MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_009482	CGC	2	6	2159173	2159178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243570
47502	NC_009482	CAG	2	6	2159231	2159236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243570
47503	NC_009482	TCACAC	2	12	2159259	2159270	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148243570
47504	NC_009482	AG	3	6	2159308	2159313	50 %	0 %	50 %	0 %	148243570
47505	NC_009482	ATCA	2	8	2159342	2159349	50 %	25 %	0 %	25 %	148243570
47506	NC_009482	TGAGC	2	10	2159385	2159394	20 %	20 %	40 %	20 %	148243570
47507	NC_009482	CAGC	2	8	2159397	2159404	25 %	0 %	25 %	50 %	148243571
47508	NC_009482	GCT	2	6	2159418	2159423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47509	NC_009482	GCT	2	6	2159439	2159444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47510	NC_009482	CGG	2	6	2159510	2159515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243571
47511	NC_009482	TCC	2	6	2159516	2159521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243571
47512	NC_009482	CTG	2	6	2159539	2159544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47513	NC_009482	AGCTC	2	10	2159610	2159619	20 %	20 %	20 %	40 %	148243571
47514	NC_009482	CAG	2	6	2159635	2159640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47515	NC_009482	TGA	2	6	2159751	2159756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243571
47516	NC_009482	CGT	2	6	2159797	2159802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47517	NC_009482	GTC	2	6	2159827	2159832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47518	NC_009482	GT	3	6	2159835	2159840	0 %	50 %	50 %	0 %	148243571
47519	NC_009482	AGGCTG	2	12	2159870	2159881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243571
47520	NC_009482	CTG	3	9	2159879	2159887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47521	NC_009482	CTG	3	9	2159890	2159898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47522	NC_009482	GCCC	2	8	2159916	2159923	0 %	0 %	25 %	75 %	148243571
47523	NC_009482	AGCTGC	2	12	2159939	2159950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47524	NC_009482	CTG	2	6	2160004	2160009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47525	NC_009482	GCA	2	6	2160050	2160055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47526	NC_009482	GGC	2	6	2160073	2160078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243571
47527	NC_009482	CGC	2	6	2160177	2160182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243571
47528	NC_009482	CAC	2	6	2160211	2160216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243571
47529	NC_009482	AGC	3	9	2160236	2160244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243571
47530	NC_009482	CAA	2	6	2160253	2160258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243571
47531	NC_009482	CCA	2	6	2160313	2160318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243571
47532	NC_009482	AGCC	2	8	2160371	2160378	25 %	0 %	25 %	50 %	148243571
47533	NC_009482	GAA	2	6	2160381	2160386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243571
47534	NC_009482	GCG	2	6	2160447	2160452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243572
47535	NC_009482	CCT	2	6	2160581	2160586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243572
47536	NC_009482	CAA	2	6	2160603	2160608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243572
47537	NC_009482	GCA	2	6	2160638	2160643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243572
47538	NC_009482	GAG	2	6	2160699	2160704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243572
47539	NC_009482	GCT	2	6	2160749	2160754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243572
47540	NC_009482	CCCG	2	8	2160759	2160766	0 %	0 %	25 %	75 %	148243572
47541	NC_009482	CAC	2	6	2160807	2160812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243572
47542	NC_009482	GGACCC	2	12	2160946	2160957	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148243572
47543	NC_009482	GCT	2	6	2160998	2161003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243572
47544	NC_009482	AG	3	6	2161062	2161067	50 %	0 %	50 %	0 %	148243572
47545	NC_009482	CAA	2	6	2161200	2161205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243573
47546	NC_009482	ATCG	2	8	2161221	2161228	25 %	25 %	25 %	25 %	148243573
47547	NC_009482	GAA	2	6	2161281	2161286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243573
47548	NC_009482	CAG	2	6	2161325	2161330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243573
47549	NC_009482	CCA	2	6	2161331	2161336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243573
