MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_009482	CTG	2	6	2003472	2003477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44003	NC_009482	TGC	2	6	2003485	2003490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44004	NC_009482	GCT	2	6	2003576	2003581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44005	NC_009482	TGC	2	6	2003608	2003613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44006	NC_009482	ACG	2	6	2003695	2003700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44007	NC_009482	GCCT	2	8	2003820	2003827	0 %	25 %	25 %	50 %	148243405
44008	NC_009482	GGT	2	6	2003846	2003851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243405
44009	NC_009482	GAT	2	6	2003895	2003900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243405
44010	NC_009482	CTG	2	6	2003925	2003930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44011	NC_009482	GTG	2	6	2003947	2003952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243405
44012	NC_009482	AG	3	6	2004008	2004013	50 %	0 %	50 %	0 %	148243405
44013	NC_009482	CTG	2	6	2004030	2004035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44014	NC_009482	TGG	4	12	2004064	2004075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243405
44015	NC_009482	CGG	2	6	2004083	2004088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243405
44016	NC_009482	CGA	2	6	2004158	2004163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44017	NC_009482	CTG	2	6	2004191	2004196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44018	NC_009482	ACACC	2	10	2004269	2004278	40 %	0 %	0 %	60 %	148243405
44019	NC_009482	CTGG	2	8	2004279	2004286	0 %	25 %	50 %	25 %	148243405
44020	NC_009482	GCA	2	6	2004305	2004310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44021	NC_009482	CGC	2	6	2004317	2004322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243405
44022	NC_009482	GCA	2	6	2004415	2004420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44023	NC_009482	CAG	2	6	2004441	2004446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243405
44024	NC_009482	ATCGGC	2	12	2004510	2004521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243406
44025	NC_009482	TGG	2	6	2004574	2004579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243406
44026	NC_009482	CCGC	2	8	2004598	2004605	0 %	0 %	25 %	75 %	148243406
44027	NC_009482	TGCCG	2	10	2004689	2004698	0 %	20 %	40 %	40 %	148243406
44028	NC_009482	CTG	2	6	2004702	2004707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243406
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44030	NC_009482	GCCT	2	8	2004726	2004733	0 %	25 %	25 %	50 %	148243406
44031	NC_009482	CGC	2	6	2004803	2004808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243406
44032	NC_009482	TGC	2	6	2004829	2004834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243406
44033	NC_009482	GCT	2	6	2004875	2004880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243406
44034	NC_009482	GTG	2	6	2004885	2004890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243406
44035	NC_009482	GAA	2	6	2004897	2004902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243406
44036	NC_009482	GTG	3	9	2004903	2004911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243406
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44038	NC_009482	TGA	2	6	2004976	2004981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243406
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44040	NC_009482	CGC	2	6	2005034	2005039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243406
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44042	NC_009482	GCA	2	6	2005051	2005056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243406
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44045	NC_009482	GC	3	6	2005226	2005231	0 %	0 %	50 %	50 %	148243406
44046	NC_009482	G	6	6	2005255	2005260	0 %	0 %	100 %	0 %	148243406
44047	NC_009482	ACG	2	6	2005276	2005281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243406
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44051	NC_009482	GCA	2	6	2005445	2005450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243406
44052	NC_009482	TGC	2	6	2005456	2005461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243406
44053	NC_009482	CCA	2	6	2005498	2005503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243407
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44055	NC_009482	CCAA	2	8	2005624	2005631	50 %	0 %	0 %	50 %	148243407
44056	NC_009482	CAC	2	6	2005655	2005660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243407
44057	NC_009482	GTC	2	6	2005676	2005681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243407
44058	NC_009482	A	6	6	2005706	2005711	100 %	0 %	0 %	0 %	148243407
44059	NC_009482	ACA	2	6	2005723	2005728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243407
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44064	NC_009482	CAAT	2	8	2005873	2005880	50 %	25 %	0 %	25 %	148243407
44065	NC_009482	TGC	2	6	2005893	2005898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243407
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44068	NC_009482	TGC	2	6	2005965	2005970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243407
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44087	NC_009482	TCCAGC	2	12	2006700	2006711	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243407
44088	NC_009482	GAGC	2	8	2006732	2006739	25 %	0 %	50 %	25 %	148243407
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44100	NC_009482	CGATG	2	10	2007216	2007225	20 %	20 %	40 %	20 %	148243407
44101	NC_009482	CATCGC	2	12	2007238	2007249	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243407
44102	NC_009482	AGCC	2	8	2007283	2007290	25 %	0 %	25 %	50 %	148243407
44103	NC_009482	GCCG	2	8	2007358	2007365	0 %	0 %	50 %	50 %	148243407
44104	NC_009482	GCG	2	6	2007382	2007387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243407
44105	NC_009482	CAG	2	6	2007404	2007409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243407
44106	NC_009482	GGCT	2	8	2007471	2007478	0 %	25 %	50 %	25 %	148243407
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44201	NC_009482	C	7	7	2011364	2011370	0 %	0 %	0 %	100 %	148243411
44202	NC_009482	GCTG	2	8	2011385	2011392	0 %	25 %	50 %	25 %	148243411
44203	NC_009482	GCT	2	6	2011415	2011420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
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44207	NC_009482	TGC	2	6	2011525	2011530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243411
