MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_009482	GCA	2	6	2136953	2136958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243544
47002	NC_009482	TCACC	2	10	2137005	2137014	20 %	20 %	0 %	60 %	148243544
47003	NC_009482	CTG	2	6	2137060	2137065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243544
47004	NC_009482	CTG	2	6	2137071	2137076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243544
47005	NC_009482	GGC	2	6	2137081	2137086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243544
47006	NC_009482	GC	3	6	2137147	2137152	0 %	0 %	50 %	50 %	148243544
47007	NC_009482	CGC	2	6	2137180	2137185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243544
47008	NC_009482	GAA	2	6	2137303	2137308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243544
47009	NC_009482	CTG	2	6	2137330	2137335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243544
47010	NC_009482	TTGAG	2	10	2137342	2137351	20 %	40 %	40 %	0 %	148243544
47011	NC_009482	AGC	2	6	2137377	2137382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47012	NC_009482	CTG	2	6	2137460	2137465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47013	NC_009482	GCG	2	6	2137473	2137478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243545
47014	NC_009482	AGC	2	6	2137494	2137499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47015	NC_009482	ACC	2	6	2137546	2137551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243545
47016	NC_009482	CAG	2	6	2137559	2137564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47017	NC_009482	GGC	2	6	2137646	2137651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243545
47018	NC_009482	CCT	2	6	2137664	2137669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243545
47019	NC_009482	GCAA	2	8	2137672	2137679	50 %	0 %	25 %	25 %	148243545
47020	NC_009482	GCT	2	6	2137686	2137691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47021	NC_009482	CCA	2	6	2137708	2137713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243545
47022	NC_009482	CAA	2	6	2137730	2137735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243545
47023	NC_009482	GTG	2	6	2137736	2137741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243545
47024	NC_009482	CGA	2	6	2137768	2137773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47025	NC_009482	AGCC	2	8	2137831	2137838	25 %	0 %	25 %	50 %	148243545
47026	NC_009482	TGC	3	9	2137857	2137865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47027	NC_009482	GCA	2	6	2137866	2137871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47028	NC_009482	TGC	2	6	2137886	2137891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47029	NC_009482	GCA	2	6	2137893	2137898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47030	NC_009482	CTG	2	6	2137907	2137912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47031	NC_009482	GGGC	2	8	2137921	2137928	0 %	0 %	75 %	25 %	148243545
47032	NC_009482	CGC	3	9	2137938	2137946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243545
47033	NC_009482	AGC	2	6	2137949	2137954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47034	NC_009482	AAG	2	6	2138007	2138012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243545
47035	NC_009482	CT	3	6	2138026	2138031	0 %	50 %	0 %	50 %	148243545
47036	NC_009482	GCT	3	9	2138050	2138058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243545
47037	NC_009482	GCC	2	6	2138073	2138078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243545
47038	NC_009482	GCT	2	6	2138277	2138282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243546
47039	NC_009482	GAC	2	6	2138297	2138302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243546
47040	NC_009482	CTC	2	6	2138391	2138396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243546
47041	NC_009482	TGG	2	6	2138445	2138450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243546
47042	NC_009482	TCG	2	6	2138472	2138477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243546
47043	NC_009482	TAAC	2	8	2138506	2138513	50 %	25 %	0 %	25 %	148243546
47044	NC_009482	TA	3	6	2138795	2138800	50 %	50 %	0 %	0 %	148243547
47045	NC_009482	ACA	2	6	2138893	2138898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243547
47046	NC_009482	GCC	2	6	2139125	2139130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243547
47047	NC_009482	TGG	2	6	2139172	2139177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243547
47048	NC_009482	CAG	2	6	2139211	2139216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243547
47049	NC_009482	AAG	2	6	2139245	2139250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243547
47050	NC_009482	CTT	2	6	2139256	2139261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243547
47051	NC_009482	ACC	2	6	2139269	2139274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243547
47052	NC_009482	AGC	2	6	2139296	2139301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243547
