MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 31436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009620	CGC	2	6	242490	242495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375942
5002	NC_009620	CGT	2	6	242500	242505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375942
5003	NC_009620	CGA	2	6	242584	242589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375942
5004	NC_009620	CAA	2	6	242614	242619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375942
5005	NC_009620	CGC	2	6	242641	242646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375942
5006	NC_009620	GAC	2	6	242686	242691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375942
5007	NC_009620	ACG	3	9	242730	242738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375942
5008	NC_009620	CG	4	8	242785	242792	0 %	0 %	50 %	50 %	150375942
5009	NC_009620	CGA	2	6	242797	242802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375942
5010	NC_009620	CGT	2	6	242824	242829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375942
5011	NC_009620	GAC	2	6	242840	242845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375942
5012	NC_009620	TTG	2	6	243078	243083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375943
5013	NC_009620	ATGACG	2	12	243147	243158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150375943
5014	NC_009620	CGT	2	6	243171	243176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375943
5015	NC_009620	GC	3	6	243334	243339	0 %	0 %	50 %	50 %	150375943
5016	NC_009620	TCA	2	6	243354	243359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375943
5017	NC_009620	AAT	2	6	243371	243376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375943
5018	NC_009620	GCC	2	6	243448	243453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375944
5019	NC_009620	CAT	2	6	243520	243525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375944
5020	NC_009620	CGG	2	6	243570	243575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375944
5021	NC_009620	AGG	2	6	243590	243595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375944
5022	NC_009620	GAC	2	6	243601	243606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375944
5023	NC_009620	CTT	2	6	243667	243672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375944
5024	NC_009620	GCG	2	6	243734	243739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375944
5025	NC_009620	AAGA	2	8	243820	243827	75 %	0 %	25 %	0 %	150375944
5026	NC_009620	CGAT	2	8	243828	243835	25 %	25 %	25 %	25 %	150375944
5027	NC_009620	CTG	2	6	243846	243851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375944
5028	NC_009620	CCT	2	6	243861	243866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375944
5029	NC_009620	ATG	2	6	243908	243913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375944
5030	NC_009620	TCG	2	6	243932	243937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375944
5031	NC_009620	CAAG	2	8	243938	243945	50 %	0 %	25 %	25 %	150375944
5032	NC_009620	TACC	2	8	243969	243976	25 %	25 %	0 %	50 %	150375944
5033	NC_009620	GCA	2	6	244014	244019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375944
5034	NC_009620	TCA	2	6	244028	244033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375944
5035	NC_009620	CAG	2	6	244036	244041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375944
5036	NC_009620	AAT	2	6	244093	244098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375945
5037	NC_009620	TCCC	2	8	244143	244150	0 %	25 %	0 %	75 %	150375945
5038	NC_009620	CAA	2	6	244158	244163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375945
5039	NC_009620	CTT	2	6	244201	244206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375945
5040	NC_009620	CCG	2	6	244245	244250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375945
5041	NC_009620	TTG	2	6	244295	244300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375945
5042	NC_009620	CTG	2	6	244390	244395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375945
5043	NC_009620	GCG	2	6	244459	244464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375945
5044	NC_009620	CGT	2	6	244509	244514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375945
5045	NC_009620	CAT	2	6	244552	244557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375945
5046	NC_009620	CGA	2	6	244579	244584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375945
5047	NC_009620	CGCC	2	8	244585	244592	0 %	0 %	25 %	75 %	150375945
5048	NC_009620	GTC	2	6	244594	244599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375945
5049	NC_009620	CG	3	6	244621	244626	0 %	0 %	50 %	50 %	150375945
5050	NC_009620	CTGCC	2	10	244666	244675	0 %	20 %	20 %	60 %	150375945
5051	NC_009620	CCG	2	6	244816	244821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375945
5052	NC_009620	CGT	2	6	244956	244961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375945
5053	NC_009620	GATG	2	8	245083	245090	25 %	25 %	50 %	0 %	150375945
5054	NC_009620	GCC	2	6	245107	245112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375945
