MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 38640

< Previous12...66676869707172737475767778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_009785	TTG	2	6	2190592	2190597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151596
38502	NC_009785	ATTG	2	8	2190630	2190637	25 %	50 %	25 %	0 %	157151596
38503	NC_009785	CAA	2	6	2190659	2190664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157151596
38504	NC_009785	TCA	3	9	2190700	2190708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151596
38505	NC_009785	ATTT	2	8	2190761	2190768	25 %	75 %	0 %	0 %	157151596
38506	NC_009785	GTT	2	6	2190829	2190834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151596
38507	NC_009785	T	6	6	2190840	2190845	0 %	100 %	0 %	0 %	157151596
38508	NC_009785	TGA	2	6	2190854	2190859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151596
38509	NC_009785	TTG	2	6	2190920	2190925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151596
38510	NC_009785	TGC	2	6	2190939	2190944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151596
38511	NC_009785	TAAA	2	8	2190971	2190978	75 %	25 %	0 %	0 %	157151596
38512	NC_009785	CTG	2	6	2191013	2191018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151596
38513	NC_009785	T	6	6	2191353	2191358	0 %	100 %	0 %	0 %	157150731
38514	NC_009785	TCT	2	6	2191363	2191368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150731
38515	NC_009785	T	6	6	2191368	2191373	0 %	100 %	0 %	0 %	157150731
38516	NC_009785	TTTC	2	8	2191391	2191398	0 %	75 %	0 %	25 %	157150731
38517	NC_009785	CAT	2	6	2191439	2191444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150731
38518	NC_009785	A	6	6	2191522	2191527	100 %	0 %	0 %	0 %	157150731
38519	NC_009785	T	6	6	2191591	2191596	0 %	100 %	0 %	0 %	157150731
38520	NC_009785	CAA	2	6	2191598	2191603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150731
38521	NC_009785	GTC	2	6	2191627	2191632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150731
38522	NC_009785	AT	3	6	2191636	2191641	50 %	50 %	0 %	0 %	157150731
38523	NC_009785	A	6	6	2191692	2191697	100 %	0 %	0 %	0 %	157150731
38524	NC_009785	CAA	2	6	2191700	2191705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150731
38525	NC_009785	AATTA	2	10	2191719	2191728	60 %	40 %	0 %	0 %	157150731
38526	NC_009785	TTC	2	6	2191923	2191928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150731
38527	NC_009785	ATATCT	2	12	2191936	2191947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157150731
38528	NC_009785	TTC	2	6	2192052	2192057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150731
38529	NC_009785	TCT	2	6	2192095	2192100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150731
38530	NC_009785	T	6	6	2192119	2192124	0 %	100 %	0 %	0 %	157150265
38531	NC_009785	CTTT	2	8	2192126	2192133	0 %	75 %	0 %	25 %	157150265
38532	NC_009785	AAT	2	6	2192155	2192160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150265
38533	NC_009785	TCA	2	6	2192190	2192195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150265
38534	NC_009785	AAT	2	6	2192204	2192209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150265
38535	NC_009785	ATT	2	6	2192219	2192224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150265
38536	NC_009785	TTG	2	6	2192251	2192256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150265
38537	NC_009785	TCT	2	6	2192277	2192282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150265
38538	NC_009785	ATT	2	6	2192399	2192404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150265
38539	NC_009785	AC	3	6	2192527	2192532	50 %	0 %	0 %	50 %	157150265
38540	NC_009785	ATT	2	6	2192555	2192560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150265
38541	NC_009785	A	7	7	2192567	2192573	100 %	0 %	0 %	0 %	157150265
38542	NC_009785	CTT	2	6	2192638	2192643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150265
38543	NC_009785	AGTTGT	2	12	2192751	2192762	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	157150265
38544	NC_009785	TTC	2	6	2192768	2192773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150265
38545	NC_009785	T	7	7	2192775	2192781	0 %	100 %	0 %	0 %	157150265
38546	NC_009785	ATAAA	2	10	2192828	2192837	80 %	20 %	0 %	0 %	157150265
