MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome

Total Repeats: 77137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009901	CAA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959831
2	NC_009901	CT	3	6	271	276	0 %	50 %	0 %	50 %	157959831
3	NC_009901	GTTTT	2	10	356	365	0 %	80 %	20 %	0 %	157959831
4	NC_009901	ATC	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959831
5	NC_009901	T	6	6	406	411	0 %	100 %	0 %	0 %	157959831
6	NC_009901	GTC	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959831
7	NC_009901	GTT	2	6	481	486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959831
8	NC_009901	CAG	3	9	494	502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959831
9	NC_009901	CTT	2	6	542	547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959831
10	NC_009901	CGCA	2	8	557	564	25 %	0 %	25 %	50 %	157959831
11	NC_009901	GCTAAT	2	12	574	585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157959831
12	NC_009901	GTA	2	6	590	595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959831
13	NC_009901	GCT	2	6	661	666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959831
14	NC_009901	TGG	2	6	687	692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959831
15	NC_009901	TGG	2	6	717	722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959831
16	NC_009901	ATT	2	6	769	774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959831
17	NC_009901	AGT	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959831
18	NC_009901	CTA	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959831
19	NC_009901	TTC	2	6	919	924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959831
20	NC_009901	CAA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959831
21	NC_009901	AGAT	2	8	933	940	50 %	25 %	25 %	0 %	157959831
22	NC_009901	AAG	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959831
23	NC_009901	TTC	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959831
24	NC_009901	TTA	2	6	973	978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959831
25	NC_009901	ATC	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959831
26	NC_009901	TTGG	2	8	1061	1068	0 %	50 %	50 %	0 %	157959831
27	NC_009901	CCA	2	6	1090	1095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959831
28	NC_009901	AG	3	6	1137	1142	50 %	0 %	50 %	0 %	157959831
29	NC_009901	CGTG	2	8	1200	1207	0 %	25 %	50 %	25 %	157959831
30	NC_009901	GCTAAC	2	12	1237	1248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157959831
31	NC_009901	ACTT	2	8	1298	1305	25 %	50 %	0 %	25 %	157959831
32	NC_009901	ATA	2	6	1334	1339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959831
33	NC_009901	AGA	2	6	1343	1348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959831
34	NC_009901	TAC	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959831
35	NC_009901	CGT	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959831
36	NC_009901	TAAC	2	8	1454	1461	50 %	25 %	0 %	25 %	157959831
37	NC_009901	TGG	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959831
38	NC_009901	CA	3	6	1504	1509	50 %	0 %	0 %	50 %	157959831
39	NC_009901	CATG	2	8	1519	1526	25 %	25 %	25 %	25 %	157959831
40	NC_009901	GAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959831
41	NC_009901	AGA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959831
42	NC_009901	TCT	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959831
43	NC_009901	GTG	2	6	1680	1685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959832
44	NC_009901	AG	3	6	1690	1695	50 %	0 %	50 %	0 %	157959832
45	NC_009901	TCAC	2	8	1744	1751	25 %	25 %	0 %	50 %	157959832
46	NC_009901	A	6	6	1844	1849	100 %	0 %	0 %	0 %	157959832
47	NC_009901	AGC	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959832
48	NC_009901	TGT	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959832
49	NC_009901	CTG	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959832
50	NC_009901	TTA	2	6	2083	2088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959832
51	NC_009901	TGC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959832
52	NC_009901	CGTT	2	8	2240	2247	0 %	50 %	25 %	25 %	157959832
53	NC_009901	CGATTG	2	12	2271	2282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157959832
54	NC_009901	CAG	2	6	2313	2318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959832
55	NC_009901	TTG	2	6	2334	2339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959832
56	NC_009901	TCG	2	6	2359	2364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959832
57	NC_009901	GTT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959832
58	NC_009901	GC	3	6	2431	2436	0 %	0 %	50 %	50 %	157959832
59	NC_009901	GTG	2	6	2463	2468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959832
60	NC_009901	TAA	2	6	2509	2514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959832
61	NC_009901	GAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959832
62	NC_009901	TTAC	2	8	2593	2600	25 %	50 %	0 %	25 %	157959832
63	NC_009901	AAT	2	6	2612	2617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959832
64	NC_009901	GAT	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959832
65	NC_009901	GC	3	6	2664	2669	0 %	0 %	50 %	50 %	157959832
66	NC_009901	TATG	2	8	2698	2705	25 %	50 %	25 %	0 %	157959832
67	NC_009901	AT	3	6	2886	2891	50 %	50 %	0 %	0 %	157959833
68	NC_009901	GAT	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959833
69	NC_009901	TGA	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959833
70	NC_009901	CGT	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959833
71	NC_009901	TAAAG	2	10	3148	3157	60 %	20 %	20 %	0 %	157959833
72	NC_009901	CGCT	2	8	3168	3175	0 %	25 %	25 %	50 %	157959833
73	NC_009901	CTG	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959833
74	NC_009901	ATTG	2	8	3254	3261	25 %	50 %	25 %	0 %	157959833
75	NC_009901	TGC	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959833
76	NC_009901	AGC	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959833
77	NC_009901	ACA	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959833