5055	NC_009620	AC	3	6	245142	245147	50 %	0 %	0 %	50 %	150375945
5056	NC_009620	GC	3	6	245157	245162	0 %	0 %	50 %	50 %	150375945
5057	NC_009620	CGG	2	6	245349	245354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375945
5058	NC_009620	GAC	2	6	245401	245406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375945
5059	NC_009620	GC	3	6	245413	245418	0 %	0 %	50 %	50 %	150375945
5060	NC_009620	GAC	2	6	245473	245478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375945
5061	NC_009620	GGC	2	6	245492	245497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375945
5062	NC_009620	GC	3	6	245589	245594	0 %	0 %	50 %	50 %	150375945
5063	NC_009620	GCCG	2	8	245599	245606	0 %	0 %	50 %	50 %	150375945
5064	NC_009620	CCA	2	6	245607	245612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375945
5065	NC_009620	GGC	2	6	245779	245784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375945
5066	NC_009620	GCTTTC	2	12	245794	245805	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150375945
5067	NC_009620	TGGCA	2	10	245835	245844	20 %	20 %	40 %	20 %	150375945
5068	NC_009620	GCA	2	6	245904	245909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375945
5069	NC_009620	CG	3	6	246262	246267	0 %	0 %	50 %	50 %	150375946
5070	NC_009620	CGG	2	6	246273	246278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375946
5071	NC_009620	TCGG	2	8	246330	246337	0 %	25 %	50 %	25 %	150375946
5072	NC_009620	TTC	2	6	246463	246468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375946
5073	NC_009620	AGC	2	6	246497	246502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375946
5074	NC_009620	CG	3	6	246544	246549	0 %	0 %	50 %	50 %	150375946
5075	NC_009620	CG	3	6	246620	246625	0 %	0 %	50 %	50 %	150375946
5076	NC_009620	GCA	2	6	246661	246666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375946
5077	NC_009620	TCC	2	6	246703	246708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375946
5078	NC_009620	GTG	2	6	246756	246761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375946
5079	NC_009620	TTTTTC	2	12	246791	246802	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150375946
5080	NC_009620	CTG	2	6	246838	246843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375946
5081	NC_009620	CGC	2	6	246844	246849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375946
5082	NC_009620	TCG	2	6	246872	246877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375946
5083	NC_009620	GGGC	2	8	246897	246904	0 %	0 %	75 %	25 %	150375946
5084	NC_009620	TCT	2	6	246938	246943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375946
5085	NC_009620	CGC	3	9	246969	246977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375946
5086	NC_009620	GAC	2	6	247014	247019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375946
5087	NC_009620	CTGG	2	8	247041	247048	0 %	25 %	50 %	25 %	150375946
5088	NC_009620	TCG	3	9	247052	247060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375946
5089	NC_009620	T	6	6	247062	247067	0 %	100 %	0 %	0 %	150375946
5090	NC_009620	CCG	2	6	247093	247098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375946
5091	NC_009620	CGCC	2	8	247101	247108	0 %	0 %	25 %	75 %	150375946
5092	NC_009620	GAAA	2	8	247110	247117	75 %	0 %	25 %	0 %	150375946
5093	NC_009620	GCCG	2	8	247215	247222	0 %	0 %	50 %	50 %	150375946
5094	NC_009620	TCGCCG	2	12	247331	247342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	150375946
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5098	NC_009620	CATT	2	8	247556	247563	25 %	50 %	0 %	25 %	150375947
5099	NC_009620	TCT	2	6	247569	247574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375947
5100	NC_009620	GGC	2	6	247615	247620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375947
5101	NC_009620	CGG	2	6	247674	247679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375947
5102	NC_009620	CTC	2	6	247693	247698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375947
5103	NC_009620	TTC	2	6	247804	247809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375947
5104	NC_009620	CGCT	2	8	247810	247817	0 %	25 %	25 %	50 %	150375947
5105	NC_009620	GCC	2	6	247820	247825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375947
5106	NC_009620	ATC	2	6	247840	247845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375947
5107	NC_009620	GCA	2	6	247901	247906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375947
5108	NC_009620	CGA	2	6	247911	247916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375947
5109	NC_009620	GGTC	2	8	247995	248002	0 %	25 %	50 %	25 %	150375947
5110	NC_009620	CGGC	2	8	248024	248031	0 %	0 %	50 %	50 %	150375947
5111	NC_009620	ATC	2	6	248035	248040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375947
5112	NC_009620	GAAA	2	8	248050	248057	75 %	0 %	25 %	0 %	150375947
5113	NC_009620	CGA	2	6	248069	248074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375947
5114	NC_009620	TCGA	2	8	248077	248084	25 %	25 %	25 %	25 %	150375947
