MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 56855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009632	ACA	2	6	507551	507556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392957
10002	NC_009632	AGTG	2	8	507565	507572	25 %	25 %	50 %	0 %	150392957
10003	NC_009632	TCA	2	6	507573	507578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392957
10004	NC_009632	TTA	2	6	507608	507613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392957
10005	NC_009632	GTTA	2	8	507670	507677	25 %	50 %	25 %	0 %	150392957
10006	NC_009632	ATT	2	6	507720	507725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392957
10007	NC_009632	GAA	2	6	507727	507732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392957
10008	NC_009632	AGG	2	6	507741	507746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150392957
10009	NC_009632	ACA	2	6	507758	507763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392958
10010	NC_009632	TTA	2	6	507804	507809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392958
10011	NC_009632	CGATTT	2	12	507822	507833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150392958
10012	NC_009632	GCA	2	6	507836	507841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392958
10013	NC_009632	GTG	2	6	507960	507965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392958
10014	NC_009632	CAT	2	6	508089	508094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
10015	NC_009632	AT	3	6	508093	508098	50 %	50 %	0 %	0 %	150392958
10016	NC_009632	ATGTTG	2	12	508110	508121	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392958
10017	NC_009632	CTA	2	6	508130	508135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
10018	NC_009632	ATCAT	2	10	508165	508174	40 %	40 %	0 %	20 %	150392958
10019	NC_009632	ATG	2	6	508179	508184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392958
10020	NC_009632	AAT	2	6	508204	508209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392958
10021	NC_009632	CATG	2	8	508331	508338	25 %	25 %	25 %	25 %	150392958
10022	NC_009632	TGT	2	6	508518	508523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392958
10023	NC_009632	AAC	2	6	508551	508556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392958
10024	NC_009632	ATT	2	6	508569	508574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392958
10025	NC_009632	TGA	2	6	508612	508617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392958
10026	NC_009632	AGTC	2	8	508623	508630	25 %	25 %	25 %	25 %	150392958
10027	NC_009632	CAT	2	6	508680	508685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
10028	NC_009632	TAC	2	6	508691	508696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
10029	NC_009632	TAC	2	6	508719	508724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
10030	NC_009632	GCA	2	6	508763	508768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392958
10031	NC_009632	A	6	6	508842	508847	100 %	0 %	0 %	0 %	150392958
10032	NC_009632	GGCG	2	8	508870	508877	0 %	0 %	75 %	25 %	150392958
10033	NC_009632	AC	3	6	508950	508955	50 %	0 %	0 %	50 %	150392958
10034	NC_009632	TGA	2	6	508963	508968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392958
10035	NC_009632	ATA	2	6	508971	508976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392958
10036	NC_009632	GTTC	2	8	509033	509040	0 %	50 %	25 %	25 %	150392958
10037	NC_009632	AGC	2	6	509065	509070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392958
10038	NC_009632	CCG	2	6	509174	509179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150392958
10039	NC_009632	ACA	2	6	509230	509235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392958
10040	NC_009632	TGA	2	6	509274	509279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392958
10041	NC_009632	AAT	2	6	509282	509287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392958
10042	NC_009632	CG	3	6	509375	509380	0 %	0 %	50 %	50 %	150392958
10043	NC_009632	A	6	6	509388	509393	100 %	0 %	0 %	0 %	150392958
10044	NC_009632	GAGCAA	2	12	509483	509494	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150392958
10045	NC_009632	CGTT	2	8	509550	509557	0 %	50 %	25 %	25 %	150392958
10046	NC_009632	AAT	2	6	509588	509593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392958
10047	NC_009632	CAT	2	6	509597	509602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
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10049	NC_009632	TTA	2	6	509657	509662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392958
10050	NC_009632	GAT	2	6	509665	509670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392958
10051	NC_009632	GT	3	6	509712	509717	0 %	50 %	50 %	0 %	150392958
10052	NC_009632	GCA	2	6	509744	509749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392958
10053	NC_009632	CAT	2	6	509753	509758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
10054	NC_009632	GAT	2	6	509851	509856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392958
10055	NC_009632	ATC	2	6	509913	509918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
10056	NC_009632	GAA	2	6	509924	509929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392958
