MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome

Total Repeats: 77137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009901	TTGC	2	8	1019663	1019670	0 %	50 %	25 %	25 %	157960649
15002	NC_009901	TAC	2	6	1019674	1019679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960649
15003	NC_009901	ACT	2	6	1019714	1019719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960649
15004	NC_009901	TCAT	2	8	1019720	1019727	25 %	50 %	0 %	25 %	157960649
15005	NC_009901	TGA	2	6	1019733	1019738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960649
15006	NC_009901	AGA	2	6	1019778	1019783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960649
15007	NC_009901	GAA	2	6	1019808	1019813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960649
15008	NC_009901	TGTT	2	8	1019825	1019832	0 %	75 %	25 %	0 %	157960649
15009	NC_009901	CTAT	2	8	1020223	1020230	25 %	50 %	0 %	25 %	157960650
15010	NC_009901	TCGAC	2	10	1020337	1020346	20 %	20 %	20 %	40 %	157960650
15011	NC_009901	TGTT	2	8	1020352	1020359	0 %	75 %	25 %	0 %	157960650
15012	NC_009901	TAGGC	2	10	1020928	1020937	20 %	20 %	40 %	20 %	157960651
15013	NC_009901	GTT	2	6	1020947	1020952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960651
15014	NC_009901	TGC	2	6	1020979	1020984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
15015	NC_009901	GCG	2	6	1021130	1021135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157960651
15016	NC_009901	T	7	7	1021237	1021243	0 %	100 %	0 %	0 %	157960651
15017	NC_009901	GC	3	6	1021310	1021315	0 %	0 %	50 %	50 %	157960651
15018	NC_009901	GTTT	2	8	1021421	1021428	0 %	75 %	25 %	0 %	157960651
15019	NC_009901	GCTT	2	8	1021568	1021575	0 %	50 %	25 %	25 %	157960651
15020	NC_009901	AGT	2	6	1021769	1021774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960651
15021	NC_009901	GTC	2	6	1021777	1021782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
15022	NC_009901	CGC	2	6	1021920	1021925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157960651
15023	NC_009901	TGT	2	6	1021947	1021952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960651
15024	NC_009901	ACT	2	6	1022023	1022028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960651
15025	NC_009901	GTTT	2	8	1022036	1022043	0 %	75 %	25 %	0 %	157960651
15026	NC_009901	GCT	2	6	1022053	1022058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
15027	NC_009901	TGC	2	6	1022070	1022075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
15028	NC_009901	GGC	2	6	1022152	1022157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157960651
15029	NC_009901	TTG	2	6	1022233	1022238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960651
15030	NC_009901	GCT	2	6	1022332	1022337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
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15032	NC_009901	TTGT	2	8	1022395	1022402	0 %	75 %	25 %	0 %	157960651
15033	NC_009901	CTGG	2	8	1022446	1022453	0 %	25 %	50 %	25 %	157960651
15034	NC_009901	GAAGC	2	10	1022474	1022483	40 %	0 %	40 %	20 %	157960651
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15036	NC_009901	CATG	2	8	1022553	1022560	25 %	25 %	25 %	25 %	157960651
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15038	NC_009901	CTG	2	6	1022637	1022642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
15039	NC_009901	TTA	2	6	1022696	1022701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157960651
15040	NC_009901	AGT	2	6	1022721	1022726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960651
15041	NC_009901	AAAG	2	8	1022731	1022738	75 %	0 %	25 %	0 %	157960651
15042	NC_009901	CTG	2	6	1022746	1022751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
15043	NC_009901	GC	3	6	1022800	1022805	0 %	0 %	50 %	50 %	157960651
15044	NC_009901	GCAT	2	8	1022861	1022868	25 %	25 %	25 %	25 %	157960651
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15047	NC_009901	GT	3	6	1022997	1023002	0 %	50 %	50 %	0 %	157960651
15048	NC_009901	CTG	2	6	1023043	1023048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
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15051	NC_009901	TGC	2	6	1023129	1023134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
15052	NC_009901	TAA	2	6	1023181	1023186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157960651
15053	NC_009901	TGT	3	9	1023210	1023218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960651
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15055	NC_009901	TGC	2	6	1023341	1023346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960651
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15065	NC_009901	GCT	2	6	1023989	1023994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960652
15066	NC_009901	GTA	2	6	1024046	1024051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960652
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15084	NC_009901	GTAGT	2	10	1025115	1025124	20 %	40 %	40 %	0 %	157960653
15085	NC_009901	TGG	2	6	1025149	1025154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157960653
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15088	NC_009901	TGCT	2	8	1025477	1025484	0 %	50 %	25 %	25 %	157960653
