MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu3

Total Repeats: 56427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009782	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978332
2	NC_009782	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156978332
3	NC_009782	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156978332
4	NC_009782	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156978332
5	NC_009782	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978332
6	NC_009782	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156978332
7	NC_009782	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156978332
8	NC_009782	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156978332
9	NC_009782	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	156978332
10	NC_009782	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156978332
11	NC_009782	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978332
12	NC_009782	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	156978332
13	NC_009782	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	156978332
14	NC_009782	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156978332
15	NC_009782	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156978332
16	NC_009782	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978332
17	NC_009782	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978332
18	NC_009782	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978332
19	NC_009782	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978332
20	NC_009782	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156978332
21	NC_009782	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978332
22	NC_009782	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156978332
23	NC_009782	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156978332
24	NC_009782	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978332
25	NC_009782	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978332
26	NC_009782	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156978332
27	NC_009782	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	156978332
28	NC_009782	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	156978332
29	NC_009782	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978332
30	NC_009782	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156978332
31	NC_009782	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	156978332
32	NC_009782	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	156978332
33	NC_009782	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	156978332
34	NC_009782	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978332
35	NC_009782	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156978332
36	NC_009782	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	156978332
37	NC_009782	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	156978332
38	NC_009782	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978332
39	NC_009782	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978332
40	NC_009782	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	156978333
41	NC_009782	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978333
42	NC_009782	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978333
43	NC_009782	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156978333
44	NC_009782	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978333
45	NC_009782	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156978333
46	NC_009782	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	156978333
47	NC_009782	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	156978333
48	NC_009782	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	156978333
49	NC_009782	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978333
50	NC_009782	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	156978333
51	NC_009782	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	156978333
52	NC_009782	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978333
53	NC_009782	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156978333
54	NC_009782	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	156978333
55	NC_009782	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978333
56	NC_009782	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156978333
57	NC_009782	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	156978333
58	NC_009782	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978333
59	NC_009782	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156978333
60	NC_009782	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	156978333
61	NC_009782	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978333
62	NC_009782	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156978333
63	NC_009782	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978333
64	NC_009782	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978333
65	NC_009782	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156978333
66	NC_009782	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156978333
67	NC_009782	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978333
68	NC_009782	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156978333
69	NC_009782	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	156978333
70	NC_009782	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	156978333
71	NC_009782	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	156978333
72	NC_009782	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978333
73	NC_009782	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978333
74	NC_009782	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156978333
75	NC_009782	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156978333
76	NC_009782	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	156978333
77	NC_009782	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978334
78	NC_009782	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978334
79	NC_009782	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978334
80	NC_009782	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978334
81	NC_009782	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156978334
82	NC_009782	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	156978334
83	NC_009782	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	156978334
84	NC_009782	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	156978334
85	NC_009782	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978335
86	NC_009782	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	156978335
87	NC_009782	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156978335
88	NC_009782	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	156978335
89	NC_009782	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978335
90	NC_009782	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156978335
91	NC_009782	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156978335
92	NC_009782	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156978335
93	NC_009782	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156978335
94	NC_009782	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	156978335
95	NC_009782	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156978335
96	NC_009782	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978335
97	NC_009782	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978335
98	NC_009782	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978335
99	NC_009782	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156978335
100	NC_009782	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978335
101	NC_009782	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978335
102	NC_009782	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978335
103	NC_009782	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978335
104	NC_009782	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156978336
105	NC_009782	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	156978336
106	NC_009782	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	156978336
107	NC_009782	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156978336
108	NC_009782	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156978336
109	NC_009782	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	156978336
110	NC_009782	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156978336
111	NC_009782	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156978336
112	NC_009782	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156978336
113	NC_009782	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156978336
114	NC_009782	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	156978336
115	NC_009782	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156978336
116	NC_009782	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	156978336
117	NC_009782	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978336
118	NC_009782	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156978336
119	NC_009782	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	156978336
120	NC_009782	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978336
121	NC_009782	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978336
122	NC_009782	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978336
123	NC_009782	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156978336
124	NC_009782	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156978336
125	NC_009782	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156978336
126	NC_009782	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978336
127	NC_009782	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	156978336
128	NC_009782	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978336
129	NC_009782	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978336
130	NC_009782	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156978336
131	NC_009782	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156978336
132	NC_009782	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	156978336
133	NC_009782	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156978336
134	NC_009782	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978336
135	NC_009782	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	156978336
136	NC_009782	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	156978336
137	NC_009782	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	156978336
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162	NC_009782	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156978337
163	NC_009782	A	6	6	7828	7833	100 %	0 %	0 %	0 %	156978337
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246	NC_009782	TAT	2	6	11286	11291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156978339
247	NC_009782	CAA	2	6	11305	11310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156978339
248	NC_009782	CT	3	6	11313	11318	0 %	50 %	0 %	50 %	156978339
249	NC_009782	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156978339
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252	NC_009782	AGA	2	6	11532	11537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978339
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257	NC_009782	AATG	2	8	11811	11818	50 %	25 %	25 %	0 %	156978339
258	NC_009782	GGT	2	6	11875	11880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156978339
259	NC_009782	ATC	2	6	11915	11920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156978339
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263	NC_009782	AAG	2	6	12140	12145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156978339
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388	NC_009782	TCAAT	2	10	18921	18930	40 %	40 %	0 %	20 %	156978345
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