MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 56855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009632	TAT	2	6	765	770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
2	NC_009632	CAA	2	6	803	808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392481
3	NC_009632	TGT	2	6	841	846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392481
4	NC_009632	TAC	2	6	874	879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392481
5	NC_009632	GAA	2	6	881	886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
6	NC_009632	TAA	2	6	901	906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392481
7	NC_009632	ACA	2	6	929	934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392481
8	NC_009632	AAC	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392481
9	NC_009632	AG	3	6	977	982	50 %	0 %	50 %	0 %	150392481
10	NC_009632	GCA	2	6	1046	1051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392481
11	NC_009632	ATT	2	6	1093	1098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
12	NC_009632	GGTT	2	8	1111	1118	0 %	50 %	50 %	0 %	150392481
13	NC_009632	ATGC	2	8	1136	1143	25 %	25 %	25 %	25 %	150392481
14	NC_009632	TCA	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392481
15	NC_009632	ATA	2	6	1164	1169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392481
16	NC_009632	TTA	2	6	1221	1226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
17	NC_009632	TTA	2	6	1286	1291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
18	NC_009632	GAT	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392481
19	NC_009632	AAG	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
20	NC_009632	ACC	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392481
21	NC_009632	AGA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
22	NC_009632	TTG	2	6	1464	1469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392481
23	NC_009632	CCA	2	6	1478	1483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392481
24	NC_009632	AGA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
25	NC_009632	GAA	3	9	1523	1531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
26	NC_009632	CCA	2	6	1544	1549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392481
27	NC_009632	TA	3	6	1562	1567	50 %	50 %	0 %	0 %	150392481
28	NC_009632	CAAAT	2	10	1569	1578	60 %	20 %	0 %	20 %	150392481
29	NC_009632	ATT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392481
30	NC_009632	CTG	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392481
31	NC_009632	A	6	6	1734	1739	100 %	0 %	0 %	0 %	150392481
32	NC_009632	A	7	7	1783	1789	100 %	0 %	0 %	0 %	150392481
33	NC_009632	AG	3	6	1838	1843	50 %	0 %	50 %	0 %	150392481
34	NC_009632	GAA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
35	NC_009632	TGG	2	6	1882	1887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392481
36	NC_009632	TCAT	2	8	1905	1912	25 %	50 %	0 %	25 %	150392481
37	NC_009632	A	6	6	1920	1925	100 %	0 %	0 %	0 %	150392481
38	NC_009632	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
39	NC_009632	AAG	2	6	1962	1967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392481
40	NC_009632	TAAT	2	8	2274	2281	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
41	NC_009632	ATT	2	6	2305	2310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
42	NC_009632	TTA	2	6	2311	2316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
43	NC_009632	AAC	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392482
44	NC_009632	AGT	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392482
45	NC_009632	TTG	2	6	2527	2532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392482
46	NC_009632	A	7	7	2540	2546	100 %	0 %	0 %	0 %	150392482
47	NC_009632	ATTA	2	8	2594	2601	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
48	NC_009632	AATTT	2	10	2617	2626	40 %	60 %	0 %	0 %	150392482
49	NC_009632	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
50	NC_009632	CAATT	2	10	2683	2692	40 %	40 %	0 %	20 %	150392482
51	NC_009632	GACT	2	8	2816	2823	25 %	25 %	25 %	25 %	150392482
52	NC_009632	AGA	2	6	2855	2860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392482
53	NC_009632	TCA	2	6	2881	2886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392482
54	NC_009632	TAAA	2	8	2911	2918	75 %	25 %	0 %	0 %	150392482
55	NC_009632	GAA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392482
56	NC_009632	TCT	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392482
57	NC_009632	TTTA	2	8	2972	2979	25 %	75 %	0 %	0 %	150392482
58	NC_009632	ATT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
59	NC_009632	ACA	2	6	3033	3038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392482
60	NC_009632	AAATT	2	10	3061	3070	60 %	40 %	0 %	0 %	150392482
61	NC_009632	TTA	2	6	3117	3122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
62	NC_009632	GGT	2	6	3132	3137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392482
63	NC_009632	TTA	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392482
64	NC_009632	TGA	2	6	3164	3169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392482
65	NC_009632	GTT	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392482
66	NC_009632	TCT	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392482
67	NC_009632	AGA	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392482
68	NC_009632	GGT	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392482