15089	NC_009901	CAA	2	6	1025584	1025589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157960653
15090	NC_009901	TGC	2	6	1025594	1025599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960653
15091	NC_009901	TAAT	2	8	1025655	1025662	50 %	50 %	0 %	0 %	157960653
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15097	NC_009901	GCAA	2	8	1026109	1026116	50 %	0 %	25 %	25 %	157960654
15098	NC_009901	TTA	2	6	1026118	1026123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157960654
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15100	NC_009901	AAG	2	6	1026848	1026853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960655
15101	NC_009901	AAG	2	6	1026932	1026937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960655
15102	NC_009901	AGA	2	6	1027013	1027018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960655
15103	NC_009901	AAG	2	6	1027061	1027066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960655
15104	NC_009901	TCA	2	6	1027103	1027108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960655
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15106	NC_009901	GCAC	2	8	1027425	1027432	25 %	0 %	25 %	50 %	157960655
15107	NC_009901	T	6	6	1027713	1027718	0 %	100 %	0 %	0 %	157960656
15108	NC_009901	AGA	2	6	1027791	1027796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960656
15109	NC_009901	ATA	2	6	1027805	1027810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157960656
15110	NC_009901	CAG	2	6	1027834	1027839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960656
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15112	NC_009901	AGA	2	6	1028019	1028024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960656
15113	NC_009901	CGT	2	6	1028050	1028055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960656
15114	NC_009901	ATTG	2	8	1028069	1028076	25 %	50 %	25 %	0 %	157960656
15115	NC_009901	GCT	2	6	1028259	1028264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960657
15116	NC_009901	CGA	2	6	1028268	1028273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960657
15117	NC_009901	TGC	2	6	1028300	1028305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960657
15118	NC_009901	CT	3	6	1028317	1028322	0 %	50 %	0 %	50 %	157960657
15119	NC_009901	GTAG	2	8	1028469	1028476	25 %	25 %	50 %	0 %	157960657
15120	NC_009901	CCTG	2	8	1028562	1028569	0 %	25 %	25 %	50 %	157960657
15121	NC_009901	CTGC	2	8	1028672	1028679	0 %	25 %	25 %	50 %	157960657
15122	NC_009901	ATCAGA	2	12	1028698	1028709	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157960657
15123	NC_009901	ATC	2	6	1028749	1028754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960657
15124	NC_009901	GAG	2	6	1028896	1028901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157960658
15125	NC_009901	T	6	6	1028930	1028935	0 %	100 %	0 %	0 %	157960658
15126	NC_009901	GGC	2	6	1028965	1028970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157960658
15127	NC_009901	CTTT	2	8	1029012	1029019	0 %	75 %	0 %	25 %	157960658
15128	NC_009901	CTC	2	6	1029023	1029028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157960658
15129	NC_009901	TCA	2	6	1029042	1029047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960658
15130	NC_009901	ACC	2	6	1029060	1029065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157960658
15131	NC_009901	TGA	2	6	1029171	1029176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960658
15132	NC_009901	TAA	2	6	1029214	1029219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157960658
15133	NC_009901	CTGA	2	8	1029226	1029233	25 %	25 %	25 %	25 %	157960658
15134	NC_009901	GCT	2	6	1029241	1029246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960658
15135	NC_009901	ATA	2	6	1029307	1029312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157960658
15136	NC_009901	CTGCT	2	10	1029365	1029374	0 %	40 %	20 %	40 %	157960658
15137	NC_009901	AG	3	6	1029410	1029415	50 %	0 %	50 %	0 %	157960658
15138	NC_009901	GAAA	2	8	1029437	1029444	75 %	0 %	25 %	0 %	157960658
15139	NC_009901	CT	3	6	1029470	1029475	0 %	50 %	0 %	50 %	157960658
15140	NC_009901	CACGC	2	10	1029482	1029491	20 %	0 %	20 %	60 %	157960658
15141	NC_009901	GCT	2	6	1029517	1029522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960658
15142	NC_009901	ATG	2	6	1029558	1029563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960658
15143	NC_009901	TTA	2	6	1029570	1029575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157960658
15144	NC_009901	GTT	2	6	1029626	1029631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960658
15145	NC_009901	TTG	2	6	1029653	1029658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960658
15146	NC_009901	TGA	2	6	1029703	1029708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960658
15147	NC_009901	TGG	2	6	1029762	1029767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157960658
15148	NC_009901	GTT	2	6	1029860	1029865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960658
15149	NC_009901	T	6	6	1029886	1029891	0 %	100 %	0 %	0 %	157960658
