MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 20671

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_009621	ACA	2	6	1233129	1233134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378252
20502	NC_009621	TCG	2	6	1233179	1233184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378252
20503	NC_009621	CCG	2	6	1233203	1233208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378252
20504	NC_009621	CAA	2	6	1233297	1233302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378252
20505	NC_009621	CGA	2	6	1233339	1233344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378252
20506	NC_009621	ACC	2	6	1233384	1233389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378252
20507	NC_009621	GGA	2	6	1233754	1233759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378253
20508	NC_009621	GGC	2	6	1233775	1233780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378253
20509	NC_009621	CCG	2	6	1233803	1233808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378253
20510	NC_009621	CAG	2	6	1233824	1233829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378253
20511	NC_009621	CTG	2	6	1233905	1233910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378253
20512	NC_009621	ACG	2	6	1233919	1233924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378253
20513	NC_009621	CTG	2	6	1233926	1233931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378253
20514	NC_009621	GTG	2	6	1233975	1233980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378253
20515	NC_009621	GCG	2	6	1234013	1234018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378253
20516	NC_009621	GTC	2	6	1234040	1234045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378253
20517	NC_009621	GTGA	2	8	1234121	1234128	25 %	25 %	50 %	0 %	150378253
20518	NC_009621	GGC	2	6	1234131	1234136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378253
20519	NC_009621	CCAC	2	8	1234153	1234160	25 %	0 %	0 %	75 %	150378253
20520	NC_009621	TCG	2	6	1234197	1234202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378253
20521	NC_009621	TGG	2	6	1234209	1234214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378253
20522	NC_009621	GCA	2	6	1234302	1234307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378253
20523	NC_009621	ATC	2	6	1234331	1234336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378253
20524	NC_009621	CAT	2	6	1234399	1234404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378253
20525	NC_009621	TCGG	2	8	1234415	1234422	0 %	25 %	50 %	25 %	150378253
20526	NC_009621	GCT	2	6	1234435	1234440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378253
20527	NC_009621	TC	3	6	1234504	1234509	0 %	50 %	0 %	50 %	150378253
20528	NC_009621	TATC	2	8	1234525	1234532	25 %	50 %	0 %	25 %	150378253
20529	NC_009621	CGA	2	6	1234554	1234559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378253
20530	NC_009621	TCA	2	6	1234566	1234571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378253
20531	NC_009621	CGG	2	6	1234670	1234675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378254
20532	NC_009621	GTA	2	6	1234687	1234692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378254
20533	NC_009621	TTCGCC	2	12	1234693	1234704	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	150378254
20534	NC_009621	GGC	2	6	1234756	1234761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378254
20535	NC_009621	GCC	2	6	1234774	1234779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378254
20536	NC_009621	GTG	2	6	1234781	1234786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378254
20537	NC_009621	CT	3	6	1234821	1234826	0 %	50 %	0 %	50 %	150378254
20538	NC_009621	GTA	2	6	1234849	1234854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378254
20539	NC_009621	ACG	2	6	1234899	1234904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378254
20540	NC_009621	GTT	2	6	1234956	1234961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150378254
20541	NC_009621	CGA	2	6	1235000	1235005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378254
20542	NC_009621	GAG	2	6	1235045	1235050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378254
20543	NC_009621	GCG	2	6	1235080	1235085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378254
20544	NC_009621	GAT	2	6	1235336	1235341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378255
20545	NC_009621	TCG	2	6	1235361	1235366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378255
20546	NC_009621	CCA	2	6	1235380	1235385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378255
20547	NC_009621	GCG	2	6	1235412	1235417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378255
20548	NC_009621	GC	3	6	1235445	1235450	0 %	0 %	50 %	50 %	150378255
20549	NC_009621	GTG	2	6	1235459	1235464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378255
20550	NC_009621	CAT	2	6	1235470	1235475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378255
20551	NC_009621	CGGA	2	8	1235559	1235566	25 %	0 %	50 %	25 %	150378255
20552	NC_009621	CGGAT	2	10	1235568	1235577	20 %	20 %	40 %	20 %	150378255
20553	NC_009621	CGA	2	6	1235599	1235604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378255
20554	NC_009621	CG	3	6	1235628	1235633	0 %	0 %	50 %	50 %	150378255
20555	NC_009621	GCC	2	6	1235680	1235685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378255
