MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 80391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009831	ATC	2	6	563	568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373142
2	NC_009831	ATC	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373142
3	NC_009831	TGG	2	6	685	690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373142
4	NC_009831	CGT	2	6	717	722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373142
5	NC_009831	TGC	2	6	774	779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373142
6	NC_009831	CTC	2	6	785	790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157373142
7	NC_009831	GGT	3	9	962	970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373142
8	NC_009831	CGG	2	6	997	1002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373142
9	NC_009831	CACG	2	8	1017	1024	25 %	0 %	25 %	50 %	157373142
10	NC_009831	GTG	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373142
11	NC_009831	AGG	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373142
12	NC_009831	CAC	2	6	1226	1231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373142
13	NC_009831	CTTG	2	8	1258	1265	0 %	50 %	25 %	25 %	157373142
14	NC_009831	TGA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373142
15	NC_009831	AG	3	6	1331	1336	50 %	0 %	50 %	0 %	157373142
16	NC_009831	GCC	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373142
17	NC_009831	TGG	2	6	1477	1482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373142
18	NC_009831	GCC	2	6	1628	1633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373142
19	NC_009831	GATC	2	8	1705	1712	25 %	25 %	25 %	25 %	157373142
20	NC_009831	CTTCAC	2	12	1714	1725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	157373142
21	NC_009831	CAC	3	9	1831	1839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373142
22	NC_009831	TGT	2	6	1874	1879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373142
23	NC_009831	TTC	2	6	2010	2015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
24	NC_009831	TCT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
25	NC_009831	GAA	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373143
26	NC_009831	TAC	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
27	NC_009831	CAT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
28	NC_009831	TCG	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373143
29	NC_009831	TCT	2	6	2185	2190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
30	NC_009831	CAG	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373143
31	NC_009831	CTTTCT	2	12	2377	2388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
32	NC_009831	CAT	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
33	NC_009831	TCT	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
34	NC_009831	TCA	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
35	NC_009831	ACA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373143
36	NC_009831	GAA	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373143
37	NC_009831	ACC	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
38	NC_009831	CTT	2	6	2680	2685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
39	NC_009831	CAT	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
40	NC_009831	CAC	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
41	NC_009831	AAT	2	6	2804	2809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373143
42	NC_009831	TGG	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373143
43	NC_009831	AGT	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373143
44	NC_009831	ACC	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
45	NC_009831	ATC	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
46	NC_009831	CAC	2	6	2962	2967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
47	NC_009831	CAT	3	9	2978	2986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
48	NC_009831	GCT	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373143
49	NC_009831	TGT	2	6	3058	3063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373143
50	NC_009831	GCT	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373143
51	NC_009831	CAC	2	6	3370	3375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
52	NC_009831	TGA	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373143
53	NC_009831	CAA	2	6	3436	3441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373143
54	NC_009831	CAG	3	9	3442	3450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373143
55	NC_009831	TGA	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373143
56	NC_009831	AT	3	6	3610	3615	50 %	50 %	0 %	0 %	157373143
57	NC_009831	TATT	2	8	3636	3643	25 %	75 %	0 %	0 %	157373144
58	NC_009831	T	7	7	3653	3659	0 %	100 %	0 %	0 %	157373144
59	NC_009831	G	6	6	3660	3665	0 %	0 %	100 %	0 %	157373144
60	NC_009831	TGC	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373144
61	NC_009831	TTA	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373144
62	NC_009831	TGA	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373144
63	NC_009831	AGG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373145
64	NC_009831	TGA	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373145
65	NC_009831	CTTT	2	8	4041	4048	0 %	75 %	0 %	25 %	157373145
66	NC_009831	TGT	2	6	4085	4090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373145
67	NC_009831	GAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373145
68	NC_009831	ACG	3	9	4260	4268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373146
69	NC_009831	ACGCTT	2	12	4323	4334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157373146
70	NC_009831	GCA	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373147
71	NC_009831	GAC	2	6	4843	4848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373147
72	NC_009831	CT	3	6	4860	4865	0 %	50 %	0 %	50 %	157373147
73	NC_009831	ATGG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	50 %	0 %	157373147
74	NC_009831	ACATCA	2	12	4975	4986	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157373147
75	NC_009831	T	6	6	4995	5000	0 %	100 %	0 %	0 %	157373147
76	NC_009831	CTG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373147
77	NC_009831	GGC	2	6	5249	5254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373147
