MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 chromosome

Total Repeats: 76510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009665	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998556
2	NC_009665	CAG	2	6	439	444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998556
3	NC_009665	ATGG	2	8	478	485	25 %	25 %	50 %	0 %	152998556
4	NC_009665	GTC	2	6	620	625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998556
5	NC_009665	ACG	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998556
6	NC_009665	AGCCG	2	10	723	732	20 %	0 %	40 %	40 %	152998556
7	NC_009665	GCG	2	6	823	828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998556
8	NC_009665	GGT	2	6	850	855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998556
9	NC_009665	ATT	2	6	867	872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998556
10	NC_009665	TTG	2	6	907	912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998556
11	NC_009665	AAT	2	6	940	945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998556
12	NC_009665	GAA	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998556
13	NC_009665	TAC	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998556
14	NC_009665	GAT	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998556
15	NC_009665	T	6	6	1081	1086	0 %	100 %	0 %	0 %	152998556
16	NC_009665	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998556
17	NC_009665	TTC	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998556
18	NC_009665	CTTG	2	8	1134	1141	0 %	50 %	25 %	25 %	152998556
19	NC_009665	ATT	2	6	1156	1161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998556
20	NC_009665	TTGG	2	8	1223	1230	0 %	50 %	50 %	0 %	152998556
21	NC_009665	CCA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998556
22	NC_009665	AG	3	6	1299	1304	50 %	0 %	50 %	0 %	152998556
23	NC_009665	CTT	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998556
24	NC_009665	CGTG	2	8	1362	1369	0 %	25 %	50 %	25 %	152998556
25	NC_009665	CGCTAA	2	12	1398	1409	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152998556
26	NC_009665	TAC	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998556
27	NC_009665	TGT	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998556
28	NC_009665	CG	3	6	1575	1580	0 %	0 %	50 %	50 %	152998556
29	NC_009665	TAAC	2	8	1616	1623	50 %	25 %	0 %	25 %	152998556
30	NC_009665	TGG	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998556
31	NC_009665	CAC	2	6	1668	1673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998556
32	NC_009665	AG	3	6	1713	1718	50 %	0 %	50 %	0 %	152998556
33	NC_009665	AGA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998556
34	NC_009665	TCT	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998556
35	NC_009665	GT	3	6	1838	1843	0 %	50 %	50 %	0 %	152998557
36	NC_009665	CCT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152998557
37	NC_009665	AAGT	2	8	1896	1903	50 %	25 %	25 %	0 %	152998557
38	NC_009665	TCAC	2	8	1906	1913	25 %	25 %	0 %	50 %	152998557
39	NC_009665	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998557
40	NC_009665	TAC	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998557
41	NC_009665	GCT	2	6	2011	2016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998557
42	NC_009665	AAC	2	6	2061	2066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998557
43	NC_009665	ATA	2	6	2070	2075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998557
44	NC_009665	TGC	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998557
45	NC_009665	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998557
46	NC_009665	GT	3	6	2187	2192	0 %	50 %	50 %	0 %	152998557
47	NC_009665	TTA	2	6	2245	2250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998557
48	NC_009665	GC	3	6	2290	2295	0 %	0 %	50 %	50 %	152998557
49	NC_009665	CGAC	2	8	2301	2308	25 %	0 %	25 %	50 %	152998557
50	NC_009665	CTA	2	6	2463	2468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998557
51	NC_009665	AAGC	2	8	2579	2586	50 %	0 %	25 %	25 %	152998557
52	NC_009665	CGAA	2	8	2610	2617	50 %	0 %	25 %	25 %	152998557
53	NC_009665	GTG	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998557
54	NC_009665	GAA	2	6	2687	2692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998557
55	NC_009665	ATC	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998557
56	NC_009665	ACA	2	6	2718	2723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998557
57	NC_009665	CAA	2	6	2773	2778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998557
58	NC_009665	GAT	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998557
59	NC_009665	GAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998557
60	NC_009665	ATGT	2	8	2861	2868	25 %	50 %	25 %	0 %	152998557
61	NC_009665	CGTT	2	8	3239	3246	0 %	50 %	25 %	25 %	152998558
62	NC_009665	TAA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998558
63	NC_009665	GC	3	6	3320	3325	0 %	0 %	50 %	50 %	152998558
64	NC_009665	GTG	2	6	3360	3365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998558
65	NC_009665	CCG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998558
66	NC_009665	CGC	2	6	3554	3559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998558
67	NC_009665	CG	3	6	3753	3758	0 %	0 %	50 %	50 %	152998558
68	NC_009665	ACT	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998558
69	NC_009665	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998558
70	NC_009665	ACA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998558
71	NC_009665	GAT	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998558
72	NC_009665	TCCG	2	8	4003	4010	0 %	25 %	25 %	50 %	152998558
73	NC_009665	CTG	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998558
74	NC_009665	AC	3	6	4114	4119	50 %	0 %	0 %	50 %	152998558
75	NC_009665	ATA	2	6	4186	4191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998559
76	NC_009665	TTC	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998559
77	NC_009665	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
78	NC_009665	CAT	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998559
79	NC_009665	AGT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998559
80	NC_009665	GAA	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998559
81	NC_009665	GCA	2	6	4461	4466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
82	NC_009665	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998559
83	NC_009665	CGA	2	6	4505	4510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
