MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 31436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009620	ATCTG	2	10	195794	195803	20 %	40 %	20 %	20 %	150375902
4002	NC_009620	AAG	2	6	195850	195855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375902
4003	NC_009620	CT	3	6	195883	195888	0 %	50 %	0 %	50 %	150375902
4004	NC_009620	GC	3	6	195922	195927	0 %	0 %	50 %	50 %	150375902
4005	NC_009620	TGG	2	6	195946	195951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375902
4006	NC_009620	ACA	2	6	196112	196117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375902
4007	NC_009620	AGA	2	6	196133	196138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375902
4008	NC_009620	CCT	2	6	196178	196183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375902
4009	NC_009620	GAA	2	6	196290	196295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375902
4010	NC_009620	GCA	2	6	196351	196356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375902
4011	NC_009620	GA	3	6	196361	196366	50 %	0 %	50 %	0 %	150375902
4012	NC_009620	CATG	2	8	196386	196393	25 %	25 %	25 %	25 %	150375902
4013	NC_009620	ATC	2	6	196480	196485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375902
4014	NC_009620	A	6	6	196494	196499	100 %	0 %	0 %	0 %	150375902
4015	NC_009620	CT	3	6	196532	196537	0 %	50 %	0 %	50 %	150375902
4016	NC_009620	CCG	2	6	196538	196543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375902
4017	NC_009620	AGG	2	6	196562	196567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375902
4018	NC_009620	CTTC	2	8	196582	196589	0 %	50 %	0 %	50 %	150375902
4019	NC_009620	GAG	2	6	196612	196617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375902
4020	NC_009620	CGG	2	6	196998	197003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375903
4021	NC_009620	TTC	2	6	197005	197010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375903
4022	NC_009620	CGG	2	6	197045	197050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375903
4023	NC_009620	GCC	2	6	197074	197079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375903
4024	NC_009620	TGG	2	6	197089	197094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375903
4025	NC_009620	CGC	2	6	197121	197126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375903
4026	NC_009620	CGTT	2	8	197133	197140	0 %	50 %	25 %	25 %	150375903
4027	NC_009620	GCG	2	6	197152	197157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375903
4028	NC_009620	CGA	2	6	197158	197163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4029	NC_009620	CCT	2	6	197169	197174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375903
4030	NC_009620	GGGC	2	8	197180	197187	0 %	0 %	75 %	25 %	150375903
4031	NC_009620	GCC	2	6	197188	197193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375903
4032	NC_009620	TCGTCT	2	12	197327	197338	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150375903
4033	NC_009620	TGA	2	6	197372	197377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375903
4034	NC_009620	GCT	2	6	197409	197414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4035	NC_009620	TCG	2	6	197423	197428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4036	NC_009620	CGTCTT	2	12	197430	197441	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150375903
4037	NC_009620	GCA	2	6	197453	197458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4038	NC_009620	CGG	2	6	197559	197564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375903
4039	NC_009620	CTGG	2	8	197595	197602	0 %	25 %	50 %	25 %	150375903
4040	NC_009620	TGA	2	6	197606	197611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375903
4041	NC_009620	CCG	2	6	197612	197617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375903
4042	NC_009620	GCT	2	6	197649	197654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4043	NC_009620	TGC	2	6	197705	197710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4044	NC_009620	ATC	2	6	197713	197718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375903
4045	NC_009620	C	6	6	197722	197727	0 %	0 %	0 %	100 %	150375903
4046	NC_009620	GGTC	2	8	197733	197740	0 %	25 %	50 %	25 %	150375903
4047	NC_009620	GCT	2	6	197751	197756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4048	NC_009620	TCA	2	6	197774	197779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375903
4049	NC_009620	TCCT	2	8	197878	197885	0 %	50 %	0 %	50 %	150375903
4050	NC_009620	CGT	2	6	197898	197903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4051	NC_009620	GAA	2	6	197926	197931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375903
4052	NC_009620	TGA	2	6	197990	197995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375903
4053	NC_009620	GGC	2	6	198070	198075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375903
4054	NC_009620	TCT	2	6	198101	198106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375903
