MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 20671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009621	TGCT	2	8	24590	24597	0 %	50 %	25 %	25 %	150377194
502	NC_009621	GCA	2	6	24612	24617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377194
503	NC_009621	CCT	2	6	24621	24626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377194
504	NC_009621	GCTTC	2	10	24640	24649	0 %	40 %	20 %	40 %	150377194
505	NC_009621	CCG	2	6	24669	24674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377194
506	NC_009621	CGG	2	6	24683	24688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377194
507	NC_009621	CCA	2	6	24738	24743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377194
508	NC_009621	TCA	2	6	24756	24761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377194
509	NC_009621	GAT	2	6	24763	24768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377194
510	NC_009621	TGATCA	2	12	24807	24818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150377194
511	NC_009621	GGT	2	6	24892	24897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377194
512	NC_009621	TCG	2	6	24902	24907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377194
513	NC_009621	ATC	2	6	24947	24952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377194
514	NC_009621	CCG	2	6	24968	24973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377194
515	NC_009621	CAG	2	6	25033	25038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377194
516	NC_009621	CGCCC	2	10	25060	25069	0 %	0 %	20 %	80 %	150377194
517	NC_009621	GCCG	2	8	25107	25114	0 %	0 %	50 %	50 %	150377194
518	NC_009621	GTTCA	2	10	25177	25186	20 %	40 %	20 %	20 %	150377194
519	NC_009621	GCCT	2	8	25188	25195	0 %	25 %	25 %	50 %	150377194
520	NC_009621	G	6	6	25259	25264	0 %	0 %	100 %	0 %	150377194
521	NC_009621	GC	3	6	25376	25381	0 %	0 %	50 %	50 %	150377194
522	NC_009621	GTC	2	6	25546	25551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377195
523	NC_009621	CCA	2	6	25584	25589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377195
524	NC_009621	CGG	2	6	25644	25649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377195
525	NC_009621	AGG	2	6	25676	25681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150377195
526	NC_009621	ATCG	2	8	25707	25714	25 %	25 %	25 %	25 %	150377195
527	NC_009621	GCA	2	6	25736	25741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377195
528	NC_009621	GC	3	6	25794	25799	0 %	0 %	50 %	50 %	150377195
529	NC_009621	AGC	2	6	25942	25947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377195
530	NC_009621	TCA	2	6	25958	25963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377195
531	NC_009621	CGG	2	6	26015	26020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377195
532	NC_009621	GCC	2	6	26034	26039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377195
533	NC_009621	AGA	2	6	26054	26059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377195
534	NC_009621	CGG	4	12	26060	26071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377195
535	NC_009621	CGA	2	6	26096	26101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377195
536	NC_009621	GGC	2	6	26120	26125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377195
537	NC_009621	GGC	2	6	26176	26181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377195
538	NC_009621	CGA	2	6	26222	26227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377195
539	NC_009621	CGA	2	6	26237	26242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377195
540	NC_009621	AGAT	2	8	26305	26312	50 %	25 %	25 %	0 %	150377195
541	NC_009621	CCCT	2	8	26375	26382	0 %	25 %	0 %	75 %	150377196
542	NC_009621	AGA	2	6	26416	26421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377196
543	NC_009621	TCG	2	6	26468	26473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377196
544	NC_009621	CAC	2	6	26478	26483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377196
545	NC_009621	GAT	2	6	26499	26504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377196
546	NC_009621	ATC	2	6	26512	26517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377196
547	NC_009621	GCCAG	2	10	26529	26538	20 %	0 %	40 %	40 %	150377196
548	NC_009621	CGA	3	9	26552	26560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377196
549	NC_009621	TGA	2	6	26603	26608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377196
550	NC_009621	GCA	2	6	26612	26617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377196
551	NC_009621	ACG	2	6	26652	26657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377196
552	NC_009621	TGA	2	6	26684	26689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377196
553	NC_009621	ATC	2	6	26710	26715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377196
554	NC_009621	CAC	2	6	26724	26729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377196
555	NC_009621	CAG	2	6	26736	26741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377196
556	NC_009621	GCA	2	6	26753	26758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377196
557	NC_009621	GC	3	6	26945	26950	0 %	0 %	50 %	50 %	150377196
558	NC_009621	CGA	3	9	26951	26959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377196
559	NC_009621	GAA	2	6	27102	27107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377196
560	NC_009621	GC	3	6	27156	27161	0 %	0 %	50 %	50 %	150377196
561	NC_009621	CAG	2	6	27237	27242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377196
