477	NC_010102	ATG	2	6	4281914	4281919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617266
81478	NC_010102	ATTA	2	8	4281925	4281932	50 %	50 %	0 %	0 %	161617266
81479	NC_010102	CGG	3	9	4282039	4282047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617266
81480	NC_010102	GTG	2	6	4282052	4282057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617266
81481	NC_010102	TGA	2	6	4282065	4282070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617266
81482	NC_010102	AAAG	2	8	4282093	4282100	75 %	0 %	25 %	0 %	161617266
81483	NC_010102	CAT	2	6	4282135	4282140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617266
81484	NC_010102	GC	3	6	4282146	4282151	0 %	0 %	50 %	50 %	161617266
81485	NC_010102	CTG	2	6	4282175	4282180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617266
81486	NC_010102	GAA	2	6	4282189	4282194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617266
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81488	NC_010102	GGT	2	6	4282342	4282347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617266
81489	NC_010102	GAC	2	6	4282367	4282372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617266
81490	NC_010102	TGA	2	6	4282380	4282385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617266
81491	NC_010102	GGC	2	6	4282402	4282407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617266
81492	NC_010102	GGC	2	6	4282417	4282422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617266
81493	NC_010102	AGC	2	6	4282518	4282523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617266
81494	NC_010102	ATT	2	6	4282538	4282543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617266
81495	NC_010102	GAT	2	6	4282552	4282557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617266
81496	NC_010102	TGC	2	6	4282582	4282587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617266
81497	NC_010102	TAT	2	6	4282804	4282809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617267
81498	NC_010102	GGC	2	6	4282837	4282842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617267
81499	NC_010102	ACTG	2	8	4282954	4282961	25 %	25 %	25 %	25 %	161617267
81500	NC_010102	GAA	2	6	4282982	4282987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617267

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