4055	NC_009620	TCCC	2	8	198132	198139	0 %	25 %	0 %	75 %	150375903
4056	NC_009620	CAT	2	6	198156	198161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375903
4057	NC_009620	CCT	2	6	198162	198167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375903
4058	NC_009620	GCG	2	6	198251	198256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375903
4059	NC_009620	CTGCC	2	10	198263	198272	0 %	20 %	20 %	60 %	150375903
4060	NC_009620	TCG	2	6	198329	198334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4061	NC_009620	TCG	2	6	198350	198355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4062	NC_009620	CGG	2	6	198438	198443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375903
4063	NC_009620	GAC	2	6	198480	198485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4064	NC_009620	CTT	2	6	198532	198537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375903
4065	NC_009620	TGA	3	9	198596	198604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375903
4066	NC_009620	TA	3	6	198640	198645	50 %	50 %	0 %	0 %	150375903
4067	NC_009620	GCC	2	6	198660	198665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375903
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4069	NC_009620	CGG	2	6	198738	198743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375903
4070	NC_009620	CGA	2	6	198777	198782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4071	NC_009620	GCT	2	6	198840	198845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375903
4072	NC_009620	CGGC	2	8	198847	198854	0 %	0 %	50 %	50 %	150375903
4073	NC_009620	TCGT	2	8	198877	198884	0 %	50 %	25 %	25 %	150375903
4074	NC_009620	GC	3	6	198885	198890	0 %	0 %	50 %	50 %	150375903
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4080	NC_009620	CGT	2	6	199163	199168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375904
4081	NC_009620	GCT	2	6	199253	199258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375904
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4091	NC_009620	CCGAA	2	10	199670	199679	40 %	0 %	20 %	40 %	150375904
4092	NC_009620	GCA	2	6	199691	199696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375904
4093	NC_009620	CACG	2	8	199724	199731	25 %	0 %	25 %	50 %	150375904
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4101	NC_009620	CGG	2	6	200018	200023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375904
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4103	NC_009620	TCG	3	9	200107	200115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375904
4104	NC_009620	CAG	2	6	200119	200124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375904
4105	NC_009620	GC	3	6	200129	200134	0 %	0 %	50 %	50 %	150375904
4106	NC_009620	AACG	2	8	200147	200154	50 %	0 %	25 %	25 %	150375904
4107	NC_009620	TCA	2	6	200188	200193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375904
4108	NC_009620	TGA	2	6	200253	200258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375905
4109	NC_009620	CGT	2	6	200266	200271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375905
4110	NC_009620	CG	4	8	200311	200318	0 %	0 %	50 %	50 %	150375905
4111	NC_009620	AGGC	2	8	200319	200326	25 %	0 %	50 %	25 %	150375905
4112	NC_009620	CGC	2	6	200351	200356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375905
4113	NC_009620	GAG	2	6	200480	200485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375905
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4118	NC_009620	CGAT	2	8	200700	200707	25 %	25 %	25 %	25 %	150375905
4119	NC_009620	CAA	2	6	200749	200754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375905
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4121	NC_009620	TCT	2	6	200794	200799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375905
4122	NC_009620	CGG	2	6	200806	200811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375905
4123	NC_009620	CGGC	2	8	200859	200866	0 %	0 %	50 %	50 %	150375905
4124	NC_009620	CTA	2	6	200878	200883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375905
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4153	NC_009620	CGGG	2	8	203043	203050	0 %	0 %	75 %	25 %	150375909
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4231	NC_009620	TCG	2	6	206740	206745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375912
4232	NC_009620	TGC	2	6	206815	206820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375912
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4235	NC_009620	ACC	2	6	206953	206958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375912
4236	NC_009620	AGA	2	6	206989	206994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375912
4237	NC_009620	TTGC	2	8	207001	207008	0 %	50 %	25 %	25 %	150375912
4238	NC_009620	CGT	2	6	207011	207016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375912
4239	NC_009620	ACG	2	6	207019	207024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375912