78	NC_009901	A	7	7	3731	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	157959833
79	NC_009901	TGG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959833
80	NC_009901	GCA	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959833
81	NC_009901	TAG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959833
82	NC_009901	CGC	2	6	3876	3881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157959833
83	NC_009901	CGA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959834
84	NC_009901	GA	3	6	3937	3942	50 %	0 %	50 %	0 %	157959834
85	NC_009901	ATA	2	6	3943	3948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959834
86	NC_009901	TTC	2	6	3968	3973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
87	NC_009901	GAT	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
88	NC_009901	AGT	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
89	NC_009901	ACG	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959834
90	NC_009901	ATT	2	6	4128	4133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959834
91	NC_009901	CTG	3	9	4216	4224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
92	NC_009901	TTA	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959834
93	NC_009901	TGG	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
94	NC_009901	GAT	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
95	NC_009901	GGT	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
96	NC_009901	GT	3	6	4306	4311	0 %	50 %	50 %	0 %	157959834
97	NC_009901	CGT	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
98	NC_009901	TTG	2	6	4561	4566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959834
99	NC_009901	TGA	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
100	NC_009901	TTC	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
101	NC_009901	ACT	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157959834
102	NC_009901	AAG	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959834
103	NC_009901	TCT	2	6	4747	4752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
104	NC_009901	CAA	2	6	4760	4765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157959834
105	NC_009901	TGG	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
106	NC_009901	GTG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
107	NC_009901	TAA	2	6	4856	4861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959834
108	NC_009901	CTG	2	6	4873	4878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
109	NC_009901	TGA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
110	NC_009901	AGTTC	2	10	4942	4951	20 %	40 %	20 %	20 %	157959834
111	NC_009901	AGTT	2	8	4966	4973	25 %	50 %	25 %	0 %	157959834
112	NC_009901	CTG	2	6	4990	4995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
113	NC_009901	TTG	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959834
114	NC_009901	TCG	2	6	5126	5131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
115	NC_009901	GGT	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
116	NC_009901	TGG	2	6	5234	5239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
117	NC_009901	TTC	2	6	5278	5283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
118	NC_009901	AAG	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157959834
119	NC_009901	CTT	3	9	5486	5494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
120	NC_009901	TA	3	6	5530	5535	50 %	50 %	0 %	0 %	157959834
121	NC_009901	ACC	2	6	5543	5548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959834
122	NC_009901	GAT	2	6	5592	5597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
123	NC_009901	AGC	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157959834
124	NC_009901	TGA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
125	NC_009901	TA	3	6	5887	5892	50 %	50 %	0 %	0 %	157959834
126	NC_009901	AC	3	6	5967	5972	50 %	0 %	0 %	50 %	157959834
127	NC_009901	CTT	2	6	5990	5995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157959834
128	NC_009901	TAG	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959834
129	NC_009901	TGG	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
130	NC_009901	GTG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959834
131	NC_009901	TCG	2	6	6227	6232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
132	NC_009901	GTT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959834
133	NC_009901	CGT	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157959834
134	NC_009901	A	6	6	6478	6483	100 %	0 %	0 %	0 %	157959835
135	NC_009901	TTG	2	6	6575	6580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959835
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145	NC_009901	GTT	2	6	7125	7130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959835
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173	NC_009901	GGCG	2	8	8397	8404	0 %	0 %	75 %	25 %	157959836
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263	NC_009901	TTG	2	6	14396	14401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959840
264	NC_009901	ATT	2	6	14431	14436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157959840
265	NC_009901	GGT	2	6	14440	14445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157959840
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273	NC_009901	CAC	2	6	15024	15029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157959840
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289	NC_009901	TGGC	2	8	16223	16230	0 %	25 %	50 %	25 %	157959842
290	NC_009901	CG	3	6	16272	16277	0 %	0 %	50 %	50 %	157959842
291	NC_009901	TTG	2	6	16278	16283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157959842
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382	NC_009901	TAGC	2	8	21501	21508	25 %	25 %	25 %	25 %	157959848
383	NC_009901	TGA	2	6	21510	21515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157959848
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387	NC_009901	CGTAC	2	10	21887	21896	20 %	20 %	20 %	40 %	157959848
388	NC_009901	AAT	2	6	21910	21915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157959848
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