MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
79001	NC_010102	CAG	2	6	4157681	4157686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617126
79002	NC_010102	CGC	2	6	4157736	4157741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617126
79003	NC_010102	TGG	2	6	4157757	4157762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617126
79004	NC_010102	GCA	2	6	4157863	4157868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617126
79005	NC_010102	CG	3	6	4157874	4157879	0 %	0 %	50 %	50 %	161617126
79006	NC_010102	GCGCT	2	10	4157903	4157912	0 %	20 %	40 %	40 %	161617127
79007	NC_010102	CCA	2	6	4157991	4157996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617127
79008	NC_010102	CA	3	6	4158003	4158008	50 %	0 %	0 %	50 %	161617127
79009	NC_010102	AGC	2	6	4158255	4158260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617128
79010	NC_010102	GGC	2	6	4158263	4158268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617128
79011	NC_010102	TGA	2	6	4158354	4158359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617128
79012	NC_010102	CGG	2	6	4158413	4158418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617128
79013	NC_010102	CCT	2	6	4158484	4158489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161617128
79014	NC_010102	CGG	2	6	4158493	4158498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617128
79015	NC_010102	TAA	2	6	4158590	4158595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617128
79016	NC_010102	GCG	2	6	4158621	4158626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617128
79017	NC_010102	A	6	6	4158633	4158638	100 %	0 %	0 %	0 %	161617128
79018	NC_010102	GC	3	6	4158641	4158646	0 %	0 %	50 %	50 %	161617128
79019	NC_010102	CGG	2	6	4158680	4158685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617128
79020	NC_010102	GTT	2	6	4158751	4158756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617128
79021	NC_010102	TGG	2	6	4158765	4158770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617128
79022	NC_010102	GGC	2	6	4158773	4158778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617128
79023	NC_010102	CAGC	2	8	4158838	4158845	25 %	0 %	25 %	50 %	161617128
79024	NC_010102	GCC	2	6	4158908	4158913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617128
79025	NC_010102	TCAA	2	8	4158993	4159000	50 %	25 %	0 %	25 %	161617128
79026	NC_010102	GCC	2	6	4159014	4159019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617128
79027	NC_010102	GAA	2	6	4159128	4159133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617128
79028	NC_010102	AAT	2	6	4159148	4159153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617128
79029	NC_010102	GGCG	2	8	4159172	4159179	0 %	0 %	75 %	25 %	161617128
79030	NC_010102	TGT	2	6	4159196	4159201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617128
79031	NC_010102	GCT	4	12	4159228	4159239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617128
79032	NC_010102	TCA	2	6	4159281	4159286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617128
79033	NC_010102	CTG	2	6	4159322	4159327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617128
79034	NC_010102	CGG	2	6	4159339	4159344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617128
79035	NC_010102	ATG	2	6	4159371	4159376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617128
79036	NC_010102	GTT	2	6	4159396	4159401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617128
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79038	NC_010102	GGT	2	6	4159514	4159519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617128
79039	NC_010102	ATC	3	9	4159574	4159582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617128
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79041	NC_010102	GATA	2	8	4159714	4159721	50 %	25 %	25 %	0 %	161617129
79042	NC_010102	GCC	2	6	4159735	4159740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617129
79043	NC_010102	GGA	2	6	4159787	4159792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161617129
79044	NC_010102	CGC	2	6	4159825	4159830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617129
79045	NC_010102	GGTACG	2	12	4159870	4159881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161617129
79046	NC_010102	CGC	2	6	4159893	4159898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617129
79047	NC_010102	CAG	2	6	4159939	4159944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617129
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79050	NC_010102	TGC	2	6	4160099	4160104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617129
79051	NC_010102	ATG	2	6	4160153	4160158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617129
79052	NC_010102	GCGCC	2	10	4160211	4160220	0 %	0 %	40 %	60 %	161617129
79053	NC_010102	GCC	2	6	4160227	4160232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617129
79054	NC_010102	GCG	2	6	4160279	4160284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617129
79055	NC_010102	TGC	2	6	4160288	4160293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617129
79056	NC_010102	TGC	2	6	4160297	4160302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617129
79057	NC_010102	GAC	2	6	4160319	4160324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617129
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79060	NC_010102	GCGA	2	8	4160400	4160407	25 %	0 %	50 %	25 %	161617129
79061	NC_010102	ATCA	2	8	4160410	4160417	50 %	25 %	0 %	25 %	161617129
79062	NC_010102	CTG	2	6	4160554	4160559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617129
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79089	NC_010102	CG	3	6	4161998	4162003	0 %	0 %	50 %	50 %	161617130
79090	NC_010102	GAA	2	6	4162109	4162114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617130
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79099	NC_010102	CG	3	6	4162825	4162830	0 %	0 %	50 %	50 %	161617132
79100	NC_010102	GGT	2	6	4162970	4162975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617132
79101	NC_010102	TGC	2	6	4163010	4163015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617132
79102	NC_010102	TGG	2	6	4163016	4163021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161617132
79103	NC_010102	A	6	6	4163066	4163071	100 %	0 %	0 %	0 %	161617132