10057	NC_009632	CAT	2	6	509991	509996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
10058	NC_009632	GAC	2	6	510006	510011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392958
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10060	NC_009632	CAT	2	6	510103	510108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392958
10061	NC_009632	CGTCA	2	10	510208	510217	20 %	20 %	20 %	40 %	150392958
10062	NC_009632	GCT	2	6	510284	510289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392958
10063	NC_009632	TGT	2	6	510349	510354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392958
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10065	NC_009632	ATT	2	6	510742	510747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392959
10066	NC_009632	CAG	2	6	510770	510775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392959
10067	NC_009632	GT	4	8	510782	510789	0 %	50 %	50 %	0 %	150392959
10068	NC_009632	TGA	2	6	510896	510901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392959
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10072	NC_009632	A	6	6	511265	511270	100 %	0 %	0 %	0 %	150392960
10073	NC_009632	TTG	2	6	511287	511292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392960
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10076	NC_009632	CTAA	2	8	511406	511413	50 %	25 %	0 %	25 %	150392960
10077	NC_009632	TA	3	6	511429	511434	50 %	50 %	0 %	0 %	150392960
10078	NC_009632	TAA	2	6	511475	511480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392960
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10085	NC_009632	TCA	2	6	511995	512000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392961
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10087	NC_009632	ATT	2	6	512104	512109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392961
10088	NC_009632	ATT	3	9	512129	512137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392961
10089	NC_009632	TGC	2	6	512143	512148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392961
10090	NC_009632	ATT	2	6	512206	512211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392961
10091	NC_009632	GGC	2	6	512255	512260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150392961
10092	NC_009632	ATC	2	6	512319	512324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392961
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10096	NC_009632	GTT	2	6	512511	512516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392962
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10101	NC_009632	GCA	2	6	512689	512694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392962
10102	NC_009632	TGTCA	2	10	512716	512725	20 %	40 %	20 %	20 %	150392962
10103	NC_009632	A	6	6	512736	512741	100 %	0 %	0 %	0 %	150392962
10104	NC_009632	TGA	2	6	512743	512748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392962
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10106	NC_009632	AGCA	2	8	512811	512818	50 %	0 %	25 %	25 %	150392962
10107	NC_009632	AGC	2	6	512833	512838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392962
10108	NC_009632	TGA	2	6	512842	512847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392962
10109	NC_009632	TGA	2	6	512884	512889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392962
10110	NC_009632	TTA	2	6	512910	512915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392962
10111	NC_009632	AT	3	6	512928	512933	50 %	50 %	0 %	0 %	150392962
10112	NC_009632	TGG	2	6	512938	512943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392962
10113	NC_009632	TTTA	2	8	512978	512985	25 %	75 %	0 %	0 %	150392962
10114	NC_009632	CAT	2	6	513035	513040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392962
10115	NC_009632	AGA	2	6	513073	513078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392962
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10117	NC_009632	ACA	2	6	513492	513497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392963
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10119	NC_009632	ATTT	2	8	513522	513529	25 %	75 %	0 %	0 %	150392963
10120	NC_009632	AT	3	6	513579	513584	50 %	50 %	0 %	0 %	150392963
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10481	NC_009632	CTG	3	9	531008	531016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392977
10482	NC_009632	CTA	2	6	531028	531033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392977
10483	NC_009632	TTA	2	6	531079	531084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392977
10484	NC_009632	CGT	2	6	531130	531135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392977
10485	NC_009632	GAA	2	6	531148	531153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392977
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10488	NC_009632	ATTAT	2	10	531232	531241	40 %	60 %	0 %	0 %	150392977
10489	NC_009632	ATT	2	6	531314	531319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392977
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10500	NC_009632	TGC	2	6	531864	531869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392977

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