69	NC_009632	TTCA	2	8	3260	3267	25 %	50 %	0 %	25 %	150392482
70	NC_009632	AT	3	6	3275	3280	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
71	NC_009632	GATG	2	8	3281	3288	25 %	25 %	50 %	0 %	150392482
72	NC_009632	ATG	2	6	3307	3312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392482
73	NC_009632	GTTGAA	2	12	3315	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392482
74	NC_009632	TTC	2	6	3327	3332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392482
75	NC_009632	GAC	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392482
76	NC_009632	AATT	2	8	3385	3392	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
77	NC_009632	AAG	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392483
78	NC_009632	GTA	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392483
79	NC_009632	ATT	2	6	3866	3871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392483
80	NC_009632	TGG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392483
81	NC_009632	ATTA	2	8	3916	3923	50 %	50 %	0 %	0 %	150392483
82	NC_009632	TTCT	2	8	4006	4013	0 %	75 %	0 %	25 %	150392483
83	NC_009632	TCAT	2	8	4017	4024	25 %	50 %	0 %	25 %	150392483
84	NC_009632	ATG	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392484
85	NC_009632	A	6	6	4300	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	150392484
86	NC_009632	GTC	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392484
87	NC_009632	AT	3	6	4353	4358	50 %	50 %	0 %	0 %	150392484
88	NC_009632	AGA	2	6	4389	4394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392484
89	NC_009632	CTC	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150392484
90	NC_009632	GAC	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392484
91	NC_009632	CTG	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392484
92	NC_009632	AAT	2	6	4516	4521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392484
93	NC_009632	A	7	7	4547	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	150392484
94	NC_009632	CAG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392484
95	NC_009632	AAG	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392484
96	NC_009632	ATT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392484
97	NC_009632	GAA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392484
98	NC_009632	ATA	2	6	4784	4789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392484
99	NC_009632	GAT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392484
100	NC_009632	TTA	3	9	4972	4980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392484
101	NC_009632	GAT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392484
102	NC_009632	TTA	2	6	5023	5028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392484
103	NC_009632	ACA	2	6	5183	5188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392485
104	NC_009632	GTAT	2	8	5255	5262	25 %	50 %	25 %	0 %	150392485
105	NC_009632	AG	4	8	5277	5284	50 %	0 %	50 %	0 %	150392485
106	NC_009632	ATA	2	6	5315	5320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392485
107	NC_009632	GTT	2	6	5362	5367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392485
108	NC_009632	A	6	6	5432	5437	100 %	0 %	0 %	0 %	150392485
109	NC_009632	TGG	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392485
110	NC_009632	CGG	2	6	5493	5498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150392485
111	NC_009632	TGG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392485
112	NC_009632	TCA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392485
113	NC_009632	TA	3	6	5598	5603	50 %	50 %	0 %	0 %	150392485
114	NC_009632	TCA	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392485
115	NC_009632	A	6	6	5617	5622	100 %	0 %	0 %	0 %	150392485
116	NC_009632	AAG	2	6	5645	5650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392485
117	NC_009632	CAG	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392485
118	NC_009632	AG	3	6	5755	5760	50 %	0 %	50 %	0 %	150392485
119	NC_009632	TGA	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392485
120	NC_009632	AGA	2	6	5826	5831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392485
121	NC_009632	ATG	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392485
122	NC_009632	TCA	2	6	5919	5924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392485
123	NC_009632	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392485
124	NC_009632	GGT	2	6	6022	6027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392485
125	NC_009632	AGA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392485
126	NC_009632	TATC	2	8	6158	6165	25 %	50 %	0 %	25 %	150392485
127	NC_009632	ATT	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392485
128	NC_009632	TAT	2	6	6315	6320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392485
129	NC_009632	GGC	2	6	6321	6326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150392485
130	NC_009632	TGC	2	6	6339	6344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392485
131	NC_009632	A	6	6	6346	6351	100 %	0 %	0 %	0 %	150392485
132	NC_009632	CGT	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392485
133	NC_009632	GAA	2	6	6436	6441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392485
134	NC_009632	G	6	6	6475	6480	0 %	0 %	100 %	0 %	150392485
135	NC_009632	TAGA	2	8	6563	6570	50 %	25 %	25 %	0 %	150392485
136	NC_009632	TGGA	2	8	6689	6696	25 %	25 %	50 %	0 %	150392485
137	NC_009632	TTA	2	6	6715	6720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392485
