MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 56855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45003	NC_009632	TCA	2	6	2287516	2287521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394644
45004	NC_009632	AT	3	6	2287564	2287569	50 %	50 %	0 %	0 %	150394644
45005	NC_009632	TGC	2	6	2288205	2288210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394645
45006	NC_009632	ATT	2	6	2288300	2288305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394645
45007	NC_009632	CGT	2	6	2288323	2288328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394645
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45010	NC_009632	TAC	2	6	2288525	2288530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394645
45011	NC_009632	AGC	2	6	2288568	2288573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150394645
45012	NC_009632	GTT	2	6	2288596	2288601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394645
45013	NC_009632	TTC	2	6	2288661	2288666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394645
45014	NC_009632	ATA	2	6	2288672	2288677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394645
45015	NC_009632	TTA	2	6	2288683	2288688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394645
45016	NC_009632	TCAAT	2	10	2288915	2288924	40 %	40 %	0 %	20 %	150394646
45017	NC_009632	ACCA	2	8	2288969	2288976	50 %	0 %	0 %	50 %	150394646
45018	NC_009632	ATC	2	6	2289011	2289016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394646
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45020	NC_009632	T	7	7	2289144	2289150	0 %	100 %	0 %	0 %	150394646
45021	NC_009632	TAC	2	6	2289187	2289192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394646
45022	NC_009632	T	6	6	2289194	2289199	0 %	100 %	0 %	0 %	150394646
45023	NC_009632	TCA	2	6	2289216	2289221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394646
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45025	NC_009632	CTT	2	6	2289280	2289285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394646
45026	NC_009632	TAG	2	6	2289305	2289310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394646
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45028	NC_009632	ATA	3	9	2289339	2289347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394646
45029	NC_009632	TCA	2	6	2289357	2289362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394646
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45031	NC_009632	T	6	6	2289518	2289523	0 %	100 %	0 %	0 %	150394646
45032	NC_009632	AAAT	2	8	2289537	2289544	75 %	25 %	0 %	0 %	150394646
45033	NC_009632	CATT	2	8	2289546	2289553	25 %	50 %	0 %	25 %	150394646
45034	NC_009632	AT	3	6	2289559	2289564	50 %	50 %	0 %	0 %	150394646
45035	NC_009632	CAT	2	6	2290113	2290118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394647
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45039	NC_009632	TAA	2	6	2290246	2290251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394647
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45113	NC_009632	AAC	2	6	2293746	2293751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150394651
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45117	NC_009632	ATC	2	6	2293857	2293862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394651
45118	NC_009632	CAT	2	6	2293890	2293895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394651
45119	NC_009632	T	6	6	2293944	2293949	0 %	100 %	0 %	0 %	150394651
45120	NC_009632	TCG	2	6	2294011	2294016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394651
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45133	NC_009632	T	6	6	2294481	2294486	0 %	100 %	0 %	0 %	150394651
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45146	NC_009632	TACG	2	8	2295352	2295359	25 %	25 %	25 %	25 %	150394652
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45157	NC_009632	CTG	2	6	2295769	2295774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394652
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45162	NC_009632	T	6	6	2296325	2296330	0 %	100 %	0 %	0 %	150394653
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45171	NC_009632	A	6	6	2296812	2296817	100 %	0 %	0 %	0 %	150394653
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45232	NC_009632	AATT	2	8	2300611	2300618	50 %	50 %	0 %	0 %	150394657
45233	NC_009632	GCA	2	6	2300645	2300650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150394657
45234	NC_009632	ATTA	2	8	2300652	2300659	50 %	50 %	0 %	0 %	150394657
45235	NC_009632	CTA	2	6	2300738	2300743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394657
45236	NC_009632	CAC	2	6	2300807	2300812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150394657
45237	NC_009632	AT	3	6	2300824	2300829	50 %	50 %	0 %	0 %	150394657
45238	NC_009632	ATC	2	6	2300887	2300892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394658
45239	NC_009632	AGT	2	6	2300955	2300960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394658
45240	NC_009632	CT	3	6	2301027	2301032	0 %	50 %	0 %	50 %	150394658
45241	NC_009632	TG	3	6	2301101	2301106	0 %	50 %	50 %	0 %	150394658
45242	NC_009632	AAT	2	6	2301123	2301128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394658
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45245	NC_009632	AT	3	6	2301355	2301360	50 %	50 %	0 %	0 %	150394658
45246	NC_009632	CTT	2	6	2301404	2301409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394658
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45249	NC_009632	TTAG	2	8	2301571	2301578	25 %	50 %	25 %	0 %	150394658
45250	NC_009632	TAA	2	6	2301668	2301673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394658
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45254	NC_009632	TTA	2	6	2302245	2302250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394659
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45265	NC_009632	TTG	2	6	2302857	2302862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394659
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45303	NC_009632	ATTT	2	8	2304943	2304950	25 %	75 %	0 %	0 %	150394662
45304	NC_009632	A	6	6	2304960	2304965	100 %	0 %	0 %	0 %	150394662
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45310	NC_009632	CAT	2	6	2305148	2305153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394662
