MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_009482	CTGCA	2	10	1897180	1897189	20 %	20 %	20 %	40 %	148243285
41503	NC_009482	A	6	6	1897203	1897208	100 %	0 %	0 %	0 %	148243285
41504	NC_009482	CAA	3	9	1897219	1897227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243285
41505	NC_009482	GGT	2	6	1897231	1897236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243285
41506	NC_009482	CCA	2	6	1897270	1897275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243285
41507	NC_009482	CGAT	2	8	1897301	1897308	25 %	25 %	25 %	25 %	148243285
41508	NC_009482	GCC	2	6	1897367	1897372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243285
41509	NC_009482	TGG	3	9	1897383	1897391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243285
41510	NC_009482	AGC	2	6	1897435	1897440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243285
41511	NC_009482	TTGA	2	8	1897487	1897494	25 %	50 %	25 %	0 %	148243285
41512	NC_009482	TGG	2	6	1897572	1897577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243285
41513	NC_009482	CAGC	2	8	1897585	1897592	25 %	0 %	25 %	50 %	148243285
41514	NC_009482	GC	3	6	1897605	1897610	0 %	0 %	50 %	50 %	148243285
41515	NC_009482	CCG	2	6	1897618	1897623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243285
41516	NC_009482	ACAA	2	8	1897638	1897645	75 %	0 %	0 %	25 %	148243285
41517	NC_009482	GCA	2	6	1897651	1897656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243285
41518	NC_009482	CCA	2	6	1897694	1897699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243285
41519	NC_009482	GCT	2	6	1897708	1897713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243285
41520	NC_009482	GGA	2	6	1897762	1897767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243285
41521	NC_009482	CAC	2	6	1897831	1897836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243285
41522	NC_009482	T	6	6	1897863	1897868	0 %	100 %	0 %	0 %	148243285
41523	NC_009482	CGGCC	2	10	1897969	1897978	0 %	0 %	40 %	60 %	148243285
41524	NC_009482	GCTT	2	8	1897983	1897990	0 %	50 %	25 %	25 %	148243285
41525	NC_009482	AGG	2	6	1898041	1898046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243285
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41527	NC_009482	TGA	2	6	1898342	1898347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243286
41528	NC_009482	CTG	2	6	1898371	1898376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243286
41529	NC_009482	ATCGC	2	10	1898396	1898405	20 %	20 %	20 %	40 %	148243286
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41531	NC_009482	GC	3	6	1898487	1898492	0 %	0 %	50 %	50 %	148243286
41532	NC_009482	CCAC	2	8	1898633	1898640	25 %	0 %	0 %	75 %	148243286
41533	NC_009482	TGG	2	6	1898672	1898677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243286
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41538	NC_009482	GCT	2	6	1898822	1898827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243287
41539	NC_009482	CTG	2	6	1898898	1898903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243287
41540	NC_009482	GTG	2	6	1898973	1898978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243287
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41542	NC_009482	T	6	6	1899114	1899119	0 %	100 %	0 %	0 %	148243287
41543	NC_009482	GCA	2	6	1899151	1899156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243287
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41545	NC_009482	CTG	2	6	1899225	1899230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243287
41546	NC_009482	TGG	2	6	1899241	1899246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243287
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41549	NC_009482	CCCA	2	8	1899297	1899304	25 %	0 %	0 %	75 %	148243287
41550	NC_009482	CG	3	6	1899305	1899310	0 %	0 %	50 %	50 %	148243287
41551	NC_009482	ATCG	2	8	1899311	1899318	25 %	25 %	25 %	25 %	148243287
41552	NC_009482	TGC	2	6	1899346	1899351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243287
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41554	NC_009482	TGG	3	9	1899406	1899414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243287
41555	NC_009482	ACCG	2	8	1899453	1899460	25 %	0 %	25 %	50 %	148243287
41556	NC_009482	CTG	2	6	1899477	1899482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243287
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41558	NC_009482	CTG	2	6	1899510	1899515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243287
41559	NC_009482	ATC	2	6	1899522	1899527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243287
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41562	NC_009482	CAA	2	6	1899710	1899715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243288
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41589	NC_009482	GCGG	2	8	1900538	1900545	0 %	0 %	75 %	25 %	148243288
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41605	NC_009482	CCAC	2	8	1901346	1901353	25 %	0 %	0 %	75 %	148243289
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41961	NC_009482	CTC	2	6	1917360	1917365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243310
41962	NC_009482	CAA	2	6	1917422	1917427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243310
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41988	NC_009482	AGC	3	9	1918652	1918660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
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41990	NC_009482	TCG	2	6	1918674	1918679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243311
41991	NC_009482	CAGC	2	8	1918702	1918709	25 %	0 %	25 %	50 %	148243311
41992	NC_009482	AGCTCA	2	12	1918716	1918727	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148243311
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41994	NC_009482	GCA	2	6	1918794	1918799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243311
41995	NC_009482	GGT	2	6	1918804	1918809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243311
41996	NC_009482	GGC	2	6	1918814	1918819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243311
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41998	NC_009482	CA	3	6	1918856	1918861	50 %	0 %	0 %	50 %	148243311
41999	NC_009482	TGA	2	6	1918930	1918935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243311
42000	NC_009482	G	7	7	1918936	1918942	0 %	0 %	100 %	0 %	148243311

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