562	NC_009621	GCCG	2	8	27275	27282	0 %	0 %	50 %	50 %	150377196
563	NC_009621	CAT	2	6	27294	27299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377196
564	NC_009621	CTC	2	6	27498	27503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377197
565	NC_009621	CGC	2	6	27588	27593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377197
566	NC_009621	AGA	2	6	27629	27634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377197
567	NC_009621	GGC	2	6	27648	27653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377197
568	NC_009621	TTG	3	9	27661	27669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150377197
569	NC_009621	CAT	2	6	27675	27680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377197
570	NC_009621	CAT	2	6	27795	27800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377197
571	NC_009621	GTC	2	6	27945	27950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377197
572	NC_009621	CGT	2	6	28064	28069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377197
573	NC_009621	GAGCG	2	10	28071	28080	20 %	0 %	60 %	20 %	150377197
574	NC_009621	GTC	2	6	28105	28110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377197
575	NC_009621	TGG	2	6	28145	28150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377197
576	NC_009621	CCA	2	6	28196	28201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377197
577	NC_009621	GGC	2	6	28203	28208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377197
578	NC_009621	CCG	2	6	28364	28369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377197
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580	NC_009621	GCG	2	6	28424	28429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377197
581	NC_009621	GTC	2	6	28455	28460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377197
582	NC_009621	TGC	2	6	28505	28510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377197
583	NC_009621	GCC	2	6	28521	28526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377197
584	NC_009621	TCGA	2	8	28537	28544	25 %	25 %	25 %	25 %	150377197
585	NC_009621	GGC	2	6	28569	28574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377197
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587	NC_009621	GAT	2	6	28683	28688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377197
588	NC_009621	TGA	2	6	28736	28741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377197
589	NC_009621	ACC	2	6	28837	28842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377197
590	NC_009621	CCGGG	2	10	29033	29042	0 %	0 %	60 %	40 %	150377198
591	NC_009621	CGCC	2	8	29063	29070	0 %	0 %	25 %	75 %	150377198
592	NC_009621	TGA	2	6	29072	29077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377198
593	NC_009621	CCG	2	6	29222	29227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377198
594	NC_009621	GGT	2	6	29235	29240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377198
595	NC_009621	ACGCCG	2	12	29242	29253	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	150377198
596	NC_009621	GC	3	6	29400	29405	0 %	0 %	50 %	50 %	150377198
597	NC_009621	GCG	2	6	29507	29512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377198
598	NC_009621	GCA	2	6	29531	29536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377198
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600	NC_009621	CGC	2	6	29646	29651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377198
601	NC_009621	GCC	2	6	29703	29708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377198
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603	NC_009621	TTC	2	6	29847	29852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377198
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606	NC_009621	GCC	2	6	30152	30157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377199
607	NC_009621	CGTC	2	8	30236	30243	0 %	25 %	25 %	50 %	150377199
608	NC_009621	GCCT	2	8	30245	30252	0 %	25 %	25 %	50 %	150377199
609	NC_009621	CGA	2	6	30257	30262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377199
610	NC_009621	CTTCGA	2	12	30341	30352	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150377199
611	NC_009621	CTC	2	6	30372	30377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377199
612	NC_009621	GAT	2	6	30378	30383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377199
613	NC_009621	CCA	2	6	30479	30484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377199
614	NC_009621	CACG	2	8	30515	30522	25 %	0 %	25 %	50 %	150377199
615	NC_009621	TCGG	2	8	30562	30569	0 %	25 %	50 %	25 %	150377199
616	NC_009621	ATA	2	6	30588	30593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150377199
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618	NC_009621	CG	3	6	30868	30873	0 %	0 %	50 %	50 %	150377200
619	NC_009621	GGC	2	6	30898	30903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377200
620	NC_009621	ACG	2	6	30965	30970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377200
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622	NC_009621	CGC	2	6	31021	31026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377200
623	NC_009621	GA	3	6	31123	31128	50 %	0 %	50 %	0 %	150377200
624	NC_009621	GCC	2	6	31154	31159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377200
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626	NC_009621	CAG	2	6	31186	31191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377200
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