MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_009482	CGC	2	6	2181720	2181725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243593
48002	NC_009482	GC	3	6	2181871	2181876	0 %	0 %	50 %	50 %	148243593
48003	NC_009482	GGC	2	6	2181886	2181891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243593
48004	NC_009482	CGC	2	6	2181896	2181901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243593
48005	NC_009482	CCAGCA	2	12	2181906	2181917	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148243593
48006	NC_009482	GGCCAA	2	12	2181946	2181957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243593
48007	NC_009482	GCA	2	6	2181996	2182001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243593
48008	NC_009482	CAG	2	6	2182030	2182035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243593
48009	NC_009482	CAA	2	6	2182042	2182047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243593
48010	NC_009482	AGA	2	6	2182069	2182074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243593
48011	NC_009482	CAG	2	6	2182090	2182095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243594
48012	NC_009482	TGC	2	6	2182101	2182106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243594
48013	NC_009482	TGG	2	6	2182143	2182148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243594
48014	NC_009482	CCA	2	6	2182187	2182192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243594
48015	NC_009482	AGC	2	6	2182196	2182201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243594
48016	NC_009482	TCA	2	6	2182281	2182286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243594
48017	NC_009482	CCG	2	6	2182296	2182301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243594
48018	NC_009482	GCC	2	6	2182304	2182309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243594
48019	NC_009482	AC	3	6	2182362	2182367	50 %	0 %	0 %	50 %	148243594
48020	NC_009482	GCCA	2	8	2182387	2182394	25 %	0 %	25 %	50 %	148243594
48021	NC_009482	ACC	3	9	2182405	2182413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243594
48022	NC_009482	GAG	2	6	2182440	2182445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243594
48023	NC_009482	GCT	2	6	2182449	2182454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243594
48024	NC_009482	GCA	2	6	2182470	2182475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243594
48025	NC_009482	CGG	2	6	2182485	2182490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243594
48026	NC_009482	CAG	2	6	2182495	2182500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243594
48027	NC_009482	CAC	2	6	2182501	2182506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243594
48028	NC_009482	C	6	6	2182550	2182555	0 %	0 %	0 %	100 %	148243594
48029	NC_009482	A	6	6	2182556	2182561	100 %	0 %	0 %	0 %	148243594
48030	NC_009482	GCA	2	6	2182581	2182586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243594
48031	NC_009482	CCA	3	9	2182650	2182658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243594
48032	NC_009482	AGC	2	6	2182664	2182669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243594
48033	NC_009482	GGCC	2	8	2182701	2182708	0 %	0 %	50 %	50 %	148243594
48034	NC_009482	CCA	2	6	2182770	2182775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243594
48035	NC_009482	ACG	2	6	2182796	2182801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243594
48036	NC_009482	AGCTG	2	10	2182858	2182867	20 %	20 %	40 %	20 %	148243595
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48038	NC_009482	GCT	2	6	2182968	2182973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243595
48039	NC_009482	AGGAC	2	10	2182991	2183000	40 %	0 %	40 %	20 %	148243595
48040	NC_009482	CAG	2	6	2183037	2183042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243595
48041	NC_009482	CAC	2	6	2183103	2183108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243595
48042	NC_009482	GCG	2	6	2183203	2183208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243595
48043	NC_009482	CTG	2	6	2183217	2183222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243595
48044	NC_009482	CGC	2	6	2183231	2183236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243595
48045	NC_009482	CAG	2	6	2183274	2183279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243595
48046	NC_009482	GCA	2	6	2183337	2183342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243596
48047	NC_009482	GCA	2	6	2183351	2183356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243596
48048	NC_009482	GTT	2	6	2183367	2183372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243596
48049	NC_009482	ATCA	2	8	2183500	2183507	50 %	25 %	0 %	25 %	148243596
48050	NC_009482	CAA	2	6	2183536	2183541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243596
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48053	NC_009482	CAG	2	6	2183593	2183598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243597
48054	NC_009482	CGAT	2	8	2183604	2183611	25 %	25 %	25 %	25 %	148243597
48055	NC_009482	GCA	2	6	2183622	2183627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243597
48056	NC_009482	GCA	2	6	2183653	2183658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243597
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48058	NC_009482	GCA	2	6	2183721	2183726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243597
48059	NC_009482	GAG	2	6	2183732	2183737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243597
48060	NC_009482	GCA	2	6	2183788	2183793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243597
48061	NC_009482	CTGGTG	2	12	2183879	2183890	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148243597
48062	NC_009482	CGC	2	6	2183906	2183911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243597
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48064	NC_009482	GCT	2	6	2183925	2183930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243597
48065	NC_009482	GCT	2	6	2183938	2183943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243597
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48069	NC_009482	GCA	2	6	2184053	2184058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243598
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48071	NC_009482	CAG	2	6	2184117	2184122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243598
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48075	NC_009482	CCGG	3	12	2184227	2184238	0 %	0 %	50 %	50 %	148243598
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48100	NC_009482	CCTC	2	8	2185319	2185326	0 %	25 %	0 %	75 %	148243599
48101	NC_009482	CAG	2	6	2185333	2185338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243599
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48116	NC_009482	GCG	2	6	2185903	2185908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243600
48117	NC_009482	CAG	2	6	2186072	2186077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243600
48118	NC_009482	GCT	2	6	2186080	2186085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243600
48119	NC_009482	GGA	2	6	2186150	2186155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243600