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45321	NC_009632	A	6	6	2305586	2305591	100 %	0 %	0 %	0 %	150394662
45322	NC_009632	ACA	2	6	2305617	2305622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150394662
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45329	NC_009632	TGC	2	6	2307787	2307792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394663
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45331	NC_009632	TCT	2	6	2307932	2307937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394663
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45333	NC_009632	TGA	2	6	2308021	2308026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394663
45334	NC_009632	T	6	6	2308089	2308094	0 %	100 %	0 %	0 %	150394663
45335	NC_009632	ATCT	2	8	2308156	2308163	25 %	50 %	0 %	25 %	150394663
45336	NC_009632	TCTTG	2	10	2308178	2308187	0 %	60 %	20 %	20 %	150394663
45337	NC_009632	TCT	2	6	2308259	2308264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394663
45338	NC_009632	ATA	2	6	2308303	2308308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394663
45339	NC_009632	TTG	2	6	2308312	2308317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394663
45340	NC_009632	TTG	2	6	2308339	2308344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394663
45341	NC_009632	ATG	2	6	2308418	2308423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394663
45342	NC_009632	TC	4	8	2308506	2308513	0 %	50 %	0 %	50 %	150394663
45343	NC_009632	ATT	2	6	2308552	2308557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394663
45344	NC_009632	TCCA	2	8	2308573	2308580	25 %	25 %	0 %	50 %	150394663
45345	NC_009632	ATT	2	6	2308706	2308711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394664
45346	NC_009632	ATC	2	6	2308772	2308777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394664
45347	NC_009632	TTG	2	6	2308787	2308792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394664
45348	NC_009632	TTC	2	6	2308844	2308849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394664
45349	NC_009632	ATC	2	6	2308869	2308874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394664
45350	NC_009632	GCT	2	6	2308950	2308955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150394664
45351	NC_009632	ATC	2	6	2309004	2309009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394664
45352	NC_009632	GTT	2	6	2309014	2309019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394664
45353	NC_009632	ATAA	2	8	2309032	2309039	75 %	25 %	0 %	0 %	150394664
45354	NC_009632	AT	3	6	2309043	2309048	50 %	50 %	0 %	0 %	150394664
45355	NC_009632	ATG	2	6	2309087	2309092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394664
45356	NC_009632	TCA	3	9	2309109	2309117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394664
45357	NC_009632	CAC	2	6	2309159	2309164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150394664
45358	NC_009632	TGT	2	6	2309226	2309231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394664
45359	NC_009632	AT	3	6	2309320	2309325	50 %	50 %	0 %	0 %	150394664
45360	NC_009632	ATA	2	6	2309362	2309367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394664
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45362	NC_009632	ATT	2	6	2309692	2309697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394665
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45364	NC_009632	ATA	2	6	2309762	2309767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394665
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45367	NC_009632	CTT	2	6	2309845	2309850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394665
45368	NC_009632	ATA	2	6	2309871	2309876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394665
45369	NC_009632	CAC	2	6	2309887	2309892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150394665
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45371	NC_009632	CTT	2	6	2309902	2309907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150394665
45372	NC_009632	CAA	2	6	2309956	2309961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150394665
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45378	NC_009632	ATA	2	6	2310268	2310273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394665
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45381	NC_009632	TTA	2	6	2310411	2310416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394665
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45435	NC_009632	ATTT	2	8	2312968	2312975	25 %	75 %	0 %	0 %	150394666
45436	NC_009632	TAT	2	6	2312999	2313004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394666
45437	NC_009632	GGATTT	2	12	2313058	2313069	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150394666
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45443	NC_009632	TCA	2	6	2313355	2313360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150394666
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45449	NC_009632	A	6	6	2313592	2313597	100 %	0 %	0 %	0 %	150394666
45450	NC_009632	AAAC	2	8	2313616	2313623	75 %	0 %	0 %	25 %	150394666
45451	NC_009632	CCAT	2	8	2313632	2313639	25 %	25 %	0 %	50 %	150394666
45452	NC_009632	GAA	2	6	2313676	2313681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150394666
45453	NC_009632	A	7	7	2313696	2313702	100 %	0 %	0 %	0 %	150394666
45454	NC_009632	GAT	2	6	2313703	2313708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394666
45455	NC_009632	ATA	2	6	2313714	2313719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150394666
45456	NC_009632	AT	3	6	2313811	2313816	50 %	50 %	0 %	0 %	150394667
45457	NC_009632	TTCATT	2	12	2313901	2313912	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150394667
45458	NC_009632	CAAA	2	8	2313927	2313934	75 %	0 %	0 %	25 %	150394667
45459	NC_009632	A	6	6	2313932	2313937	100 %	0 %	0 %	0 %	150394667
45460	NC_009632	ATT	2	6	2314037	2314042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150394667
45461	NC_009632	GAT	2	6	2314136	2314141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150394667
45462	NC_009632	GGTA	2	8	2314207	2314214	25 %	25 %	50 %	0 %	150394667
45463	NC_009632	TCAT	2	8	2314309	2314316	25 %	50 %	0 %	25 %	150394667
45464	NC_009632	AAATC	2	10	2314318	2314327	60 %	20 %	0 %	20 %	150394667
45465	NC_009632	TTG	2	6	2314338	2314343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150394667
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