MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 20671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009621	GGC	2	6	62	67	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377169
2	NC_009621	GGC	2	6	186	191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377169
3	NC_009621	TCG	2	6	194	199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377169
4	NC_009621	TCG	2	6	232	237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377169
5	NC_009621	CGC	2	6	279	284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377169
6	NC_009621	TCT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377169
7	NC_009621	TTC	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377169
8	NC_009621	A	7	7	360	366	100 %	0 %	0 %	0 %	150377169
9	NC_009621	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377169
10	NC_009621	CCA	2	6	486	491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377169
11	NC_009621	GC	3	6	497	502	0 %	0 %	50 %	50 %	150377169
12	NC_009621	TTCG	2	8	643	650	0 %	50 %	25 %	25 %	150377169
13	NC_009621	TGC	3	9	669	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377169
14	NC_009621	TC	3	6	715	720	0 %	50 %	0 %	50 %	150377169
15	NC_009621	GCC	2	6	854	859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377169
16	NC_009621	ACA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150377169
17	NC_009621	ACT	2	6	898	903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377169
18	NC_009621	ATG	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377169
19	NC_009621	AGG	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150377170
20	NC_009621	TCC	2	6	1184	1189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377170
21	NC_009621	CGA	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377170
22	NC_009621	GTA	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377170
23	NC_009621	CCGC	2	8	1231	1238	0 %	0 %	25 %	75 %	150377170
24	NC_009621	GCC	2	6	1351	1356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377170
25	NC_009621	GCC	2	6	1402	1407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377170
26	NC_009621	GGT	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377170
27	NC_009621	TCG	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377170
28	NC_009621	GCC	2	6	1622	1627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377170
29	NC_009621	CCG	2	6	1719	1724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377170
30	NC_009621	GCG	2	6	1852	1857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
31	NC_009621	CAG	2	6	1882	1887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
32	NC_009621	GGC	2	6	1957	1962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
33	NC_009621	GTT	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150377171
34	NC_009621	GGT	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377171
35	NC_009621	GAA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377171
36	NC_009621	ATG	2	6	2078	2083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377171
37	NC_009621	GAC	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
38	NC_009621	CGC	2	6	2145	2150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377171
39	NC_009621	CGA	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
40	NC_009621	AGC	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
41	NC_009621	GCG	2	6	2266	2271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
42	NC_009621	CTTC	2	8	2354	2361	0 %	50 %	0 %	50 %	150377171
43	NC_009621	GGC	2	6	2375	2380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
44	NC_009621	GAA	2	6	2392	2397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377171
45	NC_009621	GAA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377171
46	NC_009621	CGA	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377171
47	NC_009621	CGC	2	6	2472	2477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377171
48	NC_009621	AGCG	2	8	2514	2521	25 %	0 %	50 %	25 %	150377171
49	NC_009621	AT	3	6	2546	2551	50 %	50 %	0 %	0 %	150377171
50	NC_009621	CTC	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377171
51	NC_009621	GCG	2	6	2691	2696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377171
52	NC_009621	CAT	2	6	2701	2706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377171
53	NC_009621	CGATCG	2	12	2718	2729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150377171
54	NC_009621	TGG	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377171
55	NC_009621	GCCG	2	8	3079	3086	0 %	0 %	50 %	50 %	150377172
56	NC_009621	CGA	3	9	3094	3102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377172
57	NC_009621	TCC	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377172
58	NC_009621	GTG	2	6	3193	3198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377172
59	NC_009621	GAC	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377172
60	NC_009621	GGATG	2	10	3223	3232	20 %	20 %	60 %	0 %	150377172
61	NC_009621	CAT	2	6	3236	3241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377172
62	NC_009621	CGGA	2	8	3327	3334	25 %	0 %	50 %	25 %	150377172
63	NC_009621	CAG	2	6	3362	3367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377172
64	NC_009621	CGGC	2	8	3368	3375	0 %	0 %	50 %	50 %	150377172
65	NC_009621	CGT	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377173
66	NC_009621	CGCC	2	8	3747	3754	0 %	0 %	25 %	75 %	150377173
67	NC_009621	GC	3	6	3792	3797	0 %	0 %	50 %	50 %	150377173
68	NC_009621	GTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377173
69	NC_009621	GAT	2	6	3964	3969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377173
70	NC_009621	CGT	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377173
71	NC_009621	C	6	6	4095	4100	0 %	0 %	0 %	100 %	150377174
72	NC_009621	GCA	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377174
73	NC_009621	AG	3	6	4121	4126	50 %	0 %	50 %	0 %	150377174
74	NC_009621	CG	3	6	4152	4157	0 %	0 %	50 %	50 %	150377174
75	NC_009621	GGC	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377174
76	NC_009621	CCCG	2	8	4198	4205	0 %	0 %	25 %	75 %	150377174
77	NC_009621	GCGA	2	8	4257	4264	25 %	0 %	50 %	25 %	150377174
78	NC_009621	AAG	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377174
