MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_009482	ATAA	2	8	1730674	1730681	75 %	25 %	0 %	0 %	148243094
38003	NC_009482	CCGCCA	2	12	1730699	1730710	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148243094
38004	NC_009482	CTC	2	6	1730736	1730741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243094
38005	NC_009482	GCA	2	6	1730762	1730767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243094
38006	NC_009482	GTG	2	6	1730956	1730961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243095
38007	NC_009482	AGC	2	6	1731255	1731260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243096
38008	NC_009482	CTG	2	6	1731380	1731385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243096
38009	NC_009482	CACG	2	8	1731386	1731393	25 %	0 %	25 %	50 %	148243096
38010	NC_009482	GC	3	6	1731405	1731410	0 %	0 %	50 %	50 %	148243096
38011	NC_009482	ACC	2	6	1731531	1731536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243097
38012	NC_009482	GCT	2	6	1731566	1731571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
38013	NC_009482	TCA	2	6	1731616	1731621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243097
38014	NC_009482	GCA	2	6	1731629	1731634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243097
38015	NC_009482	GCA	2	6	1731653	1731658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243097
38016	NC_009482	CGG	2	6	1731683	1731688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243097
38017	NC_009482	TGCC	2	8	1731693	1731700	0 %	25 %	25 %	50 %	148243097
38018	NC_009482	TGCCA	2	10	1731729	1731738	20 %	20 %	20 %	40 %	148243097
38019	NC_009482	TGC	2	6	1731850	1731855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
38020	NC_009482	GCA	2	6	1731869	1731874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243097
38021	NC_009482	TGC	2	6	1731898	1731903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
38022	NC_009482	CCGCT	2	10	1731998	1732007	0 %	20 %	20 %	60 %	148243097
38023	NC_009482	TGC	2	6	1732018	1732023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
38024	NC_009482	CGT	2	6	1732039	1732044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
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38026	NC_009482	A	6	6	1732184	1732189	100 %	0 %	0 %	0 %	148243098
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38028	NC_009482	TGG	2	6	1732282	1732287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243099
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38032	NC_009482	TTCA	2	8	1732534	1732541	25 %	50 %	0 %	25 %	148243099
38033	NC_009482	ACCC	2	8	1732654	1732661	25 %	0 %	0 %	75 %	148243099
38034	NC_009482	CAA	2	6	1732687	1732692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243099
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38042	NC_009482	CTTGGG	2	12	1733048	1733059	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148243100
38043	NC_009482	GGC	2	6	1733089	1733094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243100
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38047	NC_009482	TGC	2	6	1733184	1733189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243100
38048	NC_009482	ACGC	2	8	1733300	1733307	25 %	0 %	25 %	50 %	148243100
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38050	NC_009482	GA	3	6	1733406	1733411	50 %	0 %	50 %	0 %	148243100
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38055	NC_009482	GGC	2	6	1733749	1733754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243100
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38062	NC_009482	GCA	2	6	1734112	1734117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243100
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38064	NC_009482	TCC	2	6	1734153	1734158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243100
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38105	NC_009482	TCCC	2	8	1735559	1735566	0 %	25 %	0 %	75 %	148243101
38106	NC_009482	GCT	2	6	1735598	1735603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243101
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38112	NC_009482	AGC	2	6	1735857	1735862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243101
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38115	NC_009482	GCA	2	6	1736157	1736162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243102
38116	NC_009482	CAA	2	6	1736180	1736185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243102
38117	NC_009482	TCG	2	6	1736271	1736276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243102
38118	NC_009482	CGG	2	6	1736281	1736286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243102
38119	NC_009482	CAA	2	6	1736299	1736304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243102
38120	NC_009482	GTG	2	6	1736324	1736329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243102
38121	NC_009482	AGC	2	6	1736338	1736343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243102
38122	NC_009482	GAGTG	2	10	1736486	1736495	20 %	20 %	60 %	0 %	148243102
38123	NC_009482	GCT	2	6	1736560	1736565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243102
38124	NC_009482	GGT	2	6	1736566	1736571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243102
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38127	NC_009482	GCA	2	6	1736650	1736655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243102
38128	NC_009482	GCTTGG	2	12	1736671	1736682	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148243102
38129	NC_009482	CTGAT	2	10	1736857	1736866	20 %	40 %	20 %	20 %	148243102
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38144	NC_009482	CAG	2	6	1737504	1737509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243103
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38151	NC_009482	CA	3	6	1737984	1737989	50 %	0 %	0 %	50 %	148243103
38152	NC_009482	AGC	2	6	1738003	1738008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243103
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38185	NC_009482	AAT	2	6	1740690	1740695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243106
38186	NC_009482	ATC	2	6	1741482	1741487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243107
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38204	NC_009482	GAT	2	6	1742904	1742909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243108
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38222	NC_009482	CCA	2	6	1743677	1743682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243109
38223	NC_009482	CCA	2	6	1743707	1743712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243109