84	NC_009665	TGG	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998559
85	NC_009665	TCG	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
86	NC_009665	TGA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998559
87	NC_009665	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998559
88	NC_009665	TAA	2	6	4883	4888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998559
89	NC_009665	CAA	2	6	4898	4903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998559
90	NC_009665	CAA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998559
91	NC_009665	TGG	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998559
92	NC_009665	CGA	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
93	NC_009665	AGTGA	2	10	5220	5229	40 %	20 %	40 %	0 %	152998559
94	NC_009665	CTG	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
95	NC_009665	GCCCGT	2	12	5328	5339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152998559
96	NC_009665	GCG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998559
97	NC_009665	CGT	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
98	NC_009665	GGT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998559
99	NC_009665	CTG	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
100	NC_009665	TGT	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998559
101	NC_009665	AAG	2	6	5587	5592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998559
102	NC_009665	CGA	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
103	NC_009665	CAT	4	12	5669	5680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998559
104	NC_009665	CTT	3	9	5729	5737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998559
105	NC_009665	ATTG	2	8	5753	5760	25 %	50 %	25 %	0 %	152998559
106	NC_009665	CCA	2	6	5787	5792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998559
107	NC_009665	GCAA	2	8	5812	5819	50 %	0 %	25 %	25 %	152998559
108	NC_009665	TTG	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998559
109	NC_009665	AGC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
110	NC_009665	ACC	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998559
111	NC_009665	TGG	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998559
112	NC_009665	AGC	2	6	6117	6122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998559
113	NC_009665	CTG	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998559
114	NC_009665	ACTA	2	8	6210	6217	50 %	25 %	0 %	25 %	152998559
115	NC_009665	CTT	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998559
116	NC_009665	GAA	2	6	6297	6302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998559
117	NC_009665	GGC	2	6	6303	6308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998559
118	NC_009665	TGA	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998559
119	NC_009665	GTT	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998559
120	NC_009665	TCT	2	6	6690	6695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998560
121	NC_009665	CAA	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998560
122	NC_009665	TGC	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998560
123	NC_009665	ACA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998560
124	NC_009665	CAT	2	6	6862	6867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998560
125	NC_009665	CG	3	6	7006	7011	0 %	0 %	50 %	50 %	152998560
126	NC_009665	GCA	2	6	7257	7262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998560
127	NC_009665	AGT	2	6	7326	7331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998560
128	NC_009665	TTGT	2	8	7356	7363	0 %	75 %	25 %	0 %	152998560
129	NC_009665	AGT	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998561
130	NC_009665	CTGC	2	8	7505	7512	0 %	25 %	25 %	50 %	152998561
131	NC_009665	TCG	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998561
132	NC_009665	AAT	2	6	7599	7604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998561
133	NC_009665	CTG	2	6	7624	7629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998561
134	NC_009665	TG	4	8	7701	7708	0 %	50 %	50 %	0 %	152998561
135	NC_009665	T	6	6	7880	7885	0 %	100 %	0 %	0 %	152998561
136	NC_009665	CTT	2	6	7903	7908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998561
137	NC_009665	AGC	2	6	7995	8000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998561
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139	NC_009665	CGC	2	6	8027	8032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998561
140	NC_009665	A	7	7	8194	8200	100 %	0 %	0 %	0 %	152998561
141	NC_009665	ATA	2	6	8249	8254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998561
142	NC_009665	TCTA	2	8	8280	8287	25 %	50 %	0 %	25 %	152998561
143	NC_009665	TTA	2	6	8366	8371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998561
144	NC_009665	ATC	2	6	8377	8382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998561
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146	NC_009665	TGT	2	6	8893	8898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998562
147	NC_009665	TAA	2	6	8933	8938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998562
148	NC_009665	ACA	2	6	9179	9184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998562
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151	NC_009665	CGA	2	6	9341	9346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998562
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159	NC_009665	TGC	2	6	9643	9648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998562
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163	NC_009665	ATT	2	6	9891	9896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998563
164	NC_009665	CAA	2	6	9897	9902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998563
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168	NC_009665	CAAA	2	8	10025	10032	75 %	0 %	0 %	25 %	152998563
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257	NC_009665	TA	3	6	15472	15477	50 %	50 %	0 %	0 %	152998566
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262	NC_009665	ATT	2	6	15722	15727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998566
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383	NC_009665	TGCAG	2	10	23860	23869	20 %	20 %	40 %	20 %	152998572
384	NC_009665	GGC	2	6	23878	23883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998572
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