47550	NC_009482	CAA	2	6	2161346	2161351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243573
47551	NC_009482	GAT	2	6	2161392	2161397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243573
47552	NC_009482	GC	3	6	2161413	2161418	0 %	0 %	50 %	50 %	148243573
47553	NC_009482	CAC	2	6	2161419	2161424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243573
47554	NC_009482	AGGGTG	2	12	2161456	2161467	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	148243573
47555	NC_009482	TCAA	2	8	2161471	2161478	50 %	25 %	0 %	25 %	148243573
47556	NC_009482	GAAC	2	8	2161487	2161494	50 %	0 %	25 %	25 %	148243573
47557	NC_009482	CATC	2	8	2161502	2161509	25 %	25 %	0 %	50 %	148243573
47558	NC_009482	GAT	2	6	2161584	2161589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243573
47559	NC_009482	CGC	2	6	2161605	2161610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243573
47560	NC_009482	GCA	2	6	2161625	2161630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243573
47561	NC_009482	CA	3	6	2161646	2161651	50 %	0 %	0 %	50 %	148243573
47562	NC_009482	AC	3	6	2161670	2161675	50 %	0 %	0 %	50 %	148243573
47563	NC_009482	AAG	2	6	2161714	2161719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243573
47564	NC_009482	CCGG	2	8	2161734	2161741	0 %	0 %	50 %	50 %	148243573
47565	NC_009482	CCG	2	6	2161805	2161810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243573
47566	NC_009482	CCA	2	6	2161835	2161840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243573
47567	NC_009482	CAG	2	6	2161881	2161886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243573
47568	NC_009482	CCA	2	6	2161985	2161990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243573
47569	NC_009482	TGA	2	6	2162011	2162016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243574
47570	NC_009482	AGG	2	6	2162017	2162022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243574
47571	NC_009482	TCT	2	6	2162089	2162094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243574
47572	NC_009482	GGC	2	6	2162096	2162101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243574
47573	NC_009482	GCCATC	2	12	2162120	2162131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243574
47574	NC_009482	GAA	2	6	2162162	2162167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243574
47575	NC_009482	GGT	2	6	2162168	2162173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243574
47576	NC_009482	CCA	2	6	2162276	2162281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243574
47577	NC_009482	TCT	2	6	2162293	2162298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243574
47578	NC_009482	GATCA	2	10	2162321	2162330	40 %	20 %	20 %	20 %	148243574
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47582	NC_009482	TGA	2	6	2162500	2162505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243574
47583	NC_009482	TCA	2	6	2162511	2162516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243574
47584	NC_009482	CAG	2	6	2162549	2162554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243574
47585	NC_009482	ATC	2	6	2162558	2162563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243574
47586	NC_009482	AAC	3	9	2162672	2162680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243574
47587	NC_009482	CGC	2	6	2162683	2162688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243574
47588	NC_009482	TC	3	6	2162692	2162697	0 %	50 %	0 %	50 %	148243574
47589	NC_009482	AAG	2	6	2162703	2162708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243574
47590	NC_009482	CGG	2	6	2162752	2162757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243574
47591	NC_009482	CCA	2	6	2162858	2162863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243574
47592	NC_009482	ACC	2	6	2162943	2162948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243574
47593	NC_009482	GTT	2	6	2162977	2162982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243574
47594	NC_009482	GCT	2	6	2163020	2163025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243575
47595	NC_009482	GCG	2	6	2163160	2163165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243575
47596	NC_009482	GCA	2	6	2163195	2163200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243575
47597	NC_009482	TGA	2	6	2163213	2163218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243575
47598	NC_009482	CAG	2	6	2163324	2163329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243575
47599	NC_009482	CAG	2	6	2163361	2163366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243575
47600	NC_009482	CAA	2	6	2163397	2163402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243575