20556	NC_009621	GCA	2	6	1235691	1235696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378255
20557	NC_009621	CGC	2	6	1235747	1235752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378255
20558	NC_009621	CGGG	2	8	1235875	1235882	0 %	0 %	75 %	25 %	150378255
20559	NC_009621	GCA	2	6	1235901	1235906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378255
20560	NC_009621	AAG	2	6	1235933	1235938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378255
20561	NC_009621	GAA	2	6	1235953	1235958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378255
20562	NC_009621	GGA	2	6	1235987	1235992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378255
20563	NC_009621	TGG	2	6	1236031	1236036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378256
20564	NC_009621	CTG	2	6	1236070	1236075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378256
20565	NC_009621	GC	3	6	1236141	1236146	0 %	0 %	50 %	50 %	150378256
20566	NC_009621	GCG	2	6	1236187	1236192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378256
20567	NC_009621	CCG	2	6	1236208	1236213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378256
20568	NC_009621	GC	3	6	1236234	1236239	0 %	0 %	50 %	50 %	150378256
20569	NC_009621	GAA	2	6	1236328	1236333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378256
20570	NC_009621	GCTG	2	8	1236557	1236564	0 %	25 %	50 %	25 %	150378256
20571	NC_009621	ACG	2	6	1236639	1236644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20572	NC_009621	TCG	2	6	1236664	1236669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20573	NC_009621	CGA	2	6	1236764	1236769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20574	NC_009621	GAC	2	6	1236779	1236784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20575	NC_009621	TCG	2	6	1236823	1236828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20576	NC_009621	AGGAC	2	10	1236829	1236838	40 %	0 %	40 %	20 %	150378257
20577	NC_009621	CGC	2	6	1236848	1236853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378257
20578	NC_009621	CGC	2	6	1236874	1236879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378257
20579	NC_009621	CGT	2	6	1236883	1236888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20580	NC_009621	ATG	2	6	1236936	1236941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378257
20581	NC_009621	CGA	2	6	1236943	1236948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20582	NC_009621	CGA	2	6	1236950	1236955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20583	NC_009621	GTC	2	6	1237123	1237128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20584	NC_009621	GCC	2	6	1237146	1237151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378257
20585	NC_009621	CGG	2	6	1237181	1237186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378257
20586	NC_009621	CGA	2	6	1237205	1237210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20587	NC_009621	TGG	2	6	1237328	1237333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378257
20588	NC_009621	CCA	2	6	1237373	1237378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378257
20589	NC_009621	CGG	2	6	1237379	1237384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378257
20590	NC_009621	CG	3	6	1237408	1237413	0 %	0 %	50 %	50 %	150378257
20591	NC_009621	CGA	2	6	1237423	1237428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378257
20592	NC_009621	TGC	2	6	1237860	1237865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378258
20593	NC_009621	TAC	2	6	1237977	1237982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378258
20594	NC_009621	CAT	2	6	1238022	1238027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378258
20595	NC_009621	CGG	2	6	1238048	1238053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378258
20596	NC_009621	GCC	2	6	1238055	1238060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378258
20597	NC_009621	TCATG	2	10	1238138	1238147	20 %	40 %	20 %	20 %	150378259
20598	NC_009621	GGC	2	6	1238462	1238467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378259
20599	NC_009621	GCC	2	6	1238469	1238474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378259
20600	NC_009621	GAC	3	9	1238502	1238510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378259
20601	NC_009621	CG	3	6	1238562	1238567	0 %	0 %	50 %	50 %	150378259
20602	NC_009621	CAA	2	6	1240920	1240925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378260
20603	NC_009621	GCG	2	6	1241066	1241071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378260
20604	NC_009621	GAGC	2	8	1241167	1241174	25 %	0 %	50 %	25 %	150378260
20605	NC_009621	G	6	6	1241176	1241181	0 %	0 %	100 %	0 %	150378260
20606	NC_009621	GC	3	6	1241224	1241229	0 %	0 %	50 %	50 %	150378260
20607	NC_009621	GCT	2	6	1241263	1241268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378260
20608	NC_009621	GC	3	6	1241302	1241307	0 %	0 %	50 %	50 %	150378260
20609	NC_009621	ACGG	2	8	1241378	1241385	25 %	0 %	50 %	25 %	150378260
20610	NC_009621	AGGC	2	8	1241406	1241413	25 %	0 %	50 %	25 %	150378260
20611	NC_009621	GCTG	2	8	1241443	1241450	0 %	25 %	50 %	25 %	150378260
20612	NC_009621	CGG	2	6	1241461	1241466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378260
20613	NC_009621	CTG	2	6	1241483	1241488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378260