38547	NC_009785	ATA	2	6	2192850	2192855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150265
38548	NC_009785	TA	3	6	2192945	2192950	50 %	50 %	0 %	0 %	157150265
38549	NC_009785	TTA	2	6	2192955	2192960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150265
38550	NC_009785	TA	3	6	2192965	2192970	50 %	50 %	0 %	0 %	157150265
38551	NC_009785	A	7	7	2193017	2193023	100 %	0 %	0 %	0 %	157150265
38552	NC_009785	CAA	2	6	2193025	2193030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150265
38553	NC_009785	ATA	2	6	2193039	2193044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150265
38554	NC_009785	ATTA	2	8	2193059	2193066	50 %	50 %	0 %	0 %	157150265
38555	NC_009785	A	6	6	2193073	2193078	100 %	0 %	0 %	0 %	157150265
38556	NC_009785	TGT	2	6	2193087	2193092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150265
38557	NC_009785	GAA	2	6	2193117	2193122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150265
38558	NC_009785	A	6	6	2193135	2193140	100 %	0 %	0 %	0 %	157150265
38559	NC_009785	CTTTT	2	10	2193208	2193217	0 %	80 %	0 %	20 %	157150265
38560	NC_009785	ATAA	2	8	2193262	2193269	75 %	25 %	0 %	0 %	157150265
38561	NC_009785	AAT	2	6	2193295	2193300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150265
38562	NC_009785	TAA	3	9	2193305	2193313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150265
38563	NC_009785	ATT	2	6	2193342	2193347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150265
38564	NC_009785	AAT	2	6	2193362	2193367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150265
38565	NC_009785	T	6	6	2193387	2193392	0 %	100 %	0 %	0 %	157150265
38566	NC_009785	A	8	8	2193409	2193416	100 %	0 %	0 %	0 %	157150265
38567	NC_009785	A	6	6	2193424	2193429	100 %	0 %	0 %	0 %	157150265
38568	NC_009785	TAT	2	6	2193434	2193439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150265
38569	NC_009785	TAT	2	6	2193458	2193463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150265
38570	NC_009785	ATT	2	6	2193490	2193495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151683
38571	NC_009785	T	6	6	2193494	2193499	0 %	100 %	0 %	0 %	157151683
38572	NC_009785	AT	3	6	2193508	2193513	50 %	50 %	0 %	0 %	157151683
38573	NC_009785	CCA	2	6	2193518	2193523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157151683
38574	NC_009785	TTTG	2	8	2193533	2193540	0 %	75 %	25 %	0 %	157151683
38575	NC_009785	CCA	2	6	2193552	2193557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157151683
38576	NC_009785	TTTC	2	8	2193573	2193580	0 %	75 %	0 %	25 %	157151683
38577	NC_009785	TTG	2	6	2193596	2193601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151683
38578	NC_009785	TGTT	2	8	2193624	2193631	0 %	75 %	25 %	0 %	157151683
38579	NC_009785	TGA	2	6	2194005	2194010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151670
38580	NC_009785	TCA	2	6	2194033	2194038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151670
38581	NC_009785	CTTT	2	8	2194050	2194057	0 %	75 %	0 %	25 %	157151670
38582	NC_009785	ACC	2	6	2194082	2194087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157151670
38583	NC_009785	AAT	2	6	2194088	2194093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151670
38584	NC_009785	TCCT	2	8	2194229	2194236	0 %	50 %	0 %	50 %	157151670
38585	NC_009785	TTG	2	6	2194247	2194252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151670
38586	NC_009785	T	6	6	2194282	2194287	0 %	100 %	0 %	0 %	157151670
38587	NC_009785	CTT	2	6	2194354	2194359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151670
38588	NC_009785	A	7	7	2194626	2194632	100 %	0 %	0 %	0 %	157151109
38589	NC_009785	TTGTT	2	10	2194648	2194657	0 %	80 %	20 %	0 %	157151109
38590	NC_009785	GGT	2	6	2194671	2194676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157151109
38591	NC_009785	ATA	2	6	2194729	2194734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151109
38592	NC_009785	AAC	2	6	2194757	2194762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157151109
38593	NC_009785	ACA	2	6	2194785	2194790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157151109
38594	NC_009785	ACA	2	6	2194867	2194872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157151109
38595	NC_009785	AAATGA	2	12	2194883	2194894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157151109
