MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 20671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_009621	CG	4	8	1209330	1209337	0 %	0 %	50 %	50 %	150378225
20003	NC_009621	CGC	2	6	1209354	1209359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378225
20004	NC_009621	TTC	2	6	1209440	1209445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378225
20005	NC_009621	CG	3	6	1209462	1209467	0 %	0 %	50 %	50 %	150378225
20006	NC_009621	GAA	3	9	1209553	1209561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378225
20007	NC_009621	GCC	2	6	1209568	1209573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378225
20008	NC_009621	AGA	2	6	1209576	1209581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378225
20009	NC_009621	GCCGCA	2	12	1209819	1209830	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	150378226
20010	NC_009621	ACG	2	6	1209909	1209914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378226
20011	NC_009621	CAG	2	6	1209941	1209946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378226
20012	NC_009621	AGCG	2	8	1209947	1209954	25 %	0 %	50 %	25 %	150378226
20013	NC_009621	AGC	2	6	1209996	1210001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378226
20014	NC_009621	TCT	2	6	1210039	1210044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378226
20015	NC_009621	G	6	6	1210054	1210059	0 %	0 %	100 %	0 %	150378226
20016	NC_009621	GATC	2	8	1210119	1210126	25 %	25 %	25 %	25 %	150378227
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20019	NC_009621	CGA	2	6	1210200	1210205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378227
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20116	NC_009621	CCG	2	6	1214882	1214887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378233
20117	NC_009621	CGC	2	6	1214897	1214902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378233
20118	NC_009621	CCG	3	9	1214928	1214936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378233
20119	NC_009621	CGG	2	6	1214977	1214982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378234
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20121	NC_009621	CG	3	6	1215088	1215093	0 %	0 %	50 %	50 %	150378234
20122	NC_009621	TCG	2	6	1215145	1215150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378234
20123	NC_009621	GC	3	6	1215167	1215172	0 %	0 %	50 %	50 %	150378234
20124	NC_009621	GCC	2	6	1215198	1215203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378234
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20129	NC_009621	GTCTTC	2	12	1215444	1215455	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150378234
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20132	NC_009621	GC	3	6	1215760	1215765	0 %	0 %	50 %	50 %	150378234
20133	NC_009621	GTC	2	6	1215810	1215815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378234
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20144	NC_009621	TCG	2	6	1217166	1217171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378235
20145	NC_009621	CGC	2	6	1217197	1217202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378235
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20227	NC_009621	GC	3	6	1221066	1221071	0 %	0 %	50 %	50 %	150378241
20228	NC_009621	TGC	2	6	1221100	1221105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378241
20229	NC_009621	GCC	2	6	1221118	1221123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378241
20230	NC_009621	TGC	2	6	1221139	1221144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378241
20231	NC_009621	GATC	2	8	1221220	1221227	25 %	25 %	25 %	25 %	150378242
20232	NC_009621	AATCC	2	10	1221245	1221254	40 %	20 %	0 %	40 %	150378242
20233	NC_009621	GCCA	2	8	1221275	1221282	25 %	0 %	25 %	50 %	150378242
20234	NC_009621	TCA	2	6	1221349	1221354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378242
20235	NC_009621	AGC	2	6	1221438	1221443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378242
20236	NC_009621	GGT	2	6	1221509	1221514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378242
20237	NC_009621	GCC	2	6	1221564	1221569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378242
20238	NC_009621	TGT	2	6	1221607	1221612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150378242
20239	NC_009621	GAA	2	6	1221674	1221679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378242
20240	NC_009621	CTC	2	6	1221704	1221709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378242
20241	NC_009621	CG	3	6	1221771	1221776	0 %	0 %	50 %	50 %	150378242
20242	NC_009621	CAC	2	6	1221842	1221847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378242
20243	NC_009621	GCCC	2	8	1221931	1221938	0 %	0 %	25 %	75 %	150378242
20244	NC_009621	TGC	2	6	1221947	1221952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378242
20245	NC_009621	TCGGC	2	10	1221991	1222000	0 %	20 %	40 %	40 %	150378242
20246	NC_009621	CT	3	6	1222007	1222012	0 %	50 %	0 %	50 %	150378242
20247	NC_009621	CA	3	6	1222015	1222020	50 %	0 %	0 %	50 %	150378242
20248	NC_009621	CGC	2	6	1222097	1222102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378242
20249	NC_009621	GC	4	8	1222230	1222237	0 %	0 %	50 %	50 %	150378242
20250	NC_009621	ATA	2	6	1222253	1222258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150378242
20251	NC_009621	CGC	2	6	1222261	1222266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378242
20252	NC_009621	TGG	2	6	1222290	1222295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378242
20253	NC_009621	GAA	3	9	1222301	1222309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378242
20254	NC_009621	TCC	2	6	1222317	1222322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378242
20255	NC_009621	GAA	2	6	1222328	1222333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378242
20256	NC_009621	TGAT	2	8	1222365	1222372	25 %	50 %	25 %	0 %	150378242
20257	NC_009621	GCA	2	6	1222408	1222413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378242
20258	NC_009621	GGCT	2	8	1222488	1222495	0 %	25 %	50 %	25 %	150378242
20259	NC_009621	GCC	2	6	1222549	1222554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378243
20260	NC_009621	CGA	2	6	1222617	1222622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378243
20261	NC_009621	GCA	2	6	1222657	1222662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378243
20262	NC_009621	GCA	2	6	1222680	1222685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378243
20263	NC_009621	GCCG	2	8	1222702	1222709	0 %	0 %	50 %	50 %	150378243