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139	NC_009632	TAT	2	6	6817	6822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392485
140	NC_009632	TGAAT	2	10	6858	6867	40 %	40 %	20 %	0 %	150392485
141	NC_009632	AATG	2	8	6912	6919	50 %	25 %	25 %	0 %	150392485
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150	NC_009632	GCA	3	9	7480	7488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392486
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153	NC_009632	AG	3	6	7591	7596	50 %	0 %	50 %	0 %	150392486
154	NC_009632	GGTA	2	8	7656	7663	25 %	25 %	50 %	0 %	150392486
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157	NC_009632	GGA	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150392486
158	NC_009632	CTG	2	6	7787	7792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392486
159	NC_009632	TTCAA	2	10	7845	7854	40 %	40 %	0 %	20 %	150392486
160	NC_009632	GAA	2	6	7876	7881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392486
161	NC_009632	TTG	2	6	7904	7909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392486
162	NC_009632	A	6	6	7952	7957	100 %	0 %	0 %	0 %	150392486
163	NC_009632	TCGT	2	8	7967	7974	0 %	50 %	25 %	25 %	150392486
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169	NC_009632	ATT	2	6	8189	8194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392486
170	NC_009632	GTT	2	6	8212	8217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392486
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172	NC_009632	ATT	2	6	8308	8313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392486
173	NC_009632	CAGATA	2	12	8330	8341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150392486
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177	NC_009632	TTA	2	6	8470	8475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392486
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236	NC_009632	ATT	2	6	11102	11107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392488
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239	NC_009632	TAT	2	6	11155	11160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392488
240	NC_009632	AAG	2	6	11301	11306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392488
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243	NC_009632	ACAATT	2	12	11383	11394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150392488
244	NC_009632	T	6	6	11393	11398	0 %	100 %	0 %	0 %	150392488
245	NC_009632	TAT	2	6	11410	11415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392488
246	NC_009632	CAA	2	6	11429	11434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392488
247	NC_009632	CT	3	6	11437	11442	0 %	50 %	0 %	50 %	150392488
248	NC_009632	TAGCAT	2	12	11478	11489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150392488
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250	NC_009632	TA	3	6	11645	11650	50 %	50 %	0 %	0 %	150392488
251	NC_009632	AGA	2	6	11656	11661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392488
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253	NC_009632	ATG	2	6	11736	11741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392488
254	NC_009632	ACG	2	6	11819	11824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392488
255	NC_009632	CGTTG	2	10	11859	11868	0 %	40 %	40 %	20 %	150392488
256	NC_009632	AATG	2	8	11935	11942	50 %	25 %	25 %	0 %	150392488
257	NC_009632	GGT	2	6	11999	12004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392488
258	NC_009632	ATC	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392488
259	NC_009632	CGT	2	6	12083	12088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392488
260	NC_009632	GAT	2	6	12169	12174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392488
261	NC_009632	TGC	3	9	12184	12192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392488
262	NC_009632	AAG	2	6	12264	12269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392488
263	NC_009632	GCT	2	6	12293	12298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392488
264	NC_009632	ATT	2	6	12314	12319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392488
265	NC_009632	GT	3	6	12333	12338	0 %	50 %	50 %	0 %	150392488
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270	NC_009632	CAAT	2	8	12506	12513	50 %	25 %	0 %	25 %	150392488
271	NC_009632	ATT	2	6	12931	12936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392489
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382	NC_009632	ATT	2	6	18982	18987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392494
383	NC_009632	ATGA	2	8	19019	19026	50 %	25 %	25 %	0 %	150392494
384	NC_009632	TCAAT	2	10	19044	19053	40 %	40 %	0 %	20 %	150392494
385	NC_009632	TTA	2	6	19065	19070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392494
386	NC_009632	AT	3	6	19092	19097	50 %	50 %	0 %	0 %	150392494
387	NC_009632	A	6	6	19143	19148	100 %	0 %	0 %	0 %	150392494
388	NC_009632	AGA	2	6	19162	19167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392494
389	NC_009632	A	6	6	19200	19205	100 %	0 %	0 %	0 %	150392494
390	NC_009632	TTGGTG	2	12	19239	19250	0 %	50 %	50 %	0 %	150392494
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392	NC_009632	GT	3	6	19518	19523	0 %	50 %	50 %	0 %	150392494
393	NC_009632	ATG	2	6	19535	19540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392494
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