4240	NC_009620	CTC	2	6	207111	207116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375912
4241	NC_009620	CGG	2	6	207185	207190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375912
4242	NC_009620	CCG	2	6	207191	207196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375912
4243	NC_009620	TGC	3	9	207229	207237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375912
4244	NC_009620	GCG	2	6	207290	207295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375912
4245	NC_009620	GCCTCC	2	12	207319	207330	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	150375912
4246	NC_009620	GCT	2	6	207331	207336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375912
4247	NC_009620	CCTT	2	8	207337	207344	0 %	50 %	0 %	50 %	150375912
4248	NC_009620	AG	3	6	207346	207351	50 %	0 %	50 %	0 %	150375912
4249	NC_009620	TGC	2	6	207399	207404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375912
4250	NC_009620	CAG	2	6	207468	207473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375912
4251	NC_009620	GCCGG	2	10	207499	207508	0 %	0 %	60 %	40 %	150375912
4252	NC_009620	GCG	2	6	207529	207534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375912
4253	NC_009620	AGC	2	6	207587	207592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375913
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4255	NC_009620	CCG	2	6	207745	207750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375913
4256	NC_009620	CCG	2	6	207883	207888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375913
4257	NC_009620	TTCAT	2	10	207905	207914	20 %	60 %	0 %	20 %	150375913
4258	NC_009620	TCC	2	6	207917	207922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375913
4259	NC_009620	CCGAT	2	10	208003	208012	20 %	20 %	20 %	40 %	150375914
4260	NC_009620	CCA	2	6	208030	208035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375914
4261	NC_009620	ACG	3	9	208131	208139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375914
4262	NC_009620	CAG	2	6	208208	208213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375914
4263	NC_009620	CAG	2	6	208217	208222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375914
4264	NC_009620	TCA	2	6	208246	208251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375914
4265	NC_009620	CGCC	2	8	208273	208280	0 %	0 %	25 %	75 %	150375914
4266	NC_009620	GTC	3	9	208340	208348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375914
4267	NC_009620	CGT	2	6	208360	208365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375914
4268	NC_009620	GCC	2	6	208370	208375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375914
4269	NC_009620	TCG	2	6	208477	208482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375914
4270	NC_009620	TTC	2	6	208518	208523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375914
4271	NC_009620	GC	3	6	208527	208532	0 %	0 %	50 %	50 %	150375914
4272	NC_009620	GACC	2	8	208535	208542	25 %	0 %	25 %	50 %	150375914
4273	NC_009620	ATG	3	9	208560	208568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375914
4274	NC_009620	ATG	2	6	208575	208580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375914
4275	NC_009620	GCG	2	6	208602	208607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375914
4276	NC_009620	CTT	2	6	208615	208620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375914
4277	NC_009620	GC	3	6	208682	208687	0 %	0 %	50 %	50 %	150375914
4278	NC_009620	TCG	3	9	208695	208703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375914
4279	NC_009620	ATG	2	6	208704	208709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375914
4280	NC_009620	GTGCG	2	10	208711	208720	0 %	20 %	60 %	20 %	150375914
4281	NC_009620	CTGC	2	8	208738	208745	0 %	25 %	25 %	50 %	150375914
4282	NC_009620	GTG	2	6	208750	208755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375914
4283	NC_009620	GAC	2	6	208835	208840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375914
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4289	NC_009620	GCG	2	6	209185	209190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375914
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4291	NC_009620	GAG	2	6	209303	209308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375914
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4310	NC_009620	ACG	2	6	210144	210149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375914
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4313	NC_009620	CAG	2	6	210245	210250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375914
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4316	NC_009620	CG	4	8	210393	210400	0 %	0 %	50 %	50 %	150375914
4317	NC_009620	TCG	2	6	210405	210410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375914
4318	NC_009620	TCA	2	6	210427	210432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375914
4319	NC_009620	GGTC	2	8	210448	210455	0 %	25 %	50 %	25 %	150375914
