MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_009482	G	6	6	1961244	1961249	0 %	0 %	100 %	0 %	148243354
43002	NC_009482	TGG	2	6	1961291	1961296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243354
43003	NC_009482	TGA	2	6	1961312	1961317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243354
43004	NC_009482	GC	3	6	1961327	1961332	0 %	0 %	50 %	50 %	148243354
43005	NC_009482	CGG	2	6	1961361	1961366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243354
43006	NC_009482	GCT	2	6	1961454	1961459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243354
43007	NC_009482	CGG	3	9	1961466	1961474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243354
43008	NC_009482	GCTG	2	8	1961490	1961497	0 %	25 %	50 %	25 %	148243354
43009	NC_009482	GCA	2	6	1961540	1961545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243354
43010	NC_009482	GGC	2	6	1961678	1961683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243354
43011	NC_009482	GCTG	2	8	1961693	1961700	0 %	25 %	50 %	25 %	148243354
43012	NC_009482	CGG	2	6	1961733	1961738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243354
43013	NC_009482	TGG	2	6	1961740	1961745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243354
43014	NC_009482	GCC	2	6	1961762	1961767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243354
43015	NC_009482	CTG	2	6	1961788	1961793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243354
43016	NC_009482	GGC	2	6	1961795	1961800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243354
43017	NC_009482	GCG	2	6	1961819	1961824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243354
43018	NC_009482	GGCC	2	8	1961862	1961869	0 %	0 %	50 %	50 %	148243354
43019	NC_009482	TGG	3	9	1961891	1961899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243354
43020	NC_009482	TGA	2	6	1961967	1961972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243354
43021	NC_009482	GCT	2	6	1961982	1961987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243354
43022	NC_009482	GCAGC	2	10	1961991	1962000	20 %	0 %	40 %	40 %	148243354
43023	NC_009482	GCC	2	6	1962009	1962014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243354
43024	NC_009482	GGCG	2	8	1962092	1962099	0 %	0 %	75 %	25 %	148243354
43025	NC_009482	CTGAA	2	10	1962111	1962120	40 %	20 %	20 %	20 %	148243354
43026	NC_009482	CAGG	2	8	1962146	1962153	25 %	0 %	50 %	25 %	148243355
43027	NC_009482	CGG	2	6	1962160	1962165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243355
43028	NC_009482	GCG	2	6	1962172	1962177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243355
43029	NC_009482	A	6	6	1962319	1962324	100 %	0 %	0 %	0 %	148243355
43030	NC_009482	GCA	2	6	1962347	1962352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243355
43031	NC_009482	GCT	2	6	1962362	1962367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243355
43032	NC_009482	CT	3	6	1962418	1962423	0 %	50 %	0 %	50 %	148243355
43033	NC_009482	GCA	2	6	1962446	1962451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243355
43034	NC_009482	GCT	2	6	1962452	1962457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243355
43035	NC_009482	GCA	2	6	1962464	1962469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243355
43036	NC_009482	CAG	2	6	1962473	1962478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243355
43037	NC_009482	ACGC	2	8	1962495	1962502	25 %	0 %	25 %	50 %	148243355
43038	NC_009482	TCGA	2	8	1962561	1962568	25 %	25 %	25 %	25 %	148243356
43039	NC_009482	ATG	2	6	1962582	1962587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243356
43040	NC_009482	AGGA	2	8	1962617	1962624	50 %	0 %	50 %	0 %	148243356
43041	NC_009482	TTG	2	6	1962633	1962638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243356
43042	NC_009482	CAG	2	6	1962643	1962648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243356
43043	NC_009482	CGT	2	6	1962676	1962681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243356
43044	NC_009482	CTG	2	6	1962872	1962877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243356
43045	NC_009482	ACGC	2	8	1962923	1962930	25 %	0 %	25 %	50 %	148243356
43046	NC_009482	AGC	3	9	1962943	1962951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243356
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43050	NC_009482	GTC	2	6	1963184	1963189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243356
43051	NC_009482	CCA	2	6	1963230	1963235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243356
43052	NC_009482	GTT	3	9	1963247	1963255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243356
43053	NC_009482	ATC	2	6	1963296	1963301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243356
43054	NC_009482	AGA	2	6	1963321	1963326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243356
43055	NC_009482	CAG	2	6	1963370	1963375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243356
43056	NC_009482	CAT	2	6	1963403	1963408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243356