79	NC_009621	CGAGG	2	10	4622	4631	20 %	0 %	60 %	20 %	150377175
80	NC_009621	GAG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150377175
81	NC_009621	TGG	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377175
82	NC_009621	GCC	3	9	4743	4751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377175
83	NC_009621	CCG	2	6	4772	4777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377175
84	NC_009621	CTG	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377175
85	NC_009621	GCC	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377175
86	NC_009621	GACG	2	8	4855	4862	25 %	0 %	50 %	25 %	150377175
87	NC_009621	CCA	2	6	4914	4919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377175
88	NC_009621	TCG	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377175
89	NC_009621	CTT	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377175
90	NC_009621	CGG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377175
91	NC_009621	GAT	2	6	5292	5297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377176
92	NC_009621	CCG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377176
93	NC_009621	CCG	2	6	5366	5371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377176
94	NC_009621	GC	3	6	5598	5603	0 %	0 %	50 %	50 %	150377176
95	NC_009621	GTCCA	2	10	5641	5650	20 %	20 %	20 %	40 %	150377176
96	NC_009621	TCCA	2	8	5668	5675	25 %	25 %	0 %	50 %	150377176
97	NC_009621	CTG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377176
98	NC_009621	ACGC	2	8	5745	5752	25 %	0 %	25 %	50 %	150377176
99	NC_009621	GA	3	6	5796	5801	50 %	0 %	50 %	0 %	150377176
100	NC_009621	CGA	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377176
101	NC_009621	GCG	2	6	5818	5823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377176
102	NC_009621	CGT	2	6	5855	5860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377176
103	NC_009621	CAT	2	6	5867	5872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377176
104	NC_009621	TCG	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377176
105	NC_009621	GGC	2	6	5969	5974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377176
106	NC_009621	TC	3	6	5979	5984	0 %	50 %	0 %	50 %	150377176
107	NC_009621	CCA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377176
108	NC_009621	C	6	6	6010	6015	0 %	0 %	0 %	100 %	150377176
109	NC_009621	ATG	2	6	6016	6021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377176
110	NC_009621	CGA	2	6	6047	6052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377176
111	NC_009621	CAT	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377176
112	NC_009621	CAA	2	6	6579	6584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150377177
113	NC_009621	GAC	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
114	NC_009621	GGC	2	6	6700	6705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
115	NC_009621	CGA	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
116	NC_009621	GGC	2	6	6754	6759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
117	NC_009621	GGC	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
118	NC_009621	CGG	2	6	6807	6812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
119	NC_009621	TCT	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377177
120	NC_009621	CAT	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377177
121	NC_009621	CGG	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
122	NC_009621	G	6	6	6888	6893	0 %	0 %	100 %	0 %	150377177
123	NC_009621	ACG	2	6	6902	6907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
124	NC_009621	TGG	2	6	6915	6920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377177
125	NC_009621	GAC	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
126	NC_009621	ATC	2	6	6961	6966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377177
127	NC_009621	CAA	2	6	6993	6998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150377177
128	NC_009621	GCA	2	6	7029	7034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
129	NC_009621	CGGT	2	8	7037	7044	0 %	25 %	50 %	25 %	150377177
130	NC_009621	ACGAT	2	10	7058	7067	40 %	20 %	20 %	20 %	150377177
131	NC_009621	GGC	2	6	7126	7131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
132	NC_009621	CGA	2	6	7137	7142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377177
133	NC_009621	CGG	2	6	7152	7157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377177
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258	NC_009621	GC	3	6	12324	12329	0 %	0 %	50 %	50 %	150377182
259	NC_009621	GTG	2	6	12332	12337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377182
260	NC_009621	GTGA	2	8	12353	12360	25 %	25 %	50 %	0 %	150377182
261	NC_009621	GGC	2	6	12376	12381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377182
262	NC_009621	TCAGT	2	10	12384	12393	20 %	40 %	20 %	20 %	150377182
263	NC_009621	CGC	2	6	12497	12502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377183
264	NC_009621	ACG	2	6	12562	12567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377183
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267	NC_009621	ATC	2	6	12718	12723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377183
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269	NC_009621	CAT	2	6	12735	12740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377183
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295	NC_009621	CGA	4	12	13839	13850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377184
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375	NC_009621	CTC	2	6	18648	18653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377188
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377	NC_009621	CGG	2	6	18692	18697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377188
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388	NC_009621	CGG	2	6	19066	19071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377188
389	NC_009621	CG	3	6	19160	19165	0 %	0 %	50 %	50 %	150377188
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500	NC_009621	CGC	2	6	24507	24512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377194

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