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48138	NC_009482	CTG	2	6	2186857	2186862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243601
48139	NC_009482	GCT	2	6	2186874	2186879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243601
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48147	NC_009482	AGC	2	6	2187170	2187175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243601
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48218	NC_009482	CAG	2	6	2190160	2190165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243603
48219	NC_009482	ATG	2	6	2190196	2190201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243603
48220	NC_009482	GCC	2	6	2190202	2190207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243603
48221	NC_009482	TGG	2	6	2190218	2190223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243603
48222	NC_009482	AAG	2	6	2190278	2190283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243603
48223	NC_009482	TGG	2	6	2190358	2190363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243603
48224	NC_009482	CG	3	6	2190380	2190385	0 %	0 %	50 %	50 %	148243603
48225	NC_009482	CACC	2	8	2190471	2190478	25 %	0 %	0 %	75 %	148243603
48226	NC_009482	GAA	2	6	2190544	2190549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243603
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48228	NC_009482	A	6	6	2190731	2190736	100 %	0 %	0 %	0 %	148243603
48229	NC_009482	GTC	2	6	2190794	2190799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243603
48230	NC_009482	AAGCCA	2	12	2190836	2190847	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148243603
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48232	NC_009482	GCC	2	6	2190902	2190907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243604
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48329	NC_009482	CGC	2	6	2195075	2195080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243607
48330	NC_009482	ATCGAC	2	12	2195085	2195096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148243607
48331	NC_009482	GC	3	6	2195271	2195276	0 %	0 %	50 %	50 %	148243607
48332	NC_009482	C	7	7	2195288	2195294	0 %	0 %	0 %	100 %	148243607
48333	NC_009482	GAG	2	6	2195307	2195312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243607
48334	NC_009482	CTA	2	6	2195330	2195335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243607
48335	NC_009482	GCC	2	6	2195349	2195354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243607
48336	NC_009482	GCTC	2	8	2195380	2195387	0 %	25 %	25 %	50 %	148243607
48337	NC_009482	GC	3	6	2195403	2195408	0 %	0 %	50 %	50 %	148243607
48338	NC_009482	ACA	2	6	2195416	2195421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243607
48339	NC_009482	CCA	2	6	2195434	2195439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243607
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48341	NC_009482	CGC	2	6	2195561	2195566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243607
48342	NC_009482	GAA	2	6	2195664	2195669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243607
48343	NC_009482	GCT	2	6	2195675	2195680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243607
48344	NC_009482	TGA	2	6	2195725	2195730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243608
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48346	NC_009482	GTA	2	6	2195771	2195776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243608
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48462	NC_009482	CCA	2	6	2200642	2200647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243612
48463	NC_009482	CTG	2	6	2200682	2200687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48464	NC_009482	AAC	2	6	2200760	2200765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243612
48465	NC_009482	GGT	2	6	2200845	2200850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243612
48466	NC_009482	GATC	2	8	2201026	2201033	25 %	25 %	25 %	25 %	148243612
48467	NC_009482	CCG	2	6	2201037	2201042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243612
48468	NC_009482	GTC	2	6	2201051	2201056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48469	NC_009482	AGCAAC	2	12	2201064	2201075	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148243612
48470	NC_009482	TCG	2	6	2201089	2201094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48471	NC_009482	CAC	2	6	2201105	2201110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243612
48472	NC_009482	GGC	2	6	2201144	2201149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243612
48473	NC_009482	AGC	2	6	2201193	2201198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48474	NC_009482	GCT	2	6	2201250	2201255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48475	NC_009482	C	7	7	2201263	2201269	0 %	0 %	0 %	100 %	148243612
48476	NC_009482	AGC	2	6	2201354	2201359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48477	NC_009482	GCTG	2	8	2201403	2201410	0 %	25 %	50 %	25 %	148243612
48478	NC_009482	GCA	2	6	2201425	2201430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48479	NC_009482	GCT	2	6	2201464	2201469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48480	NC_009482	GCC	2	6	2201558	2201563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243612
48481	NC_009482	C	6	6	2201580	2201585	0 %	0 %	0 %	100 %	148243612
48482	NC_009482	GGC	2	6	2201590	2201595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243612
48483	NC_009482	GCT	2	6	2201614	2201619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48484	NC_009482	CAG	2	6	2201620	2201625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48485	NC_009482	GCT	2	6	2201644	2201649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48486	NC_009482	GTT	2	6	2201669	2201674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243612
48487	NC_009482	GGC	2	6	2201710	2201715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243612
48488	NC_009482	CAGC	2	8	2201716	2201723	25 %	0 %	25 %	50 %	148243612
48489	NC_009482	GCG	2	6	2201735	2201740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243612
48490	NC_009482	CTG	2	6	2201771	2201776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48491	NC_009482	CCGGC	2	10	2201788	2201797	0 %	0 %	40 %	60 %	148243612
48492	NC_009482	CAC	2	6	2201870	2201875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243612
48493	NC_009482	CGT	2	6	2201881	2201886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243612
48494	NC_009482	GCG	2	6	2201906	2201911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243612
48495	NC_009482	CTG	2	6	2202025	2202030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243613
48496	NC_009482	CGC	2	6	2202039	2202044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243613
48497	NC_009482	TTC	2	6	2202056	2202061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243613
48498	NC_009482	TC	3	6	2202080	2202085	0 %	50 %	0 %	50 %	148243613
48499	NC_009482	CCG	2	6	2202144	2202149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243613
48500	NC_009482	CTG	2	6	2202295	2202300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243613

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