5115	NC_009620	CGG	2	6	248097	248102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375947
5116	NC_009620	GTC	2	6	248158	248163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375947
5117	NC_009620	CGGTGG	2	12	248214	248225	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	150375947
5118	NC_009620	TC	3	6	248235	248240	0 %	50 %	0 %	50 %	150375947
5119	NC_009620	CGTCT	2	10	248242	248251	0 %	40 %	20 %	40 %	150375947
5120	NC_009620	ATC	2	6	248474	248479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375948
5121	NC_009620	AGG	2	6	248484	248489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375948
5122	NC_009620	GAT	2	6	248491	248496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375948
5123	NC_009620	CTT	2	6	248534	248539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375948
5124	NC_009620	AGCC	2	8	248602	248609	25 %	0 %	25 %	50 %	150375948
5125	NC_009620	CTG	2	6	248636	248641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375948
5126	NC_009620	GGC	2	6	248681	248686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375948
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5130	NC_009620	CT	3	6	248841	248846	0 %	50 %	0 %	50 %	150375948
5131	NC_009620	GGT	2	6	249046	249051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375948
5132	NC_009620	CGC	2	6	249055	249060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375948
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5135	NC_009620	ACG	2	6	249288	249293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375948
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5140	NC_009620	CCG	2	6	249559	249564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375949
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5144	NC_009620	TCG	2	6	249741	249746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375949
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5149	NC_009620	CGG	2	6	249856	249861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375949
5150	NC_009620	CCGCA	2	10	249899	249908	20 %	0 %	20 %	60 %	150375949
5151	NC_009620	GCA	2	6	250036	250041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375949
5152	NC_009620	TCA	2	6	250059	250064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375949
5153	NC_009620	TCT	2	6	250099	250104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375949
5154	NC_009620	ACG	2	6	250125	250130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375949
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5159	NC_009620	GCT	2	6	250285	250290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375949
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5233	NC_009620	CCG	2	6	253559	253564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375953
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5237	NC_009620	AACGA	2	10	253738	253747	60 %	0 %	20 %	20 %	150375953
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5241	NC_009620	C	6	6	253857	253862	0 %	0 %	0 %	100 %	150375953
5242	NC_009620	CCG	2	6	253891	253896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375953
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5244	NC_009620	CCG	2	6	253928	253933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375953
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5347	NC_009620	TCCG	2	8	262013	262020	0 %	25 %	25 %	50 %	150375958
5348	NC_009620	GCC	2	6	262029	262034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375958
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5351	NC_009620	CT	4	8	262211	262218	0 %	50 %	0 %	50 %	150375958
5352	NC_009620	CG	3	6	262239	262244	0 %	0 %	50 %	50 %	150375958
5353	NC_009620	CGA	2	6	262325	262330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375958
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5359	NC_009620	AAAG	2	8	262550	262557	75 %	0 %	25 %	0 %	150375958
5360	NC_009620	GCA	2	6	262655	262660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375958
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5362	NC_009620	CTG	2	6	262692	262697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375958
5363	NC_009620	GTTG	2	8	262811	262818	0 %	50 %	50 %	0 %	150375958
5364	NC_009620	AG	4	8	262836	262843	50 %	0 %	50 %	0 %	150375958
5365	NC_009620	CGA	2	6	262913	262918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375958
5366	NC_009620	CGC	2	6	263039	263044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375959
5367	NC_009620	CCG	2	6	263067	263072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375959
5368	NC_009620	GAGCAC	2	12	263082	263093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375959
5369	NC_009620	ATG	2	6	263128	263133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375959
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5373	NC_009620	GTC	2	6	263272	263277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375959
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5375	NC_009620	CAC	2	6	263319	263324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375959