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44212	NC_009482	TCA	2	6	2011736	2011741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243412
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44214	NC_009482	CACC	2	8	2011872	2011879	25 %	0 %	0 %	75 %	148243412
44215	NC_009482	GCC	2	6	2011883	2011888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243412
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44217	NC_009482	CAG	2	6	2011966	2011971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243412
44218	NC_009482	GCT	2	6	2012001	2012006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243412
44219	NC_009482	GCA	3	9	2012025	2012033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243412
44220	NC_009482	GCT	2	6	2012083	2012088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243412
44221	NC_009482	CTG	2	6	2012116	2012121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243412
44222	NC_009482	TCA	2	6	2012123	2012128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243412
44223	NC_009482	CCA	2	6	2012139	2012144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243412
44224	NC_009482	TCA	2	6	2012156	2012161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243412
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44229	NC_009482	GCA	2	6	2012327	2012332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243412
44230	NC_009482	GC	3	6	2012373	2012378	0 %	0 %	50 %	50 %	148243412
44231	NC_009482	CGG	2	6	2012403	2012408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243412
44232	NC_009482	CCT	2	6	2012409	2012414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243412
44233	NC_009482	CAGC	2	8	2012425	2012432	25 %	0 %	25 %	50 %	148243412
44234	NC_009482	G	6	6	2012445	2012450	0 %	0 %	100 %	0 %	148243412
44235	NC_009482	TAA	2	6	2012452	2012457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243412
44236	NC_009482	GCC	2	6	2012462	2012467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243412
44237	NC_009482	GCG	2	6	2012471	2012476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243412
44238	NC_009482	TGCAGC	2	12	2012519	2012530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243412
44239	NC_009482	AC	3	6	2012559	2012564	50 %	0 %	0 %	50 %	148243412
44240	NC_009482	CCA	2	6	2012571	2012576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243412
44241	NC_009482	GCT	2	6	2012604	2012609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243412
44242	NC_009482	AGCGCA	2	12	2013052	2013063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243413
44243	NC_009482	CGT	3	9	2013069	2013077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243413
44244	NC_009482	CCG	2	6	2013148	2013153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243413
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44254	NC_009482	GGC	2	6	2013441	2013446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243414
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44257	NC_009482	GCC	2	6	2013547	2013552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243414
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44259	NC_009482	ATGGGG	2	12	2013624	2013635	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	148243414
44260	NC_009482	CTG	2	6	2013670	2013675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243414
44261	NC_009482	GGC	2	6	2013696	2013701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243414
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44288	NC_009482	AC	3	6	2014873	2014878	50 %	0 %	0 %	50 %	148243415
44289	NC_009482	GCG	2	6	2014887	2014892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243415
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44300	NC_009482	CGA	3	9	2015197	2015205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243415
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44303	NC_009482	GTG	2	6	2015279	2015284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243415
44304	NC_009482	GTG	2	6	2015309	2015314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243415
44305	NC_009482	CAG	2	6	2015370	2015375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243415
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44309	NC_009482	GCA	2	6	2015505	2015510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243415
44310	NC_009482	GCC	2	6	2015531	2015536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243415
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44313	NC_009482	CTG	2	6	2015700	2015705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243416
44314	NC_009482	CTG	2	6	2015916	2015921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243416
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44317	NC_009482	TGA	2	6	2016031	2016036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243416
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44320	NC_009482	CGG	2	6	2016126	2016131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243417
44321	NC_009482	GGCATG	2	12	2016144	2016155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243417
44322	NC_009482	TCT	2	6	2016160	2016165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243417
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44326	NC_009482	GT	3	6	2016316	2016321	0 %	50 %	50 %	0 %	148243417
44327	NC_009482	GGCT	2	8	2016344	2016351	0 %	25 %	50 %	25 %	148243417
44328	NC_009482	CAGG	2	8	2016380	2016387	25 %	0 %	50 %	25 %	148243417
44329	NC_009482	TTG	2	6	2016420	2016425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243417
44330	NC_009482	GCT	2	6	2016630	2016635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243417
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44332	NC_009482	GCA	2	6	2016793	2016798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243418
44333	NC_009482	CCA	2	6	2016817	2016822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243418
44334	NC_009482	GGTG	2	8	2017006	2017013	0 %	25 %	75 %	0 %	148243418
44335	NC_009482	GGA	2	6	2017019	2017024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243418
44336	NC_009482	CAC	2	6	2017040	2017045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243418
44337	NC_009482	CCA	2	6	2017066	2017071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243418
44338	NC_009482	AAG	2	6	2017128	2017133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243418
