MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010102	CAGA	2	8	335197	335204	50 %	0 %	25 %	25 %	161612666
6502	NC_010102	CTG	2	6	335608	335613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612667
6503	NC_010102	CTGGC	2	10	335626	335635	0 %	20 %	40 %	40 %	161612667
6504	NC_010102	GCA	2	6	335687	335692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612667
6505	NC_010102	GAT	2	6	335860	335865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612667
6506	NC_010102	AGCGGC	2	12	335937	335948	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161612667
6507	NC_010102	CG	3	6	335949	335954	0 %	0 %	50 %	50 %	161612667
6508	NC_010102	CG	3	6	336017	336022	0 %	0 %	50 %	50 %	161612667
6509	NC_010102	GCA	2	6	336024	336029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612667
6510	NC_010102	ACA	2	6	336033	336038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612667
6511	NC_010102	GAT	2	6	336159	336164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612667
6512	NC_010102	TGAG	2	8	336257	336264	25 %	25 %	50 %	0 %	161612667
6513	NC_010102	GCT	2	6	336360	336365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612667
6514	NC_010102	GGT	2	6	336375	336380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612667
6515	NC_010102	GGT	2	6	336408	336413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612667
6516	NC_010102	GCA	2	6	336428	336433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612667
6517	NC_010102	ATTG	2	8	336450	336457	25 %	50 %	25 %	0 %	161612667
6518	NC_010102	CGC	2	6	336524	336529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612667
6519	NC_010102	TGG	2	6	336539	336544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612667
6520	NC_010102	TGCC	2	8	336560	336567	0 %	25 %	25 %	50 %	161612667
6521	NC_010102	ATG	2	6	336577	336582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612667
6522	NC_010102	TGA	2	6	336635	336640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612667
6523	NC_010102	GCG	2	6	336752	336757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612667
6524	NC_010102	T	6	6	336798	336803	0 %	100 %	0 %	0 %	161612667
6525	NC_010102	CCA	2	6	336813	336818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612667
6526	NC_010102	TCG	2	6	336876	336881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612667
6527	NC_010102	GA	3	6	336890	336895	50 %	0 %	50 %	0 %	161612667
6528	NC_010102	TGG	2	6	336902	336907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612667
6529	NC_010102	GTTT	2	8	336925	336932	0 %	75 %	25 %	0 %	161612667
6530	NC_010102	AGCGC	2	10	337115	337124	20 %	0 %	40 %	40 %	161612668
6531	NC_010102	CG	3	6	337272	337277	0 %	0 %	50 %	50 %	161612668
6532	NC_010102	GC	4	8	337283	337290	0 %	0 %	50 %	50 %	161612668
6533	NC_010102	GAT	2	6	337298	337303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612668
6534	NC_010102	CGC	2	6	337356	337361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612668
6535	NC_010102	GCG	2	6	337366	337371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612668
6536	NC_010102	GC	3	6	337401	337406	0 %	0 %	50 %	50 %	161612668
6537	NC_010102	TGCGC	2	10	337531	337540	0 %	20 %	40 %	40 %	161612668
6538	NC_010102	CAG	2	6	337541	337546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612668
6539	NC_010102	ACC	2	6	337577	337582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612668
6540	NC_010102	CGC	2	6	337659	337664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612668
6541	NC_010102	GGCGC	2	10	337697	337706	0 %	0 %	60 %	40 %	161612668
6542	NC_010102	CTG	3	9	337759	337767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612669
6543	NC_010102	CGT	2	6	337830	337835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612669
6544	NC_010102	AG	3	6	337842	337847	50 %	0 %	50 %	0 %	161612669
6545	NC_010102	AGGA	2	8	337853	337860	50 %	0 %	50 %	0 %	161612669
6546	NC_010102	TAA	2	6	337895	337900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612669
6547	NC_010102	ATGG	2	8	337921	337928	25 %	25 %	50 %	0 %	161612669
6548	NC_010102	TA	3	6	338075	338080	50 %	50 %	0 %	0 %	161612669
6549	NC_010102	GACG	2	8	338118	338125	25 %	0 %	50 %	25 %	161612669
6550	NC_010102	TGC	2	6	338165	338170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612669
6551	NC_010102	GC	3	6	338185	338190	0 %	0 %	50 %	50 %	161612669
6552	NC_010102	GCG	2	6	338315	338320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612669
6553	NC_010102	ATT	2	6	338349	338354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612669
6554	NC_010102	GC	3	6	338362	338367	0 %	0 %	50 %	50 %	161612669
6555	NC_010102	GTT	2	6	338403	338408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612669
6556	NC_010102	GGC	2	6	338412	338417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612669
6557	NC_010102	GGC	2	6	338422	338427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612669
6558	NC_010102	GCT	2	6	338478	338483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612669
6559	NC_010102	GCA	2	6	338519	338524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612669
6560	NC_010102	ATT	2	6	338551	338556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612669
6561	NC_010102	TAC	2	6	338617	338622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612669
6562	NC_010102	GCT	2	6	338682	338687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612669
6563	NC_010102	ATC	2	6	338693	338698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612669
6564	NC_010102	TGA	2	6	338768	338773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612669
6565	NC_010102	TGAAC	2	10	338931	338940	40 %	20 %	20 %	20 %	161612669
