MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 56855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_009632	GCC	2	6	2812018	2812023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150395144
55002	NC_009632	CAG	2	6	2812121	2812126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395144
55003	NC_009632	TAC	2	6	2812131	2812136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395144
55004	NC_009632	TGA	2	6	2812221	2812226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395144
55005	NC_009632	TGTT	2	8	2812265	2812272	0 %	75 %	25 %	0 %	150395144
55006	NC_009632	GCTAT	2	10	2812273	2812282	20 %	40 %	20 %	20 %	150395144
55007	NC_009632	CAT	2	6	2812286	2812291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395144
55008	NC_009632	GTT	2	6	2812294	2812299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150395144
55009	NC_009632	TTA	2	6	2812300	2812305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395144
55010	NC_009632	CTT	2	6	2812322	2812327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395144
55011	NC_009632	GCA	2	6	2812354	2812359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395144
55012	NC_009632	TTG	2	6	2812400	2812405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150395144
55013	NC_009632	TGT	2	6	2812416	2812421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150395144
55014	NC_009632	TGT	2	6	2812455	2812460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150395144
55015	NC_009632	TGTTTG	2	12	2812478	2812489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150395144
55016	NC_009632	T	7	7	2812549	2812555	0 %	100 %	0 %	0 %	150395144
55017	NC_009632	ATT	2	6	2812572	2812577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395144
55018	NC_009632	TGA	2	6	2812624	2812629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395144
55019	NC_009632	ATAGT	2	10	2812643	2812652	40 %	40 %	20 %	0 %	150395144
55020	NC_009632	CTA	2	6	2812658	2812663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395144
55021	NC_009632	AAT	2	6	2812724	2812729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395144
55022	NC_009632	T	7	7	2812736	2812742	0 %	100 %	0 %	0 %	150395144
55023	NC_009632	ACAT	2	8	2813101	2813108	50 %	25 %	0 %	25 %	150395145
55024	NC_009632	AAC	2	6	2813152	2813157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150395145
55025	NC_009632	AAT	2	6	2813182	2813187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395145
55026	NC_009632	TAA	2	6	2813313	2813318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395145
55027	NC_009632	TGC	2	6	2813369	2813374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150395145
55028	NC_009632	TTA	2	6	2813385	2813390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395145
55029	NC_009632	AT	3	6	2813409	2813414	50 %	50 %	0 %	0 %	150395145
55030	NC_009632	CAT	2	6	2813415	2813420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395145
55031	NC_009632	A	6	6	2813432	2813437	100 %	0 %	0 %	0 %	150395145
55032	NC_009632	ATA	2	6	2813535	2813540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395145
55033	NC_009632	TTA	2	6	2813549	2813554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395145
55034	NC_009632	TAA	2	6	2813595	2813600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395145
55035	NC_009632	ATAA	2	8	2813650	2813657	75 %	25 %	0 %	0 %	150395145
55036	NC_009632	TAT	2	6	2813766	2813771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395145
55037	NC_009632	TG	3	6	2813909	2813914	0 %	50 %	50 %	0 %	150395146
55038	NC_009632	TTA	2	6	2813920	2813925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395146
55039	NC_009632	T	6	6	2813970	2813975	0 %	100 %	0 %	0 %	150395146
55040	NC_009632	CAA	2	6	2813990	2813995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150395146
55041	NC_009632	T	6	6	2814060	2814065	0 %	100 %	0 %	0 %	150395146
55042	NC_009632	ATC	2	6	2814084	2814089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395146
55043	NC_009632	TGT	2	6	2814094	2814099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150395146
55044	NC_009632	TAA	2	6	2814119	2814124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395146
55045	NC_009632	T	7	7	2814240	2814246	0 %	100 %	0 %	0 %	150395146
55046	NC_009632	CCA	2	6	2814262	2814267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150395146
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55048	NC_009632	ACT	2	6	2814352	2814357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395146
55049	NC_009632	TCT	2	6	2814379	2814384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395146
55050	NC_009632	TTC	2	6	2814417	2814422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395146
55051	NC_009632	CTT	3	9	2814425	2814433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395146
55052	NC_009632	TTGGT	2	10	2814452	2814461	0 %	60 %	40 %	0 %	150395146
55053	NC_009632	ATC	2	6	2814480	2814485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395146
55054	NC_009632	GATT	2	8	2814554	2814561	25 %	50 %	25 %	0 %	150395146
55055	NC_009632	CCAA	2	8	2814569	2814576	50 %	0 %	0 %	50 %	150395146
