MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 31436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_009620	CCG	2	6	1230590	1230595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376845
25003	NC_009620	CGT	2	6	1230603	1230608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376845
25004	NC_009620	GAAG	2	8	1230624	1230631	50 %	0 %	50 %	0 %	150376845
25005	NC_009620	GTC	2	6	1230658	1230663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376845
25006	NC_009620	CGT	2	6	1230711	1230716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376845
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25009	NC_009620	GTC	2	6	1230793	1230798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376845
25010	NC_009620	GAT	2	6	1230814	1230819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376845
25011	NC_009620	GTC	2	6	1230820	1230825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376845
25012	NC_009620	ATC	2	6	1230847	1230852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376845
25013	NC_009620	CGT	3	9	1230900	1230908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376845
25014	NC_009620	GCC	2	6	1230913	1230918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376845
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25019	NC_009620	CGA	2	6	1231629	1231634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376846
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25041	NC_009620	CCTC	2	8	1232318	1232325	0 %	25 %	0 %	75 %	150376846
25042	NC_009620	CGA	2	6	1232355	1232360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376846
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25099	NC_009620	ATCG	2	8	1234960	1234967	25 %	25 %	25 %	25 %	150376848
25100	NC_009620	ATCGC	2	10	1234969	1234978	20 %	20 %	20 %	40 %	150376848
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25104	NC_009620	CATG	2	8	1235315	1235322	25 %	25 %	25 %	25 %	150376849
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25114	NC_009620	GCA	2	6	1235846	1235851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376849
25115	NC_009620	GTC	2	6	1235958	1235963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376849
25116	NC_009620	TCG	2	6	1235968	1235973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376849
25117	NC_009620	CG	3	6	1235972	1235977	0 %	0 %	50 %	50 %	150376849
25118	NC_009620	GGC	3	9	1236017	1236025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376849
25119	NC_009620	GTC	2	6	1236030	1236035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376849
25120	NC_009620	TCG	2	6	1236064	1236069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376849
25121	NC_009620	GCG	2	6	1236070	1236075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376849
25122	NC_009620	GC	3	6	1236091	1236096	0 %	0 %	50 %	50 %	150376849
25123	NC_009620	C	6	6	1236099	1236104	0 %	0 %	0 %	100 %	150376849
25124	NC_009620	ATC	2	6	1236124	1236129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376849
25125	NC_009620	GA	3	6	1236156	1236161	50 %	0 %	50 %	0 %	150376849
25126	NC_009620	CGT	2	6	1236176	1236181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376849
25127	NC_009620	GCG	2	6	1236283	1236288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376849
25128	NC_009620	ATCGG	2	10	1236297	1236306	20 %	20 %	40 %	20 %	150376849
25129	NC_009620	CG	3	6	1236438	1236443	0 %	0 %	50 %	50 %	150376849
25130	NC_009620	GC	3	6	1236444	1236449	0 %	0 %	50 %	50 %	150376849
25131	NC_009620	CG	3	6	1236488	1236493	0 %	0 %	50 %	50 %	150376849
25132	NC_009620	CGG	2	6	1236522	1236527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376849
25133	NC_009620	TGC	2	6	1236530	1236535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376849
25134	NC_009620	TCT	2	6	1236747	1236752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376850
25135	NC_009620	CGA	2	6	1236769	1236774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376850
25136	NC_009620	GA	3	6	1236808	1236813	50 %	0 %	50 %	0 %	150376850
25137	NC_009620	GGC	2	6	1237063	1237068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376850
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25139	NC_009620	GCT	2	6	1237130	1237135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376850
25140	NC_009620	TGC	2	6	1237276	1237281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376850
25141	NC_009620	TGGCG	2	10	1237295	1237304	0 %	20 %	60 %	20 %	150376850
25142	NC_009620	GCG	3	9	1237459	1237467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376850
25143	NC_009620	GCGA	2	8	1237542	1237549	25 %	0 %	50 %	25 %	150376850
25144	NC_009620	TCG	2	6	1237735	1237740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376850
25145	NC_009620	GTC	2	6	1237758	1237763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376850
25146	NC_009620	CGT	2	6	1237805	1237810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376850
25147	NC_009620	CCG	2	6	1237837	1237842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376850
25148	NC_009620	GGCCG	2	10	1237851	1237860	0 %	0 %	60 %	40 %	150376850
25149	NC_009620	GC	3	6	1237915	1237920	0 %	0 %	50 %	50 %	150376850
25150	NC_009620	GCTC	2	8	1237940	1237947	0 %	25 %	25 %	50 %	150376850
25151	NC_009620	CG	3	6	1237961	1237966	0 %	0 %	50 %	50 %	150376850
25152	NC_009620	CTT	2	6	1238015	1238020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376850
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25154	NC_009620	CGTG	2	8	1238084	1238091	0 %	25 %	50 %	25 %	150376850
25155	NC_009620	GCCGT	2	10	1238116	1238125	0 %	20 %	40 %	40 %	150376850
25156	NC_009620	GTG	2	6	1238233	1238238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376851
25157	NC_009620	GTC	2	6	1238326	1238331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376851
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25161	NC_009620	GCCGG	2	10	1238428	1238437	0 %	0 %	60 %	40 %	150376851
25162	NC_009620	GC	3	6	1238443	1238448	0 %	0 %	50 %	50 %	150376851