47601	NC_009482	GCC	2	6	2163409	2163414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243575
47602	NC_009482	GGC	2	6	2163424	2163429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243575
47603	NC_009482	GGT	2	6	2163451	2163456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243575
47604	NC_009482	CAC	2	6	2163463	2163468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243575
47605	NC_009482	GGT	2	6	2163508	2163513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243575
47606	NC_009482	GCCC	2	8	2163589	2163596	0 %	0 %	25 %	75 %	148243575
47607	NC_009482	TCA	2	6	2163606	2163611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243575
47608	NC_009482	GCC	2	6	2163677	2163682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243575
47609	NC_009482	TCT	2	6	2163704	2163709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243575
47610	NC_009482	TGC	2	6	2163819	2163824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243576
47611	NC_009482	GCA	2	6	2163871	2163876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243576
47612	NC_009482	GC	3	6	2163969	2163974	0 %	0 %	50 %	50 %	148243576
47613	NC_009482	GCC	2	6	2163998	2164003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243576
47614	NC_009482	GCT	2	6	2164020	2164025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243576
47615	NC_009482	ATGG	2	8	2164060	2164067	25 %	25 %	50 %	0 %	148243576
47616	NC_009482	CCA	2	6	2164071	2164076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243576
47617	NC_009482	CTC	2	6	2164096	2164101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243576
47618	NC_009482	CATG	2	8	2164149	2164156	25 %	25 %	25 %	25 %	148243576
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47620	NC_009482	CG	3	6	2164275	2164280	0 %	0 %	50 %	50 %	148243577
47621	NC_009482	ATGTC	2	10	2164291	2164300	20 %	40 %	20 %	20 %	148243577
47622	NC_009482	AGGG	2	8	2164312	2164319	25 %	0 %	75 %	0 %	148243577
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47626	NC_009482	GCGG	2	8	2164514	2164521	0 %	0 %	75 %	25 %	148243577
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47628	NC_009482	GATC	2	8	2164708	2164715	25 %	25 %	25 %	25 %	148243577
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47646	NC_009482	CG	3	6	2165863	2165868	0 %	0 %	50 %	50 %	148243578
47647	NC_009482	GGCC	2	8	2165882	2165889	0 %	0 %	50 %	50 %	148243578
47648	NC_009482	TTC	2	6	2165899	2165904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243578
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47702	NC_009482	GAAA	2	8	2168879	2168886	75 %	0 %	25 %	0 %	148243581
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47710	NC_009482	TGGCC	2	10	2169317	2169326	0 %	20 %	40 %	40 %	148243582
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47716	NC_009482	ATC	2	6	2169639	2169644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243582
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47718	NC_009482	TGGT	2	8	2169735	2169742	0 %	50 %	50 %	0 %	148243582
47719	NC_009482	CTG	2	6	2169792	2169797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243582
47720	NC_009482	CTG	2	6	2169800	2169805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243582
47721	NC_009482	CCTG	2	8	2169929	2169936	0 %	25 %	25 %	50 %	148243582
47722	NC_009482	GGC	2	6	2169957	2169962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243582
47723	NC_009482	CACC	2	8	2169992	2169999	25 %	0 %	0 %	75 %	148243582
47724	NC_009482	GCTG	2	8	2170055	2170062	0 %	25 %	50 %	25 %	148243582
47725	NC_009482	TGT	2	6	2170094	2170099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243583
47726	NC_009482	CTG	2	6	2170105	2170110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243583
47727	NC_009482	GGAACT	2	12	2170130	2170141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148243583
47728	NC_009482	GAA	2	6	2170185	2170190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243583
47729	NC_009482	GCA	2	6	2170194	2170199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243583
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47731	NC_009482	CAA	2	6	2170299	2170304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243583
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47734	NC_009482	TGC	2	6	2170414	2170419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243583
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47962	NC_009482	TGC	2	6	2180299	2180304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243593
47963	NC_009482	GCC	2	6	2180345	2180350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243593
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