MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT01

Total Repeats: 6274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009507	GGC	2	6	48	53	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550552
2	NC_009507	GCGAT	2	10	76	85	20 %	20 %	40 %	20 %	148550552
3	NC_009507	CCG	2	6	117	122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550552
4	NC_009507	CGC	2	6	134	139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550552
5	NC_009507	GTG	3	9	188	196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550552
6	NC_009507	TC	3	6	287	292	0 %	50 %	0 %	50 %	148550552
7	NC_009507	CAC	2	6	314	319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550552
8	NC_009507	GCA	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550552
9	NC_009507	CGCGA	2	10	965	974	20 %	0 %	40 %	40 %	148550553
10	NC_009507	CCG	2	6	1008	1013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550553
11	NC_009507	GAC	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550553
12	NC_009507	GC	3	6	1137	1142	0 %	0 %	50 %	50 %	148550553
13	NC_009507	GGGC	2	8	1145	1152	0 %	0 %	75 %	25 %	148550553
14	NC_009507	TCCG	2	8	1229	1236	0 %	25 %	25 %	50 %	148550553
15	NC_009507	CGA	2	6	1295	1300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550553
16	NC_009507	CCG	2	6	1372	1377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550553
17	NC_009507	CGC	2	6	1419	1424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550553
18	NC_009507	AGA	2	6	1441	1446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550553
19	NC_009507	CGG	2	6	1509	1514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550554
20	NC_009507	CGA	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550554
21	NC_009507	TTC	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550554
22	NC_009507	GC	4	8	1592	1599	0 %	0 %	50 %	50 %	148550554
23	NC_009507	GGCG	2	8	1600	1607	0 %	0 %	75 %	25 %	148550554
24	NC_009507	CCTGG	2	10	1612	1621	0 %	20 %	40 %	40 %	148550554
25	NC_009507	GC	3	6	1628	1633	0 %	0 %	50 %	50 %	148550554
26	NC_009507	CT	3	6	1642	1647	0 %	50 %	0 %	50 %	148550554
27	NC_009507	AGC	3	9	1722	1730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550554
28	NC_009507	CTGG	2	8	1756	1763	0 %	25 %	50 %	25 %	148550554
29	NC_009507	GCG	2	6	1825	1830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550554
30	NC_009507	CGA	2	6	1855	1860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550554
31	NC_009507	GCG	2	6	1864	1869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550554
32	NC_009507	GCT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550554
33	NC_009507	GAC	2	6	1891	1896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550554
34	NC_009507	CGG	2	6	1899	1904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550554
35	NC_009507	GATTG	2	10	1924	1933	20 %	40 %	40 %	0 %	148550554
36	NC_009507	ATTC	2	8	1941	1948	25 %	50 %	0 %	25 %	148550554
37	NC_009507	CGGCG	2	10	1957	1966	0 %	0 %	60 %	40 %	148550554
38	NC_009507	GGA	2	6	1981	1986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550554
39	NC_009507	GGC	2	6	2033	2038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550554
40	NC_009507	CCA	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550554
41	NC_009507	CG	4	8	2146	2153	0 %	0 %	50 %	50 %	148550554
42	NC_009507	C	6	6	2175	2180	0 %	0 %	0 %	100 %	148550554
43	NC_009507	GC	3	6	2215	2220	0 %	0 %	50 %	50 %	148550554
44	NC_009507	CG	3	6	2264	2269	0 %	0 %	50 %	50 %	148550554
45	NC_009507	CAC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550554
46	NC_009507	CGG	2	6	2296	2301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550554
47	NC_009507	CGA	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550554
48	NC_009507	CAC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550554
49	NC_009507	TGACG	2	10	2377	2386	20 %	20 %	40 %	20 %	148550554
50	NC_009507	GGC	2	6	2416	2421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550554
51	NC_009507	GGC	2	6	2492	2497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550555
52	NC_009507	GC	3	6	2516	2521	0 %	0 %	50 %	50 %	148550555
53	NC_009507	GC	3	6	2528	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	148550555
54	NC_009507	TCGGCG	2	12	2543	2554	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148550555
55	NC_009507	CG	5	10	2560	2569	0 %	0 %	50 %	50 %	148550555
56	NC_009507	GCGG	2	8	2612	2619	0 %	0 %	75 %	25 %	148550555
57	NC_009507	GCC	2	6	2642	2647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550555
58	NC_009507	GC	3	6	2770	2775	0 %	0 %	50 %	50 %	148550555
59	NC_009507	TTC	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550555
60	NC_009507	GC	3	6	2833	2838	0 %	0 %	50 %	50 %	148550555
61	NC_009507	TCG	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550555
62	NC_009507	CGC	2	6	2914	2919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550555