5376	NC_009620	CGA	2	6	263342	263347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375959
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5378	NC_009620	CTCGAT	2	12	263358	263369	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150375959
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5384	NC_009620	TCGG	2	8	263713	263720	0 %	25 %	50 %	25 %	150375959
5385	NC_009620	AGT	2	6	263723	263728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375959
5386	NC_009620	GTA	2	6	263775	263780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375959
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5390	NC_009620	GATCGT	2	12	263906	263917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150375960
5391	NC_009620	GAT	2	6	263921	263926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375960
5392	NC_009620	AAC	2	6	263931	263936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375960
5393	NC_009620	GCC	2	6	263946	263951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375960
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5402	NC_009620	CGA	2	6	264628	264633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375960
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5418	NC_009620	CGGCCG	2	12	265523	265534	0 %	0 %	50 %	50 %	150375961
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5432	NC_009620	ACG	2	6	266723	266728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375962
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5434	NC_009620	CGT	2	6	266866	266871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375962
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5437	NC_009620	CTG	2	6	267074	267079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375962
5438	NC_009620	TCGATA	2	12	267147	267158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150375962
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5444	NC_009620	TCG	2	6	267402	267407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375962
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5447	NC_009620	GAC	2	6	267497	267502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375962
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5450	NC_009620	GC	3	6	267565	267570	0 %	0 %	50 %	50 %	150375962
5451	NC_009620	CTCGC	2	10	267579	267588	0 %	20 %	20 %	60 %	150375962
5452	NC_009620	GCT	2	6	267604	267609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375962
5453	NC_009620	GCCG	3	12	267611	267622	0 %	0 %	50 %	50 %	150375962
5454	NC_009620	CGG	2	6	267681	267686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375962
5455	NC_009620	CAG	2	6	267822	267827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375963
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5462	NC_009620	GC	3	6	268131	268136	0 %	0 %	50 %	50 %	150375963
5463	NC_009620	TCG	2	6	268141	268146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375963
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5465	NC_009620	GC	3	6	268195	268200	0 %	0 %	50 %	50 %	150375963
5466	NC_009620	TCG	2	6	268213	268218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375963
5467	NC_009620	CAGC	2	8	268340	268347	25 %	0 %	25 %	50 %	150375963
5468	NC_009620	GCCG	2	8	268368	268375	0 %	0 %	50 %	50 %	150375963
5469	NC_009620	CAGT	2	8	268552	268559	25 %	25 %	25 %	25 %	150375964
5470	NC_009620	GCC	2	6	268563	268568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375964
5471	NC_009620	GC	4	8	268576	268583	0 %	0 %	50 %	50 %	150375964
5472	NC_009620	CAT	2	6	268584	268589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375964
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5474	NC_009620	GCT	2	6	268800	268805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375964
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5476	NC_009620	TGC	3	9	268824	268832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375964
5477	NC_009620	GC	3	6	268831	268836	0 %	0 %	50 %	50 %	150375964
5478	NC_009620	TCC	2	6	268865	268870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375964
5479	NC_009620	CTG	2	6	268896	268901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375964
5480	NC_009620	TGGA	2	8	268906	268913	25 %	25 %	50 %	0 %	150375964
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5482	NC_009620	GCC	2	6	269071	269076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375964
5483	NC_009620	TCG	2	6	269081	269086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375964
5484	NC_009620	CGC	2	6	269102	269107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375964
5485	NC_009620	CAC	2	6	269156	269161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375965
5486	NC_009620	CGC	2	6	269162	269167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375965
5487	NC_009620	TCG	2	6	269185	269190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375965
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