44339	NC_009482	GCG	2	6	2017160	2017165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243418
44340	NC_009482	AAG	2	6	2017302	2017307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243418
44341	NC_009482	ATTGCC	2	12	2017316	2017327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148243418
44342	NC_009482	CA	3	6	2017339	2017344	50 %	0 %	0 %	50 %	148243418
44343	NC_009482	CCT	2	6	2017354	2017359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243418
44344	NC_009482	CAC	2	6	2017370	2017375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243418
44345	NC_009482	TCG	2	6	2017399	2017404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243418
44346	NC_009482	GGT	2	6	2017505	2017510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243418
44347	NC_009482	CGA	2	6	2017513	2017518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243418
44348	NC_009482	AGC	2	6	2017539	2017544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243418
44349	NC_009482	CAC	2	6	2017583	2017588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243418
44350	NC_009482	CGC	2	6	2017591	2017596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243418
44351	NC_009482	AAC	2	6	2017641	2017646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243418
44352	NC_009482	CCA	2	6	2017657	2017662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243418
44353	NC_009482	GAT	2	6	2017688	2017693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243418
44354	NC_009482	GGC	2	6	2017729	2017734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243418
44355	NC_009482	CG	3	6	2017757	2017762	0 %	0 %	50 %	50 %	148243418
44356	NC_009482	C	6	6	2017768	2017773	0 %	0 %	0 %	100 %	148243418
44357	NC_009482	GCTC	2	8	2017858	2017865	0 %	25 %	25 %	50 %	148243418
44358	NC_009482	CGG	2	6	2017917	2017922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243418
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44363	NC_009482	AGC	2	6	2018230	2018235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243419
44364	NC_009482	CCA	2	6	2018270	2018275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243419
44365	NC_009482	CGC	2	6	2018355	2018360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243419
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44371	NC_009482	CTG	2	6	2018496	2018501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243419
44372	NC_009482	GGCC	2	8	2018514	2018521	0 %	0 %	50 %	50 %	148243419
44373	NC_009482	TGA	2	6	2018532	2018537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243419
44374	NC_009482	TGG	2	6	2018580	2018585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243419
44375	NC_009482	CAC	2	6	2018595	2018600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243419
44376	NC_009482	CAG	3	9	2018601	2018609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243419
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44381	NC_009482	GGA	2	6	2018836	2018841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243419
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44383	NC_009482	TGG	2	6	2018991	2018996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243419
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44400	NC_009482	T	6	6	2020167	2020172	0 %	100 %	0 %	0 %	148243421
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44402	NC_009482	TGG	2	6	2020298	2020303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243421
44403	NC_009482	GCA	2	6	2020390	2020395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243421
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44409	NC_009482	CCAAC	2	10	2020860	2020869	40 %	0 %	0 %	60 %	148243422
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44413	NC_009482	GCA	2	6	2021062	2021067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243422
44414	NC_009482	CAAG	2	8	2021074	2021081	50 %	0 %	25 %	25 %	148243422
44415	NC_009482	GGCA	2	8	2021117	2021124	25 %	0 %	50 %	25 %	148243422
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44422	NC_009482	ACG	2	6	2021337	2021342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243423
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44433	NC_009482	CTG	2	6	2021741	2021746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243423
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44452	NC_009482	CCCAGC	2	12	2022455	2022466	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148243423
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44454	NC_009482	TGC	3	9	2022549	2022557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243423
44455	NC_009482	GGC	2	6	2022579	2022584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243423
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44457	NC_009482	CGC	2	6	2022628	2022633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243423
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44461	NC_009482	CTG	2	6	2022752	2022757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243423
44462	NC_009482	CAG	2	6	2022760	2022765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243423
44463	NC_009482	GC	3	6	2022782	2022787	0 %	0 %	50 %	50 %	148243423
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44483	NC_009482	GCT	2	6	2023608	2023613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243426
44484	NC_009482	CGG	2	6	2023645	2023650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243426
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44489	NC_009482	CCG	2	6	2024142	2024147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243427
44490	NC_009482	CGG	2	6	2024154	2024159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243427
44491	NC_009482	GAG	2	6	2024182	2024187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243427
44492	NC_009482	GC	3	6	2024199	2024204	0 %	0 %	50 %	50 %	148243427
44493	NC_009482	GCC	2	6	2024221	2024226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243427
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44495	NC_009482	CTG	2	6	2024284	2024289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243427
44496	NC_009482	TC	3	6	2024319	2024324	0 %	50 %	0 %	50 %	148243427
44497	NC_009482	CGG	2	6	2024328	2024333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243427
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44500	NC_009482	TGA	2	6	2024532	2024537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243427

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