MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 chromosome

Total Repeats: 148116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009511	CGG	2	6	122876	122881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553054
3502	NC_009511	TCG	2	6	122907	122912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3503	NC_009511	GCT	2	6	122935	122940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3504	NC_009511	CGA	2	6	122960	122965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3505	NC_009511	CTC	2	6	123017	123022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553054
3506	NC_009511	TGA	2	6	123043	123048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553054
3507	NC_009511	TCG	2	6	123067	123072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3508	NC_009511	TCT	2	6	123088	123093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553054
3509	NC_009511	GCA	2	6	123103	123108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3510	NC_009511	GGT	2	6	123149	123154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553054
3511	NC_009511	GCC	2	6	123176	123181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553054
3512	NC_009511	CGC	2	6	123220	123225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553054
3513	NC_009511	TCG	2	6	123261	123266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3514	NC_009511	CTC	2	6	123323	123328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553054
3515	NC_009511	CGC	2	6	123334	123339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553054
3516	NC_009511	AGC	2	6	123357	123362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3517	NC_009511	GC	3	6	123361	123366	0 %	0 %	50 %	50 %	148553054
3518	NC_009511	CGAG	2	8	123373	123380	25 %	0 %	50 %	25 %	148553054
3519	NC_009511	CCG	2	6	123388	123393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553054
3520	NC_009511	GCA	3	9	123394	123402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3521	NC_009511	CGA	2	6	123421	123426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3522	NC_009511	GC	3	6	123431	123436	0 %	0 %	50 %	50 %	148553054
3523	NC_009511	GTT	2	6	123491	123496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148553054
3524	NC_009511	CGG	2	6	123504	123509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553054
3525	NC_009511	GC	3	6	123613	123618	0 %	0 %	50 %	50 %	148553054
3526	NC_009511	CTT	2	6	123626	123631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553054
3527	NC_009511	TCC	2	6	123657	123662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553054
3528	NC_009511	GCT	2	6	123682	123687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3529	NC_009511	GGCC	2	8	123697	123704	0 %	0 %	50 %	50 %	148553054
3530	NC_009511	GGC	2	6	123742	123747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553054
3531	NC_009511	CTG	3	9	123755	123763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3532	NC_009511	GAA	2	6	123767	123772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553054
3533	NC_009511	CGCT	2	8	123789	123796	0 %	25 %	25 %	50 %	148553054
3534	NC_009511	CGA	2	6	123805	123810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3535	NC_009511	CCT	2	6	123829	123834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553054
3536	NC_009511	CGA	2	6	123842	123847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3537	NC_009511	CG	3	6	123863	123868	0 %	0 %	50 %	50 %	148553054
3538	NC_009511	TGG	2	6	123892	123897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553054
3539	NC_009511	GCTC	2	8	123973	123980	0 %	25 %	25 %	50 %	148553054
3540	NC_009511	CGC	2	6	123988	123993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553054
3541	NC_009511	TCA	2	6	124000	124005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553054
3542	NC_009511	GAG	2	6	124037	124042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553054
3543	NC_009511	GCT	2	6	124076	124081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553054
3544	NC_009511	GGC	2	6	124082	124087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553054
3545	NC_009511	GC	3	6	124358	124363	0 %	0 %	50 %	50 %	148553055
3546	NC_009511	TCG	2	6	124371	124376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553055
3547	NC_009511	GAT	2	6	124384	124389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553055
3548	NC_009511	TCG	2	6	124422	124427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553055
3549	NC_009511	TCG	2	6	124446	124451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553055
3550	NC_009511	GAG	2	6	124581	124586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553056
3551	NC_009511	CGGGC	2	10	124631	124640	0 %	0 %	60 %	40 %	148553056
3552	NC_009511	CGC	2	6	124664	124669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553056
3553	NC_009511	CCG	4	12	124716	124727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553056
3554	NC_009511	GC	3	6	124729	124734	0 %	0 %	50 %	50 %	148553056
3555	NC_009511	GCT	2	6	124799	124804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553056
3556	NC_009511	GC	3	6	124819	124824	0 %	0 %	50 %	50 %	148553056
3557	NC_009511	TCG	2	6	124825	124830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553056
3558	NC_009511	GCG	2	6	124834	124839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553056
3559	NC_009511	CGG	2	6	124858	124863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553056
3560	NC_009511	GGC	3	9	124910	124918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553056
3561	NC_009511	GC	3	6	124961	124966	0 %	0 %	50 %	50 %	148553056
3562	NC_009511	GCC	2	6	124971	124976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553056
3563	NC_009511	GCT	2	6	124988	124993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553056
3564	NC_009511	CCG	2	6	125071	125076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553056
3565	NC_009511	GCC	2	6	125094	125099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553056
3566	NC_009511	GCC	2	6	125115	125120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553056
3567	NC_009511	CGG	2	6	125210	125215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553056
3568	NC_009511	GGA	2	6	125249	125254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553056
3569	NC_009511	GCC	2	6	125257	125262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553056
3570	NC_009511	CGG	2	6	125282	125287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553056
3571	NC_009511	CTGACC	2	12	125331	125342	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148553056
3572	NC_009511	CGG	2	6	125380	125385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553056
3573	NC_009511	CGA	2	6	125390	125395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553056
3574	NC_009511	GTC	2	6	125406	125411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553056
3575	NC_009511	GAG	2	6	125424	125429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553056
