MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_010102	CTGC	2	8	3950170	3950177	0 %	25 %	25 %	50 %	161616906
75003	NC_010102	GTG	2	6	3950186	3950191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161616906
75004	NC_010102	ATA	2	6	3950194	3950199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161616906
75005	NC_010102	TGA	2	6	3950204	3950209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161616906
75006	NC_010102	CGCCA	2	10	3950290	3950299	20 %	0 %	20 %	60 %	161616906
75007	NC_010102	TGC	2	6	3950381	3950386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616906
75008	NC_010102	CTGT	2	8	3950431	3950438	0 %	50 %	25 %	25 %	161616906
75009	NC_010102	ACG	2	6	3950491	3950496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616906
75010	NC_010102	A	6	6	3950540	3950545	100 %	0 %	0 %	0 %	161616906
75011	NC_010102	ATAG	2	8	3950581	3950588	50 %	25 %	25 %	0 %	161616906
75012	NC_010102	GA	3	6	3950644	3950649	50 %	0 %	50 %	0 %	161616906
75013	NC_010102	CCAG	2	8	3950691	3950698	25 %	0 %	25 %	50 %	161616906
75014	NC_010102	CGA	2	6	3950791	3950796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616906
75015	NC_010102	TTGA	2	8	3950890	3950897	25 %	50 %	25 %	0 %	161616906
75016	NC_010102	GCC	2	6	3950939	3950944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616906
75017	NC_010102	A	7	7	3951081	3951087	100 %	0 %	0 %	0 %	161616907
75018	NC_010102	A	6	6	3951095	3951100	100 %	0 %	0 %	0 %	161616907
75019	NC_010102	GCT	2	6	3951300	3951305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616908
75020	NC_010102	GAT	2	6	3951396	3951401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161616908
75021	NC_010102	GCC	2	6	3951469	3951474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616908
75022	NC_010102	ATG	2	6	3951505	3951510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161616908
75023	NC_010102	CGGCG	2	10	3951519	3951528	0 %	0 %	60 %	40 %	161616908
75024	NC_010102	CT	3	6	3951565	3951570	0 %	50 %	0 %	50 %	161616908
75025	NC_010102	TGG	2	6	3951590	3951595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161616908
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75031	NC_010102	CGG	2	6	3951846	3951851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161616908
75032	NC_010102	GC	3	6	3951927	3951932	0 %	0 %	50 %	50 %	161616908
75033	NC_010102	CTG	2	6	3951976	3951981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616908
75034	NC_010102	CTGAA	2	10	3952013	3952022	40 %	20 %	20 %	20 %	161616908
75035	NC_010102	GCT	2	6	3952050	3952055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616908
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75037	NC_010102	CTG	2	6	3952195	3952200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616908
75038	NC_010102	GCGG	2	8	3952210	3952217	0 %	0 %	75 %	25 %	161616908
75039	NC_010102	ATATGC	2	12	3952280	3952291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161616908
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75042	NC_010102	GAT	2	6	3952359	3952364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161616908
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75044	NC_010102	TGC	2	6	3952391	3952396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616908
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75051	NC_010102	ATC	2	6	3952600	3952605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161616908
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75054	NC_010102	CGC	2	6	3952769	3952774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616909
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75056	NC_010102	CCGCTG	2	12	3952828	3952839	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	161616909
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75233	NC_010102	GCA	2	6	3961388	3961393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616927
75234	NC_010102	CGC	2	6	3961400	3961405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616927
75235	NC_010102	TCC	2	6	3961414	3961419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161616927
75236	NC_010102	AGCC	2	8	3961558	3961565	25 %	0 %	25 %	50 %	161616927
75237	NC_010102	CAT	2	6	3961580	3961585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161616927
75238	NC_010102	TCC	2	6	3961627	3961632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161616927
75239	NC_010102	CAG	2	6	3961671	3961676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616927
75240	NC_010102	CTG	2	6	3961698	3961703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616927
75241	NC_010102	GGC	2	6	3961749	3961754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161616927
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75249	NC_010102	GCA	2	6	3961913	3961918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616927
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75254	NC_010102	GGC	2	6	3962006	3962011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161616927
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75332	NC_010102	CAG	3	9	3964435	3964443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616929
75333	NC_010102	C	6	6	3964458	3964463	0 %	0 %	0 %	100 %	161616929
75334	NC_010102	GGC	2	6	3964468	3964473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161616929
75335	NC_010102	CGCC	2	8	3964572	3964579	0 %	0 %	25 %	75 %	161616929
75336	NC_010102	CAG	2	6	3964591	3964596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616929