55056	NC_009632	CAC	2	6	2814602	2814607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150395146
55057	NC_009632	TTG	2	6	2814654	2814659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150395146
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55059	NC_009632	TGTT	2	8	2814762	2814769	0 %	75 %	25 %	0 %	150395146
55060	NC_009632	CTT	2	6	2814785	2814790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395146
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55062	NC_009632	TTAA	2	8	2814887	2814894	50 %	50 %	0 %	0 %	150395147
55063	NC_009632	ATA	2	6	2814914	2814919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395147
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55069	NC_009632	ATG	2	6	2815076	2815081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395147
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55083	NC_009632	T	6	6	2815585	2815590	0 %	100 %	0 %	0 %	150395147
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55089	NC_009632	CCT	2	6	2815916	2815921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150395147
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55101	NC_009632	TA	4	8	2816685	2816692	50 %	50 %	0 %	0 %	150395148
55102	NC_009632	ACC	2	6	2816743	2816748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150395148
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55115	NC_009632	TCT	2	6	2817427	2817432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395149
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55117	NC_009632	CAT	2	6	2817599	2817604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395149
55118	NC_009632	CT	3	6	2817612	2817617	0 %	50 %	0 %	50 %	150395149
55119	NC_009632	GAAT	2	8	2817650	2817657	50 %	25 %	25 %	0 %	150395149
55120	NC_009632	ATC	2	6	2817663	2817668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395149
55121	NC_009632	TCT	2	6	2817682	2817687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395149
55122	NC_009632	TTTA	2	8	2817729	2817736	25 %	75 %	0 %	0 %	150395149
55123	NC_009632	TCA	2	6	2817739	2817744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395149
55124	NC_009632	AAT	2	6	2817750	2817755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395149
55125	NC_009632	AT	3	6	2817758	2817763	50 %	50 %	0 %	0 %	150395149
55126	NC_009632	CTA	2	6	2817878	2817883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395149
55127	NC_009632	T	6	6	2817885	2817890	0 %	100 %	0 %	0 %	150395149
55128	NC_009632	CGC	2	6	2818004	2818009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150395149
55129	NC_009632	GAT	2	6	2818073	2818078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395149
55130	NC_009632	AT	3	6	2818087	2818092	50 %	50 %	0 %	0 %	150395149
55131	NC_009632	AATA	2	8	2818095	2818102	75 %	25 %	0 %	0 %	150395149
55132	NC_009632	TCG	3	9	2818110	2818118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150395149
55133	NC_009632	GATT	2	8	2818136	2818143	25 %	50 %	25 %	0 %	150395149
55134	NC_009632	ATC	2	6	2818224	2818229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395149
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55137	NC_009632	ATT	2	6	2818288	2818293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395149
55138	NC_009632	AAT	2	6	2818327	2818332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395149
55139	NC_009632	TCT	2	6	2818342	2818347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395149
55140	NC_009632	T	7	7	2818364	2818370	0 %	100 %	0 %	0 %	150395149
55141	NC_009632	CAT	2	6	2818385	2818390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395149
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55143	NC_009632	GCT	2	6	2818432	2818437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150395149
55144	NC_009632	CTCTT	2	10	2818467	2818476	0 %	60 %	0 %	40 %	150395149
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55147	NC_009632	AAT	2	6	2819009	2819014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395150
55148	NC_009632	TCT	2	6	2819096	2819101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395150
55149	NC_009632	TGA	2	6	2819178	2819183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395150
55150	NC_009632	TC	3	6	2819225	2819230	0 %	50 %	0 %	50 %	150395150
55151	NC_009632	ATT	2	6	2819248	2819253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395150
55152	NC_009632	AT	4	8	2819296	2819303	50 %	50 %	0 %	0 %	150395150
55153	NC_009632	TTG	3	9	2819328	2819336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150395150
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55155	NC_009632	AT	3	6	2819366	2819371	50 %	50 %	0 %	0 %	150395150
55156	NC_009632	T	6	6	2819386	2819391	0 %	100 %	0 %	0 %	150395150
55157	NC_009632	TTC	2	6	2819444	2819449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395150
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55159	NC_009632	GCT	2	6	2820011	2820016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150395151
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55162	NC_009632	GT	3	6	2820150	2820155	0 %	50 %	50 %	0 %	150395151
55163	NC_009632	GT	3	6	2820280	2820285	0 %	50 %	50 %	0 %	150395151