78	NC_009831	CTT	2	6	5300	5305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373147
79	NC_009831	TGG	2	6	5309	5314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373147
80	NC_009831	GAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373147
81	NC_009831	TAC	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373147
82	NC_009831	TTTA	2	8	5489	5496	25 %	75 %	0 %	0 %	157373147
83	NC_009831	GAT	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373147
84	NC_009831	GAA	2	6	5538	5543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373147
85	NC_009831	ATC	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373147
86	NC_009831	ATC	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373147
87	NC_009831	AGAC	2	8	5633	5640	50 %	0 %	25 %	25 %	157373147
88	NC_009831	GCC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373147
89	NC_009831	CTT	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373147
90	NC_009831	CAAGAT	2	12	5957	5968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157373147
91	NC_009831	CGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373147
92	NC_009831	AACC	2	8	6047	6054	50 %	0 %	0 %	50 %	157373147
93	NC_009831	TGG	2	6	6083	6088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373147
94	NC_009831	GA	3	6	6137	6142	50 %	0 %	50 %	0 %	157373147
95	NC_009831	AGA	2	6	6161	6166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373147
96	NC_009831	TGA	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373148
97	NC_009831	GA	3	6	6283	6288	50 %	0 %	50 %	0 %	157373148
98	NC_009831	AGTG	2	8	6327	6334	25 %	25 %	50 %	0 %	157373148
99	NC_009831	TCAC	2	8	6336	6343	25 %	25 %	0 %	50 %	157373148
100	NC_009831	TGG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373148
101	NC_009831	AGGA	2	8	6410	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	157373148
102	NC_009831	A	6	6	6436	6441	100 %	0 %	0 %	0 %	157373148
103	NC_009831	GAA	2	6	6559	6564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373148
104	NC_009831	TTA	2	6	6675	6680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373148
105	NC_009831	TGT	2	6	6692	6697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373148
106	NC_009831	TGC	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373148
107	NC_009831	GAA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373148
108	NC_009831	CTATCG	2	12	6863	6874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157373148
109	NC_009831	CGA	2	6	6893	6898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373148
110	NC_009831	CGT	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373148
111	NC_009831	AAT	2	6	7078	7083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373148
112	NC_009831	AAT	2	6	7102	7107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373148
113	NC_009831	GAA	2	6	7117	7122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373148
114	NC_009831	CAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373148
115	NC_009831	TGA	2	6	7218	7223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373148
116	NC_009831	AGA	2	6	7278	7283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373148
117	NC_009831	ACT	2	6	7667	7672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373149
118	NC_009831	GAT	2	6	7806	7811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373149
119	NC_009831	AG	3	6	7850	7855	50 %	0 %	50 %	0 %	157373149
120	NC_009831	GTG	2	6	7882	7887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373149
121	NC_009831	GTT	2	6	8474	8479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373149
122	NC_009831	ACA	2	6	8483	8488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373149
123	NC_009831	TGG	2	6	8512	8517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373149
124	NC_009831	CAG	2	6	8527	8532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373149
125	NC_009831	TGC	2	6	8560	8565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373149
126	NC_009831	CGC	2	6	8641	8646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373149
127	NC_009831	CGA	2	6	8698	8703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373150
128	NC_009831	GA	3	6	8702	8707	50 %	0 %	50 %	0 %	157373150
129	NC_009831	ATA	2	6	8708	8713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373150
130	NC_009831	TTC	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373150
131	NC_009831	CGA	2	6	8805	8810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373150
132	NC_009831	CAT	2	6	8824	8829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373150
133	NC_009831	AGT	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373150
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136	NC_009831	TTA	2	6	8993	8998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373150
137	NC_009831	CGG	2	6	9015	9020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373150
138	NC_009831	GAT	2	6	9028	9033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373150
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140	NC_009831	TGT	2	6	9078	9083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373150
141	NC_009831	TCG	2	6	9117	9122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373150
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153	NC_009831	AGTGA	2	10	9742	9751	40 %	20 %	40 %	0 %	157373150
154	NC_009831	CTG	2	6	9755	9760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373150
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159	NC_009831	TCG	2	6	9891	9896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373150
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252	NC_009831	TCTT	2	8	16825	16832	0 %	75 %	0 %	25 %	157373155
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255	NC_009831	AAT	2	6	16896	16901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373155
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259	NC_009831	CCA	2	6	17128	17133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373155
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384	NC_009831	T	7	7	25760	25766	0 %	100 %	0 %	0 %	157373162
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