25163	NC_009620	TGC	2	6	1238525	1238530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376851
25164	NC_009620	GC	3	6	1238619	1238624	0 %	0 %	50 %	50 %	150376851
25165	NC_009620	CTGCA	2	10	1238653	1238662	20 %	20 %	20 %	40 %	150376851
25166	NC_009620	CGGG	2	8	1238713	1238720	0 %	0 %	75 %	25 %	150376851
25167	NC_009620	TCG	2	6	1238795	1238800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376851
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25170	NC_009620	TCC	2	6	1238894	1238899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376851
25171	NC_009620	TCG	2	6	1238936	1238941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376851
25172	NC_009620	CGGA	2	8	1238980	1238987	25 %	0 %	50 %	25 %	150376851
25173	NC_009620	CGC	2	6	1238991	1238996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376851
25174	NC_009620	CCGAC	2	10	1239011	1239020	20 %	0 %	20 %	60 %	150376851
25175	NC_009620	CGA	2	6	1239045	1239050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376851
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25177	NC_009620	CTG	3	9	1239142	1239150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376851
25178	NC_009620	TGC	2	6	1239161	1239166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376851
25179	NC_009620	CAG	2	6	1239382	1239387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376851
25180	NC_009620	TTCCC	2	10	1239422	1239431	0 %	40 %	0 %	60 %	150376851
25181	NC_009620	TCA	2	6	1239455	1239460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376851
25182	NC_009620	CAG	2	6	1239466	1239471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376851
25183	NC_009620	TGA	2	6	1239473	1239478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376851
25184	NC_009620	GCG	2	6	1239513	1239518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376851
25185	NC_009620	CGGC	2	8	1239521	1239528	0 %	0 %	50 %	50 %	150376851
25186	NC_009620	AGG	2	6	1239593	1239598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376851
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25189	NC_009620	GCT	2	6	1239706	1239711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376851
25190	NC_009620	CG	3	6	1239713	1239718	0 %	0 %	50 %	50 %	150376851
25191	NC_009620	CGA	2	6	1239783	1239788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376851
25192	NC_009620	CGGCTC	2	12	1239846	1239857	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	150376851
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25195	NC_009620	GGAA	2	8	1239993	1240000	50 %	0 %	50 %	0 %	150376851
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25199	NC_009620	GCC	2	6	1240200	1240205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376851
25200	NC_009620	GATC	2	8	1240302	1240309	25 %	25 %	25 %	25 %	150376851
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25202	NC_009620	CG	3	6	1240343	1240348	0 %	0 %	50 %	50 %	150376851
25203	NC_009620	TGA	2	6	1240532	1240537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376851
25204	NC_009620	CAG	2	6	1240549	1240554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376851
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25211	NC_009620	GC	3	6	1240975	1240980	0 %	0 %	50 %	50 %	150376852
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25215	NC_009620	ATCT	2	8	1241472	1241479	25 %	50 %	0 %	25 %	150376852
25216	NC_009620	GC	3	6	1241495	1241500	0 %	0 %	50 %	50 %	150376852
25217	NC_009620	GAA	2	6	1241507	1241512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376852
25218	NC_009620	TCG	2	6	1241584	1241589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376852
25219	NC_009620	CTT	2	6	1241777	1241782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376852
25220	NC_009620	GC	3	6	1241798	1241803	0 %	0 %	50 %	50 %	150376852
25221	NC_009620	CTT	2	6	1241809	1241814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376852
25222	NC_009620	GCAG	2	8	1241864	1241871	25 %	0 %	50 %	25 %	150376852
25223	NC_009620	TGG	2	6	1241887	1241892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376852
25224	NC_009620	TCG	2	6	1241986	1241991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376852
25225	NC_009620	ACC	2	6	1241995	1242000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150376852
25226	NC_009620	AG	3	6	1242072	1242077	50 %	0 %	50 %	0 %	150376852
25227	NC_009620	AAG	2	6	1242241	1242246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376853
25228	NC_009620	GATC	2	8	1242252	1242259	25 %	25 %	25 %	25 %	150376853
25229	NC_009620	AAG	2	6	1242265	1242270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376853
25230	NC_009620	ACG	2	6	1242329	1242334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376853
25231	NC_009620	GGT	2	6	1242501	1242506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376853
25232	NC_009620	GAA	2	6	1242588	1242593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376853
25233	NC_009620	CTT	2	6	1242603	1242608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376853
25234	NC_009620	CG	3	6	1242614	1242619	0 %	0 %	50 %	50 %	150376853
25235	NC_009620	CCG	2	6	1242629	1242634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376853
25236	NC_009620	CTT	2	6	1242690	1242695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376853
25237	NC_009620	TCG	2	6	1242751	1242756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376853
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25239	NC_009620	TCG	2	6	1242803	1242808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376853
25240	NC_009620	ACT	2	6	1242819	1242824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376853
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25244	NC_009620	TTC	2	6	1242997	1243002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376853
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25334	NC_009620	GTC	2	6	1247532	1247537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376858