43057	NC_009482	GGCGC	2	10	1963424	1963433	0 %	0 %	60 %	40 %	148243356
43058	NC_009482	CAGC	2	8	1963447	1963454	25 %	0 %	25 %	50 %	148243356
43059	NC_009482	GCG	2	6	1963497	1963502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243356
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43062	NC_009482	CAC	2	6	1963628	1963633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243356
43063	NC_009482	TCA	2	6	1963794	1963799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243357
43064	NC_009482	TGC	2	6	1963808	1963813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243357
43065	NC_009482	TGC	2	6	1963859	1963864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243357
43066	NC_009482	GCG	3	9	1963880	1963888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243357
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43073	NC_009482	CAG	2	6	1964079	1964084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243357
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43087	NC_009482	AGC	2	6	1964923	1964928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243358
43088	NC_009482	GC	3	6	1965000	1965005	0 %	0 %	50 %	50 %	148243358
43089	NC_009482	G	6	6	1965007	1965012	0 %	0 %	100 %	0 %	148243358
43090	NC_009482	C	7	7	1965086	1965092	0 %	0 %	0 %	100 %	148243358
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43099	NC_009482	GCC	2	6	1965508	1965513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243358
43100	NC_009482	CA	3	6	1965532	1965537	50 %	0 %	0 %	50 %	148243358
43101	NC_009482	GTT	2	6	1965554	1965559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243358
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43104	NC_009482	CCA	2	6	1965727	1965732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243358
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43111	NC_009482	C	6	6	1965964	1965969	0 %	0 %	0 %	100 %	148243359
43112	NC_009482	GAA	2	6	1966010	1966015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243359
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43114	NC_009482	GC	3	6	1966087	1966092	0 %	0 %	50 %	50 %	148243359
43115	NC_009482	ACC	2	6	1966133	1966138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243359
43116	NC_009482	GATGCT	2	12	1966171	1966182	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148243359
43117	NC_009482	ATCTG	2	10	1966230	1966239	20 %	40 %	20 %	20 %	148243359
43118	NC_009482	CTGC	2	8	1966245	1966252	0 %	25 %	25 %	50 %	148243359
43119	NC_009482	GCT	2	6	1966321	1966326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243359
43120	NC_009482	ATGG	2	8	1966396	1966403	25 %	25 %	50 %	0 %	148243360
43121	NC_009482	GAA	2	6	1966426	1966431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243360
43122	NC_009482	CTG	2	6	1966432	1966437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243360
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43124	NC_009482	TGG	2	6	1966460	1966465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243360
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43127	NC_009482	GCT	2	6	1966629	1966634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243360
43128	NC_009482	TGC	2	6	1966640	1966645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243360
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43130	NC_009482	GAC	2	6	1966738	1966743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243360
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43135	NC_009482	CGC	2	6	1966946	1966951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243360
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43145	NC_009482	TGA	2	6	1967411	1967416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243361
43146	NC_009482	CTG	2	6	1967424	1967429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243361
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43151	NC_009482	GT	3	6	1967562	1967567	0 %	50 %	50 %	0 %	148243361
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43173	NC_009482	CCA	2	6	1968456	1968461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243362
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43185	NC_009482	GCA	2	6	1968937	1968942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243363
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43219	NC_009482	CCTGC	2	10	1970026	1970035	0 %	20 %	20 %	60 %	148243364
43220	NC_009482	CGC	2	6	1970109	1970114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243364
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43223	NC_009482	GGC	2	6	1970180	1970185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243364
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43226	NC_009482	CAC	2	6	1970218	1970223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243364
43227	NC_009482	AGC	2	6	1970249	1970254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243364
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43229	NC_009482	TGC	2	6	1970338	1970343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243364