6566	NC_010102	ACGC	2	8	338980	338987	25 %	0 %	25 %	50 %	161612669
6567	NC_010102	AGT	2	6	339068	339073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612669
6568	NC_010102	ATT	2	6	339167	339172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612670
6569	NC_010102	AGGT	2	8	339213	339220	25 %	25 %	50 %	0 %	161612670
6570	NC_010102	CGCGG	2	10	339287	339296	0 %	0 %	60 %	40 %	161612670
6571	NC_010102	AT	3	6	339298	339303	50 %	50 %	0 %	0 %	161612670
6572	NC_010102	GAC	2	6	339347	339352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612670
6573	NC_010102	CAT	2	6	339376	339381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612670
6574	NC_010102	TCTTTG	2	12	339420	339431	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161612670
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6576	NC_010102	GAC	2	6	339470	339475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612670
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6579	NC_010102	CCG	2	6	339667	339672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612671
6580	NC_010102	CGA	2	6	339706	339711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612671
6581	NC_010102	GCCA	3	12	339713	339724	25 %	0 %	25 %	50 %	161612671
6582	NC_010102	CAGG	2	8	339781	339788	25 %	0 %	50 %	25 %	161612671
6583	NC_010102	ATC	2	6	339864	339869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612671
6584	NC_010102	TGCC	2	8	339881	339888	0 %	25 %	25 %	50 %	161612671
6585	NC_010102	CAG	2	6	339920	339925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612671
6586	NC_010102	CCG	2	6	339933	339938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612671
6587	NC_010102	GCA	2	6	339979	339984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612671
6588	NC_010102	CT	3	6	339996	340001	0 %	50 %	0 %	50 %	161612671
6589	NC_010102	GCT	2	6	340007	340012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612671
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6591	NC_010102	CGC	2	6	340034	340039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612671
6592	NC_010102	CTG	2	6	340148	340153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612671
6593	NC_010102	AG	3	6	340168	340173	50 %	0 %	50 %	0 %	161612671
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6597	NC_010102	CCGC	2	8	340384	340391	0 %	0 %	25 %	75 %	161612671
6598	NC_010102	CTG	2	6	340418	340423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612671
6599	NC_010102	CGCC	2	8	340474	340481	0 %	0 %	25 %	75 %	161612671
6600	NC_010102	GCCA	2	8	340498	340505	25 %	0 %	25 %	50 %	161612671
6601	NC_010102	GCC	2	6	340515	340520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612671
6602	NC_010102	CGG	2	6	340561	340566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612671
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6604	NC_010102	CGG	2	6	340593	340598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612671
6605	NC_010102	TCA	2	6	340602	340607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612671
6606	NC_010102	CAG	2	6	340625	340630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612671
6607	NC_010102	ATA	2	6	340668	340673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612671
6608	NC_010102	TCA	2	6	340741	340746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612671
6609	NC_010102	AGCC	2	8	340797	340804	25 %	0 %	25 %	50 %	161612671
6610	NC_010102	TGG	2	6	340884	340889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612671
6611	NC_010102	A	6	6	340963	340968	100 %	0 %	0 %	0 %	161612671
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6620	NC_010102	GAACAG	2	12	341586	341597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	161612672
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6622	NC_010102	GAT	2	6	341625	341630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612672
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6857	NC_010102	CTGG	2	8	353267	353274	0 %	25 %	50 %	25 %	161612683
6858	NC_010102	TGCTG	2	10	353314	353323	0 %	40 %	40 %	20 %	161612683
6859	NC_010102	CG	3	6	353343	353348	0 %	0 %	50 %	50 %	161612683
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6985	NC_010102	GGC	2	6	360237	360242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612692
6986	NC_010102	GTC	2	6	360263	360268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612692
6987	NC_010102	A	6	6	360284	360289	100 %	0 %	0 %	0 %	161612692
6988	NC_010102	ACT	2	6	360415	360420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612693
6989	NC_010102	ATG	2	6	360459	360464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612693
6990	NC_010102	A	6	6	360666	360671	100 %	0 %	0 %	0 %	161612693
6991	NC_010102	CAT	2	6	360680	360685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612693
6992	NC_010102	ACCT	2	8	360756	360763	25 %	25 %	0 %	50 %	161612693
6993	NC_010102	CAT	2	6	360782	360787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612693
6994	NC_010102	AGC	2	6	360806	360811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612693
6995	NC_010102	GAC	2	6	360819	360824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612693
6996	NC_010102	CAT	2	6	360839	360844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612693
6997	NC_010102	AAC	2	6	360852	360857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612693
6998	NC_010102	GTG	2	6	360867	360872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612693
6999	NC_010102	CG	5	10	360903	360912	0 %	0 %	50 %	50 %	161612693
7000	NC_010102	ATC	2	6	360915	360920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612693

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