47053	NC_009482	CAAC	2	8	2139507	2139514	50 %	0 %	0 %	50 %	148243547
47054	NC_009482	CAA	2	6	2139625	2139630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243547
47055	NC_009482	ACA	2	6	2139753	2139758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243547
47056	NC_009482	CCT	2	6	2139952	2139957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243547
47057	NC_009482	TGC	2	6	2139996	2140001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243547
47058	NC_009482	ATCA	2	8	2140039	2140046	50 %	25 %	0 %	25 %	148243547
47059	NC_009482	CTT	2	6	2140185	2140190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243548
47060	NC_009482	TGCC	2	8	2140220	2140227	0 %	25 %	25 %	50 %	148243548
47061	NC_009482	TTC	2	6	2140285	2140290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243548
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47063	NC_009482	AGAT	2	8	2140448	2140455	50 %	25 %	25 %	0 %	148243548
47064	NC_009482	AGA	2	6	2140499	2140504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243548
47065	NC_009482	TAC	2	6	2140551	2140556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243548
47066	NC_009482	GCA	2	6	2140763	2140768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243548
47067	NC_009482	TCT	2	6	2140871	2140876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243548
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47070	NC_009482	CTGA	2	8	2141193	2141200	25 %	25 %	25 %	25 %	148243549
47071	NC_009482	GGT	2	6	2141205	2141210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243549
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47073	NC_009482	GTA	2	6	2141247	2141252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243549
47074	NC_009482	TGC	2	6	2141281	2141286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243549
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47077	NC_009482	ATG	2	6	2141320	2141325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243549
47078	NC_009482	CGC	2	6	2141326	2141331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243549
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47082	NC_009482	AAG	2	6	2141479	2141484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243549
47083	NC_009482	C	7	7	2141544	2141550	0 %	0 %	0 %	100 %	148243549
47084	NC_009482	CAG	2	6	2141571	2141576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243549
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47086	NC_009482	GGC	2	6	2141656	2141661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243549
47087	NC_009482	AAT	2	6	2141721	2141726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243549
47088	NC_009482	GGT	2	6	2141739	2141744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243549
47089	NC_009482	AC	3	6	2141772	2141777	50 %	0 %	0 %	50 %	148243549
47090	NC_009482	GTA	2	6	2141832	2141837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243549
47091	NC_009482	TCC	2	6	2141877	2141882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243550
47092	NC_009482	CTG	2	6	2141918	2141923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243550
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47094	NC_009482	GCA	2	6	2141965	2141970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243550
47095	NC_009482	TCA	2	6	2142081	2142086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243550
47096	NC_009482	CAGCC	2	10	2142089	2142098	20 %	0 %	20 %	60 %	148243550
47097	NC_009482	CCA	2	6	2142109	2142114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243550
47098	NC_009482	GCA	2	6	2142115	2142120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243550
47099	NC_009482	CCA	2	6	2142136	2142141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243550
47100	NC_009482	TGC	2	6	2142234	2142239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243550
47101	NC_009482	GCCG	2	8	2142265	2142272	0 %	0 %	50 %	50 %	148243550
47102	NC_009482	GCT	2	6	2142289	2142294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243550
47103	NC_009482	CACC	2	8	2142406	2142413	25 %	0 %	0 %	75 %	148243550
47104	NC_009482	ACC	2	6	2142432	2142437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243550
47105	NC_009482	AAG	2	6	2142477	2142482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243550
47106	NC_009482	TGAGAT	2	12	2142541	2142552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243550
47107	NC_009482	AG	3	6	2142604	2142609	50 %	0 %	50 %	0 %	148243550
47108	NC_009482	GTC	2	6	2142612	2142617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243550
47109	NC_009482	CCT	2	6	2142627	2142632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243551
47110	NC_009482	AACC	2	8	2142722	2142729	50 %	0 %	0 %	50 %	148243551
47111	NC_009482	GAC	2	6	2142754	2142759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243551