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4321	NC_009620	CT	3	6	210521	210526	0 %	50 %	0 %	50 %	150375914
4322	NC_009620	GCC	2	6	210606	210611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375914
4323	NC_009620	GAT	2	6	210647	210652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375914
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4325	NC_009620	GCA	3	9	210852	210860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375915
4326	NC_009620	GCCG	2	8	210873	210880	0 %	0 %	50 %	50 %	150375915
4327	NC_009620	TGA	2	6	210945	210950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375915
4328	NC_009620	TCA	2	6	211059	211064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375915
4329	NC_009620	GAAC	2	8	211083	211090	50 %	0 %	25 %	25 %	150375915
4330	NC_009620	GCCGG	2	10	211105	211114	0 %	0 %	60 %	40 %	150375915
4331	NC_009620	GTC	2	6	211120	211125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375915
4332	NC_009620	GCGGTC	2	12	211180	211191	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	150375915
4333	NC_009620	ATC	2	6	211198	211203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375915
4334	NC_009620	CTT	2	6	211276	211281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375915
4335	NC_009620	TGA	2	6	211302	211307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375915
4336	NC_009620	GC	3	6	211340	211345	0 %	0 %	50 %	50 %	150375915
4337	NC_009620	CGG	2	6	211380	211385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375915
4338	NC_009620	CCT	2	6	211386	211391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375915
4339	NC_009620	GC	3	6	211416	211421	0 %	0 %	50 %	50 %	150375915
4340	NC_009620	CAAA	2	8	211425	211432	75 %	0 %	0 %	25 %	150375915
4341	NC_009620	CGG	2	6	211603	211608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375916
4342	NC_009620	ACG	2	6	211618	211623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375916
4343	NC_009620	CCA	2	6	211627	211632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375916
4344	NC_009620	TGC	2	6	211704	211709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375916
4345	NC_009620	TGT	2	6	211735	211740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375916
4346	NC_009620	AGG	2	6	211745	211750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375916
4347	NC_009620	CGC	2	6	211751	211756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375916
4348	NC_009620	CGG	2	6	211769	211774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375916
4349	NC_009620	GGTGA	2	10	211814	211823	20 %	20 %	60 %	0 %	150375916
4350	NC_009620	TCG	2	6	211960	211965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375916
4351	NC_009620	CGC	2	6	211998	212003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375916
4352	NC_009620	GC	3	6	212006	212011	0 %	0 %	50 %	50 %	150375916
4353	NC_009620	GC	3	6	212042	212047	0 %	0 %	50 %	50 %	150375916
4354	NC_009620	CGC	2	6	212189	212194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375916
4355	NC_009620	TCC	2	6	212289	212294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375916
4356	NC_009620	CCA	2	6	212353	212358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375916
4357	NC_009620	CGA	2	6	212392	212397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375916
4358	NC_009620	GCC	2	6	212405	212410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375916
4359	NC_009620	GTC	2	6	212423	212428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375916
4360	NC_009620	GATA	2	8	212433	212440	50 %	25 %	25 %	0 %	150375916
4361	NC_009620	GCG	2	6	212441	212446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375916
4362	NC_009620	TC	3	6	212480	212485	0 %	50 %	0 %	50 %	150375916
4363	NC_009620	GATCGC	2	12	212488	212499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150375916
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4367	NC_009620	GCCAT	2	10	212595	212604	20 %	20 %	20 %	40 %	150375916
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4483	NC_009620	GGC	2	6	217392	217397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375921
4484	NC_009620	GAA	2	6	217407	217412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375921
4485	NC_009620	TCG	2	6	217438	217443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375921
4486	NC_009620	GCC	2	6	217522	217527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375921
4487	NC_009620	ACC	2	6	217621	217626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375921
4488	NC_009620	GGC	2	6	217754	217759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375921
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4497	NC_009620	GTC	3	9	218314	218322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375922
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4500	NC_009620	ATT	2	6	218389	218394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375922

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