63	NC_009507	GC	3	6	2926	2931	0 %	0 %	50 %	50 %	148550555
64	NC_009507	CGC	2	6	2962	2967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550555
65	NC_009507	GGCAC	2	10	2976	2985	20 %	0 %	40 %	40 %	148550555
66	NC_009507	GC	3	6	3073	3078	0 %	0 %	50 %	50 %	148550556
67	NC_009507	TCG	3	9	3092	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550556
68	NC_009507	GCCC	2	8	3151	3158	0 %	0 %	25 %	75 %	148550556
69	NC_009507	CGC	2	6	3162	3167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550556
70	NC_009507	GCG	2	6	3198	3203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550556
71	NC_009507	GTCG	2	8	3205	3212	0 %	25 %	50 %	25 %	148550556
72	NC_009507	AGA	2	6	3233	3238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550556
73	NC_009507	CGC	2	6	3374	3379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550557
74	NC_009507	TCG	2	6	3444	3449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550557
75	NC_009507	GCA	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550557
76	NC_009507	GCG	2	6	3510	3515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550557
77	NC_009507	TCG	2	6	3529	3534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550557
78	NC_009507	C	6	6	4072	4077	0 %	0 %	0 %	100 %	148550558
79	NC_009507	CGCGTG	2	12	4086	4097	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148550558
80	NC_009507	CGC	2	6	4238	4243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550558
81	NC_009507	TGGGC	2	10	4322	4331	0 %	20 %	60 %	20 %	148550558
82	NC_009507	GC	3	6	4346	4351	0 %	0 %	50 %	50 %	148550558
83	NC_009507	CAC	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550558
84	NC_009507	CTCC	2	8	4409	4416	0 %	25 %	0 %	75 %	148550558
85	NC_009507	CGG	2	6	4436	4441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550558
86	NC_009507	AAG	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550558
87	NC_009507	CG	3	6	4520	4525	0 %	0 %	50 %	50 %	148550558
88	NC_009507	GCA	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550558
89	NC_009507	CGA	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550558
90	NC_009507	GGT	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550558
91	NC_009507	CAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550559
92	NC_009507	GTG	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550559
93	NC_009507	ACC	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550559
94	NC_009507	GCC	4	12	4774	4785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550559
95	NC_009507	TCGACC	2	12	4814	4825	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148550559
96	NC_009507	GCG	2	6	4849	4854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550559
97	NC_009507	C	7	7	4892	4898	0 %	0 %	0 %	100 %	148550559
98	NC_009507	GCC	2	6	4906	4911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550559
99	NC_009507	GCC	2	6	4981	4986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550559
100	NC_009507	GCC	2	6	4990	4995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550559
101	NC_009507	GGC	2	6	5001	5006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550559
102	NC_009507	GAC	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550559
103	NC_009507	CGG	2	6	5114	5119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550559
104	NC_009507	CCGCG	2	10	5129	5138	0 %	0 %	40 %	60 %	148550559
105	NC_009507	CGG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550559
106	NC_009507	GGC	2	6	5274	5279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550559
107	NC_009507	TTGC	2	8	5376	5383	0 %	50 %	25 %	25 %	148550560
108	NC_009507	GGC	2	6	5438	5443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550560
109	NC_009507	CCGC	2	8	5452	5459	0 %	0 %	25 %	75 %	148550560
110	NC_009507	GCA	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550560
111	NC_009507	AGC	3	9	5490	5498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550560
112	NC_009507	AAG	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550560
113	NC_009507	CCGC	2	8	5578	5585	0 %	0 %	25 %	75 %	148550560
114	NC_009507	ACC	2	6	6254	6259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550561
115	NC_009507	CT	3	6	6297	6302	0 %	50 %	0 %	50 %	148550561
116	NC_009507	GAG	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550561
117	NC_009507	TCA	2	6	6342	6347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550561
118	NC_009507	T	6	6	6408	6413	0 %	100 %	0 %	0 %	148550561
119	NC_009507	TTG	2	6	6483	6488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550561
120	NC_009507	GGC	2	6	6528	6533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550561
121	NC_009507	AAT	2	6	6560	6565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550561
122	NC_009507	CGG	2	6	6634	6639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550561
