MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 31436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009620	CGC	2	6	541511	541516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376224
11002	NC_009620	CGTCC	2	10	541554	541563	0 %	20 %	20 %	60 %	150376224
11003	NC_009620	CCG	2	6	541625	541630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376225
11004	NC_009620	ATCG	2	8	541717	541724	25 %	25 %	25 %	25 %	150376225
11005	NC_009620	TCG	2	6	541731	541736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376225
11006	NC_009620	GCTCG	2	10	541888	541897	0 %	20 %	40 %	40 %	150376225
11007	NC_009620	TGA	2	6	541947	541952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376225
11008	NC_009620	GCC	2	6	541970	541975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376225
11009	NC_009620	ATG	2	6	541976	541981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376225
11010	NC_009620	TGC	2	6	541998	542003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376225
11011	NC_009620	TCGGCA	2	12	542018	542029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150376225
11012	NC_009620	AGA	2	6	542043	542048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376225
11013	NC_009620	CCG	2	6	542049	542054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376225
11014	NC_009620	GC	4	8	542084	542091	0 %	0 %	50 %	50 %	150376225
11015	NC_009620	CGA	2	6	542118	542123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376225
11016	NC_009620	CCG	2	6	542124	542129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376225
11017	NC_009620	CGT	2	6	542145	542150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376225
11018	NC_009620	CGG	2	6	542207	542212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376225
11019	NC_009620	TCGC	2	8	542219	542226	0 %	25 %	25 %	50 %	150376225
11020	NC_009620	CGGC	2	8	542253	542260	0 %	0 %	50 %	50 %	150376225
11021	NC_009620	CTC	2	6	542284	542289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376225
11022	NC_009620	CGA	2	6	542307	542312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376225
11023	NC_009620	CCA	2	6	542349	542354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150376225
11024	NC_009620	CTT	2	6	542362	542367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376225
11025	NC_009620	GACC	2	8	542451	542458	25 %	0 %	25 %	50 %	150376225
11026	NC_009620	CGA	2	6	542472	542477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376225
11027	NC_009620	TGC	2	6	542514	542519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376225
11028	NC_009620	GCA	2	6	542609	542614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376225
11029	NC_009620	A	6	6	542649	542654	100 %	0 %	0 %	0 %	150376225
11030	NC_009620	AGCG	2	8	542668	542675	25 %	0 %	50 %	25 %	150376225
11031	NC_009620	CG	3	6	543511	543516	0 %	0 %	50 %	50 %	150376226
11032	NC_009620	CGC	2	6	543531	543536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376226
11033	NC_009620	CGG	2	6	543609	543614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376226
11034	NC_009620	TGCG	2	8	543630	543637	0 %	25 %	50 %	25 %	150376226
11035	NC_009620	AGC	2	6	543638	543643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376226
11036	NC_009620	GC	3	6	543665	543670	0 %	0 %	50 %	50 %	150376226
11037	NC_009620	CCG	2	6	543691	543696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376226
11038	NC_009620	G	6	6	543743	543748	0 %	0 %	100 %	0 %	150376226
11039	NC_009620	AAC	2	6	543785	543790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150376226
11040	NC_009620	GGGT	2	8	543819	543826	0 %	25 %	75 %	0 %	150376226
11041	NC_009620	TAT	2	6	543856	543861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150376226
11042	NC_009620	TTCG	2	8	543862	543869	0 %	50 %	25 %	25 %	150376226
11043	NC_009620	TTC	2	6	544373	544378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376227
11044	NC_009620	CGA	2	6	544469	544474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376227
11045	NC_009620	GGC	2	6	544497	544502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376227
11046	NC_009620	CGC	2	6	544623	544628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376227
11047	NC_009620	CTC	2	6	544653	544658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376227
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11049	NC_009620	TGC	2	6	544723	544728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376227
11050	NC_009620	TCG	2	6	544744	544749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376227
11051	NC_009620	GCG	2	6	544763	544768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376227
11052	NC_009620	GCT	2	6	544787	544792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376227
11053	NC_009620	CGG	2	6	544799	544804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376227
11054	NC_009620	AAG	2	6	544812	544817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376227
11055	NC_009620	CCATG	2	10	544887	544896	20 %	20 %	20 %	40 %	150376227
11056	NC_009620	GCC	2	6	544899	544904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376227
11057	NC_009620	CGT	2	6	545001	545006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376227
