MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_009482	CTG	2	6	2090401	2090406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243492
46003	NC_009482	GTGG	2	8	2090407	2090414	0 %	25 %	75 %	0 %	148243492
46004	NC_009482	CAA	2	6	2090443	2090448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243492
46005	NC_009482	CCA	2	6	2090449	2090454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243492
46006	NC_009482	GCA	2	6	2090512	2090517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243492
46007	NC_009482	CCA	2	6	2090616	2090621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243493
46008	NC_009482	CGG	2	6	2090682	2090687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243493
46009	NC_009482	GCCA	2	8	2090704	2090711	25 %	0 %	25 %	50 %	148243493
46010	NC_009482	AGC	2	6	2090807	2090812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243493
46011	NC_009482	CAG	2	6	2090905	2090910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243493
46012	NC_009482	CGCC	2	8	2090913	2090920	0 %	0 %	25 %	75 %	148243493
46013	NC_009482	GCT	2	6	2091000	2091005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243493
46014	NC_009482	CGC	2	6	2091015	2091020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243493
46015	NC_009482	GCCG	2	8	2091132	2091139	0 %	0 %	50 %	50 %	148243493
46016	NC_009482	CATGC	2	10	2091195	2091204	20 %	20 %	20 %	40 %	148243493
46017	NC_009482	GGC	2	6	2091214	2091219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243493
46018	NC_009482	CCAC	2	8	2091451	2091458	25 %	0 %	0 %	75 %	148243494
46019	NC_009482	GCC	2	6	2091472	2091477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243494
46020	NC_009482	TGG	2	6	2091523	2091528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243494
46021	NC_009482	GCCT	2	8	2091594	2091601	0 %	25 %	25 %	50 %	148243494
46022	NC_009482	ACC	2	6	2091619	2091624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243494
46023	NC_009482	CTT	2	6	2091671	2091676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243494
46024	NC_009482	GCG	2	6	2091685	2091690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243494
46025	NC_009482	CCA	3	9	2091737	2091745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243494
46026	NC_009482	ATC	2	6	2091769	2091774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243494
46027	NC_009482	ACA	2	6	2091775	2091780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243494
46028	NC_009482	TGG	2	6	2091795	2091800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243494
46029	NC_009482	CTA	2	6	2091881	2091886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243494
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46031	NC_009482	TGC	3	9	2091910	2091918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243494
46032	NC_009482	TGGC	2	8	2091928	2091935	0 %	25 %	50 %	25 %	148243494
46033	NC_009482	CTG	2	6	2091936	2091941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243494
46034	NC_009482	CGG	2	6	2091968	2091973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243494
46035	NC_009482	CTGG	2	8	2092031	2092038	0 %	25 %	50 %	25 %	148243494
46036	NC_009482	CCAC	2	8	2092048	2092055	25 %	0 %	0 %	75 %	148243494
46037	NC_009482	CAA	2	6	2092097	2092102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243494
46038	NC_009482	GGC	2	6	2092112	2092117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243494
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46040	NC_009482	CCA	2	6	2092148	2092153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243494
46041	NC_009482	GATC	2	8	2092196	2092203	25 %	25 %	25 %	25 %	148243494
46042	NC_009482	GCA	2	6	2092211	2092216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243494
46043	NC_009482	GC	3	6	2092229	2092234	0 %	0 %	50 %	50 %	148243494
46044	NC_009482	CAAG	2	8	2092247	2092254	50 %	0 %	25 %	25 %	148243494
46045	NC_009482	CGG	2	6	2092264	2092269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243494
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46049	NC_009482	CCG	2	6	2092500	2092505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243495
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46052	NC_009482	CGA	2	6	2092611	2092616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243495
46053	NC_009482	CCA	2	6	2092670	2092675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243495
46054	NC_009482	TGG	2	6	2092682	2092687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243495
46055	NC_009482	GCACC	2	10	2092716	2092725	20 %	0 %	20 %	60 %	148243495
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46057	NC_009482	TGAA	2	8	2092874	2092881	50 %	25 %	25 %	0 %	148243496
