MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 38640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009785	TGA	2	6	24226	24231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150287
502	NC_009785	ATG	2	6	24246	24251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150287
503	NC_009785	GAT	2	6	24281	24286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150287
504	NC_009785	T	6	6	24402	24407	0 %	100 %	0 %	0 %	157150700
505	NC_009785	T	6	6	24433	24438	0 %	100 %	0 %	0 %	157150700
506	NC_009785	A	10	10	24443	24452	100 %	0 %	0 %	0 %	157150700
507	NC_009785	CA	3	6	24471	24476	50 %	0 %	0 %	50 %	157150700
508	NC_009785	GCTG	2	8	24538	24545	0 %	25 %	50 %	25 %	157149984
509	NC_009785	TTG	2	6	24645	24650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149984
510	NC_009785	GA	3	6	24675	24680	50 %	0 %	50 %	0 %	157149984
511	NC_009785	AGA	2	6	24862	24867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149984
512	NC_009785	GGTAA	2	10	24869	24878	40 %	20 %	40 %	0 %	157149984
513	NC_009785	TCA	2	6	24898	24903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149984
514	NC_009785	TGC	2	6	24910	24915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149984
515	NC_009785	ATT	3	9	24959	24967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149984
516	NC_009785	AGC	2	6	25006	25011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149984
517	NC_009785	CTC	2	6	25074	25079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149984
518	NC_009785	ATG	2	6	25107	25112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
519	NC_009785	TGA	2	6	25132	25137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
520	NC_009785	TGA	2	6	25168	25173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
521	NC_009785	CCA	2	6	25351	25356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149984
522	NC_009785	AGA	2	6	25387	25392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149984
523	NC_009785	AGA	2	6	25426	25431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149984
524	NC_009785	ATG	2	6	25481	25486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
525	NC_009785	GCTAT	2	10	25494	25503	20 %	40 %	20 %	20 %	157149984
526	NC_009785	CAG	2	6	25575	25580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149984
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528	NC_009785	ATT	2	6	25628	25633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149984
529	NC_009785	TGAT	2	8	25713	25720	25 %	50 %	25 %	0 %	157149984
530	NC_009785	GAT	2	6	25850	25855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
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532	NC_009785	AAAC	2	8	25944	25951	75 %	0 %	0 %	25 %	157149984
533	NC_009785	AGA	2	6	25960	25965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149984
534	NC_009785	AGTTC	2	10	26044	26053	20 %	40 %	20 %	20 %	157149984
535	NC_009785	TGA	2	6	26077	26082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
536	NC_009785	GAT	2	6	26204	26209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
537	NC_009785	AATC	2	8	26251	26258	50 %	25 %	0 %	25 %	157149984
538	NC_009785	CAG	2	6	26301	26306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149984
539	NC_009785	GGAA	2	8	26332	26339	50 %	0 %	50 %	0 %	157149984
540	NC_009785	GTA	2	6	26346	26351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149984
541	NC_009785	AAAAC	2	10	26368	26377	80 %	0 %	0 %	20 %	157149984
542	NC_009785	TGA	2	6	26726	26731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150426
543	NC_009785	A	6	6	26731	26736	100 %	0 %	0 %	0 %	157150426
544	NC_009785	TGCT	2	8	26834	26841	0 %	50 %	25 %	25 %	157150426
545	NC_009785	CTT	2	6	26844	26849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150426
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547	NC_009785	T	6	6	26893	26898	0 %	100 %	0 %	0 %	157150426
548	NC_009785	CAG	2	6	26903	26908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150426
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551	NC_009785	ACA	2	6	27052	27057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150426
552	NC_009785	CAG	2	6	27088	27093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150426
553	NC_009785	ATG	2	6	27094	27099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150426
554	NC_009785	T	6	6	27190	27195	0 %	100 %	0 %	0 %	157150426
555	NC_009785	ATG	2	6	27212	27217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150426
556	NC_009785	TAT	2	6	27255	27260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150426
557	NC_009785	ATG	2	6	27275	27280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150426
558	NC_009785	AGA	2	6	27285	27290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150426
559	NC_009785	TGT	2	6	27291	27296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150426
560	NC_009785	TCAG	2	8	27311	27318	25 %	25 %	25 %	25 %	157150426
561	NC_009785	TTG	2	6	27329	27334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150426
562	NC_009785	TCG	2	6	27378	27383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150426
563	NC_009785	ATGGAG	2	12	27527	27538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	157150426
564	NC_009785	GGA	2	6	27595	27600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157150426
565	NC_009785	TCT	2	6	27644	27649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150426
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573	NC_009785	AGCTT	2	10	27989	27998	20 %	40 %	20 %	20 %	157150426
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592	NC_009785	AAG	2	6	28759	28764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150251
593	NC_009785	GCAA	2	8	28826	28833	50 %	0 %	25 %	25 %	157150251
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613	NC_009785	CAA	2	6	29714	29719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149685
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622	NC_009785	TTGA	2	8	30137	30144	25 %	50 %	25 %	0 %	157149685
623	NC_009785	CT	3	6	30266	30271	0 %	50 %	0 %	50 %	157149685
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