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43231	NC_009482	GCA	3	9	1970472	1970480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243364
43232	NC_009482	TGA	2	6	1970495	1970500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243364
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43234	NC_009482	TGC	2	6	1970561	1970566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243365
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43347	NC_009482	GGC	2	6	1975521	1975526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243371
43348	NC_009482	GCT	3	9	1975541	1975549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243371
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43372	NC_009482	CTG	2	6	1976306	1976311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243372
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43458	NC_009482	CTG	2	6	1980042	1980047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43459	NC_009482	TCCTG	2	10	1980085	1980094	0 %	40 %	20 %	40 %	148243376
43460	NC_009482	CTG	2	6	1980120	1980125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43461	NC_009482	CAG	2	6	1980167	1980172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43462	NC_009482	CTG	2	6	1980189	1980194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43463	NC_009482	GCT	2	6	1980227	1980232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43464	NC_009482	GGC	2	6	1980234	1980239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243376
43465	NC_009482	CCCTGG	2	12	1980277	1980288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243376
43466	NC_009482	GGT	2	6	1980299	1980304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243376
43467	NC_009482	GAT	2	6	1980305	1980310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243376
43468	NC_009482	TCG	2	6	1980337	1980342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43469	NC_009482	TCT	2	6	1980406	1980411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243376
43470	NC_009482	GAA	2	6	1980465	1980470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243376
43471	NC_009482	TGG	2	6	1980475	1980480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243376
43472	NC_009482	CTG	2	6	1980561	1980566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43473	NC_009482	GGCT	2	8	1980624	1980631	0 %	25 %	50 %	25 %	148243376
43474	NC_009482	TCA	2	6	1980664	1980669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243376
43475	NC_009482	TGA	2	6	1980688	1980693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243376
43476	NC_009482	CTG	2	6	1980732	1980737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43477	NC_009482	CTG	2	6	1980771	1980776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43478	NC_009482	CTG	2	6	1980795	1980800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43479	NC_009482	CTG	2	6	1980819	1980824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243376
43480	NC_009482	CCG	2	6	1980829	1980834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243376
43481	NC_009482	GGC	2	6	1980864	1980869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243376
43482	NC_009482	TCCGC	2	10	1980920	1980929	0 %	20 %	20 %	60 %	148243377
43483	NC_009482	CG	4	8	1981009	1981016	0 %	0 %	50 %	50 %	148243377
43484	NC_009482	GCG	2	6	1981042	1981047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243377
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43486	NC_009482	TGA	2	6	1981194	1981199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243377
43487	NC_009482	CCA	2	6	1981206	1981211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243377
43488	NC_009482	ACT	2	6	1981230	1981235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243377
43489	NC_009482	TCT	2	6	1981257	1981262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243377
43490	NC_009482	CCA	2	6	1981287	1981292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243377
43491	NC_009482	GGC	2	6	1981324	1981329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243377
43492	NC_009482	CCAA	2	8	1981379	1981386	50 %	0 %	0 %	50 %	148243377
43493	NC_009482	CAC	2	6	1981390	1981395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243377
43494	NC_009482	CTG	2	6	1981401	1981406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243377
43495	NC_009482	TGG	2	6	1981407	1981412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243377
43496	NC_009482	GGA	2	6	1981528	1981533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243377
43497	NC_009482	C	7	7	1981546	1981552	0 %	0 %	0 %	100 %	148243378
43498	NC_009482	GTG	3	9	1981600	1981608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243378
43499	NC_009482	GTG	2	6	1981621	1981626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243378
43500	NC_009482	TGC	2	6	1981628	1981633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243378

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