MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 54239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_010079	TCA	2	6	2331323	2331328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510400
44003	NC_010079	ATA	2	6	2331481	2331486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510400
44004	NC_010079	TAA	2	6	2331544	2331549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510400
44005	NC_010079	TAA	2	6	2331564	2331569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510400
44006	NC_010079	TGTT	2	8	2331619	2331626	0 %	75 %	25 %	0 %	161510400
44007	NC_010079	ATGC	2	8	2331681	2331688	25 %	25 %	25 %	25 %	161510400
44008	NC_010079	T	6	6	2331709	2331714	0 %	100 %	0 %	0 %	161510400
44009	NC_010079	ACC	2	6	2331808	2331813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161510400
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44011	NC_010079	CAT	2	6	2331846	2331851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510400
44012	NC_010079	GGAT	2	8	2331889	2331896	25 %	25 %	50 %	0 %	161510400
44013	NC_010079	GTTAAA	2	12	2331902	2331913	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161510400
44014	NC_010079	TCA	2	6	2331971	2331976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510401
44015	NC_010079	T	6	6	2332039	2332044	0 %	100 %	0 %	0 %	161510401
44016	NC_010079	TAA	2	6	2332074	2332079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510401
44017	NC_010079	ATA	2	6	2332088	2332093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510401
44018	NC_010079	TAA	2	6	2332102	2332107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510401
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44021	NC_010079	TTTA	2	8	2332216	2332223	25 %	75 %	0 %	0 %	161510401
44022	NC_010079	AAC	2	6	2332285	2332290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161510401
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44024	NC_010079	TTA	2	6	2332472	2332477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161510402
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44028	NC_010079	AT	3	6	2332616	2332621	50 %	50 %	0 %	0 %	161510402
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44031	NC_010079	CAA	2	6	2332767	2332772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161510402
44032	NC_010079	CAA	2	6	2332800	2332805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161510402
44033	NC_010079	CAT	2	6	2332806	2332811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510402
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44035	NC_010079	TGA	2	6	2332836	2332841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510402
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44037	NC_010079	AAT	3	9	2332876	2332884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510402
44038	NC_010079	ATA	2	6	2332889	2332894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510402
44039	NC_010079	ACT	2	6	2333265	2333270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510403
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44041	NC_010079	TCTTCA	2	12	2333301	2333312	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161510403
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44047	NC_010079	TAC	2	6	2333488	2333493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510403
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44052	NC_010079	CTT	2	6	2333680	2333685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510403
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44469	NC_010079	CTG	2	6	2355722	2355727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510425
44470	NC_010079	TCA	2	6	2355733	2355738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510425
44471	NC_010079	ATA	2	6	2355745	2355750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510425
44472	NC_010079	AAT	2	6	2355949	2355954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510425
44473	NC_010079	AT	3	6	2356006	2356011	50 %	50 %	0 %	0 %	161510425
44474	NC_010079	TCA	2	6	2356042	2356047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510425
44475	NC_010079	AGT	2	6	2356062	2356067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510425
44476	NC_010079	CAT	2	6	2356169	2356174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510425
44477	NC_010079	CCA	2	6	2356252	2356257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161510426
44478	NC_010079	ATG	2	6	2356276	2356281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510426
44479	NC_010079	ATTT	2	8	2356301	2356308	25 %	75 %	0 %	0 %	161510426
44480	NC_010079	CTT	2	6	2356381	2356386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510426
44481	NC_010079	GCT	2	6	2356603	2356608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510426
44482	NC_010079	C	6	6	2356614	2356619	0 %	0 %	0 %	100 %	161510426
44483	NC_010079	CAA	2	6	2356759	2356764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161510426
44484	NC_010079	ATC	2	6	2356823	2356828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510426
44485	NC_010079	ATT	2	6	2356841	2356846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161510426
44486	NC_010079	A	6	6	2356849	2356854	100 %	0 %	0 %	0 %	161510426
44487	NC_010079	CAA	2	6	2356927	2356932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161510426
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44489	NC_010079	TCC	2	6	2357043	2357048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161510426
44490	NC_010079	CGA	2	6	2357628	2357633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161510427
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44492	NC_010079	AAT	2	6	2357700	2357705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510427
44493	NC_010079	ACG	2	6	2357777	2357782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161510427
44494	NC_010079	T	6	6	2357798	2357803	0 %	100 %	0 %	0 %	161510427
44495	NC_010079	CAA	2	6	2357824	2357829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161510427
44496	NC_010079	CTT	2	6	2357839	2357844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510427
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44499	NC_010079	TAATCC	2	12	2357988	2357999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510428
44500	NC_010079	TCT	2	6	2358004	2358009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510428

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