MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfurovum sp. NBC37-1 chromosome

Total Repeats: 46547

< Previous12...82838485868788899091929394Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_009663	TACC	2	8	2559507	2559514	25 %	25 %	0 %	50 %	152994032
46502	NC_009663	GA	3	6	2559525	2559530	50 %	0 %	50 %	0 %	152994032
46503	NC_009663	CAG	2	6	2559537	2559542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994032
46504	NC_009663	TGC	2	6	2559544	2559549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152994032
46505	NC_009663	TGA	2	6	2559637	2559642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994032
46506	NC_009663	GTA	3	9	2559669	2559677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994032
46507	NC_009663	TGG	2	6	2559730	2559735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994032
46508	NC_009663	TAC	2	6	2559785	2559790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994032
46509	NC_009663	CCCGT	2	10	2560282	2560291	0 %	20 %	20 %	60 %	152994033
46510	NC_009663	ACCCG	2	10	2560298	2560307	20 %	0 %	20 %	60 %	152994033
46511	NC_009663	GGA	2	6	2560403	2560408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152994033
46512	NC_009663	GAC	2	6	2560413	2560418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994033
46513	NC_009663	GGC	2	6	2560427	2560432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152994033
46514	NC_009663	CTT	2	6	2560448	2560453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152994033
46515	NC_009663	GGT	2	6	2560467	2560472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152994033
46516	NC_009663	ACT	2	6	2560477	2560482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994033
46517	NC_009663	A	6	6	2560514	2560519	100 %	0 %	0 %	0 %	152994033
46518	NC_009663	ATC	2	6	2560593	2560598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994033
46519	NC_009663	GAG	2	6	2560599	2560604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152994033
46520	NC_009663	AGCAG	2	10	2560606	2560615	40 %	0 %	40 %	20 %	152994033
46521	NC_009663	GAT	2	6	2560667	2560672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152994033
46522	NC_009663	TAA	2	6	2560747	2560752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994034
46523	NC_009663	T	6	6	2560785	2560790	0 %	100 %	0 %	0 %	152994034
46524	NC_009663	CAT	2	6	2560811	2560816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994034
46525	NC_009663	TTC	2	6	2560825	2560830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152994034
46526	NC_009663	AG	3	6	2560890	2560895	50 %	0 %	50 %	0 %	152994034
46527	NC_009663	TGGG	2	8	2560933	2560940	0 %	25 %	75 %	0 %	152994034
46528	NC_009663	ATA	2	6	2561124	2561129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152994034
46529	NC_009663	GCC	2	6	2561148	2561153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152994034
46530	NC_009663	CTTTTT	2	12	2561190	2561201	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152994034
46531	NC_009663	T	6	6	2561245	2561250	0 %	100 %	0 %	0 %	152994034
46532	NC_009663	CAC	2	6	2561288	2561293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152994034
46533	NC_009663	CAT	2	6	2561363	2561368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994034
46534	NC_009663	TC	3	6	2561458	2561463	0 %	50 %	0 %	50 %	152994034
46535	NC_009663	CTT	2	6	2561722	2561727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152994035
46536	NC_009663	CT	3	6	2561739	2561744	0 %	50 %	0 %	50 %	152994035
46537	NC_009663	T	6	6	2561800	2561805	0 %	100 %	0 %	0 %	152994035
46538	NC_009663	T	6	6	2561875	2561880	0 %	100 %	0 %	0 %	152994035
46539	NC_009663	GT	3	6	2561892	2561897	0 %	50 %	50 %	0 %	152994035
46540	NC_009663	AG	4	8	2561933	2561940	50 %	0 %	50 %	0 %	152994035
46541	NC_009663	A	6	6	2561989	2561994	100 %	0 %	0 %	0 %	152994035
46542	NC_009663	CTA	2	6	2562054	2562059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152994035
46543	NC_009663	CGA	2	6	2562063	2562068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152994035
46544	NC_009663	TCTTGA	2	12	2562090	2562101	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152994035
46545	NC_009663	T	6	6	2562128	2562133	0 %	100 %	0 %	0 %	152994035
46546	NC_009663	GGA	2	6	2562144	2562149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152994035
46547	NC_009663	ATTC	2	8	2562193	2562200	25 %	50 %	0 %	25 %	152994035

< Previous12...82838485868788899091929394Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.