79104	NC_010102	CAA	2	6	4163107	4163112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617132
79105	NC_010102	GC	3	6	4163127	4163132	0 %	0 %	50 %	50 %	161617132
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79108	NC_010102	CGAC	2	8	4163184	4163191	25 %	0 %	25 %	50 %	161617132
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79114	NC_010102	ATC	2	6	4163441	4163446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617132
79115	NC_010102	TGA	2	6	4163632	4163637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617132
79116	NC_010102	TTC	2	6	4163654	4163659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161617132
79117	NC_010102	AAG	2	6	4163688	4163693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617132
79118	NC_010102	GAA	2	6	4163768	4163773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617132
79119	NC_010102	GATGCG	2	12	4163780	4163791	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161617132
79120	NC_010102	CGT	2	6	4163846	4163851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617132
79121	NC_010102	AGC	2	6	4163952	4163957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617132
79122	NC_010102	CATGAC	2	12	4164091	4164102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161617132
79123	NC_010102	CTG	2	6	4164116	4164121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617132
79124	NC_010102	ACG	2	6	4164141	4164146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617132
79125	NC_010102	ATT	2	6	4164293	4164298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617132
79126	NC_010102	TGCG	2	8	4164363	4164370	0 %	25 %	50 %	25 %	161617132
79127	NC_010102	TGA	2	6	4164442	4164447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617132
79128	NC_010102	CGA	2	6	4164448	4164453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617132
79129	NC_010102	TATCCG	2	12	4164478	4164489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161617132
79130	NC_010102	CGC	2	6	4164515	4164520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617132
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79140	NC_010102	TAC	2	6	4165099	4165104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617134
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79142	NC_010102	ATT	2	6	4165244	4165249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617134
79143	NC_010102	GCC	2	6	4165322	4165327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617134
79144	NC_010102	TTA	2	6	4165348	4165353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617134
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79148	NC_010102	GCC	2	6	4165662	4165667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617134
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79151	NC_010102	TAT	2	6	4165730	4165735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617135
79152	NC_010102	TTTC	2	8	4165761	4165768	0 %	75 %	0 %	25 %	161617135
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79465	NC_010102	GAG	3	9	4180708	4180716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161617149
79466	NC_010102	ACT	2	6	4180733	4180738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617150
79467	NC_010102	CTG	2	6	4180751	4180756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617150
79468	NC_010102	CTG	2	6	4180865	4180870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617150
79469	NC_010102	GTTG	2	8	4180937	4180944	0 %	50 %	50 %	0 %	161617150
79470	NC_010102	TCG	2	6	4181023	4181028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617150
79471	NC_010102	T	6	6	4181140	4181145	0 %	100 %	0 %	0 %	161617150
79472	NC_010102	CATC	2	8	4181156	4181163	25 %	25 %	0 %	50 %	161617150
79473	NC_010102	TTA	2	6	4181184	4181189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161617151
79474	NC_010102	ATCA	2	8	4181306	4181313	50 %	25 %	0 %	25 %	161617151
79475	NC_010102	CCA	2	6	4181315	4181320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161617151
79476	NC_010102	T	7	7	4181389	4181395	0 %	100 %	0 %	0 %	161617151
79477	NC_010102	ACA	2	6	4181602	4181607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161617152
79478	NC_010102	GCC	2	6	4181638	4181643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617152
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79480	NC_010102	AGC	2	6	4181881	4181886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617152
79481	NC_010102	GGC	2	6	4181997	4182002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617152
79482	NC_010102	CCG	2	6	4182244	4182249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617152
79483	NC_010102	AGC	2	6	4182257	4182262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161617152
79484	NC_010102	ATA	2	6	4182270	4182275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161617152
79485	NC_010102	ATG	2	6	4182277	4182282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617152
79486	NC_010102	GCG	2	6	4182308	4182313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161617152
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79488	NC_010102	CGT	2	6	4182387	4182392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161617152
79489	NC_010102	GCCC	2	8	4182405	4182412	0 %	0 %	25 %	75 %	161617152
79490	NC_010102	TCA	2	6	4182418	4182423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161617152
79491	NC_010102	AGA	2	6	4182438	4182443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161617152
79492	NC_010102	CGC	2	6	4182453	4182458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161617152
79493	NC_010102	TCC	2	6	4182466	4182471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161617152
79494	NC_010102	AAAAAT	2	12	4182607	4182618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	161617153
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79496	NC_010102	TGT	2	6	4182659	4182664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161617153
79497	NC_010102	ATG	2	6	4182708	4182713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617154
79498	NC_010102	GGAT	2	8	4182718	4182725	25 %	25 %	50 %	0 %	161617154
79499	NC_010102	GCAAC	2	10	4182788	4182797	40 %	0 %	20 %	40 %	161617154
79500	NC_010102	AATGGT	2	12	4182943	4182954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161617154

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