47112	NC_009482	CAGC	2	8	2142787	2142794	25 %	0 %	25 %	50 %	148243551
47113	NC_009482	AGGCC	2	10	2142799	2142808	20 %	0 %	40 %	40 %	148243551
47114	NC_009482	GCC	2	6	2142877	2142882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243551
47115	NC_009482	GC	3	6	2142966	2142971	0 %	0 %	50 %	50 %	148243551
47116	NC_009482	ACC	2	6	2142988	2142993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243551
47117	NC_009482	TCA	2	6	2143061	2143066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243551
47118	NC_009482	CAC	2	6	2143102	2143107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243551
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47131	NC_009482	GCA	2	6	2143653	2143658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243551
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47345	NC_009482	GCT	2	6	2152058	2152063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243562
47346	NC_009482	G	6	6	2152064	2152069	0 %	0 %	100 %	0 %	148243562
47347	NC_009482	CCA	2	6	2152099	2152104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243562
47348	NC_009482	TGC	2	6	2152138	2152143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243562
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47350	NC_009482	CAC	2	6	2152268	2152273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243562
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47352	NC_009482	CGAT	2	8	2152282	2152289	25 %	25 %	25 %	25 %	148243562
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47357	NC_009482	CAG	2	6	2152484	2152489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243562
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47402	NC_009482	TGA	2	6	2154578	2154583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243564
47403	NC_009482	TGC	2	6	2154598	2154603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243564
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47415	NC_009482	AGC	2	6	2155147	2155152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243564
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47422	NC_009482	TGAT	2	8	2155545	2155552	25 %	50 %	25 %	0 %	148243565
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47429	NC_009482	CTG	3	9	2155943	2155951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243565
47430	NC_009482	GGGC	2	8	2155969	2155976	0 %	0 %	75 %	25 %	148243565
47431	NC_009482	CTG	2	6	2156003	2156008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243565
47432	NC_009482	CT	3	6	2156011	2156016	0 %	50 %	0 %	50 %	148243565
47433	NC_009482	GC	3	6	2156066	2156071	0 %	0 %	50 %	50 %	148243565
47434	NC_009482	ATC	2	6	2156135	2156140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243565
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47436	NC_009482	GAC	2	6	2156227	2156232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243565
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47438	NC_009482	ATC	2	6	2156280	2156285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243565
47439	NC_009482	GCA	2	6	2156320	2156325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243565
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47441	NC_009482	ACCG	2	8	2156554	2156561	25 %	0 %	25 %	50 %	148243566
47442	NC_009482	CAC	2	6	2156592	2156597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243566
47443	NC_009482	GCC	2	6	2156601	2156606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243566
47444	NC_009482	CTG	2	6	2156608	2156613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243566
47445	NC_009482	GGA	2	6	2156625	2156630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243566
47446	NC_009482	ACC	2	6	2156634	2156639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243566
47447	NC_009482	CTGC	2	8	2156772	2156779	0 %	25 %	25 %	50 %	148243566
47448	NC_009482	GCA	2	6	2156787	2156792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243566
47449	NC_009482	ATC	2	6	2156803	2156808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243566
47450	NC_009482	GGCC	2	8	2156843	2156850	0 %	0 %	50 %	50 %	148243566
47451	NC_009482	GGT	2	6	2156904	2156909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243566
47452	NC_009482	GAT	2	6	2156910	2156915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243566
47453	NC_009482	TGC	2	6	2156920	2156925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243566
47454	NC_009482	TGA	2	6	2157072	2157077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243566
47455	NC_009482	TCC	2	6	2157100	2157105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243566
47456	NC_009482	CCG	2	6	2157119	2157124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243566
47457	NC_009482	GGCC	2	8	2157146	2157153	0 %	0 %	50 %	50 %	148243566
47458	NC_009482	TGT	2	6	2157282	2157287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243567
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