46058	NC_009482	AG	3	6	2092884	2092889	50 %	0 %	50 %	0 %	148243496
46059	NC_009482	ACGC	2	8	2092893	2092900	25 %	0 %	25 %	50 %	148243496
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46082	NC_009482	GC	3	6	2094019	2094024	0 %	0 %	50 %	50 %	148243496
46083	NC_009482	TGA	3	9	2094092	2094100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243496
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46099	NC_009482	CG	3	6	2094642	2094647	0 %	0 %	50 %	50 %	148243498
46100	NC_009482	ATCGC	2	10	2094686	2094695	20 %	20 %	20 %	40 %	148243498
46101	NC_009482	TGGG	2	8	2094719	2094726	0 %	25 %	75 %	0 %	148243498
46102	NC_009482	GC	3	6	2094852	2094857	0 %	0 %	50 %	50 %	148243498
46103	NC_009482	CGCC	2	8	2094879	2094886	0 %	0 %	25 %	75 %	148243498
46104	NC_009482	TGC	2	6	2094890	2094895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243498
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46111	NC_009482	CAG	2	6	2095097	2095102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243498
46112	NC_009482	GCCGG	2	10	2095103	2095112	0 %	0 %	60 %	40 %	148243498
46113	NC_009482	CGC	2	6	2095204	2095209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243498
46114	NC_009482	GGA	2	6	2095230	2095235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243498
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46116	NC_009482	TCGA	2	8	2095420	2095427	25 %	25 %	25 %	25 %	148243498
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46347	NC_009482	CCT	2	6	2105306	2105311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243509
46348	NC_009482	GCT	2	6	2105350	2105355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243509
46349	NC_009482	GCT	2	6	2105383	2105388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243509
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46378	NC_009482	AAGA	2	8	2106964	2106971	75 %	0 %	25 %	0 %	148243510
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46382	NC_009482	AG	3	6	2107200	2107205	50 %	0 %	50 %	0 %	148243510
46383	NC_009482	TAAT	2	8	2107228	2107235	50 %	50 %	0 %	0 %	148243510
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46449	NC_009482	ACCAGA	2	12	2110108	2110119	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148243514
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46461	NC_009482	CAC	2	6	2110589	2110594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243515
46462	NC_009482	GC	3	6	2110681	2110686	0 %	0 %	50 %	50 %	148243515
46463	NC_009482	GTG	2	6	2110714	2110719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243515
46464	NC_009482	CG	3	6	2110764	2110769	0 %	0 %	50 %	50 %	148243515
46465	NC_009482	CAC	2	6	2110779	2110784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243515
46466	NC_009482	GGC	2	6	2110836	2110841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243515
46467	NC_009482	TCA	2	6	2110885	2110890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243515
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46480	NC_009482	GC	4	8	2111743	2111750	0 %	0 %	50 %	50 %	148243515
46481	NC_009482	GC	3	6	2111775	2111780	0 %	0 %	50 %	50 %	148243515
46482	NC_009482	CAC	2	6	2111781	2111786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243515
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46485	NC_009482	GGC	2	6	2111867	2111872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243515
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46487	NC_009482	CTC	2	6	2112099	2112104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243515
46488	NC_009482	GCC	2	6	2112109	2112114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243515
46489	NC_009482	GC	3	6	2112126	2112131	0 %	0 %	50 %	50 %	148243515
46490	NC_009482	CGGC	2	8	2112157	2112164	0 %	0 %	50 %	50 %	148243515
46491	NC_009482	TGC	2	6	2112176	2112181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243515
46492	NC_009482	GGGC	2	8	2112251	2112258	0 %	0 %	75 %	25 %	148243515
46493	NC_009482	TCA	2	6	2112301	2112306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243515
46494	NC_009482	CCA	2	6	2112329	2112334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243515
46495	NC_009482	CCA	2	6	2112356	2112361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243515
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46497	NC_009482	TCAC	2	8	2112523	2112530	25 %	25 %	0 %	50 %	148243515
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46499	NC_009482	CGC	2	6	2112710	2112715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243515
46500	NC_009482	CAG	2	6	2112733	2112738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243515

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