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11059	NC_009620	CGC	2	6	545034	545039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376227
11060	NC_009620	CGC	2	6	545054	545059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376227
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11062	NC_009620	CCT	2	6	545123	545128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376227
11063	NC_009620	CGT	2	6	545231	545236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376227
11064	NC_009620	GCC	2	6	545243	545248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376227
11065	NC_009620	CCGCC	2	10	545267	545276	0 %	0 %	20 %	80 %	150376227
11066	NC_009620	CGG	2	6	545282	545287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376227
11067	NC_009620	TGA	2	6	545306	545311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376227
11068	NC_009620	AGCGC	2	10	545381	545390	20 %	0 %	40 %	40 %	150376227
11069	NC_009620	TCT	2	6	545679	545684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376228
11070	NC_009620	GCAA	2	8	545687	545694	50 %	0 %	25 %	25 %	150376228
11071	NC_009620	CGT	2	6	545704	545709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376228
11072	NC_009620	ACA	2	6	545754	545759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150376228
11073	NC_009620	CGA	2	6	545779	545784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376228
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11075	NC_009620	TCG	2	6	545829	545834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376228
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11079	NC_009620	CGG	2	6	545956	545961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376228
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11083	NC_009620	CGA	3	9	546220	546228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376228
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11085	NC_009620	GGCC	2	8	546643	546650	0 %	0 %	50 %	50 %	150376229
11086	NC_009620	T	6	6	546710	546715	0 %	100 %	0 %	0 %	150376229
11087	NC_009620	TCG	2	6	546766	546771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376229
11088	NC_009620	CTG	2	6	546786	546791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376229
11089	NC_009620	GGC	2	6	546839	546844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376229
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11091	NC_009620	GAGC	2	8	547071	547078	25 %	0 %	50 %	25 %	150376230
11092	NC_009620	GC	3	6	547077	547082	0 %	0 %	50 %	50 %	150376230
11093	NC_009620	TCG	2	6	547087	547092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376230
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11098	NC_009620	GAAA	2	8	547479	547486	75 %	0 %	25 %	0 %	150376230
11099	NC_009620	TCGCC	2	10	547492	547501	0 %	20 %	20 %	60 %	150376230
11100	NC_009620	GGCC	2	8	547538	547545	0 %	0 %	50 %	50 %	150376230
11101	NC_009620	CCG	2	6	547546	547551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376230
11102	NC_009620	TTGC	2	8	547554	547561	0 %	50 %	25 %	25 %	150376230
11103	NC_009620	CTC	2	6	547722	547727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376230
11104	NC_009620	TCG	2	6	547792	547797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376230
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11108	NC_009620	CGGC	2	8	547962	547969	0 %	0 %	50 %	50 %	150376230
11109	NC_009620	GCC	2	6	548004	548009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376230
11110	NC_009620	AGC	2	6	548013	548018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376230
11111	NC_009620	GAG	2	6	548103	548108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376230
11112	NC_009620	TTCGC	2	10	548110	548119	0 %	40 %	20 %	40 %	150376230
11113	NC_009620	GC	3	6	548161	548166	0 %	0 %	50 %	50 %	150376230
11114	NC_009620	TCA	2	6	548189	548194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376230
11115	NC_009620	TCA	2	6	548198	548203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376230
11116	NC_009620	GCCGA	2	10	548221	548230	20 %	0 %	40 %	40 %	150376230
11117	NC_009620	GAT	2	6	548241	548246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376230
11118	NC_009620	GC	3	6	548300	548305	0 %	0 %	50 %	50 %	150376230
11119	NC_009620	CTC	2	6	548319	548324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150376230
11120	NC_009620	CAG	2	6	548325	548330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376230
11121	NC_009620	AGC	2	6	548359	548364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376230
11122	NC_009620	GGA	2	6	548418	548423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376230
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11160	NC_009620	CCG	2	6	550715	550720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376233
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11224	NC_009620	TTG	2	6	553176	553181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150376235
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11228	NC_009620	CAA	2	6	553337	553342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150376235
11229	NC_009620	GAG	2	6	553352	553357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376235
11230	NC_009620	CT	3	6	553368	553373	0 %	50 %	0 %	50 %	150376235
11231	NC_009620	CAAT	2	8	553444	553451	50 %	25 %	0 %	25 %	150376235