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55175	NC_009632	TATT	2	8	2820833	2820840	25 %	75 %	0 %	0 %	150395151
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55181	NC_009632	AATC	2	8	2821260	2821267	50 %	25 %	0 %	25 %	150395151
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55224	NC_009632	TTCG	2	8	2823614	2823621	0 %	50 %	25 %	25 %	150395154
55225	NC_009632	CAA	2	6	2823626	2823631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150395154
55226	NC_009632	A	6	6	2823668	2823673	100 %	0 %	0 %	0 %	150395154
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55228	NC_009632	ATC	2	6	2823739	2823744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395154
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55230	NC_009632	CAA	2	6	2823833	2823838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150395154
55231	NC_009632	AAC	2	6	2823850	2823855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150395154
55232	NC_009632	ACA	2	6	2823868	2823873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150395154
55233	NC_009632	ATG	2	6	2823942	2823947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395154
55234	NC_009632	TAA	2	6	2824054	2824059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395154
55235	NC_009632	GCA	2	6	2824123	2824128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395154
55236	NC_009632	ACA	2	6	2824165	2824170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150395154
55237	NC_009632	TA	3	6	2824176	2824181	50 %	50 %	0 %	0 %	150395154
55238	NC_009632	ATTT	2	8	2824220	2824227	25 %	75 %	0 %	0 %	150395154
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55259	NC_009632	ATC	2	6	2824846	2824851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395154
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55262	NC_009632	ACAAA	2	10	2825015	2825024	80 %	0 %	0 %	20 %	150395154
55263	NC_009632	AATT	2	8	2825031	2825038	50 %	50 %	0 %	0 %	150395154
55264	NC_009632	GAT	3	9	2825048	2825056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395154
55265	NC_009632	GAT	2	6	2825081	2825086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150395154
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55325	NC_009632	TAT	2	6	2827967	2827972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395156
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55330	NC_009632	TAAT	2	8	2828336	2828343	50 %	50 %	0 %	0 %	150395157
55331	NC_009632	TCC	2	6	2828469	2828474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150395157
55332	NC_009632	ACC	2	6	2828475	2828480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150395157
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55334	NC_009632	AAT	2	6	2828568	2828573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395157
55335	NC_009632	ATA	2	6	2828600	2828605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395157
55336	NC_009632	CTTGT	2	10	2828711	2828720	0 %	60 %	20 %	20 %	150395157
55337	NC_009632	GACT	2	8	2828727	2828734	25 %	25 %	25 %	25 %	150395157
55338	NC_009632	TAT	2	6	2828750	2828755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395157
55339	NC_009632	TAA	2	6	2828763	2828768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395157
55340	NC_009632	TCT	2	6	2828864	2828869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395157
55341	NC_009632	AAT	2	6	2828886	2828891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395157
55342	NC_009632	GCTT	2	8	2828896	2828903	0 %	50 %	25 %	25 %	150395157
55343	NC_009632	GT	3	6	2828921	2828926	0 %	50 %	50 %	0 %	150395157
55344	NC_009632	CAT	2	6	2828945	2828950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395157
55345	NC_009632	T	6	6	2828982	2828987	0 %	100 %	0 %	0 %	150395157
55346	NC_009632	ATTT	2	8	2829011	2829018	25 %	75 %	0 %	0 %	150395157
55347	NC_009632	TTTA	2	8	2829069	2829076	25 %	75 %	0 %	0 %	150395157
55348	NC_009632	TAA	2	6	2829105	2829110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395157
55349	NC_009632	AGC	2	6	2829192	2829197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150395157
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55469	NC_009632	ATC	2	6	2835027	2835032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395160
55470	NC_009632	TTG	2	6	2835084	2835089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150395160
55471	NC_009632	TTA	2	6	2835142	2835147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150395160
55472	NC_009632	ATC	2	6	2835186	2835191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150395160
55473	NC_009632	TTC	2	6	2835204	2835209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150395160
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55475	NC_009632	GAAA	2	8	2835469	2835476	75 %	0 %	25 %	0 %	150395160
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55496	NC_009632	TA	3	6	2836943	2836948	50 %	50 %	0 %	0 %	150395161
55497	NC_009632	AAT	3	9	2837028	2837036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150395161
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55499	NC_009632	TA	3	6	2837147	2837152	50 %	50 %	0 %	0 %	150395161
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