25335	NC_009620	ATC	2	6	1247644	1247649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376858
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25339	NC_009620	C	6	6	1247838	1247843	0 %	0 %	0 %	100 %	150376858
25340	NC_009620	GGC	2	6	1247872	1247877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376858
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25347	NC_009620	TCG	2	6	1248258	1248263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376859
25348	NC_009620	TGA	2	6	1248280	1248285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376859
25349	NC_009620	GCCG	2	8	1248296	1248303	0 %	0 %	50 %	50 %	150376859
25350	NC_009620	CGT	2	6	1248358	1248363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376859
25351	NC_009620	CGA	2	6	1248421	1248426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376859
25352	NC_009620	TCG	2	6	1248579	1248584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376859
25353	NC_009620	GCTC	2	8	1248592	1248599	0 %	25 %	25 %	50 %	150376859
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25355	NC_009620	CTG	2	6	1248704	1248709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376859
25356	NC_009620	CGG	2	6	1248801	1248806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376860
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25359	NC_009620	AGG	2	6	1248885	1248890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376860
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25369	NC_009620	GAG	2	6	1249519	1249524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376862
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25375	NC_009620	CGT	2	6	1249872	1249877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376862
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25378	NC_009620	GAC	2	6	1249948	1249953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376862
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25381	NC_009620	GGC	2	6	1250166	1250171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376863
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25390	NC_009620	CAG	2	6	1250751	1250756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376864
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25408	NC_009620	GCCG	2	8	1251881	1251888	0 %	0 %	50 %	50 %	150376865
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25437	NC_009620	ATCG	2	8	1253590	1253597	25 %	25 %	25 %	25 %	150376866
25438	NC_009620	CGACG	2	10	1253773	1253782	20 %	0 %	40 %	40 %	150376867
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25445	NC_009620	CTGT	2	8	1254071	1254078	0 %	50 %	25 %	25 %	150376867
25446	NC_009620	GCTG	2	8	1254080	1254087	0 %	25 %	50 %	25 %	150376867
25447	NC_009620	CATG	2	8	1254089	1254096	25 %	25 %	25 %	25 %	150376867
25448	NC_009620	CAC	2	6	1254110	1254115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150376867
25449	NC_009620	GGC	2	6	1254158	1254163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376867
25450	NC_009620	CGC	2	6	1254293	1254298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376867
25451	NC_009620	GCC	2	6	1254351	1254356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376867
25452	NC_009620	CAT	2	6	1254365	1254370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376867
25453	NC_009620	CGC	2	6	1254371	1254376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376867
25454	NC_009620	AGCGA	2	10	1254427	1254436	40 %	0 %	40 %	20 %	150376868
25455	NC_009620	CGG	2	6	1254442	1254447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376868
25456	NC_009620	GGC	2	6	1254455	1254460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376868
25457	NC_009620	TGA	2	6	1254517	1254522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376868
25458	NC_009620	GCA	2	6	1254542	1254547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376868
25459	NC_009620	GGA	2	6	1254593	1254598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376868
25460	NC_009620	CGC	2	6	1254641	1254646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376868
25461	NC_009620	GCT	2	6	1254689	1254694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376868
25462	NC_009620	GGCG	2	8	1254695	1254702	0 %	0 %	75 %	25 %	150376868
25463	NC_009620	ACGC	2	8	1254752	1254759	25 %	0 %	25 %	50 %	150376868
25464	NC_009620	CAA	2	6	1254794	1254799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150376868
25465	NC_009620	ATGC	2	8	1254846	1254853	25 %	25 %	25 %	25 %	150376868
25466	NC_009620	GAGC	2	8	1254862	1254869	25 %	0 %	50 %	25 %	150376868
25467	NC_009620	TCCG	2	8	1254890	1254897	0 %	25 %	25 %	50 %	150376868
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25469	NC_009620	CTG	2	6	1254990	1254995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376868
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25485	NC_009620	GCCG	2	8	1255701	1255708	0 %	0 %	50 %	50 %	150376869
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25489	NC_009620	CGG	2	6	1255820	1255825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376869
25490	NC_009620	TCA	2	6	1255829	1255834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376869
25491	NC_009620	GGC	2	6	1255953	1255958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376869
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25493	NC_009620	GCC	2	6	1256116	1256121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376869
25494	NC_009620	CGAG	2	8	1256139	1256146	25 %	0 %	50 %	25 %	150376869
25495	NC_009620	TGG	3	9	1256169	1256177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150376869
25496	NC_009620	GCC	2	6	1256227	1256232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376869
25497	NC_009620	GCA	2	6	1256271	1256276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376869
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25499	NC_009620	GC	3	6	1256330	1256335	0 %	0 %	50 %	50 %	150376869
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