MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 54239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_010079	CAT	2	6	2808616	2808621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510857
53003	NC_010079	TAA	2	6	2808652	2808657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510858
53004	NC_010079	AAATA	2	10	2808723	2808732	80 %	20 %	0 %	0 %	161510858
53005	NC_010079	AAT	3	9	2808733	2808741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510858
53006	NC_010079	CAT	2	6	2808748	2808753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510858
53007	NC_010079	TCA	2	6	2808759	2808764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510858
53008	NC_010079	TGTT	2	8	2808809	2808816	0 %	75 %	25 %	0 %	161510858
53009	NC_010079	ACA	2	6	2808921	2808926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161510858
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53011	NC_010079	ATA	2	6	2809090	2809095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510858
53012	NC_010079	TAA	2	6	2809107	2809112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510858
53013	NC_010079	CAT	2	6	2809145	2809150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510858
53014	NC_010079	TTG	2	6	2809151	2809156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510858
53015	NC_010079	ACT	2	6	2809214	2809219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510858
53016	NC_010079	TGA	2	6	2809290	2809295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510858
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53019	NC_010079	ATC	2	6	2809481	2809486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510858
53020	NC_010079	TGT	2	6	2809497	2809502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510858
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53022	NC_010079	TGTT	2	8	2809556	2809563	0 %	75 %	25 %	0 %	161510858
53023	NC_010079	AAG	2	6	2809660	2809665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161510858
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53031	NC_010079	TAA	2	6	2809829	2809834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510858
53032	NC_010079	GT	3	6	2809840	2809845	0 %	50 %	50 %	0 %	161510858
53033	NC_010079	CAT	2	6	2809858	2809863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510858
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53042	NC_010079	ACAA	2	8	2810308	2810315	75 %	0 %	0 %	25 %	161510859
53043	NC_010079	AAT	2	6	2810337	2810342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161510859
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53115	NC_010079	TTG	2	6	2814029	2814034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510860
53116	NC_010079	ATG	3	9	2814047	2814055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510860
53117	NC_010079	TTG	2	6	2814089	2814094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510860
53118	NC_010079	ATG	2	6	2814164	2814169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510860
53119	NC_010079	GTACTT	2	12	2814205	2814216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161510860
53120	NC_010079	TTGA	2	8	2814224	2814231	25 %	50 %	25 %	0 %	161510860
53121	NC_010079	TGA	2	6	2814276	2814281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510860
53122	NC_010079	TTCACT	2	12	2814294	2814305	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161510860
53123	NC_010079	ATG	2	6	2814320	2814325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510860
53124	NC_010079	ATG	2	6	2814428	2814433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510860
53125	NC_010079	ACGTTG	2	12	2814509	2814520	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161510860
53126	NC_010079	TAC	2	6	2814554	2814559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510860
53127	NC_010079	TTG	2	6	2814563	2814568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510860
53128	NC_010079	ATG	2	6	2814578	2814583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510860
53129	NC_010079	ACT	2	6	2814642	2814647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510860
53130	NC_010079	CT	3	6	2814766	2814771	0 %	50 %	0 %	50 %	161510860
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53133	NC_010079	GTAC	2	8	2815081	2815088	25 %	25 %	25 %	25 %	161510860
53134	NC_010079	TTG	2	6	2815115	2815120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510860
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53140	NC_010079	TGC	2	6	2815350	2815355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510860
53141	NC_010079	TCG	2	6	2815391	2815396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510860
53142	NC_010079	TTG	2	6	2815481	2815486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161510860
53143	NC_010079	GCTAT	2	10	2815504	2815513	20 %	40 %	20 %	20 %	161510860
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53145	NC_010079	ATG	2	6	2815598	2815603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510860
53146	NC_010079	GAC	2	6	2815615	2815620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161510860
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53149	NC_010079	ATG	2	6	2815784	2815789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510860
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53207	NC_010079	AACC	2	8	2819312	2819319	50 %	0 %	0 %	50 %	161510861
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53216	NC_010079	TCAA	2	8	2819970	2819977	50 %	25 %	0 %	25 %	161510862
53217	NC_010079	A	7	7	2820015	2820021	100 %	0 %	0 %	0 %	161510862
53218	NC_010079	TTA	2	6	2820043	2820048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161510862
53219	NC_010079	A	7	7	2820057	2820063	100 %	0 %	0 %	0 %	161510862
53220	NC_010079	A	6	6	2820076	2820081	100 %	0 %	0 %	0 %	161510862
53221	NC_010079	GAT	2	6	2820161	2820166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510862
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53226	NC_010079	A	6	6	2820497	2820502	100 %	0 %	0 %	0 %	161510863
53227	NC_010079	AAG	2	6	2820772	2820777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161510864
53228	NC_010079	ACT	2	6	2820858	2820863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510864
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53230	NC_010079	AGCT	2	8	2820878	2820885	25 %	25 %	25 %	25 %	161510864
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53465	NC_010079	T	6	6	2832329	2832334	0 %	100 %	0 %	0 %	161510877
53466	NC_010079	ATC	2	6	2832335	2832340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510877
53467	NC_010079	ATC	2	6	2832362	2832367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161510877
53468	NC_010079	GAT	2	6	2832376	2832381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161510877
53469	NC_010079	TCT	2	6	2832384	2832389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510877
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53471	NC_010079	TCC	2	6	2832522	2832527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161510877
53472	NC_010079	GCT	2	6	2832558	2832563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161510877
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53483	NC_010079	T	6	6	2833910	2833915	0 %	100 %	0 %	0 %	161510879
53484	NC_010079	CTT	2	6	2833951	2833956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510879
53485	NC_010079	T	7	7	2833964	2833970	0 %	100 %	0 %	0 %	161510879
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53491	NC_010079	CTT	2	6	2834284	2834289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161510879
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