38224	NC_009482	CAG	2	6	1743759	1743764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243109
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38226	NC_009482	TGC	3	9	1743859	1743867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243109
38227	NC_009482	CGGCT	2	10	1743870	1743879	0 %	20 %	40 %	40 %	148243109
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38229	NC_009482	GCC	2	6	1744044	1744049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243110
38230	NC_009482	CTG	2	6	1744076	1744081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243110
38231	NC_009482	GCA	2	6	1744123	1744128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243110
38232	NC_009482	GC	3	6	1744146	1744151	0 %	0 %	50 %	50 %	148243110
38233	NC_009482	CAAA	2	8	1744156	1744163	75 %	0 %	0 %	25 %	148243110
38234	NC_009482	ATC	2	6	1744229	1744234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243110
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38335	NC_009482	CAGC	2	8	1748736	1748743	25 %	0 %	25 %	50 %	148243115
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38346	NC_009482	GCC	2	6	1749157	1749162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243115
38347	NC_009482	CAA	2	6	1749172	1749177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243115
38348	NC_009482	GGCG	2	8	1749189	1749196	0 %	0 %	75 %	25 %	148243115
38349	NC_009482	GCT	2	6	1749243	1749248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243115
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38353	NC_009482	GCAA	2	8	1749351	1749358	50 %	0 %	25 %	25 %	148243115
38354	NC_009482	TGC	2	6	1749372	1749377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243115
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38450	NC_009482	C	6	6	1754399	1754404	0 %	0 %	0 %	100 %	148243120
38451	NC_009482	ACG	2	6	1754427	1754432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243121
38452	NC_009482	TGCCC	2	10	1754449	1754458	0 %	20 %	20 %	60 %	148243121
38453	NC_009482	GCT	2	6	1754464	1754469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243121
38454	NC_009482	GCT	2	6	1754488	1754493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243121
38455	NC_009482	GCT	2	6	1754620	1754625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243121
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38457	NC_009482	CTCAGC	2	12	1754699	1754710	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243121
38458	NC_009482	AGC	2	6	1754715	1754720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243121
38459	NC_009482	AAGCC	2	10	1754746	1754755	40 %	0 %	20 %	40 %	148243121
38460	NC_009482	GAT	2	6	1754783	1754788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243121
38461	NC_009482	CTG	2	6	1754880	1754885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243122
38462	NC_009482	CAG	2	6	1754925	1754930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243122
38463	NC_009482	GCT	3	9	1754960	1754968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243122
38464	NC_009482	TGG	2	6	1754969	1754974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243122
38465	NC_009482	GCC	2	6	1755007	1755012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243122
38466	NC_009482	GCT	2	6	1755048	1755053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243122
38467	NC_009482	GCCA	2	8	1755211	1755218	25 %	0 %	25 %	50 %	148243122
38468	NC_009482	CTG	2	6	1755219	1755224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243122
38469	NC_009482	GGGC	2	8	1755272	1755279	0 %	0 %	75 %	25 %	148243122
38470	NC_009482	GCG	2	6	1755303	1755308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243122
38471	NC_009482	CGC	2	6	1755319	1755324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243122
38472	NC_009482	CAG	2	6	1755387	1755392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243122
38473	NC_009482	AGC	2	6	1755430	1755435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243122
38474	NC_009482	GCA	2	6	1755440	1755445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243122
38475	NC_009482	CAG	2	6	1755538	1755543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243122
38476	NC_009482	GCC	2	6	1755559	1755564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243122
38477	NC_009482	TGG	2	6	1755721	1755726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243123
38478	NC_009482	TGG	2	6	1755736	1755741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243123
38479	NC_009482	GGT	2	6	1755800	1755805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243123
38480	NC_009482	G	6	6	1755806	1755811	0 %	0 %	100 %	0 %	148243123
38481	NC_009482	CTG	2	6	1755888	1755893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243123
38482	NC_009482	CGA	2	6	1755896	1755901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243123
38483	NC_009482	TCC	2	6	1755922	1755927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243123
38484	NC_009482	ATG	2	6	1756020	1756025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243123
38485	NC_009482	GCG	2	6	1756030	1756035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243123
38486	NC_009482	CCTC	2	8	1756105	1756112	0 %	25 %	0 %	75 %	148243123
38487	NC_009482	GA	3	6	1756151	1756156	50 %	0 %	50 %	0 %	148243123
38488	NC_009482	CAG	2	6	1756158	1756163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243123
38489	NC_009482	CTG	2	6	1756185	1756190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243123
38490	NC_009482	CCT	2	6	1756325	1756330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243124
38491	NC_009482	CTT	2	6	1756505	1756510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243124
38492	NC_009482	GCCTCT	2	12	1756561	1756572	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148243124
38493	NC_009482	GGT	2	6	1756619	1756624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243124
38494	NC_009482	TGG	2	6	1756633	1756638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243124
38495	NC_009482	CTG	2	6	1756644	1756649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243124
38496	NC_009482	GAG	2	6	1756674	1756679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243124
38497	NC_009482	CCA	2	6	1756702	1756707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243124
38498	NC_009482	TGG	2	6	1756723	1756728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243124
38499	NC_009482	GAG	2	6	1756746	1756751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243124
38500	NC_009482	TGC	2	6	1756801	1756806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243124

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