11232	NC_009620	ATCTGA	2	12	553537	553548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150376235
11233	NC_009620	CCA	2	6	553581	553586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150376235
11234	NC_009620	CTG	2	6	553653	553658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376235
11235	NC_009620	CCA	2	6	553685	553690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150376235
11236	NC_009620	CGA	2	6	553692	553697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376235
11237	NC_009620	GTC	3	9	553814	553822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376235
11238	NC_009620	CGC	2	6	553888	553893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376235
11239	NC_009620	CGT	2	6	553897	553902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376235
11240	NC_009620	CCGA	2	8	553923	553930	25 %	0 %	25 %	50 %	150376235
11241	NC_009620	GGCA	2	8	554035	554042	25 %	0 %	50 %	25 %	150376235
11242	NC_009620	TGA	2	6	554057	554062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376235
11243	NC_009620	GAA	2	6	554540	554545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376236
11244	NC_009620	TTC	2	6	554572	554577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376236
11245	NC_009620	CGA	2	6	554589	554594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376236
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11250	NC_009620	AGT	2	6	554732	554737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376236
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11252	NC_009620	GAA	2	6	554793	554798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150376236
11253	NC_009620	ACTCGT	2	12	554843	554854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150376236
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11265	NC_009620	GC	3	6	555234	555239	0 %	0 %	50 %	50 %	150376236
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11270	NC_009620	TGA	2	6	555837	555842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150376237
11271	NC_009620	CCG	2	6	555843	555848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376237
11272	NC_009620	GTC	2	6	555882	555887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376237
11273	NC_009620	CGC	2	6	555895	555900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376237
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11275	NC_009620	GGCGA	2	10	556054	556063	20 %	0 %	60 %	20 %	150376237
11276	NC_009620	GCCGAT	2	12	556076	556087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150376237
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11281	NC_009620	GC	3	6	556417	556422	0 %	0 %	50 %	50 %	150376237
11282	NC_009620	TGC	2	6	556425	556430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376237
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11325	NC_009620	GCG	2	6	558844	558849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376240
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11332	NC_009620	GAC	2	6	559225	559230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376240
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11343	NC_009620	GACC	2	8	559626	559633	25 %	0 %	25 %	50 %	150376240
11344	NC_009620	GCC	2	6	559832	559837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376240
11345	NC_009620	CGC	2	6	559854	559859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376240
11346	NC_009620	TC	3	6	559876	559881	0 %	50 %	0 %	50 %	150376240
11347	NC_009620	CCG	2	6	560312	560317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376241
11348	NC_009620	GC	5	10	560321	560330	0 %	0 %	50 %	50 %	150376241
11349	NC_009620	GAC	2	6	560332	560337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376241
11350	NC_009620	GGA	2	6	560346	560351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376241
11351	NC_009620	TCG	2	6	560366	560371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376241
11352	NC_009620	AGC	2	6	560381	560386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376241
11353	NC_009620	CGAT	2	8	560399	560406	25 %	25 %	25 %	25 %	150376241
11354	NC_009620	GCC	2	6	560452	560457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150376241
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11356	NC_009620	TCA	2	6	560522	560527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376241
11357	NC_009620	CTT	2	6	560590	560595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150376241
11358	NC_009620	CGG	2	6	560670	560675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150376241
11359	NC_009620	TCG	2	6	560687	560692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150376241
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11466	NC_009620	GCCGA	2	10	565087	565096	20 %	0 %	40 %	40 %	150376246
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11469	NC_009620	GGA	2	6	565211	565216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150376246
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11474	NC_009620	CGA	2	6	565412	565417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150376246
11475	NC_009620	TCA	2	6	565418	565423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150376246
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