20264	NC_009621	TGA	2	6	1222719	1222724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378243
20265	NC_009621	GCG	2	6	1222743	1222748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378243
20266	NC_009621	GTA	2	6	1222781	1222786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378243
20267	NC_009621	ATGA	2	8	1222867	1222874	50 %	25 %	25 %	0 %	150378243
20268	NC_009621	TCCGGT	2	12	1222928	1222939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378243
20269	NC_009621	CG	3	6	1222940	1222945	0 %	0 %	50 %	50 %	150378243
20270	NC_009621	ACC	2	6	1222961	1222966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378243
20271	NC_009621	CG	3	6	1222986	1222991	0 %	0 %	50 %	50 %	150378243
20272	NC_009621	ATG	2	6	1223006	1223011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378243
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20282	NC_009621	CGA	2	6	1223516	1223521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378244
20283	NC_009621	CGA	2	6	1223582	1223587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378244
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20293	NC_009621	GGC	2	6	1223925	1223930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378244
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20297	NC_009621	CCACA	2	10	1224079	1224088	40 %	0 %	0 %	60 %	150378244
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20299	NC_009621	CGGTA	2	10	1224209	1224218	20 %	20 %	40 %	20 %	150378244
20300	NC_009621	CGG	3	9	1224276	1224284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378244
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20303	NC_009621	GAG	2	6	1224409	1224414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378245
20304	NC_009621	TGAC	2	8	1224512	1224519	25 %	25 %	25 %	25 %	150378245
20305	NC_009621	CGAG	2	8	1224572	1224579	25 %	0 %	50 %	25 %	150378245
20306	NC_009621	GCT	2	6	1224659	1224664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378245
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20309	NC_009621	GCT	2	6	1224788	1224793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378245
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20311	NC_009621	CGG	2	6	1224847	1224852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378245
20312	NC_009621	GAA	2	6	1224874	1224879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378245
20313	NC_009621	CAG	2	6	1224903	1224908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378245
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20315	NC_009621	GTC	2	6	1224939	1224944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378245
20316	NC_009621	ATC	2	6	1224952	1224957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378245
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20322	NC_009621	CAG	2	6	1225088	1225093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378245
20323	NC_009621	GCC	2	6	1225107	1225112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378245
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20328	NC_009621	CGAC	2	8	1225295	1225302	25 %	0 %	25 %	50 %	150378245
20329	NC_009621	CTC	2	6	1225377	1225382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378245
20330	NC_009621	CGA	2	6	1225424	1225429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378245
20331	NC_009621	GCC	2	6	1225468	1225473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378245
20332	NC_009621	GGC	2	6	1225626	1225631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378245
20333	NC_009621	TCG	2	6	1225639	1225644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378245
20334	NC_009621	GACC	2	8	1225748	1225755	25 %	0 %	25 %	50 %	150378246
20335	NC_009621	AGC	2	6	1225765	1225770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378246
20336	NC_009621	ACC	2	6	1225801	1225806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378246
20337	NC_009621	TGA	2	6	1225829	1225834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378246
20338	NC_009621	CAG	3	9	1225890	1225898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378246
20339	NC_009621	CAG	2	6	1225935	1225940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378246
20340	NC_009621	CGGC	2	8	1225967	1225974	0 %	0 %	50 %	50 %	150378246
20341	NC_009621	G	7	7	1226002	1226008	0 %	0 %	100 %	0 %	150378246
20342	NC_009621	GCC	3	9	1226020	1226028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378246
20343	NC_009621	TGA	2	6	1226093	1226098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378246
20344	NC_009621	CAT	2	6	1226160	1226165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378246
20345	NC_009621	CAA	2	6	1226202	1226207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378246
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20464	NC_009621	CCT	2	6	1231355	1231360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378251
20465	NC_009621	CGC	2	6	1231455	1231460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378251
20466	NC_009621	CGA	2	6	1231584	1231589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378251
20467	NC_009621	GC	3	6	1231765	1231770	0 %	0 %	50 %	50 %	150378251
20468	NC_009621	GCC	2	6	1231804	1231809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378251
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20488	NC_009621	GCC	3	9	1232507	1232515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378252
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20490	NC_009621	CGA	2	6	1232574	1232579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378252
20491	NC_009621	ATG	2	6	1232587	1232592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378252
20492	NC_009621	CCG	2	6	1232711	1232716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378252
20493	NC_009621	GGCC	2	8	1232806	1232813	0 %	0 %	50 %	50 %	150378252
20494	NC_009621	CGCCGG	2	12	1232832	1232843	0 %	0 %	50 %	50 %	150378252
20495	NC_009621	CGC	2	6	1232853	1232858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378252
20496	NC_009621	GAA	2	6	1232932	1232937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378252
20497	NC_009621	CGC	2	6	1232943	1232948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378252
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20499	NC_009621	CACC	2	8	1232968	1232975	25 %	0 %	0 %	75 %	150378252
20500	NC_009621	CGC	2	6	1233055	1233060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378252

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