MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 plasmid pSJH101

Total Repeats: 621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009619	ATTA	2	8	47	54	50 %	50 %	0 %	0 %	150375693
2	NC_009619	TTG	2	6	56	61	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375693
3	NC_009619	ACAGC	2	10	92	101	40 %	0 %	20 %	40 %	150375693
4	NC_009619	TGA	2	6	105	110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375693
5	NC_009619	ATG	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375693
6	NC_009619	CT	3	6	331	336	0 %	50 %	0 %	50 %	150375694
7	NC_009619	TAA	2	6	351	356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375694
8	NC_009619	AAT	2	6	357	362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375694
9	NC_009619	TA	3	6	405	410	50 %	50 %	0 %	0 %	150375694
10	NC_009619	ATG	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375694
11	NC_009619	AC	3	6	473	478	50 %	0 %	0 %	50 %	150375694
12	NC_009619	TCT	2	6	485	490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375694
13	NC_009619	ATA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375694
14	NC_009619	TCT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375694
15	NC_009619	T	6	6	534	539	0 %	100 %	0 %	0 %	150375694
16	NC_009619	ATC	2	6	568	573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375694
17	NC_009619	A	6	6	578	583	100 %	0 %	0 %	0 %	150375694
18	NC_009619	ATCAC	2	10	620	629	40 %	20 %	0 %	40 %	150375694
19	NC_009619	AAT	3	9	709	717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
20	NC_009619	TA	3	6	733	738	50 %	50 %	0 %	0 %	150375695
21	NC_009619	AAT	2	6	739	744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
22	NC_009619	CAA	2	6	771	776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375695
23	NC_009619	AAG	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375695
24	NC_009619	AAAATT	2	12	830	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
25	NC_009619	AGTA	2	8	856	863	50 %	25 %	25 %	0 %	150375695
26	NC_009619	TTCA	2	8	979	986	25 %	50 %	0 %	25 %	150375695
27	NC_009619	T	6	6	991	996	0 %	100 %	0 %	0 %	150375695
28	NC_009619	CT	3	6	999	1004	0 %	50 %	0 %	50 %	150375695
29	NC_009619	ATC	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375695
30	NC_009619	ACTA	2	8	1123	1130	50 %	25 %	0 %	25 %	150375695
31	NC_009619	ATA	2	6	1139	1144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
32	NC_009619	A	6	6	1204	1209	100 %	0 %	0 %	0 %	150375695
33	NC_009619	TAA	2	6	1213	1218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
34	NC_009619	TAA	2	6	1225	1230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
35	NC_009619	CTG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375695
36	NC_009619	CAG	3	9	1257	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375695
37	NC_009619	CAA	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375695
38	NC_009619	ATA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
39	NC_009619	CTTT	2	8	2403	2410	0 %	75 %	0 %	25 %	150375696
40	NC_009619	A	7	7	2470	2476	100 %	0 %	0 %	0 %	150375696
41	NC_009619	TCA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375696
42	NC_009619	TAAAA	2	10	2502	2511	80 %	20 %	0 %	0 %	150375696
43	NC_009619	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	150375696
44	NC_009619	TA	3	6	2568	2573	50 %	50 %	0 %	0 %	150375696
45	NC_009619	TCAT	2	8	2587	2594	25 %	50 %	0 %	25 %	150375696
46	NC_009619	ATT	2	6	2718	2723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375697
47	NC_009619	AAT	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375697
48	NC_009619	GAA	2	6	2785	2790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375697
49	NC_009619	A	6	6	2792	2797	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
50	NC_009619	AAGA	2	8	2863	2870	75 %	0 %	25 %	0 %	150375697
51	NC_009619	A	6	6	2935	2940	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
52	NC_009619	A	7	7	2950	2956	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
53	NC_009619	AGA	2	6	2964	2969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375697
54	NC_009619	TAA	2	6	3036	3041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375697
55	NC_009619	A	6	6	3056	3061	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
56	NC_009619	AT	3	6	3088	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	150375697
57	NC_009619	ACA	2	6	3101	3106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375697
58	NC_009619	A	7	7	3106	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
59	NC_009619	A	6	6	3131	3136	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
60	NC_009619	TTA	2	6	3170	3175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375697
61	NC_009619	GTA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375697
62	NC_009619	ACT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375697
63	NC_009619	CGG	2	6	3336	3341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375697
64	NC_009619	ATT	2	6	4568	4573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375698
65	NC_009619	ATATT	2	10	4582	4591	40 %	60 %	0 %	0 %	150375698
66	NC_009619	TTC	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375698
67	NC_009619	T	6	6	4722	4727	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
68	NC_009619	AAG	2	6	4739	4744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375698
