MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_009482	ACAA	2	8	1940317	1940324	75 %	0 %	0 %	25 %	148243333
42503	NC_009482	TGC	2	6	1940344	1940349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243333
42504	NC_009482	GCA	2	6	1940357	1940362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243333
42505	NC_009482	GCA	2	6	1940366	1940371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243333
42506	NC_009482	AGC	2	6	1940419	1940424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243333
42507	NC_009482	GCA	2	6	1940435	1940440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243333
42508	NC_009482	GCT	3	9	1940465	1940473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243333
42509	NC_009482	ACC	2	6	1940475	1940480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243333
42510	NC_009482	CG	3	6	1940555	1940560	0 %	0 %	50 %	50 %	148243333
42511	NC_009482	CAA	2	6	1940589	1940594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243333
42512	NC_009482	CCCTG	2	10	1940717	1940726	0 %	20 %	20 %	60 %	148243333
42513	NC_009482	TCACC	2	10	1940732	1940741	20 %	20 %	0 %	60 %	148243333
42514	NC_009482	ACC	2	6	1940889	1940894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243333
42515	NC_009482	CAC	2	6	1940931	1940936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243333
42516	NC_009482	CTCC	2	8	1940966	1940973	0 %	25 %	0 %	75 %	148243333
42517	NC_009482	CCA	2	6	1940990	1940995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243333
42518	NC_009482	TGC	2	6	1941013	1941018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243333
42519	NC_009482	CCT	2	6	1941047	1941052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243333
42520	NC_009482	GCCA	2	8	1941183	1941190	25 %	0 %	25 %	50 %	148243333
42521	NC_009482	TGG	3	9	1941206	1941214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243333
42522	NC_009482	TCA	2	6	1941217	1941222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243333
42523	NC_009482	GCG	2	6	1941233	1941238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243333
42524	NC_009482	CCA	2	6	1941283	1941288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243333
42525	NC_009482	GCA	2	6	1941341	1941346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243333
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42527	NC_009482	CGC	2	6	1941360	1941365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243333
42528	NC_009482	AGACC	2	10	1941449	1941458	40 %	0 %	20 %	40 %	148243333
42529	NC_009482	CGC	2	6	1941493	1941498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243333
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42531	NC_009482	CAA	2	6	1941558	1941563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243333
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42533	NC_009482	CCA	3	9	1941689	1941697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243333
42534	NC_009482	GCA	2	6	1941710	1941715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243333
42535	NC_009482	GCT	2	6	1941737	1941742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243333
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42538	NC_009482	CTG	2	6	1941998	1942003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243334
42539	NC_009482	CAG	2	6	1942040	1942045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243334
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42541	NC_009482	TGC	2	6	1942098	1942103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243334
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42543	NC_009482	ACG	2	6	1942149	1942154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243334
42544	NC_009482	TGG	2	6	1942155	1942160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243334
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42547	NC_009482	GGC	2	6	1942244	1942249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243334
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42549	NC_009482	TGGCCA	2	12	1942305	1942316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243334
42550	NC_009482	GTG	2	6	1942328	1942333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243334
42551	NC_009482	AGC	3	9	1942395	1942403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243334
42552	NC_009482	GGA	2	6	1942480	1942485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243334
42553	NC_009482	CAG	2	6	1942532	1942537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243334
42554	NC_009482	GAA	2	6	1942562	1942567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243334
42555	NC_009482	GCT	2	6	1942588	1942593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243334
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42557	NC_009482	GGC	2	6	1942717	1942722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243334
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42566	NC_009482	GC	3	6	1943336	1943341	0 %	0 %	50 %	50 %	148243334
42567	NC_009482	CGA	2	6	1943377	1943382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243334
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42597	NC_009482	CATCGC	2	12	1944935	1944946	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243335
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42599	NC_009482	CGGC	2	8	1945066	1945073	0 %	0 %	50 %	50 %	148243335
42600	NC_009482	G	6	6	1945080	1945085	0 %	0 %	100 %	0 %	148243335
42601	NC_009482	CACGA	2	10	1945092	1945101	40 %	0 %	20 %	40 %	148243335
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42605	NC_009482	CTG	3	9	1945281	1945289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243335
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42609	NC_009482	TGC	2	6	1945363	1945368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243335
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42612	NC_009482	GCA	2	6	1945523	1945528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243336
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42941	NC_009482	GGCT	2	8	1958865	1958872	0 %	25 %	50 %	25 %	148243351
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42951	NC_009482	TGC	3	9	1959271	1959279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243352
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42960	NC_009482	CTG	2	6	1959482	1959487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243352
42961	NC_009482	GCTG	2	8	1959556	1959563	0 %	25 %	50 %	25 %	148243352
42962	NC_009482	CGCTG	2	10	1959587	1959596	0 %	20 %	40 %	40 %	148243352
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42965	NC_009482	CCA	2	6	1959679	1959684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243352
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42981	NC_009482	CGG	2	6	1960378	1960383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243353
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42983	NC_009482	GCT	2	6	1960492	1960497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243353
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42985	NC_009482	AGC	2	6	1960626	1960631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243353
42986	NC_009482	C	6	6	1960723	1960728	0 %	0 %	0 %	100 %	148243353
42987	NC_009482	GGCT	2	8	1960739	1960746	0 %	25 %	50 %	25 %	148243353
42988	NC_009482	CTG	3	9	1960784	1960792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243353
42989	NC_009482	GCC	2	6	1960808	1960813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243353
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42992	NC_009482	GCC	2	6	1960979	1960984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243353
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42994	NC_009482	CTG	2	6	1961052	1961057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243354
42995	NC_009482	GCG	2	6	1961078	1961083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243354
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