MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 38640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009785	AAT	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149691
2	NC_009785	A	8	8	222	229	100 %	0 %	0 %	0 %	157149691
3	NC_009785	T	6	6	241	246	0 %	100 %	0 %	0 %	157149691
4	NC_009785	GATT	2	8	260	267	25 %	50 %	25 %	0 %	157149691
5	NC_009785	AAT	2	6	277	282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149691
6	NC_009785	AGA	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
7	NC_009785	AGA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
8	NC_009785	ATTT	2	8	436	443	25 %	75 %	0 %	0 %	157149691
9	NC_009785	CAG	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149691
10	NC_009785	GAAAA	2	10	469	478	80 %	0 %	20 %	0 %	157149691
11	NC_009785	A	6	6	475	480	100 %	0 %	0 %	0 %	157149691
12	NC_009785	TCC	2	6	483	488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149691
13	NC_009785	TGG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149691
14	NC_009785	TTA	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149691
15	NC_009785	CTG	2	6	713	718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149691
16	NC_009785	TAT	2	6	800	805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149691
17	NC_009785	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149691
18	NC_009785	A	6	6	832	837	100 %	0 %	0 %	0 %	157149691
19	NC_009785	AAG	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
20	NC_009785	T	6	6	856	861	0 %	100 %	0 %	0 %	157149691
21	NC_009785	ACT	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149691
22	NC_009785	GAA	2	6	943	948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
23	NC_009785	CTC	2	6	992	997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149691
24	NC_009785	GAA	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
25	NC_009785	ATA	2	6	1373	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149691
26	NC_009785	ACA	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149691
27	NC_009785	AGA	3	9	1461	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
28	NC_009785	A	6	6	1500	1505	100 %	0 %	0 %	0 %	157149691
29	NC_009785	TAAAA	2	10	1506	1515	80 %	20 %	0 %	0 %	157149691
30	NC_009785	TAA	2	6	1691	1696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151517
31	NC_009785	ATTT	2	8	1699	1706	25 %	75 %	0 %	0 %	157151517
32	NC_009785	AAT	2	6	1854	1859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151517
33	NC_009785	CTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151517
34	NC_009785	CTTT	2	8	1912	1919	0 %	75 %	0 %	25 %	157151517
35	NC_009785	TGT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151517
36	NC_009785	AGCAAA	2	12	1972	1983	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157151517
37	NC_009785	TAAT	2	8	2107	2114	50 %	50 %	0 %	0 %	157151517
38	NC_009785	GTC	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151517
39	NC_009785	ATT	2	6	2241	2246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151517
40	NC_009785	A	7	7	2251	2257	100 %	0 %	0 %	0 %	157151517
41	NC_009785	GTT	2	6	2274	2279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151517
42	NC_009785	ATC	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151517
43	NC_009785	GTT	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151517
44	NC_009785	TGC	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151517
45	NC_009785	TAT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151517
46	NC_009785	CA	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	157151517
47	NC_009785	TGAA	2	8	2605	2612	50 %	25 %	25 %	0 %	157151517
48	NC_009785	GA	3	6	2638	2643	50 %	0 %	50 %	0 %	157151517
49	NC_009785	AAG	3	9	2764	2772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151517
50	NC_009785	AATT	2	8	2782	2789	50 %	50 %	0 %	0 %	157151517
51	NC_009785	TGAAA	2	10	2833	2842	60 %	20 %	20 %	0 %	157151188
52	NC_009785	TGT	2	6	2947	2952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151188
53	NC_009785	GAT	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151188
54	NC_009785	GA	3	6	2975	2980	50 %	0 %	50 %	0 %	157151188
55	NC_009785	A	6	6	2987	2992	100 %	0 %	0 %	0 %	157151188
56	NC_009785	TGA	2	6	3001	3006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151188
57	NC_009785	TAT	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150252
58	NC_009785	T	7	7	3026	3032	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
59	NC_009785	TTC	2	6	3035	3040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
60	NC_009785	T	6	6	3059	3064	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
61	NC_009785	T	6	6	3073	3078	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
62	NC_009785	T	7	7	3109	3115	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
63	NC_009785	T	7	7	3120	3126	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
64	NC_009785	ATC	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
65	NC_009785	TTC	2	6	3272	3277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
66	NC_009785	AGC	2	6	3290	3295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150252
67	NC_009785	T	7	7	3297	3303	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
68	NC_009785	CTT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
69	NC_009785	TCA	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
70	NC_009785	GAAAT	2	10	3342	3351	60 %	20 %	20 %	0 %	157150252
71	NC_009785	AGT	2	6	3356	3361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150252
72	NC_009785	TAG	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150252
73	NC_009785	TTGAT	2	10	3413	3422	20 %	60 %	20 %	0 %	157150252
74	NC_009785	TAA	2	6	3438	3443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150252
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81	NC_009785	T	8	8	3613	3620	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
82	NC_009785	CCTT	2	8	3670	3677	0 %	50 %	0 %	50 %	157150786
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90	NC_009785	TGAT	2	8	3928	3935	25 %	50 %	25 %	0 %	157150786
91	NC_009785	TGTT	2	8	4008	4015	0 %	75 %	25 %	0 %	157150786
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101	NC_009785	T	6	6	4277	4282	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
102	NC_009785	TTTG	2	8	4324	4331	0 %	75 %	25 %	0 %	157150786
103	NC_009785	ATT	2	6	4347	4352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
104	NC_009785	TTA	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
105	NC_009785	A	6	6	4384	4389	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
106	NC_009785	TTTTG	2	10	4406	4415	0 %	80 %	20 %	0 %	157150786
107	NC_009785	AGATTA	2	12	4540	4551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157150786
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109	NC_009785	A	6	6	4689	4694	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
110	NC_009785	TAT	3	9	4700	4708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
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115	NC_009785	A	6	6	4957	4962	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
116	NC_009785	AAAAAC	2	12	4977	4988	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	157150786
117	NC_009785	AAAT	2	8	4991	4998	75 %	25 %	0 %	0 %	157150786
118	NC_009785	AATTT	2	10	5038	5047	40 %	60 %	0 %	0 %	157150786
119	NC_009785	CTG	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150786
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121	NC_009785	AATA	2	8	5184	5191	75 %	25 %	0 %	0 %	157150786
122	NC_009785	A	7	7	5202	5208	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
123	NC_009785	A	6	6	5247	5252	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
124	NC_009785	TAGC	2	8	5258	5265	25 %	25 %	25 %	25 %	157150786
125	NC_009785	T	6	6	5366	5371	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
126	NC_009785	ATA	2	6	5465	5470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150786
127	NC_009785	A	6	6	5491	5496	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
128	NC_009785	TGT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150786
129	NC_009785	A	6	6	5535	5540	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
130	NC_009785	A	6	6	5543	5548	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
131	NC_009785	CAT	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150786
132	NC_009785	AT	3	6	5566	5571	50 %	50 %	0 %	0 %	157150786
133	NC_009785	T	9	9	5629	5637	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
134	NC_009785	AAT	2	6	5676	5681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150786
135	NC_009785	T	7	7	5777	5783	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
136	NC_009785	AGC	2	6	5805	5810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150786
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138	NC_009785	A	6	6	5969	5974	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
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405	NC_009785	TAC	2	6	18483	18488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150603
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