69	NC_009619	T	7	7	4809	4815	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
70	NC_009619	TAA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375698
71	NC_009619	TTAG	2	8	4876	4883	25 %	50 %	25 %	0 %	150375698
72	NC_009619	ATC	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375698
73	NC_009619	TCAT	2	8	4996	5003	25 %	50 %	0 %	25 %	150375698
74	NC_009619	ATT	2	6	5007	5012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375698
75	NC_009619	CTTC	2	8	5141	5148	0 %	50 %	0 %	50 %	150375698
76	NC_009619	TCT	2	6	5173	5178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375698
77	NC_009619	TTTA	2	8	5241	5248	25 %	75 %	0 %	0 %	150375698
78	NC_009619	CGT	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375698
79	NC_009619	T	7	7	5292	5298	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
80	NC_009619	CTTTT	2	10	5310	5319	0 %	80 %	0 %	20 %	150375698
81	NC_009619	T	6	6	5316	5321	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
82	NC_009619	TCA	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375698
83	NC_009619	TTAG	2	8	5452	5459	25 %	50 %	25 %	0 %	150375698
84	NC_009619	TCTT	2	8	5508	5515	0 %	75 %	0 %	25 %	150375698
85	NC_009619	TTTA	2	8	5604	5611	25 %	75 %	0 %	0 %	150375699
86	NC_009619	ATTT	2	8	5619	5626	25 %	75 %	0 %	0 %	150375699
87	NC_009619	ATT	2	6	5653	5658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375699
88	NC_009619	TA	3	6	5662	5667	50 %	50 %	0 %	0 %	150375699
89	NC_009619	TA	3	6	5685	5690	50 %	50 %	0 %	0 %	150375699
90	NC_009619	TTA	2	6	5712	5717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375699
91	NC_009619	GAA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
92	NC_009619	TAA	2	6	6034	6039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375700
93	NC_009619	AGA	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
94	NC_009619	A	6	6	6111	6116	100 %	0 %	0 %	0 %	150375700
95	NC_009619	TAC	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375700
96	NC_009619	ACAA	2	8	6174	6181	75 %	0 %	0 %	25 %	150375700
97	NC_009619	A	8	8	6180	6187	100 %	0 %	0 %	0 %	150375700
98	NC_009619	ATA	2	6	6195	6200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375700
99	NC_009619	TAG	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375700
100	NC_009619	AAT	2	6	6266	6271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375700
101	NC_009619	GTC	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375700
102	NC_009619	ACA	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375700
103	NC_009619	AAGA	2	8	6333	6340	75 %	0 %	25 %	0 %	150375700
104	NC_009619	AG	3	6	6376	6381	50 %	0 %	50 %	0 %	150375700
105	NC_009619	TAA	2	6	6382	6387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375700
106	NC_009619	AGAAAA	2	12	6415	6426	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150375700
107	NC_009619	CTA	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375700
108	NC_009619	A	6	6	6486	6491	100 %	0 %	0 %	0 %	150375700
109	NC_009619	TAC	2	6	6496	6501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375700
110	NC_009619	GAA	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
111	NC_009619	AT	3	6	6564	6569	50 %	50 %	0 %	0 %	150375700
112	NC_009619	CGA	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375700
113	NC_009619	GAA	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
114	NC_009619	A	7	7	6610	6616	100 %	0 %	0 %	0 %	150375700
115	NC_009619	AGA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
116	NC_009619	GAA	2	6	6671	6676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
117	NC_009619	GTTT	2	8	6705	6712	0 %	75 %	25 %	0 %	150375700
118	NC_009619	CTA	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375701
119	NC_009619	AT	3	6	7174	7179	50 %	50 %	0 %	0 %	150375701
120	NC_009619	GTG	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375701
121	NC_009619	TCA	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375701
122	NC_009619	GAA	2	6	7271	7276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375701
123	NC_009619	A	6	6	7284	7289	100 %	0 %	0 %	0 %	150375701
124	NC_009619	TTA	2	6	7292	7297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375701
125	NC_009619	TGA	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375701
126	NC_009619	ACAT	2	8	7376	7383	50 %	25 %	0 %	25 %	150375701
127	NC_009619	TTAAAC	2	12	7531	7542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150375701
128	NC_009619	AAGA	2	8	7610	7617	75 %	0 %	25 %	0 %	150375701
129	NC_009619	A	6	6	7643	7648	100 %	0 %	0 %	0 %	150375701
130	NC_009619	TA	3	6	7681	7686	50 %	50 %	0 %	0 %	150375701
131	NC_009619	GAA	2	6	8073	8078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375702
132	NC_009619	TGA	2	6	8087	8092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375702
133	NC_009619	TTGATA	2	12	8104	8115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150375702
134	NC_009619	ATA	2	6	8170	8175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375702
135	NC_009619	TTTA	2	8	8233	8240	25 %	75 %	0 %	0 %	150375702
136	NC_009619	ATT	2	6	8291	8296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375702
137	NC_009619	TTA	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375702
138	NC_009619	GTT	2	6	8329	8334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375702
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