38596	NC_009785	TAGC	2	8	2194900	2194907	25 %	25 %	25 %	25 %	157151109
38597	NC_009785	CTTA	2	8	2194948	2194955	25 %	50 %	0 %	25 %	157151109
38598	NC_009785	AC	3	6	2194965	2194970	50 %	0 %	0 %	50 %	157151109
38599	NC_009785	A	7	7	2194985	2194991	100 %	0 %	0 %	0 %	157151109
38600	NC_009785	TTC	2	6	2195228	2195233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151109
38601	NC_009785	AGA	2	6	2195240	2195245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151109
38602	NC_009785	GCA	2	6	2195283	2195288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157151109
38603	NC_009785	TGG	2	6	2195306	2195311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157151109
38604	NC_009785	AAT	2	6	2195373	2195378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151109
38605	NC_009785	GTA	2	6	2195380	2195385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151109
38606	NC_009785	ATG	2	6	2195422	2195427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151109
38607	NC_009785	AGT	2	6	2195505	2195510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151109
38608	NC_009785	TCT	2	6	2195514	2195519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151109
38609	NC_009785	GTT	2	6	2195568	2195573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151109
38610	NC_009785	CTG	2	6	2195596	2195601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151109
38611	NC_009785	ATG	2	6	2195620	2195625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151109
38612	NC_009785	TGA	2	6	2195639	2195644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151109
38613	NC_009785	ATC	2	6	2195654	2195659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151109
38614	NC_009785	GAA	2	6	2195703	2195708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151109
38615	NC_009785	TTA	2	6	2195720	2195725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151109
38616	NC_009785	ACA	2	6	2195745	2195750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157151109
38617	NC_009785	ACTA	2	8	2195759	2195766	50 %	25 %	0 %	25 %	157151109
38618	NC_009785	TGA	2	6	2195774	2195779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151109
38619	NC_009785	AATA	2	8	2195791	2195798	75 %	25 %	0 %	0 %	157151109
38620	NC_009785	AT	3	6	2195875	2195880	50 %	50 %	0 %	0 %	157150241
38621	NC_009785	TTAA	2	8	2195882	2195889	50 %	50 %	0 %	0 %	157150241
38622	NC_009785	TAT	2	6	2195989	2195994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150241
38623	NC_009785	ATC	2	6	2196004	2196009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150241
38624	NC_009785	AGA	2	6	2196041	2196046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150241
38625	NC_009785	GAT	2	6	2196107	2196112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150241
38626	NC_009785	ATG	2	6	2196116	2196121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150241
38627	NC_009785	TAT	2	6	2196130	2196135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150241
38628	NC_009785	AG	3	6	2196149	2196154	50 %	0 %	50 %	0 %	157150241
38629	NC_009785	AGA	2	6	2196169	2196174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150241
38630	NC_009785	ATG	2	6	2196216	2196221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150241
38631	NC_009785	TAA	2	6	2196348	2196353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150241
38632	NC_009785	ATT	2	6	2196392	2196397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150241
38633	NC_009785	ATT	2	6	2196430	2196435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150241
38634	NC_009785	A	6	6	2196474	2196479	100 %	0 %	0 %	0 %	157150241
38635	NC_009785	GAA	4	12	2196491	2196502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150241
38636	NC_009785	ATT	2	6	2196514	2196519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150241
38637	NC_009785	TC	3	6	2196541	2196546	0 %	50 %	0 %	50 %	157150241
38638	NC_009785	AAAC	2	8	2196551	2196558	75 %	0 %	0 %	25 %	157150241
38639	NC_009785	GAA	2	6	2196590	2196595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150241
38640	NC_009785	ATT	2	6	2196605	2196610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150241

< Previous12...66676869707172737475767778Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.