20614	NC_009621	GGGTC	2	10	1241520	1241529	0 %	20 %	60 %	20 %	150378260
20615	NC_009621	AGGA	2	8	1241565	1241572	50 %	0 %	50 %	0 %	150378260
20616	NC_009621	GTG	2	6	1241604	1241609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378260
20617	NC_009621	CGA	2	6	1241664	1241669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378260
20618	NC_009621	GGT	2	6	1241686	1241691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378260
20619	NC_009621	CGA	2	6	1241713	1241718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378260
20620	NC_009621	CGG	2	6	1241752	1241757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378260
20621	NC_009621	ATGG	2	8	1241763	1241770	25 %	25 %	50 %	0 %	150378260
20622	NC_009621	CTATTG	2	12	1241773	1241784	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150378260
20623	NC_009621	GAC	2	6	1241798	1241803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378260
20624	NC_009621	AC	3	6	1241866	1241871	50 %	0 %	0 %	50 %	150378260
20625	NC_009621	ATC	2	6	1241933	1241938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378260
20626	NC_009621	GCA	2	6	1241961	1241966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378260
20627	NC_009621	GGCC	2	8	1242008	1242015	0 %	0 %	50 %	50 %	150378260
20628	NC_009621	CCG	2	6	1242023	1242028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378260
20629	NC_009621	GTC	2	6	1242067	1242072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378260
20630	NC_009621	TAG	2	6	1242120	1242125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378260
20631	NC_009621	GGA	2	6	1242266	1242271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378261
20632	NC_009621	GCCG	2	8	1242376	1242383	0 %	0 %	50 %	50 %	150378261
20633	NC_009621	GAT	2	6	1242401	1242406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378261
20634	NC_009621	TGG	2	6	1242432	1242437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378261
20635	NC_009621	ATC	2	6	1242456	1242461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378261
20636	NC_009621	C	6	6	1242514	1242519	0 %	0 %	0 %	100 %	150378261
20637	NC_009621	GCA	2	6	1242544	1242549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378261
20638	NC_009621	CCG	2	6	1242577	1242582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378261
20639	NC_009621	GCC	2	6	1242643	1242648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378261
20640	NC_009621	CG	3	6	1242777	1242782	0 %	0 %	50 %	50 %	150378261
20641	NC_009621	GAT	2	6	1242791	1242796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378261
20642	NC_009621	GGA	2	6	1242841	1242846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378261
20643	NC_009621	GCT	2	6	1242877	1242882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378261
20644	NC_009621	GCTT	2	8	1242913	1242920	0 %	50 %	25 %	25 %	150378261
20645	NC_009621	CGT	2	6	1242965	1242970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378261
20646	NC_009621	GCTG	2	8	1243330	1243337	0 %	25 %	50 %	25 %	150378262
20647	NC_009621	TAT	2	6	1243343	1243348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150378262
20648	NC_009621	GC	3	6	1243354	1243359	0 %	0 %	50 %	50 %	150378262
20649	NC_009621	CAC	2	6	1243420	1243425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378262
20650	NC_009621	CGCC	2	8	1243440	1243447	0 %	0 %	25 %	75 %	150378262
20651	NC_009621	TCG	2	6	1243452	1243457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378262
20652	NC_009621	CCG	2	6	1243476	1243481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378262
20653	NC_009621	GGC	2	6	1243493	1243498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378262
20654	NC_009621	ACA	2	6	1243545	1243550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378262
20655	NC_009621	CGCGC	2	10	1243636	1243645	0 %	0 %	40 %	60 %	150378262
20656	NC_009621	GC	4	8	1243642	1243649	0 %	0 %	50 %	50 %	150378262
20657	NC_009621	GAC	2	6	1243651	1243656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378262
20658	NC_009621	CAG	2	6	1243763	1243768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378262
20659	NC_009621	TTC	2	6	1243769	1243774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378262
20660	NC_009621	CGA	2	6	1243798	1243803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378262
20661	NC_009621	GGC	2	6	1243808	1243813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378262
20662	NC_009621	ACCGC	2	10	1243881	1243890	20 %	0 %	20 %	60 %	150378262
20663	NC_009621	CGA	2	6	1243927	1243932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378262
20664	NC_009621	TCG	2	6	1243965	1243970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378262
20665	NC_009621	CCGG	2	8	1244077	1244084	0 %	0 %	50 %	50 %	150378262
20666	NC_009621	GTC	2	6	1244085	1244090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378262
20667	NC_009621	CG	3	6	1244091	1244096	0 %	0 %	50 %	50 %	150378262
20668	NC_009621	GGC	2	6	1244105	1244110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378262
20669	NC_009621	TCG	2	6	1244175	1244180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378262
20670	NC_009621	CTT	2	6	1244227	1244232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378262
20671	NC_009621	CG	3	6	1244242	1244247	0 %	0 %	50 %	50 %	150378262

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.