15150	NC_009901	CCAG	2	8	1029924	1029931	25 %	0 %	25 %	50 %	157960658
15151	NC_009901	TTG	2	6	1030046	1030051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960658
15152	NC_009901	AAC	2	6	1030061	1030066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157960658
15153	NC_009901	AAAG	2	8	1030091	1030098	75 %	0 %	25 %	0 %	157960658
15154	NC_009901	GCA	2	6	1030224	1030229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960658
15155	NC_009901	GTA	2	6	1030256	1030261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960658
15156	NC_009901	ATTG	2	8	1030332	1030339	25 %	50 %	25 %	0 %	157960658
15157	NC_009901	TGA	2	6	1030498	1030503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960658
15158	NC_009901	T	6	6	1030580	1030585	0 %	100 %	0 %	0 %	157960658
15159	NC_009901	GAGAT	2	10	1030823	1030832	40 %	20 %	40 %	0 %	157960659
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15162	NC_009901	CCAATG	2	12	1031158	1031169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157960659
15163	NC_009901	GTT	2	6	1031285	1031290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960659
15164	NC_009901	TC	3	6	1031327	1031332	0 %	50 %	0 %	50 %	157960659
15165	NC_009901	CAAT	2	8	1031401	1031408	50 %	25 %	0 %	25 %	157960659
15166	NC_009901	TAC	2	6	1031434	1031439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960659
15167	NC_009901	CTG	2	6	1031450	1031455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960659
15168	NC_009901	ATG	2	6	1031522	1031527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960659
15169	NC_009901	AGCAC	2	10	1031580	1031589	40 %	0 %	20 %	40 %	157960659
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15172	NC_009901	CAAAG	2	10	1031755	1031764	60 %	0 %	20 %	20 %	157960659
15173	NC_009901	AGTT	2	8	1031834	1031841	25 %	50 %	25 %	0 %	157960659
15174	NC_009901	GCT	2	6	1032022	1032027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960659
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15182	NC_009901	GCTGAA	2	12	1032199	1032210	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157960659
15183	NC_009901	AAGT	2	8	1032229	1032236	50 %	25 %	25 %	0 %	157960659
15184	NC_009901	AGT	2	6	1032820	1032825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960660
15185	NC_009901	CTTG	2	8	1032901	1032908	0 %	50 %	25 %	25 %	157960660
15186	NC_009901	CT	3	6	1032999	1033004	0 %	50 %	0 %	50 %	157960660
15187	NC_009901	ATA	2	6	1033048	1033053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157960660
15188	NC_009901	TAGC	2	8	1033142	1033149	25 %	25 %	25 %	25 %	157960660
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15192	NC_009901	AC	3	6	1033324	1033329	50 %	0 %	0 %	50 %	157960660
15193	NC_009901	TCT	2	6	1033330	1033335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960660
15194	NC_009901	ACG	2	6	1033930	1033935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960661
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15200	NC_009901	TATG	2	8	1034180	1034187	25 %	50 %	25 %	0 %	157960662
15201	NC_009901	GAGG	2	8	1034199	1034206	25 %	0 %	75 %	0 %	157960662
15202	NC_009901	TCAG	2	8	1034240	1034247	25 %	25 %	25 %	25 %	157960662
15203	NC_009901	CTT	3	9	1034276	1034284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960662
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15206	NC_009901	TATCG	2	10	1034315	1034324	20 %	40 %	20 %	20 %	157960662
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15211	NC_009901	TGGC	2	8	1034482	1034489	0 %	25 %	50 %	25 %	157960662
15212	NC_009901	GT	3	6	1034509	1034514	0 %	50 %	50 %	0 %	157960662
15213	NC_009901	TGGTT	2	10	1034625	1034634	0 %	60 %	40 %	0 %	157960662
15214	NC_009901	TGC	2	6	1034653	1034658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960662
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15217	NC_009901	CCG	2	6	1034824	1034829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157960662
15218	NC_009901	TTGGC	2	10	1034866	1034875	0 %	40 %	40 %	20 %	157960662
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15220	NC_009901	TGG	2	6	1034887	1034892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157960662
15221	NC_009901	TGA	2	6	1034927	1034932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960662
15222	NC_009901	TTA	2	6	1034970	1034975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157960662
15223	NC_009901	TTC	2	6	1035060	1035065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960662
15224	NC_009901	ATGG	2	8	1035080	1035087	25 %	25 %	50 %	0 %	157960662
15225	NC_009901	GAA	2	6	1035123	1035128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960662
15226	NC_009901	AAC	2	6	1035553	1035558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157960663
15227	NC_009901	GCAGG	2	10	1035569	1035578	20 %	0 %	60 %	20 %	157960663
15228	NC_009901	GA	3	6	1035622	1035627	50 %	0 %	50 %	0 %	157960663
15229	NC_009901	GCA	2	6	1035640	1035645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960663
15230	NC_009901	GCGTT	2	10	1035659	1035668	0 %	40 %	40 %	20 %	157960663
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