3576	NC_009511	GGC	2	6	125431	125436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553056
3577	NC_009511	GGC	2	6	125474	125479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553056
3578	NC_009511	CGC	2	6	125490	125495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553056
3579	NC_009511	ACC	2	6	125591	125596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148553057
3580	NC_009511	GCCG	2	8	125608	125615	0 %	0 %	50 %	50 %	148553057
3581	NC_009511	GTC	2	6	125695	125700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553057
3582	NC_009511	TCG	2	6	125711	125716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553057
3583	NC_009511	CTT	2	6	125728	125733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553057
3584	NC_009511	GGC	2	6	125734	125739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553057
3585	NC_009511	TCG	2	6	125765	125770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553057
3586	NC_009511	CGC	3	9	125809	125817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553057
3587	NC_009511	ATC	2	6	125855	125860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553057
3588	NC_009511	CGG	2	6	125862	125867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553057
3589	NC_009511	CGGC	2	8	125880	125887	0 %	0 %	50 %	50 %	148553057
3590	NC_009511	GCC	2	6	125915	125920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553057
3591	NC_009511	CTG	2	6	125992	125997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553057
3592	NC_009511	CGG	2	6	126039	126044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553057
3593	NC_009511	CGG	2	6	126048	126053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553057
3594	NC_009511	GCC	2	6	126074	126079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553057
3595	NC_009511	CTT	2	6	126088	126093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553057
3596	NC_009511	AGCGCG	2	12	126113	126124	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148553057
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3598	NC_009511	GCA	2	6	126330	126335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553058
3599	NC_009511	AGCAG	2	10	126353	126362	40 %	0 %	40 %	20 %	148553058
3600	NC_009511	CGC	2	6	126399	126404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553058
3601	NC_009511	GCAAG	2	10	126422	126431	40 %	0 %	40 %	20 %	148553058
3602	NC_009511	CG	3	6	126475	126480	0 %	0 %	50 %	50 %	148553058
3603	NC_009511	CGGG	2	8	126494	126501	0 %	0 %	75 %	25 %	148553058
3604	NC_009511	GCC	2	6	126553	126558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553058
3605	NC_009511	GCC	2	6	126581	126586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553058
3606	NC_009511	AGC	2	6	126616	126621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553058
3607	NC_009511	CGCC	2	8	126626	126633	0 %	0 %	25 %	75 %	148553058
3608	NC_009511	GCC	2	6	126719	126724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553059
3609	NC_009511	TGT	2	6	126727	126732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148553059
3610	NC_009511	GCG	2	6	126753	126758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553059
3611	NC_009511	CGC	2	6	126764	126769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553059
3612	NC_009511	CGG	2	6	126799	126804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553059
3613	NC_009511	TCT	2	6	126805	126810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553059
3614	NC_009511	CTT	3	9	126836	126844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553059
3615	NC_009511	CGG	2	6	126847	126852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553059
3616	NC_009511	TTG	2	6	126855	126860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148553059
3617	NC_009511	GTC	2	6	126875	126880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553059
3618	NC_009511	CGC	2	6	127929	127934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553060
3619	NC_009511	GCG	2	6	127976	127981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553060
3620	NC_009511	CCG	2	6	128015	128020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553060
3621	NC_009511	CCG	2	6	128042	128047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553060
3622	NC_009511	CG	3	6	128053	128058	0 %	0 %	50 %	50 %	148553060
3623	NC_009511	CAT	2	6	128070	128075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553060
3624	NC_009511	TGC	2	6	128099	128104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553060
3625	NC_009511	CGG	2	6	128133	128138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553060
3626	NC_009511	GCG	2	6	128183	128188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553060
3627	NC_009511	TGA	2	6	128198	128203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553060
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3630	NC_009511	TCGA	2	8	128293	128300	25 %	25 %	25 %	25 %	148553060
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3650	NC_009511	CGA	2	6	128817	128822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553060
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3702	NC_009511	GATC	2	8	130958	130965	25 %	25 %	25 %	25 %	148553063
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3727	NC_009511	CTG	2	6	132022	132027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553064
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3739	NC_009511	TCG	2	6	132503	132508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553064
3740	NC_009511	CCGA	2	8	132566	132573	25 %	0 %	25 %	50 %	148553064
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3742	NC_009511	GAA	2	6	132646	132651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553064
3743	NC_009511	AGA	2	6	132723	132728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553064
3744	NC_009511	CGC	2	6	132836	132841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553065
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3750	NC_009511	TCG	2	6	132952	132957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553065
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3767	NC_009511	GCG	2	6	133445	133450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553065
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3775	NC_009511	CGG	2	6	133637	133642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553065
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3985	NC_009511	GGC	2	6	140810	140815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553070
3986	NC_009511	GCG	2	6	140821	140826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553070
3987	NC_009511	CGG	2	6	140827	140832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553070
3988	NC_009511	CAG	2	6	140840	140845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553070
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3991	NC_009511	ATC	2	6	140964	140969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553070
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