123	NC_009507	CGG	2	6	6648	6653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550561
124	NC_009507	TCATCG	2	12	6657	6668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148550561
125	NC_009507	TTC	3	9	6672	6680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550561
126	NC_009507	GC	4	8	6702	6709	0 %	0 %	50 %	50 %	148550561
127	NC_009507	GC	3	6	6723	6728	0 %	0 %	50 %	50 %	148550561
128	NC_009507	TGA	2	6	6739	6744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550561
129	NC_009507	TGA	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550561
130	NC_009507	CGCC	2	8	6802	6809	0 %	0 %	25 %	75 %	148550561
131	NC_009507	GTC	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550561
132	NC_009507	TCA	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550561
133	NC_009507	CG	3	6	6883	6888	0 %	0 %	50 %	50 %	148550561
134	NC_009507	GCA	2	6	6913	6918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550561
135	NC_009507	TCG	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550561
136	NC_009507	GGC	2	6	7036	7041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550561
137	NC_009507	GTG	2	6	7068	7073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550561
138	NC_009507	AATC	2	8	7265	7272	50 %	25 %	0 %	25 %	148550562
139	NC_009507	AGGTCG	2	12	7282	7293	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148550562
140	NC_009507	CCGCC	2	10	7362	7371	0 %	0 %	20 %	80 %	148550562
141	NC_009507	AGG	2	6	7435	7440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550562
142	NC_009507	TGG	2	6	7481	7486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550562
143	NC_009507	CGC	2	6	7493	7498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550562
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145	NC_009507	GAT	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550563
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147	NC_009507	ATC	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550563
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150	NC_009507	ATCG	2	8	7784	7791	25 %	25 %	25 %	25 %	148550563
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157	NC_009507	GC	3	6	8010	8015	0 %	0 %	50 %	50 %	148550563
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166	NC_009507	GGC	2	6	8261	8266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550563
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176	NC_009507	GC	4	8	8764	8771	0 %	0 %	50 %	50 %	148550563
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250	NC_009507	CAT	2	6	13176	13181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550566
251	NC_009507	CGTGT	2	10	13285	13294	0 %	40 %	40 %	20 %	148550566
252	NC_009507	GACCAA	2	12	13305	13316	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148550566
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254	NC_009507	GTC	2	6	13396	13401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550566
255	NC_009507	CAGCTG	2	12	13414	13425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148550566
256	NC_009507	CCGC	2	8	13496	13503	0 %	0 %	25 %	75 %	148550566
257	NC_009507	CGG	2	6	13509	13514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550566
258	NC_009507	TGG	2	6	13538	13543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550566
259	NC_009507	GC	3	6	13564	13569	0 %	0 %	50 %	50 %	148550566
260	NC_009507	CAG	2	6	13624	13629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550566
261	NC_009507	GACGT	2	10	13642	13651	20 %	20 %	40 %	20 %	148550566
262	NC_009507	CCA	2	6	13658	13663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550566
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393	NC_009507	CCG	2	6	19050	19055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550569
394	NC_009507	CAT	2	6	19067	19072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550569
395	NC_009507	CCG	2	6	19101	19106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550569
396	NC_009507	CATGA	2	10	19156	19165	40 %	20 %	20 %	20 %	148550569
397	NC_009507	GGCG	2	8	19200	19207	0 %	0 %	75 %	25 %	148550570
398	NC_009507	CGA	2	6	19212	19217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550570
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400	NC_009507	CAGCGC	2	12	19237	19248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148550570
401	NC_009507	GACC	2	8	19266	19273	25 %	0 %	25 %	50 %	148550570
402	NC_009507	GC	3	6	19278	19283	0 %	0 %	50 %	50 %	148550570
403	NC_009507	TGC	2	6	19302	19307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550570
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421	NC_009507	GC	3	6	20014	20019	0 %	0 %	50 %	50 %	148550571
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430	NC_009507	CGA	2	6	20400	20405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550571
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