75337	NC_010102	CAT	2	6	3964621	3964626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161616929
75338	NC_010102	CG	3	6	3964628	3964633	0 %	0 %	50 %	50 %	161616929
75339	NC_010102	CGC	2	6	3964635	3964640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616929
75340	NC_010102	GC	3	6	3964639	3964644	0 %	0 %	50 %	50 %	161616929
75341	NC_010102	CAG	3	9	3964669	3964677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616929
75342	NC_010102	CAG	2	6	3964699	3964704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616929
75343	NC_010102	CAT	2	6	3964723	3964728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161616929
75344	NC_010102	GCGG	2	8	3964754	3964761	0 %	0 %	75 %	25 %	161616930
75345	NC_010102	GGT	2	6	3964763	3964768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161616930
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75347	NC_010102	CAC	3	9	3964872	3964880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161616930
75348	NC_010102	TCACCG	2	12	3964925	3964936	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161616930
75349	NC_010102	CGT	2	6	3964946	3964951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616930
75350	NC_010102	CCG	2	6	3965014	3965019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616930
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75359	NC_010102	CGC	2	6	3965266	3965271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616931
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75374	NC_010102	GTC	2	6	3965695	3965700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616932
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75456	NC_010102	TAT	2	6	3968734	3968739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161616935
75457	NC_010102	T	7	7	3968770	3968776	0 %	100 %	0 %	0 %	161616935
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75462	NC_010102	CAA	2	6	3969079	3969084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161616936
75463	NC_010102	TCA	2	6	3969105	3969110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161616936
75464	NC_010102	ACGA	2	8	3969113	3969120	50 %	0 %	25 %	25 %	161616936
75465	NC_010102	CAA	2	6	3969125	3969130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161616936
75466	NC_010102	GCA	2	6	3969144	3969149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616936
75467	NC_010102	ATT	2	6	3969179	3969184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161616936
75468	NC_010102	GAC	2	6	3969213	3969218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161616936
75469	NC_010102	ATTC	2	8	3969239	3969246	25 %	50 %	0 %	25 %	161616936
75470	NC_010102	GTT	2	6	3969250	3969255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161616936
75471	NC_010102	GGT	2	6	3969313	3969318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161616936
75472	NC_010102	CGGC	2	8	3969319	3969326	0 %	0 %	50 %	50 %	161616936
75473	NC_010102	TCG	2	6	3969336	3969341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616936
75474	NC_010102	CTG	2	6	3969392	3969397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616936
75475	NC_010102	T	6	6	3969428	3969433	0 %	100 %	0 %	0 %	161616936
75476	NC_010102	TCA	2	6	3969439	3969444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161616936
75477	NC_010102	T	6	6	3969511	3969516	0 %	100 %	0 %	0 %	161616936
75478	NC_010102	CGC	2	6	3969536	3969541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616936
75479	NC_010102	GCCA	2	8	3969567	3969574	25 %	0 %	25 %	50 %	161616936
75480	NC_010102	TCA	2	6	3969612	3969617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161616936
75481	NC_010102	GCCA	2	8	3969642	3969649	25 %	0 %	25 %	50 %	161616936
75482	NC_010102	GCTG	2	8	3969684	3969691	0 %	25 %	50 %	25 %	161616936
75483	NC_010102	GACCG	2	10	3969750	3969759	20 %	0 %	40 %	40 %	161616937
75484	NC_010102	CCA	2	6	3969806	3969811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161616937
75485	NC_010102	CGT	2	6	3969813	3969818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616937
75486	NC_010102	GC	3	6	3969821	3969826	0 %	0 %	50 %	50 %	161616937
75487	NC_010102	CGC	2	6	3969908	3969913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616937
75488	NC_010102	CG	4	8	3970046	3970053	0 %	0 %	50 %	50 %	161616937
75489	NC_010102	TAA	2	6	3970070	3970075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161616937
75490	NC_010102	GCC	2	6	3970089	3970094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161616937
75491	NC_010102	T	6	6	3970220	3970225	0 %	100 %	0 %	0 %	161616937
75492	NC_010102	TCG	2	6	3970252	3970257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616937
75493	NC_010102	GAT	2	6	3970370	3970375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161616937
75494	NC_010102	CTG	2	6	3970446	3970451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161616937
75495	NC_010102	CAGC	2	8	3970476	3970483	25 %	0 %	25 %	50 %	161616937
75496	NC_010102	TCA	2	6	3970489	3970494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161616937
75497	NC_010102	GCG	2	6	3970577	3970582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161616937
75498	NC_010102	ACC	2	6	3970585	3970590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161616937
75499	NC_010102	GGT	2	6	3970659	3970664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161616937
75500	NC_010102	TTG	2	6	3970767	3970772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161616937

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